Análisis muy sensible para separar ácidos nucleicos monocatenarios a partir de diferencias sutiles en la secuencia de ADN, a menudo un solo par de bases, lo que conduce a una estructura secundaria diferente y una desviación medible de la movilidad en gel. Se utiliza para comparar genomas de agentes patógenos o parte de ellos.
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electroforesis capilar
Técnica analítica rápida y eficaz de separación, apta para pequeños volúmenes, que se basa en la diferente velocidad de desplazamiento que tienen las distintas proteínas en el seno de un medio líquido, contenido en un tubo capilar, al someterlas a la acción de un campo eléctrico de alto voltaje (10-30 kvoltios, corrientes de 5-100 µA). La separación se lleva a cabo en un tubo de diámetro interno de 10-75 μm y una longitud de 20-100 cm, generalmente de sílice fundida, que se llena con el tampón que constituye el medio de separación a partir de los viales situados en los extremos del capilar. La muestra contenida en otro vial, se introduce por uno de los extremos del capilar reemplazando en el momento de la inyección uno de los viales de tampón por el vial de muestra. La monitorización de la separación se lleva a cabo colocando un detector en un punto del capilar de análisis situado generalmente antes del extremo de salida de este. Un ordenador se encarga del control de la instrumentación y de la adquisición y tratamiento de los datos suministrados por el detector. Se ha utilizado para la identificación y diferenciación de virus, como el de la tristeza de los cítricos (Closterovirus tristezae, Citrus tristeza virus-CTV), según su agresividad, combinada con polimorfismo de conformación de cadena simple (SSCP) y marcadores moleculares múltiples (MMM).
SSCP
Sigla del inglés de polimorfismo de conformación de cadena simple o monocatenario.