Diccionario

Término que agrupa a cualquier elemento genético que se mueve entre células, como islas de patogenicidad (en inglés PIs), integrones, ICEs, y plásmidos, entre otros. Las IS, y otros elementos transponibles, permiten acelerar la evolución de los organismos mediante la generación de diversos tipos de cambios genéticos en el genoma del huésped o anfitrión, siendo lo más frecuente la inactivación génica por inserción física del elemento. Entre otros cambios genéticos, las IS también pueden dar lugar a cambios de expresión génica, ya que diversas IS poseen promotores activos dirigidos hacia el exterior del elemento o terminadores de la transcripción, así como favorecer reorganizaciones genómicas (inversiones, deleciones, traslocaciones, inserción de plásmidos o islas, etc.) mediante recombinación homóloga entre dos copias de una IS.

En Biología, especie, secuencia de proteína o ácido nucleico, etc., más cercana en el tiempo y de la que descienden, mediante procesos evolutivos dos o más linajes; que se consideran homólogos porque han evolucionado a partir de un ancestro común. Su conocimiento indica la posible diversificación de un agente patógeno y es clave para entender la historia evolutiva y la propagación geográfica de un patógeno, gen, elemento genético móvil, etc. Generalmente, el ancestro común se determina mediante una predicción, que se basa en el análisis de las especies o de secuencias disponibles en la actualidad. Este análisis se lleva a cabo mediante diversos métodos, entre los que destacan los de máxima verosimilitud (maximum likelihood) y los métodos bayesianos. Se emplea principalmente en análisis filogenéticos para: (i) determinar el origen evolutivo de cepas patógenas, (ii) para reconstruir la posible diseminación espacio-temporal (geográfica y temporal) de enfermedades de plantas, y (iii) para entender mejor la coevolución entre plantas huéspedes o anfitrionas y sus agentes patógenos. Un grupo de taxones que contiene un ancestro común y todos sus descendientes se denomina grupo monofilético, que es lo contrario de grupo polifilético.

Elemento genético móvil autónomo que tradicionalmente se ha definido como un fragmento corto de ADN, que no confiere un fenotipo conocido, que codifica solo para un enzima necesario para su transposición (transposasa), y que puede copiarse repetidamente, insertándose en sitios muy diversos del genoma utilizando mecanismos de recombinación no homóloga entre los extremos del elemento y el ADN diana. Su tamaño varía entre 0,7 y 2,5 kb y son muy compactas, con solo uno o dos genes (transposasa y, a veces, proteínas reguladoras); están típicamente bordeadas por repeticiones cortas invertidas, generalmente imperfectas. La especificidad de inserción es muy variable: hay ISs que se insertan solo en secuencias diana muy específicas mientras que otros tipos de IS se insertan prácticamente al azar; muchos tipos de IS están bordeadas por una repetición corta (2-14 nt) de la secuencia diana, que se genera como resultado de la inserción. Esta definición de IS, sin embargo, requerirá de una revisión debido al descubrimiento en los últimos años de nuevos elementos que solo presentan algunas características de las ISs canónicas; un ejemplo son las IS que llevan genes adicionales o los elementos no autónomos, como los MITE.