Cada una de las secuencias de ADN complementarias a una secuencia de ADN ya amplificada por PCR anidada en una primera ronda de amplificación con el uso de cebadores externos o aquel cebador único utilizado en la segunda ronda de una PCR semianidada.
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PCR semianidada
La PCR o RT-PCR semianidada utiliza dos cebadores externos y un único cebador interno. Este procedimiento permite aumentar la sensibilidad y especificidad de la PCR simple convencional. Generalmente, las amplificaciones se realizan en tubos separados, con el consiguiente alto riesgo de contaminación al transferir de uno a otro el producto de la primera amplificación. La versión RT-PCR semianidada es muy utilizada.