Diccionario

Enzima del tipo ADN polimerasa, ya sea de origen celular o viral, que interviene en el proceso de replicación del ARN. Tiene como función sintetizar ADN de doble cadena utilizando como molde ARN monocatenario. Es decir, cataliza la retrotranscripción (transcripción reversa). Se encuentra presente en los retrovirus. Su nombre se debe a que el proceso normal de la transcripción (directa), codifica el ARN a partir de la secuencia inicial de ADN, y no al revés.

Acrónimo del inglés. En español, amplificación basada en secuencias de ácidos nucleicos. Método de amplificación isotérmica, que permite la amplificación exponencial de una determinada muestra de ADN o ARN, aunque está especialmente diseñada para la amplificación de ARN. Está basada en la actividad simultánea de tres enzimas para obtener una amplificación exponencial del ARN: transcriptasa reversa del virus de la mieloblastosis aviar (AMV), RNasa H y ARN polimerasa del bacteriófago T7. Las ventajas frente a los métodos basados en PCR o RT-PCR son su mayor rapidez, no requerir termociclador (ya que todo el proceso tiene lugar a 41 oC en un proceso isotérmico), alcanzar niveles de sensibilidad analítica similares a los de la PCR o RT-PCR en tiempo real y que los amplicones (ADNc) no suponen un riesgo de contaminación.

Virus de ADN circular de doble cadena (dsADN) que presentan diversas similitudes con retrovirus —que no se encuentran en plantas—, de manera que se replican en el núcleo mediante transcripción seguida de una transcripción reversa en el citoplasma; este tipo de virus no se ha documentado en ningún otro tipo de organismo fuera de las plantas, por lo que se considera que su presencia está limitada al reino vegetal. Pertenecen principalmente a la familia Caulimoviridae y a los siguientes géneros: i) Caulimovirus, como el mosaico de la coliflor (Cauliflower mosaic virus-CaMV), que no necesita integrarse en el genoma de la planta para replicarse, aunque se han encontrado secuencias similares a CaMV integradas en genomas de algunas plantas, lo que sugiere eventos de integración pasados; ii) Badnavirus, como el virus del rayado del banano (Banana streak virus-BSV), que puede integrarse en el genoma del plátano como elemento viral endógeno (EPRV). Bajo ciertas condiciones de estrés, como la hibridación o la propagación o cultivo in vitro, los elementos virales endógenos pueden reactivarse y generar infecciones virales activas, que entorpecen los programas de mejora genética del plátano; iii) Tungrovirus, como el virus baciliforme del tungro del arroz (Rice tungro bacilliform virus-RTBV), que infecta al arroz y se transmite junto a un virus de ARN; y iv) otros géneros como Petuvirus, Soymovirus, Cavemovirus, Rosadnavirus, y Florendovirus, este último género incluye pararretrovirus endógenos (endogenous pararetroviruses, EPRVs, incluidos en el genoma de diversas especies de plantas, entre ellas de los cítricos), que no siempre causan enfermedad pero han dejado huellas en su genoma. Así pues, aunque los pararretrovirus se replican a través de un intermediario de ARN mediante transcriptasa reversa, no se integran obligatoriamente en el genoma del huésped o anfitrión como parte de su ciclo de vida normal (a diferencia de los retrovirus verdaderos), aunque en algunos casos diversas secuencias de pararretrovirus pueden integrarse de forma accidental en el genoma de la planta, como secuencias virales integradas Aunque muchas son inactivas, algunas pueden reactivarse bajo condiciones de estrés y producir virus infecciosos.

Proceso que implica la generación de una cadena de ácido desoxirribonucleico doble cadena complementario (ADNc) a partir de ácido ribonucleico (ARN) de cadena simple. La primera hebra de ADNc obtenida es la cadena complementaria de la cadena molde de ARN, y a partir de ella se sintetiza la segunda hebra de ADN para obtener una molécula bicatenaria. Como los viroides y la gran mayoría de los virus de plantas poseen genoma de ARN, la transcripción reversa se ha convertido en la técnica de referencia para la detección de ARN de patógenos mediante RT-PCR. El ARN es convertido o retrotranscrito a ADNc mediante el uso de cebadores de PCR y la acción de la enzima transcriptasa reversa.