La totalidad de organismos en un ecosistema dado, por ejemplo, una planta y su microbioma asociado, que constituyen un metaorganismo. Forman una compleja comunidad que influye decisivamente en el crecimiento, desarrollo, salud, productividad y capacidad de la planta para confrontar situaciones adversas. La tolerancia de las plantas a estreses de índole diversa puede estudiarse desde una perspectiva holística, considerando a la planta como un holobionte. El conocimiento profundo de la estructura, composición y funcionamiento de las comunidades microbianas implicadas, así como de las interacciones que se establecen entre sus componentes y entre estos y el anfitrión o huésped, pueden generar posibilidades de mejora de la resistencia frente a estreses y en el diseño de estrategias de control biológico y gestión integrada de enfermedades. Las herramientas ómicas son decisivas en este proceso.
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