Diccionario

Aquellos que codifican el mismo aminoácido, como UUU y UUC, ambos para la fenilalanina.

1. Mezcla de cebadores de composición nucleotídica similar. Cada cebador de la mezcla es un oligonucleótido compuesto de un número idéntico de nucleótidos y tiene una secuencia nucleotídica básica en común con el resto de los componentes de la misma, pero difiere en ciertas posiciones (conocidas en inglés como variable, degenerate o redundant positions). Tal mezcla es necesaria para amplificar una región genómica específica, cuya secuencia nucleotídica se ha deducido a partir de la secuencia de aminoácidos conocida de la proteína, pues un mismo aminoácido puede estar codificado por más de un triplete o codón (como es el caso de la fenilalanina y la tirosina que disponen de dos codones sinónimos, y de la isoleucina que dispone de tres, como ejemplos). 2. Por extensión, cualquiera de los cebadores individuales que componen la mezcla anterior.

Utilización preferencial de ciertos codones sinónimos. Este fenómeno, que ocurre en todos los tipos de organismos, resulta en un patrón de utilización de determinados codones para la codificación de aminoácidos en el ARNm, que es característico de cada organismo. Esto suele dar lugar a la traducción ineficiente de un ARNm en un sistema celular heterólogo, como el de un ARNm de un gen de mamífero en células de Escherichia coli, debido a que el ARNm contiene codones sinónimos cuyos ARNt son poco abundantes en el sistema celular en que se ha de traducir. Los codones sinónimos no se usan con igual frecuencia en todas las especies; por ejemplo, de entre los cuatro codones que codifican prolina, el codón CCA se utiliza solo un 4,1 % de las veces en el genoma de la bacteria Ralstonia solanacearum, pero un 17,2 % de las veces en el genoma de la bacteria Erwinia amylovora. El patrón de utilización de codones es crítico para determinar la expresión génica y las funciones celulares, al influir en diversos procesos como el procesamiento de ARN, y la traducción y plegamiento de proteínas.

Aquellos que codifican aminoácidos distintos.