1. Acción y efecto de tipificar u operación de ajustar varias cosas semejantes a un tipo o norma común, conforme al espécimen tipo a partir del cual se ha perfilado la descripción que justifica el nombre y que se conserva permanentemente en alguna institución (museo de historia natural, herbario, centro de investigación, laboratorio de referencia, etc.), perfectamente conservado, identificado y localizable. 2. Clasificación en tipos o clases de diferentes organismos, con base fenotípica, serológica y genética. Para tipificar diferentes agentes patógenos del mismo grupo, se han empleado distintas técnicas: gama de huéspedes o anfitriones, patogenicidad, agresividad, o características serológicas y moleculares. Como ejemplo los tipos del virus de la sharka de frutales de hueso o carozo (Potyvirus plumpoxi, Plum pox virus-PPV) en el que se han descrito actualmente 10 (siendo los preponderantes PPV D-Dideron, PPV M-Marcus, y PPV Rec-recombinante entre D y M). 3. (grading). Calificación de los productos de laboratorio en clases, grados o categorías comerciales, generalmente definidas en normas de calidad y en protocolos de análisis.
tipificación bacteriana por fagos
Técnica rápida y repetitiva para la identificación de bacterias, basada en su lisis por determinados bacteriófagos. Se utiliza en la subdivisión de especies, biotipos o serotipos de bacterias. Los fagotipos se definen en función de su susceptibilidad a fagos más o menos específicos de la gama de huéspedes o anfitriones.
tipificación de secuencias multilocus
MLSA
Sigla del inglés, en español podría traducirse como análisis de múltiples secuencias o análisis de secuencias de varios locus. Esquema de tipificación basado en la secuenciación de diversos genes (generalmente entre cinco y siete) de un grupo de organismos. La comparación de las secuencias concatenadas permite establecer grupos y relaciones filogenéticas con la base de diferencias en estas secuencias de nucleótidos. El MLSA puede utilizarse para comparar organismos de la misma especie o de especies relacionadas. Se trata de un método muy adecuado para estudios epidemiológicos basado en el análisis de las secuencias de distintos genes constitutivos (housekeeping genes). El método tiene la ventaja de arrojar resultados no ambiguos muy apropiados para las comparaciones interlaboratorios. Actualmente la posibilidad de secuenciar genomas completos a un precio razonable ha conducido a que se construyan filogenias basadas en la concatenación de decenas a cientos o miles de secuencias, lo que resulta básicamente en un MLSA a gran escala.
MLST
Sigla del inglés. En español, tipificación de múltiples secuencias. Esquema de tipificación basado en la secuenciación de diversos genes (generalmente entre cinco y siete) de un grupo de organismos. En vez de comparar las secuencias de estos genes, a cada alelo de cada gen se le asigna un número. Así, los diversos organismos pueden agruparse con la base del código compuesto por los números de sus alelos. Al contrario que el MLSA, el esquema MLST se utiliza generalmente para organismos de una misma especie, como para hongos (https://mlst.mycologylab.org/).
Unión Internacional de Sociedades de Microbiología
Asociación fundada en 1927 como Sociedad Internacional de Microbiología, se convirtió en la Asociación Internacional de Sociedades Microbiológicas afiliadas a la Unión Internacional de Ciencias Biológicas (IUBS) como División en 1967. Adquirió la independencia en 1980 y se convirtió en Miembro del Consejo Internacional para la Ciencia (ICSU) en 1982. Sus objetivos fundamentales son: i) promover el estudio de las ciencias microbiológicas a nivel internacional; ii) iniciar, facilitar y coordinar la investigación y otras actividades científicas que impliquen la cooperación internacional; iii) asegurar la discusión y difusión de los resultados de la investigación cooperativa internacional; iv) promover la organización de conferencias, simposios y reuniones internacionales y ayudar en la publicación de sus informes; y v) representar las ciencias microbiológicas en el ICSU y mantener contacto con otras organizaciones internacionales. Las actividades científicas de la Unión están a cargo de las Divisiones de Bacteriología y Microbiología Aplicada, Micología y Virología y por seis comités internacionales especializados, nueve comisiones y dos federaciones. Sus principales actividades incluyen la clasificación y nomenclatura de bacterias y virus, colecciones de cultivos, microbiología de alimentos, antígenos y diagnósticos moleculares y tipificación de fagos entéricos. Las divisiones son responsables de la organización de sus respectivos Congresos Internacionales. Algunas de sus publicaciones son el International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, el International Journal of Food Microbiology y las Archives of Virology (donde publica las Virology Division News). Las noticias de IUMS aparecen en ASM News. La Unión patrocina reuniones científicas en todo el mundo y apoya activamente el desarrollo de la microbiología en el tercer mundo mediante la concesión de subvenciones para viajes y el suministro de ASM News a las sociedades miembros consideradas desatendidas con respecto a las publicaciones.
VNTR
Sigla del inglés. En español, número variable de repeticiones en tándem Las repeticiones en tándem son secuencias cortas de ADN altamente variables y repetidas un número variable de veces en el genoma bacteriano. Tienen de 21 a 47 pb y están separadas por fragmentos de secuencias no repetidas del mismo tamaño. Son altamente inestables, pudiendo presentar variabilidad en el número de unidades de cada repetición, designándose su análisis como VNTR y debido a su polimorfismo, se han utilizado como marcadores para la tipificación de especies bacterianas, pero también de otros tipos de organismos, incluyendo virus y hongos. La utilización de cebadores de PCR que delimiten la región de repetición permite visualizar el polimorfismo en el número de unidades repetidas mediante electroforesis, calculando el número de repeticiones según el tamaño de las secuencias amplificadas.
calificación
1. Acción y efecto de tipificar. 2. Apreciar o determinar las cualidades o circunstancias de alguien o algo.
caracterización
clasificación
1. Acción y efecto de tipificar. 2. Acción y efecto de clasificar, ordenar o disponer algo por clases.
establecimiento
1. Acción y efecto de tipificar. 2. Efecto de establecerse o perpetuarse para el futuro previsible de un organismo patógeno o vector en una planta, tras su entrada por vez primera y no habiendo sido previamente descrito en un área o en una planta huésped. Si la planta estaba infectada o infestada a su entrada, se considera establecido el patógeno o su vector, respectivamente. Es una parte necesaria para la introducción tras la entrada en un país o área y puede ser seguida por su diseminación, en cuyo caso se puede hablar de introducción efectiva. 3. Reproducción exitosa, de una especie exótica en un hábitat o en el área a la cual ha entrado, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5. 4. Fundación o institución de carácter científico o técnico. 5. Lugar donde habitualmente se ejerce una actividad, incluida la de comercio de material y reactivos de diagnóstico o de producto fitosanitarios.
tipo de fago
Subdivisión (generalmente infraespecífica) determinada por la susceptibilidad de una bacteria a uno o más de una selección de bacteriófagos que se denominan fagos tipificadores. El tipo se considera a menudo como un patrón de zonas líticas en los lugares en los que se han observado placas de fagos en un cultivo sembrado con la cepa en estudio.