Contaminante orgánico e inorgánico incluido en la muestra de ADN o ARN que interfiere atenuando o inhibiendo completamente la reacción de amplificación por PCR o RT-PCR. La mayoría frecuentemente provienen de la muestra vegetal, del suelo o de la muestra de artrópodos analizada. Pero también pueden proceder del propio operador o del material y tampones utilizados para la amplificación, que han sido contaminados por el operador. Existe una amplia gama de métodos y protocolos y normas o precauciones de trabajo para reducirlos y de kits comerciales que eliminan o reducen significativamente los distintos inhibidores procedentes de la muestra.
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inhibidor
Sustancia de origen endógeno o exógeno que reduce la actividad enzimática. Puede competir con el sustrato por la unión al centro activo del enzima (inhibición competitiva), o unirse a un punto distinto de la molécula de enzima (inhibición alostérica). Esta última modifica, en ocasiones, la cinética enzimática y constituye un mecanismo muy frecuente de regulación metabólica, como también lo es el proceso contrario (activación), según definición del Diccionario de Ciencias Hortícolas de la SECH. Los inhibidores de la PCR son sustancias muy heterogéneas, que reducen la intensidad o inhiben la reacción de amplificación, como por ejemplo proteínas, grasas, ácido húmico, EDTA, fenol, proteasas, detergentes y distintas sales.