Diccionario

1. Mezcla de cebadores en los que determinadas posiciones contienen diversas bases, generalmente especificadas por el usuario, produciendo una población de cebadores que cubren todas las posibles combinaciones de nucleótidos en una o más posiciones. Es utilizado con el fin de detectar un gen a partir de secuencias de ADN disponibles de otros organismos estrechamente relacionados. Son aquellos cebadores que tienen similitud y usos específicos cuando se desea amplificar un gen o secuencia de un organismo similar. Un ejemplo de cebador degenerado sería AGTWCT, que comprendería una población de los cebadores AGTACT y AGTTCT. 2. Mezcla de cebadores, y cada uno de los mismos, que muestran variaciones en posiciones concretas de una secuencia común a todos los cebadores.

Variante que se diferencia de una PCR simple o convencional estándar en que utiliza un conjunto de cebadores con secuencias degeneradas en vez de un solo par de cebadores de secuencia única. Permite amplificar genes nuevos y familias multigénicas. Constituye una herramienta clave en estudios evolutivos a nivel molecular. Se basa en el diseño de un cebador degenerado con el fin de detectar o encontrar un gen a partir de secuencias de ADN disponibles de otros organismos estrechamente relacionados. También es muy frecuente la versión RT-PCR degenerada.

1. Mezcla de cebadores de composición nucleotídica similar. Cada cebador de la mezcla es un oligonucleótido compuesto de un número idéntico de nucleótidos y tiene una secuencia nucleotídica básica en común con el resto de los componentes de la misma, pero difiere en ciertas posiciones (conocidas en inglés como variable, degenerate o redundant positions). Tal mezcla es necesaria para amplificar una región genómica específica, cuya secuencia nucleotídica se ha deducido a partir de la secuencia de aminoácidos conocida de la proteína, pues un mismo aminoácido puede estar codificado por más de un triplete o codón (como es el caso de la fenilalanina y la tirosina que disponen de dos codones sinónimos, y de la isoleucina que dispone de tres, como ejemplos). 2. Por extensión, cualquiera de los cebadores individuales que componen la mezcla anterior.