Diccionario

1. Aplicación de un método a una plaga específica y una matriz específica. 2. Ensayo o experimento que se hace de algo con finalidad de detección, diagnóstico o identificación de agentes patógenos o fisiopatías de las plantas. 3. Examen oficial, no visual, para determinar la presencia de plagas o para identificar plagas, según la terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

Ensayo o experimento que se hace con organismos vivos. En Fitopatología habitualmente constan de ensayos sobre plantas indicadoras (incluyendo las cultivadas in vitro), hojas, flores o frutos desprendidos y manifestación de reacción de hipersensibilidad para bacterias (generalmente en hojas de tabaco), con fines de detección, diagnóstico o identificación de agentes patógenos. Los ensayos biológicos fueron los primeros en ser utilizados para el diagnóstico de virus, viroides y algunas especies bacterianas. Permiten detectar agentes patógenos, transmisibles por inoculación mecánica, cuscuta, injerto o vectores, de una planta donante problema a otra receptora sensible de la misma especie o de distinta. Las pruebas o bioensayos basados en inoculación por injerto son las más empleadas en plantas leñosas, y se basan en el establecimiento de conexiones citoplasmáticas, generalmente entre plantas de especies compatibles. Esto permite el paso de los agentes patógenos transmisibles por injerto desde la planta infectada a la planta sana. Se utilizan plantas indicadoras sensibles a la infección de una amplia gama de patógenos y que produzcan síntomas característicos. En el caso de algunas enfermedades, cuya etiología no ha podido ser aún determinada, la inoculación en distintas especies indicadoras es uno de los métodos de diagnóstico y detección disponible. La inoculación por injerto es todavía el método de inoculación biológica más utilizado para el diagnóstico de numerosas virosis de fresa, pequeños frutos, frutales, cítricos y vid, principalmente de aquellos agentes patógenos que permanecen con etiología desconocida. Los bioensayos, aunque de manera cada vez más reducida debido a su alto coste, duración y otros inconvenientes, continúan utilizándose en programas de certificación, debido a su simplicidad (aunque precisan sofisticadas instalaciones y personal experto) y polivalencia (posibilidad de detectar varios agentes patógenos, como virus, viroides y algunas bacterias, en un mismo huésped y ensayo). Las limitaciones de los métodos biológicos son el largo período de incubación (días para indicadores herbáceos y meses para leñosos) necesario para la expresión y observación de los síntomas por personal experto, el coste que implica el mantenimiento de invernaderos en condiciones controladas y los resultados a veces erráticos, debidos a interferencias entre varios agentes patógenos que pueden coinfectar una misma planta. Aún con estas limitaciones, los métodos biológicos son fiables y sensibles (se basan en la multiplicación del patógeno hasta provocar síntomas en huéspedes sensibles) y se continúan utilizando en programas de cuarentena y en estudios básicos, ya que son imprescindibles para valorar el poder patógeno y la agresividad en un determinado huésped. Paulatinamente, serán sustituidos por otros métodos, especialmente por la secuenciación masiva. 2. Los métodos de prueba biológica también describen experimentos estandarizados que determinan la toxicidad de una sustancia o material evaluando su efecto en los organismos vivos, frecuentemente en animales experimentales, sus tejidos cultivados in vitro, o plantas. Se realizan como un medio para establecer una relación causal entre el efecto biológico y la sustancia o material que se está probando.

Aquella o aquellas que, con un nivel aceptable de certeza, establecen o identifican la presencia de la planta enferma o infectada/infestada, microorganismo, analito o condición que se investiga. Usualmente conlleva mayor complejidad analítica y es recomendable que tenga un fundamento diferente al que se utilizó con las pruebas presuntivas. Las pruebas confirmatorias, además de tener niveles de sensibilidad diagnóstica iguales o superiores a los de las pruebas presuntivas, deben poseer alta especificidad analítica (exclusividad e inclusividad) y diagnóstica.

1. Evaluación independiente de una prueba por varios laboratorios. 2. Prueba serológica, actualmente en desuso, en la que la solución de antígeno se mezcla con glicerol y se coloca en un tubo de ensayo, y el anticuerpo o anticuerpos se colocan cuidadosamente encima en la parte superior de la solución de antígenos. Al difundir los líquidos uno en otro, se genera un precipitado de antígeno y anticuerpos en forma un anillo opalescente visible, allí donde se produzca la equivalencia.

1. Demostración de la competencia en el análisis de muestras conocidas de un laboratorio, generalmente mediante el uso de un estándar o protocolo determinado. Consiste en la remisión de muestras ciegas por parte de un laboratorio de referencia, o un laboratorio acreditado, para ser analizadas en otro laboratorio participante o candidato. Los laboratorios son evaluados según el resultado final que emitan. Constituye una herramienta externa de control de la calidad que permite a los laboratorios comparar su desempeño con el de otros laboratorios, detectar tendencias y, en función de los resultados, tomar cualquier acción correctiva que sea necesaria para facilitar su mejora continua. Consiste en analizar las mismas muestras ciegas por diferentes laboratorios y comparar los resultados. En cada laboratorio se utiliza su método (o métodos) usual validado con el objetivo de verificar que funciona adecuadamente en su laboratorio con las muestras comunes seleccionadas, con sus reactivos, equipamiento, personal, instalaciones, etc. Se pueden perseguir tres objetivos diferentes: i) validar un método de ensayo y determinar la incertidumbre de los resultados; ii) determinar las características de un producto destinado a ser utilizado como material de referencia, o iii) evaluar la fiabilidad de los resultados de los ensayos en los laboratorios participantes. 2. Establecimiento de la competencia de un laboratorio en el análisis de muestras definidas utilizando su prueba o ensayo habitual (evaluación de la competencia del laboratorio).

Ensayo utilizado en virología para diagnóstico, detección, comparación e identificación. Se basa en que el genoma de la mayor parte de los virus de plantas está constituido de ARN y durante la replicación viral, se producen moléculas de ARNds como forma replicativa del virus. Se han utilizado patrones electroforéticos de segmentos de ARNds visualizados en geles de acrilamida para diferenciar Closterovirus, para caracterizar aislados del virus de la tristeza de los cítricos (Closterovirus tristezae, Citrus tristeza virus-CTV) y para discriminar plantas de olivo sanas de las infectadas por virus, entre otros ejemplos. Los inconvenientes de este método son su baja sensibilidad y especificidad y la laboriosidad del proceso, que impide su uso a gran escala. Actualmente se utiliza secuenciación masiva para comparar los genomas virales con mayor precisión.

Ensayo o experimento que se efectúa en condiciones similares a los de la producción agrícola o forestal, en condiciones de campo.

Aquella que se realiza a plantas anfitrionas o vectores que a priori se consideran sanos (asintomáticas o no portadores, respectivamente), con la finalidad de detectar precozmente la presencia de un determinado agente patógeno en un área reducida o país. Se considera una medida preventiva para estimar la posible prevalencia de un agente patógeno.

Ensayo que se debe efectuar a las semillas de las distintas especies botánicas, en las condiciones reglamentadas, para certificar que cumplen los porcentajes mínimos de germinación de cada Reglamento Técnico de Control. La prueba puede realizarse antes de la comercialización para garantizar el porcentaje de germinación (que se suele indicar en el estuche), o como control oficial posterior a la comercialización, durante el cual suelen realizarse además análisis sanitarios.

1. Ensayo de la patogenicidad de un organismo. 2. Ensayo biológico específico que emplea la transmisión mecánica de savia de la planta problema, para determinar cuantitativamente el número de partículas infecciosas de un virus por medio de las lesiones locales que producen en un huésped, anfitrión o planta experimental.

Acción de inocular un patógeno en una planta mediante distintas técnicas, apropiadas al patógeno y anfitrión que se inocule, para demostrar su capacidad de producir o causar enfermedad en la misma, en condiciones experimentales concretas.

Acción destinada a reproducir los medios y condiciones en las que un patógeno es capaz de pasar de una planta enferma a una sana. Puede ocurrir por contacto físico o daño mecánico, cuscuta, vector, polen, agua, suelo o sustrato (transmisión horizontal) entre plantas cultivadas o silvestres, o por semilla, multiplicación vegetativa e injerto (transmisión vertical) de la planta madre a la progenie.

Prueba bioquímica rápida para determinar la viabilidad de semillas. Se hidratan las semillas para generar su actividad fisiológica de respiración y se lavan con una solución de 2, 3, 5 trifenil tetrazolio. Las células vivas adquieren un color rojizo, lo cual indicará la capacidad potencial de germinación de la semilla. Las semillas muertas (inviables) no se tiñen.

1. Conjunto de pruebas que incluyen la organización, realización y evaluación de ensayos sobre las mismas muestras o elementos de ensayo o sobre muestras muy similares, por dos o más laboratorios, de acuerdo con condiciones predeterminadas. Consiste básicamente en probar las mismas muestras, generalmente de referencia o controles estándar, en varios laboratorios, donde cada participante analiza las muestras mediante sus métodos analíticos de referencia y equipos habituales. Tiene como finalidad la comparación de resultados en orden a certificar la idoneidad o aptitud de un laboratorio en el análisis de muestras determinadas infectadas o inoculadas y de controles sanos. 2. Prueba, medición, análisis o experimento entre distintos laboratorios, que se realiza de forma independiente varias veces. El ensayo puede involucrar a varios laboratorios independientes que realizan la prueba con el uso del mismo método en diferentes equipos instrumentales, o una variedad de métodos y equipos. Frecuentemente es una combinación de los dos. Así, si se analiza una muestra, o una o más de sus propiedades, se mide en diferentes laboratorios utilizando distintos métodos incluso diferentes equipos de construcción similar, pero de fabricantes distintos, como diferentes termocicladores de PCR en tiempo real. Se utiliza básicamente para: i) valorar la aptitud de los distintos laboratorios participantes dentro de un proceso de acreditación; ii) determinar la reproducibilidad de un método o proceso de prueba; iii) validar un nuevo método de análisis, comprobando que el nuevo método produce resultados que concuerdan con el método estándar establecido; y iv) producir algunos materiales de referencia certificados, ya que las pruebas entre laboratorios pueden proporcionar la base para los certificados de análisis cuantitativo de un material determinado.

Aquella organizada internamente para evaluar el desempeño dentro de un laboratorio, por el personal, equipos y métodos analíticos habituales. Para ello se suelen utilizar muestras ciegas numeradas de referencia estándar positivas y negativas, de las que únicamente tiene información el organizador y el evaluador de la prueba.

Denominación común muy extendida, pero restrictiva, ya que con frecuencia únicamente se refiere a las técnicas que implican a ácidos nucleicos como diana o muestra, marginando a otras pruebas con moléculas como son los anticuerpos, entre otras. Incluye básicamente técnicas de hibridación, análisis de huellas genéticas, RFLP, RAPD, MLSA, MLST, MLVA y la secuenciación convencional y masiva.

Denominación común de aquellas pruebas que suponen una amplificación molecular basada en la reacción en cadena de la polimerasa de ácidos nucleicos o isotérmica. Como PCR o RT-PCR simple y sus variantes, PCR en tiempo real y sus variantes, LAMP, NASBA y sus variantes.

Aquella o aquellas que permiten de manera rápida y económica pero estandarizada, inferir la presencia o ausencia de planta infectada/infestada, enfermedad, vector, analito, metabolito o microorganismo de interés, en una población natural o cultivada de plantas o en un territorio o zona extensa, como detectar la presencia de vectores virulíferos o bacterilíferos en una zona o en un vivero. Todo resultado positivo con un análisis presuntivo debe ser confirmado con una prueba confirmatoria, que además localice el foco o las plantas infectadas. Es recomendable que las pruebas presuntivas sean de alta sensibilidad analítica, puesto que, aunque pueden arrojar un cierto porcentaje de falsos positivos, se pretende detectar el mayor número de individuos positivos, enfermos/infestados o con la condición de interés, entre la población de sospechosos (con alta probabilidad pretest de infección).

Rasgo característico, factor, medida o estándar decisivo en los que pueda basarse una opinión o decisión respecto al resultado de la prueba o test y su interpretación.

El rendimiento de las pruebas de detección o diagnóstico se ve afectado por diversos factores, que abarcan desde las primeras etapas del desarrollo hasta la etapa final de evaluación de los resultados cuando la prueba se aplica a poblaciones específicas de plantas o vectores. Una prueba, por lo tanto, no puede ser considerada válida a menos que se hayan comprobado y confirmado, o que haya cumplido un conjunto específico de criterios de validación esenciales, ya sea cuantitativa o cualitativamente. La falta de cumplimiento de cualquiera de estos criterios es probable que reduzca la confianza en que la prueba cumpla los objetivos deseados. Los primeros criterios por lo general se tratan durante la fase de desarrollo de la prueba: i) aptitud para el fin deseado; ii) optimización; iii) normalización; y iv) robustez. Los siete siguientes son evaluados durante las tres primeras etapas de la fase de validación de la prueba: v) repetibilidad; vi) sensibilidad analítica; vii) especificidad analítica; viii) umbrales (puntos de corte); ix) sensibilidad y especificidad diagnósticas; x) reproducibilidad; y xi) solidez.

Evaluación de la realización de una o más pruebas por dos o más laboratorios utilizando muestras ciegas definidas.

Aquellas que se han de seguir para su validación, una vez se ha desarrollado el ensayo o test y se ha optimizado y establecido su robustez. Generalmente consta de cuatro etapas secuenciales: i) determinación inicial de sus características analíticas (especificidad analítica, sensibilidad analítica y estimación preliminar de su repetibilidad y reproducibilidad) comparada por el método de diagnóstico o detección estándar para ese patógeno; ii) estimación de sus características diagnósticas con cepas y muestras de referencia y cálculo de la especificidad diagnóstica, sensibilidad diagnóstica y determinación del umbral o punto de corte; iii) Estima de su reproducibilidad y solidez con un conjunto de muestras positivas y negativas (normalmente mitad de ellas positivas y otras tanto negativas) a evaluar entre distintos laboratorios colaboradores; y iv) Implementación, interpretación de la prueba en distintos laboratorios internacionales con muestras estándar de referencia y otras de campo. Tras esta validación la prueba suele publicarse en revistas científicas apropiadas para que pueda ser candidata a ser incluida en estándares internacionales tipo EPPO, IPPC-FAO o ISTA.

Pieza alargada de plástico con varias celdillas o microtubos, que contienen en formato miniaturizado, diferentes medios de cultivo deshidratados o diferentes sustratos de enzimas de acuerdo al tipo de prueba que se desee efectuar. Constituye un método rápido que permite la identificación de microorganismos (bacterias, levaduras y hongos) a través de la realización de diferentes pruebas bioquímicas. Estos sistemas consisten en un dispositivo de plástico con varios microtubos que contienen diferentes medios de cultivo deshidratados o diferentes sustratos de enzimas, de acuerdo al tipo de prueba que se requiere montar. En el mercado existe una gran variedad de galerías para ser utilizadas en la identificación de diferentes tipos de microorganismos (por ejemplo, entre las más utilizadas, las galerías bioMerieux API® 20 E, 20 NE, 50 CH, API ZYM o las Biolog, entre otras), por ello, aunque todos estos sistemas tienen el mismo fundamento, difieren en el número y tipo de pruebas que permiten realizar, ya que su selección está directamente relacionada con la actividad metabólica del género al que pertenece el microorganismo a identificar. Cada microtubo del sistema debe inocularse con una suspensión de un cultivo puro del microorganismo a identificar. En algunos casos estos microtubos deben llenarse completamente con la suspensión, mientras que en otros se requiere añadir parafina líquida estéril, que proporciona condiciones anaerobias. La interpretación de los resultados se basa en la observación de la coloración desarrollada en cada microtubo inoculado, comparado con el que muestra una carta de colores. De acuerdo a esa interpretación se estable un resultado positivo o negativo.

Proceso de conversión de los valores brutos de una prueba para cada muestra problema en unidades de actividad respecto al estándar o estándares de trabajo. Los valores normalizados se pueden expresar de muchas maneras, como en porcentaje respecto al valor de un control positivo (como en una prueba ELISA), o como una concentración o título de un analito derivado de una curva estándar, o como un número de copias genómicas de la diana también derivadas de una curva estándar de valores Ct (umbral del ciclo) para PCR en tiempo real. Es una buena práctica incluir estándares de trabajo (o por lo menos una muestra razonablemente bien caracterizada) en todas las realizaciones durante el desarrollo y validación de la prueba, ya que esto permite una normalización de los datos, lo cual proporciona un medio válido para la comparación directa de los resultados entre las distintas ejecuciones de una prueba. Los sistemas automáticos de análisis permiten calcular y obtener estos datos mediante una curva estándar, o bien obtener el número del ciclo a partir del cual se está excediendo el umbral de ciclos, como en la PCR en tiempo real.

Proceso fundamental y crítico para lograr una prueba de calidad. Mediante el mismo se evalúan y ajustan y optimizan los parámetros físicos, químicos y biológicos más importantes de la prueba, para garantizar que las características de rendimiento y precisión de la misma se ajusten mejor a la aplicación concreta deseada.

Probabilidad de que la planta esté sana o el vector no sea portador, o esté infectada o sea el vector portador, una vez obtenido el resultado de la prueba (probabilidad postest), para lo cual se desarrollan los valores predictivos. El valor predictivo positivo (VPP) es la probabilidad de que la planta o el vector sea portador, una vez que el resultado de la prueba es positivo. Por su parte, el valor predictivo negativo (VPN) es la probabilidad de que la planta esté sana o el vector no sea portador, si el resultado de la prueba ha sido negativo. Estos dos parámetros dan una información más aproximada de la probabilidad posprueba. El problema puede surgir con los valores predictivos, que dependen de la prevalencia de la infección o enfermedad (probabilidad preprueba) en la población en la que se han calculado, por lo que no serán de utilidad para diferentes poblaciones en las que la prevalencia de la enfermedad o vector en estudio varíe.

Grado en que las especiales condiciones de prueba alteradas, como modificaciones en temperatura, volumen, intensidad de lavado, cambio de reactivos, etc., afectan a los valores de rendimiento de la prueba establecidos como su sensibilidad analítica y especificidad analítica. Constituye un criterio de validación.

Operación oficial, tal como inspección, prueba, vigilancia o tratamiento, llevada a cabo para aplicar medidas fitosanitarias, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

1. Documento que prueba la certeza o realidad de algo y demuestra que, alguien o algo es lo que representa o parece. 2. Sistema, procedimiento o herramienta establecida internacionalmente para generar confianza sobre la correcta ejecución de un determinado tipo de actividades denominadas «actividades de evaluación de la conformidad». Incluye la certificación ISO 9001 o ISO 17025, que garantizan que se ha demostrado que su sistema de gestión de calidad cumple los requisitos establecidos en esas normas, y que ha demostrado su competencia para llevar a cabo las actividades de evaluación para las que esté acreditado y el cumplimiento con los requisitos establecidos en una norma internacional específica para cada tipo de organismo de evaluación. Incluye calibración, inspección, certificación o verificación, entre otras, con objeto de validar si un producto, servicio, técnica, etc. es conforme con requisitos establecidos por ley, normas u otros documentos de carácter voluntario. En algunos países existen entidades nacionales de acreditación y en España el organismo oficial es ENAC (Entidad Nacional de Acreditación). Se exige en los Laboratorios oficiales de diagnóstico de organismos fitopatógenos en la Unión Europea. 3. Procedimiento por el que un organismo de acreditación reconoce oficialmente que un laboratorio o una persona son competentes para realizar determinadas tareas.

Compuesto orgánico de tipo amida, blanca, inodora y cristalina, soluble en agua, etanol, éter y cloroformo. Se utiliza su homopolímero (poliacrilamida) en forma de gel para la separación de proteínas mediante electroforesis o para diagnóstico e identificación de viroides en función de su tamaño. Su polímero no es tóxico, sin embargo, la acrilamida que no ha polimerizado es neurotóxica, de ahí que los geles deban ser manipulados con precaución pues pueden contener bajas cantidades de acrilamida no polimerizada. Se forma acrilamida en alimentos durante la cocción, fritura o asado y durante los procesos industriales a 120 oC y a baja humedad, y también es un componente del humo del tabaco. Los resultados de exposición realizados en humanos proporcionan pruebas limitadas en cuanto a su asociación con el desarrollo de cáncer de distintos órganos, e irregularidades en el sistema nervioso.

1. Resultado positivo en una prueba serológica de aglutinación, en la que antígenos y anticuerpos se unen o reconocen formando grumos visibles. Indica la presencia de anticuerpos específicos contra un antígeno en la muestra analizada. 2. Se aplica a estructuras pegadas entre sí, pero no fusionadas, como ocurre con algunas esporas de Acremonium y Fusarium, que se mantienen unidas mediante un mucílago.

1. Denominación común del síntoma de cambio de color observado en plantas de semilla por daños en raíces, exceso de humedad del suelo, deficiencia de nitrógeno, compactación del suelo, pH incorrecto, deficiencias nutricionales, plagas y otros. 2. Denominación común del síndrome, que rara vez se observa en campo, que inducen algunas cepas del virus de la tristeza de los cítricos (Closterovirus tristezae, Citrus tristeza virus-CTV) cuando se inoculan en invernadero en plantas francas de naranjo amargo, pomelo o limonero. Las plantas con SY muestran hojas pequeñas y cloróticas, brotación escasa y con entrenudos cortos y sistema radicular reducido. Se utiliza en invernadero como prueba de diagnóstico de cepas agresivas de CTV.

Prueba de hipótesis basada en experimentos ficticios realizados en ordenador o computadora (es decir, in silico) con miras a formular predicciones que luego puedan comprobarse en estudios realizados in vitro o in vivo.

Técnica muy utilizada para establecer un vínculo entre la evidencia biológica y un sospechoso en una investigación criminal, que también se utiliza en identificación y taxonomía fitopatológica para establecer si dos muestras de ADN son iguales o no. Una muestra de ADN se puede comparar con otra para evaluar si los perfiles coinciden y asignar un porcentaje de identidad. Dos individuos u organismos clonados pueden ser estudiados para determinar si poseen partes en común y, por tanto, se superponen entre sí. La prueba también se utiliza para establecer la paternidad.

Aquel realizado con técnicas, pruebas, tests, métodos estándares de oro o de referencia.

Acrónimo del inglés. En español, Organización de investigación agrícola de Israel, su página electrónica: (http://www.agri.gov.il/en/home/default.aspx). Su centro está en el campus del Centro Volcani, cerca de Tel-Aviv (Israel) y gestiona seis institutos responsables de diferentes actividades (suelo, agua, medioambiente, ciencia animal), uno de Protección Vegetal y otro de Poscosecha y Ciencias de alimentos. ARO también maneja cuatro estaciones de investigación, en varias partes del país, y sirve como un centro de pruebas para productos agrícolas y equipo. El Banco de Genes de Cosechas Agrícolas de Israel también está ubicado en el campus de Volcani.

1. Examen independiente que se realiza para comparar los diversos aspectos del desempeño de un laboratorio con una norma establecida para dicho desempeño. 2. Proceso sistemático, independiente y documentado destinado a obtener pruebas fehacientes y evaluarlas de manera objetiva a fin de determinar en qué medida se han cumplido los criterios de auditoría. 3. Una de las herramientas que establece un sistema de gestión de la calidad para realizar la revisión del mismo, verificando que se cumplen los requisitos establecidos y los de la norma de referencia.

Aquella del proceso, que consiste en un procedimiento por el que se examina más de un aspecto de un proceso en un único elemento. Se trata de una comprobación detallada de la aplicación de todos los aspectos vinculados con determinada prueba analítica o ensayo. En toda auditoría se seleccionan, de manera aleatoria, uno o varios exámenes que hayan pasado últimamente por el laboratorio. Así, se puede seguir un grupo de muestras a lo largo de todo el proceso del laboratorio, desde su recepción, su análisis, hasta la presentación del informe correspondiente.

Para generar confianza ante el consumidor, cumplir con la regulación y proteger la reputación de una marca, fabricantes y distribuidores deben asegurar las características básicas de las materias primas o reactivos utilizados a lo largo de toda la cadena de producción, o utilizados como componentes de kits de diagnóstico, evitando posibles fraudes. Las técnicas más usuales son análisis isotópico, análisis de composición química, análisis de alérgenos, análisis de perfiles cromatográficos, análisis serológicos, pruebas de especificidad, análisis genéticos y de amplificación molecular.