Diccionario

Grupo de taxones que descienden de un mismo ancestro común. Término que hace referencia a formas en las que se agrupan y definen taxones en función de cómo queda reflejada su evolución en los árboles filogenéticos. Los grupos monofiléticos y los linajes son la base más importante de la taxonomía y evolución. Todos los organismos y taxones incluidos en un grupo monofilético tienen un mismo antepasado común.

En Biología, especie, secuencia de proteína o ácido nucleico, etc., más cercana en el tiempo y de la que descienden, mediante procesos evolutivos dos o más linajes; que se consideran homólogos porque han evolucionado a partir de un ancestro común. Su conocimiento indica la posible diversificación de un agente patógeno y es clave para entender la historia evolutiva y la propagación geográfica de un patógeno, gen, elemento genético móvil, etc. Generalmente, el ancestro común se determina mediante una predicción, que se basa en el análisis de las especies o de secuencias disponibles en la actualidad. Este análisis se lleva a cabo mediante diversos métodos, entre los que destacan los de máxima verosimilitud (maximum likelihood) y los métodos bayesianos. Se emplea principalmente en análisis filogenéticos para: (i) determinar el origen evolutivo de cepas patógenas, (ii) para reconstruir la posible diseminación espacio-temporal (geográfica y temporal) de enfermedades de plantas, y (iii) para entender mejor la coevolución entre plantas huéspedes o anfitrionas y sus agentes patógenos. Un grupo de taxones que contiene un ancestro común y todos sus descendientes se denomina grupo monofilético, que es lo contrario de grupo polifilético.

Hongos que se incluían, en la clase Discomycetes, que ubicaba a los ascomicetos cuyo cuerpo fructífero era un apotecio. Actualmente, no tiene carácter taxonómico ya que los hongos con apotecios no forman un grupo monofilético. No obstante, a pesar de su incorrección, el término es todavía relativamente utilizado.

Los procariotas son microorganismos unicelulares, y su característica más significativa es que su material genético (generalmente una única molécula circular de ADN) no está rodeado por una membrana (aunque el grupo Planctomycetes/Verrucomicrobia/Chlamydiae, constituye una rara excepción) y, a diferencia de las células eucarióticas, las de los procariotas carecen de verdadero núcleo. Otras diferencias fundamentales son: i) la ausencia de orgánulos (mitocondrias, cloroplastos u otro tipo de orgánulos delimitados por membranas); ii) las enzimas implicadas en el metabolismo energético están distribuidas por el citoplasma; iii) la ausencia de esteroles en la membrana celular; y iv) los ribosomas (70S) son más pequeños que los de eucariotas (80S). De forma genérica, se sigue empleando el término bacteria para referirse a todos los procariotas, si bien se distinguen dos dominios claramente diferenciados: Bacteria, las bacterias propiamente dichas, y Archaea, que, aunque comparten muchas características, se diferencian en la composición de la membrana citoplásmica, de la pared o de los ARNt. Entre los procariotas patógenos de plantas, que son todos del dominio Bacteria, tradicionalmente se han considerado dos grupos, los que poseen pared celular y los que carecen de la misma que se denominaban micoplasmas y ahora se engloban en la clase Mollicutes del filo Mycoplasmatota (previamente Tenericutes). Actualmente el término procariota se considera obsoleto y está en desuso, ya que es engañoso al agrupar a organismos que presentan profundas diferencias estructurales, funcionales y evolutivas. Los principales argumentos en contra del uso de este término son: i) se trata de una denominación negativa —define a los organismos por ausencia de núcleo—, sin fundamento filogenético, que agrupa a bacterias y arqueas únicamente por no pertenecer a los eucariotas; ii) bacterias y arqueas no forman un grupo monofilético, y las arqueas están filogenéticamente más próximas a los eucariotas que a las bacterias; iii) existen diferencias sustanciales entre bacterias y arqueas en aspectos como la composición de la membrana, los mecanismos de transcripción y traducción, la arquitectura del genoma y la maquinaria de replicación, mostrando las arqueas mayores similitudes con los eucariotas; y iv) el término no refleja adecuadamente la evolución celular, ya que no representa una separación natural entre estos dos grupos y los eucariotas —es decir, el árbol de la vida se divide en tres dominios, no en procariotas y eucariotas—. Por ello, se recomienda referirse a los organismos celulares utilizando la clasificación en los tres dominios de la vida —Archaea, Bacteria y Eukarya—, que refleja de forma más precisa sus relaciones evolutivas.

Grupo de taxones que contiene el ancestro común, pero que no incluye todos los descendientes de este antepasado. Término que hace referencia a formas en las que se agrupan y definen taxones en función de cómo queda reflejada su evolución en los árboles filogenéticos. Un grupo parafilético puede darse cuando, por alguna razón, algunos miembros del grupo se han asignado a otro grupo.