Diccionario

Variación heredable entre individuos, medida como variación alélica o diferencia en las secuencias de ADN entre individuos de una población.

Conservatorio de material vegetal identificado y descrito, cuyo fin es preservar la variabilidad genética. Se puede mantener como colección de plantas vivas, semillas o cultivos celulares o de plantas cultivadas in vitro. La tendencia actual es a introducir y mantener el conservatorio de plantas o de semillas libres de patógenos, al menos de aquellos de cuarentena. Para mantener su sanidad se suelen cultivar en abrigos de cuarentena y en contenedores con sustrato controlado o en cultivo in vitro de plantas sanas. En ocasiones, se puede mantener in vitro o bajo abrigo de cuarentena, germoplasma considerado muy valioso por su interés, aunque esté infectado.

Diversidad de vida en la Tierra: variedad de organismos vivos relacionados con la salud de las plantas, incluyendo sus especies, subespecies, razas o patovares de microorganismos patógenos, artrópodos fitófagos o vectores y otros organismos asociados, así como los ecosistemas y procesos ecológicos que los conectan y sustentan. La biodiversidad influye en la dinámica de las enfermedades, la resistencia genética de los cultivos y masas forestales y en la estabilidad de los agroecosistemas y bosques. La variabilidad genética se puede originar por mutaciones, recombinaciones y alteraciones en el cariotipo. Los procesos que incrementan o reducen la variabilidad genética básicamente son la selección natural y la deriva genética.

Grupo de virus mutantes que se desarrolla a medida que se multiplica un virus en un huésped o anfitrión. Los virus, especialmente los de ARN y ssADN, y los viroides son nubes de mutantes relacionados por mutaciones similares. Un virus o viroide no solamente está adaptado en un momento dado a un ambiente, sino que al tratarse de una población de mutantes tiene cierto potencial para buscar otros huéspedes o anfitriones para multiplicarse y adaptarse. La mutación no es un hecho extraordinario y el aumento de variabilidad genética constituye una oportunidad para mejorar su adaptación.

Ciencia que estudia los genes, la variabilidad genética y la heredabilidad, específicamente en plantas.

Transferencia de material genético entre poblaciones mediante diseminación de individuos, reproducción o vectores; en el caso de los patógenos de vegetales, el flujo genético contribuye a su variabilidad genética, adaptación y virulencia, así como a la expansión geográfica de enfermedades de plantas.

Conjunto de genes presentes en los genomas secuenciados de todas las cepas de una misma especie o de un grupo relacionado de organismos. Representa la diversidad genética total de esa especie. Esta definición de pangenoma, denominada “pangenoma de presencia-ausencia” (presence–absence variation pangenome), es la más común en la literatura científica, aunque algunos especialistas en la disciplina de Pangenómica definen tres tipos de pangenoma, que implican diferencias en la representación del mismo y en su inclusión de genes y secuencias no codificantes. El pangenoma se divide en dos componentes principales: i) genoma central o núcleo, que representa a los genes que están presentes en todas las cepas y por estar conservados son esenciales para las funciones básicas de la especie; y ii) genoma accesorio o dispensable, que representa los genes que están presentes únicamente en algunas cepas. Estos genes diferenciales suelen estar relacionados con la adaptación al ambiente, resistencia a antibióticos, o mecanismos de patogenicidad, pero también suelen incluir secuencias típicas de fagos, plásmidos y otros elementos genéticos móviles. La importancia del pangenoma en Fitopatología es clave, ya que permite entender la diversidad genética de los patógenos y su interacción con las plantas anfitrionas u hospedadoras. Permite: i) conocer la variabilidad genética de los patógenos e identificar genes que están presentes solo en algunas cepas de un patógeno, como genes de virulencia, efectores, o de resistencia a plaguicidas, fundamental para comprender por qué ciertas cepas son más agresivas o difíciles de controlar que otras; y ii) entender la coevolución planta-patógeno, al permitir estudiar cómo los genes de los patógenos evolucionan para evadir los mecanismos de defensa de las plantas. Así, algunos genes de efectores pueden perderse por deleción o acumular mutaciones que alteren su secuencia para evitar ser detectados por genes de resistencia en las plantas. El conocimiento de qué genes del pangenoma están implicados en la infección, permite diseñar estrategias para mejorar la resistencia e identificar dianas moleculares para mejorar genéticamente cultivos determinados mediante edición genética o cruzamientos dirigidos. La identificación de los genes únicos y accesorios favorece el desarrollo de métodos, técnicas de detección y reactivos específicos de detección y diagnóstico para identificar cepas nuevas, más virulentas o resistentes. El estudio del pangenoma puede mostrar cómo una población patógena cambia con el tiempo, ayudando a predecir posibles brotes o fallos en el control basado en resistencia genética. Como ejemplo concreto, en el hongo fitopatógeno Magnaporthe oryzae (causante del añublo del arroz), el análisis del pangenoma ha permitido identificar genes de efectores que determinan si una cepa puede infectar a ciertas variedades de arroz y ello ha sido clave para el diseño de programas de mejora genética más eficaces. El pangenoma se puede representar, de forma básica, como una lista de genes presentes o ausentes en cada cepa o individuo, mediante una matriz. Como segundo tipo de pangenoma, denominado “secuencia representativa del pangenoma” (representative sequence pangenome), también puede expresarse como una concatenación de genomas completos o sus secuencias representativas, lo que es útil para análisis comparativos. El tercer tipo, denominado “pangenoma gráfico” (pangenome graph o graphical pangenome), integra múltiples secuencias genómicas de organismos de la misma población, especie o género en un único genoma de referencia.

Procesos que ocurren en muchos microorganismos, como hongos, oomicetos y bacterias, en los que se produce recombinación genética sin la necesidad de meiosis ni reproducción sexual. Implica la fusión de núcleos de células diferentes (cariogamia), el intercambio y recombinación de material genético, y la eventual segregación cromosómica. Este proceso permite la variabilidad genética en organismos que no realizan reproducción sexual convencional, permitiendo el intercambio de material genético entre individuos, lo que puede contribuir a la variabilidad genética y la adaptación a nuevos ambientes, incluyendo la resistencia a fungicidas o la capacidad de infectar nuevas especies de plantas o anfitriones. En hongos y oomicetos fitopatógenos, el intercambio de ADN generalmente ocurre a través de la fusión de hifas de diferentes cepas compatibles, seguida de la fusión de núcleos o cariogamia, recombinación genética y posterior segregación cromosómica. Los principales procesos parasexuales en bacterias son conjugación, transformación y transducción. Suele considerarse que otros elementos genéticos móviles —además de los bacteriófagos implicados en transducción—, como plásmidos o elementos transponibles, también dan lugar a procesos parasexuales en los diversos tipos de organismos; sin embargo, parasexualidad es un término muy poco utilizado en relación con estos elementos genéticos. Igualmente, los procesos de recombinación entre virus pueden considerarse procesos parasexuales, aunque la literatura científica muy raramente utiliza este concepto. Ejemplos de agentes fitopatógenos en los que se ha observado este proceso incluyen a especies como Colletotrichum acutatum, Fusarium oxysporum y Pyricularia oryzae.

Aquel que posee genes que permiten su transferencia de una célula bacteriana a otra, y que incluyen los necesarios para la síntesis de un sistema de secreción de tipo IV, una proteína acopladora y una relaxasa, además de un origen de transferencia (oriT). Durante ese proceso, denominado conjugación, dos bacterias entran en contacto y una copia del plásmido conjugativo pasa de una de las células a la otra. Incluso, algunos plásmidos conjugativos pueden además movilizar plásmidos no conjugativos, ya sea mediante cointegración o proporcionando el sistema de secreción de tipo IV y la proteína acopladora para la transferencia de otro plásmido que contenga al menos un origen de transferencia La presencia de este tipo de plásmidos colabora a crear variabilidad genética, al transferir ADN a las células que la rodean, de manera que las células receptoras pueden adquirir nuevos alelos de un gen dado o una función totalmente nueva. Así pueden las bacterias incrementar la capacidad de colonizar nuevos nichos y competir con otras o sobrevivir en condiciones adversas.

Denominación de origen búlgaro (viruela) que se emplea comúnmente para referirse a la enfermedad causada por Potyvirus plumpoxi (Plum pox virus-PPV), o virus de la viruela del ciruelo, de la familia Potyviridae, género Potyvirus. Es la enfermedad más grave del cultivo de especies del género Prunus (frutales de hueso o carozo) por las pérdidas que provoca en cultivares sensibles y por su fácil diseminación de forma no persistente por pulgones, que dificulta la obtención, en viveros al aire libre, de plantas sanas. El virus está presente en la mayoría de zonas productoras del mundo excepto en Oceanía y Sudáfrica. La enfermedad es particularmente dañina en cultivares de albaricoquero o damasco y ciruelo europeo (en los que las pérdidas pueden llegar al 100 % de frutos), melocotonero o durazno, ciruelo japonés y Prunus ornamentales. Los síntomas pueden aparecer en hojas, brotes, pétalos o frutos. Consisten en decoloraciones pálidas, anillos cloróticos, bandas, aclareo de nervios y deformación en hojas. En flores puede ocurrir una decoloración de pétalos o rotura de color en algunos cultivares. Los frutos infectados muestran manchas cloróticas o ligeros anillos amarillentos, y pueden deformarse o ser de tamaño irregular y desarrollar áreas marrones o necróticas bajo los anillos decolorados de la epidermis del fruto. En ciruelos europeos y albaricoqueros o damascos suele producirse una caída prematura de frutos antes de la madurez, y los huesos o carozos de albaricoquero o damasco infectados, suelen mostrar típicos anillos o manchas pálidas. Los frutos de árboles infectados de cerezo dulce y ácido o guindo pueden mostrar deformación y caída prematura. Los almendros infectados no muestran síntomas o son insignificantes y fugaces en hojas. En general los frutos de cultivares tempranos de todas las especies sensibles, muestran síntomas más marcados que los de aquellos cultivares de maduración más tardía. PPV muestra una gran variabilidad genética que se ha estructurado en 10 grupos monofiléticos o tipos (D-Dideron, M-Marcus, Rec-Recombinante, T-Turco, EA-El Amar, W-Winona, C-cerezo, CR-cerezo ruso, An-ancestral y CV-cerezo del Volga, de los cuales D, M y Rec son los prevalentes. Presente en España donde es prevalente el tipo D y se ha detectado el tipo M en algunas zonas.

Propiedad o habilidad de un organismo para cambiar sus características de una generación a otra como resultado de una adaptación al ambiente o una mutación.