Diccionario

Sigla del inglés. En español, Banco de Datos de ADN de Japón.

Acrónimo del inglés. Base de datos pública y gratuita que contiene una extensa colección de secuencias de nucleótidos obtenidas a partir de más de 300.000 especies. Además de la secuencia, incluye información bibliográfica, anotaciones funcionales y, si se trata de una secuencia codificante, su traducción conceptual a proteína. Cada registro contiene una secuencia ininterrumpida de una molécula de polinucleótido (ADN genómico, ARN genómico, ARN precursor, ARNm (ADNc), ARN ribosómico, ARN de transferencia, ARN pequeño nuclear o ARN pequeño citoplasmático). De su gestión y distribución se encarga el NCBI (National Center for Biotechnology Information) en los Estados Unidos de América, con el ENA (European Nucleotide Archive) y el DDBJ (DNA Data Bank of Japan). Estas instituciones forman el consorcio INSDC (International Nucleotide Sequence Database Collaboration) que diariamente actualizan sus contenidos para que todas ellas dispongan de la misma información simultáneamente.

Sigla del inglés. En español, consorcio de colaboración internacional entre las organizaciones DDBJ, EMBL-EBI y NCBI, que intercambian diariamente diversas bases de datos de secuencias de nucleótidos, de acceso gratuito y sin restricciones.

En bioinformática, es un identificador único asignado a un registro en una base de datos de secuencias biológicas. El registro puede contener distintos tipos de información, como una secuencia (ADN, ARN o proteína) y anotaciones sobre la misma, una estructura proteica o un conjunto de datos biológicos, como datos de transcriptómica. La estructura de los números de acceso es muy variable y es característica del tipo de registro y de la base de datos que lo asigna. Por ejemplo, el número de acceso de una secuencia de nucleótidos en GenBank/EMBL/DDBJ consta de una letra y cinco números (por ejemplo, X97398) o de dos letras y seis números (como, AF172350), mientras que el número de acceso de una estructura en el Protein Data Bank (PDB) consta de un dígito y tres letras u otra mezcla de letras y números (por ejemplo, 1OJ6, 3RGK). Si se introducen cambios en la secuencia o en las anotaciones del registro, lo que sí cambia es la versión de la secuencia, que se indica después del número de acceso, del que va separada por un punto (como, por ejemplo, FR820587.1). Si se producen cambios en el registro FRE820587.1, el nuevo registro tendrá un identificador FR820587.2. En cualquier caso, las bases de datos retornan siempre la última versión cuando se busca el número de acceso sin el número de versión.

Acrónimo del inglés. Identificador asignado por el NCBI, que consta de una serie de números y que se asigna consecutivamente a cada registro de secuencia de ácido nucleico o proteína en el NCBI, de manera que es único para cada versión de una secuencia. Aunque el NCBI sigue asignando este identificador, actualmente se fomenta la utilización preferente del número de acceso acompañado de la versión del registro (por ejemplo, FR820587.2).

Acrónimo del inglés. En español, identificador de información genética. Es aquel asignado con carácter único por el NCBI a cada versión de cada registro de secuencia. A partir de 2016, el NCBI dejó de asignar este identificador a los nuevos registros y ya no se incluye en los formatos GenBank, GenPept o Fasta. Sin embargo, el gi se retiene en las secuencias que lo tenían asignado y sigue siendo aceptado como input en los servicios del NCBI que previamente lo aceptaban.

1. Tablero horizontal, descubierto y elevado sobre el suelo, donde se colocan personas o instrumentos a altura suficiente para examinar las copas de los árboles durante prospecciones fitosanitarias y tomar muestras normalmente inaccesibles. 2. Entorno informático determinado, que utiliza sistemas compatibles entre sí, como las bases de datos y aplicaciones. También aquellas utilizadas para unificar las videoconferencias en la nube, un sistema de telefonía en la nube, mensajería, reuniones en línea simples, que constituyen una solución de sala de conferencias definida por software.