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RAPD

Acrónimo del inglés. En español, amplificación aleatoria de ADN polimórfico. Técnica que consiste en la amplificación aleatoria por PCR de segmentos de ADN mediante el uso de cebadores pequeños (generalmente de 10 nucleótidos de longitud) de secuencias aleatorias no palindrómicas, con un contenido de G+C entre 50 y 80 %. Se trata de marcadores que amplifican aleatoriamente segmentos de ADN en una gran variedad de especies. Se basan en la probabilidad estadística de que los cebadores arbitrarios que se unen a los sitios no específicos del ADN lo amplifiquen, ya que se presentan sitios complementarios al oligonucleótido de 10 pares de bases (pb) a lo largo del genoma. Los fragmentos amplificados migrarán en un gel de agarosa y se podrán observar las diferencias en el patrón de bandas.

ensayo molecular

Denominación común, aunque parcial e incompleta, del conjunto de pruebas o técnicas utilizadas para analizar marcadores biológicos en el genoma y proteoma de plantas, patógenos y artrópodos y cómo sus células expresan sus genes como proteínas. Las más utilizadas son de hibridación ADN-ADN, análisis de huellas genéticas (ADN fingerprinting), reacción en cadena de la polimerasa convencional o en tiempo real, RFLP, RAPD o secuenciación masiva de ADN.

marcadores moleculares múltiples, MMM

Análisis efectuado mediante diversos tipos de marcadores simultánea o secuencialmente para comparar genomas. Los tres tipos más utilizados son el análisis de fragmentos de restricción de longitud polimórfica (RFLP), la amplificación aleatoria de ADN polimórfico (RAPD) e isoenzimas. Se usan también un número variable de secuencias repetitivas asociadas en tándem (VNTRs), polimorfismo puntual o de un único nucleótido (SNP) o polimorfismo puntual y otros basados en genotipado por secuenciación.

prueba molecular

Denominación común muy extendida, pero restrictiva, ya que con frecuencia únicamente se refiere a las técnicas que implican a ácidos nucleicos como diana o muestra, marginando a otras pruebas con moléculas como son los anticuerpos, entre otras. Incluye básicamente técnicas de hibridación, análisis de huellas genéticas, RFLP, RAPD, MLSA, MLST, MLVA y la secuenciación convencional y masiva.

amplificación al azar de ADN polimórfico

Aquella que utiliza cebadores de PCR cortos (alrededor de 10 bases) con secuencias arbitrarias y a bajas temperaturas de apareamiento. Hay descritos gran número de cebadores disponibles y es fácil de realizar, pero tiene ciertas limitaciones de reproducibilidad.

Sociedad Española de Fitopatología
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