Aquel formado por la sal de una base orgánica, que contiene el cromóforo unido al catión, combinada con un ácido incoloro. Ejemplos de ellos son el azul de toluidina, azul de metilo, tionina, safranina o hematoxilina.
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azul de metileno
Colorante básico o catiónico, con apetencia por sustancias ácidas como el ADN o ciertos componentes de la matriz extracelular como los glicosaminoglicanos. Se utiliza en tinciones para su observación al microscopio ya que tiñe a todas las bacterias y se utiliza para observar estructuras del citoplasma bacteriano. También tiñe la calosa y sirve para localizar placas cribosas.
fucsina básica
Colorante básico de trifenilmetano, que disuelto en agua tiene un color rojo y se utiliza en las técnicas microscópicas convencionales. Decolora con el sulfito y es empleada para teñir flagelos bacterianos y como indicador para detectar aldehídos, que toman color rojo-violeta con este colorante por lo que se utiliza en histología para determinar la presencia de aldehídos en el núcleo.