Diccionario

Sigla del inglés. En español, número variable de repeticiones en tándem Las repeticiones en tándem son secuencias cortas de ADN altamente variables y repetidas un número variable de veces en el genoma bacteriano. Tienen de 21 a 47 pb y están separadas por fragmentos de secuencias no repetidas del mismo tamaño. Son altamente inestables, pudiendo presentar variabilidad en el número de unidades de cada repetición, designándose su análisis como VNTR y debido a su polimorfismo, se han utilizado como marcadores para la tipificación de especies bacterianas, pero también de otros tipos de organismos, incluyendo virus y hongos. La utilización de cebadores de PCR que delimiten la región de repetición permite visualizar el polimorfismo en el número de unidades repetidas mediante electroforesis, calculando el número de repeticiones según el tamaño de las secuencias amplificadas.

Análisis efectuado mediante diversos tipos de marcadores simultánea o secuencialmente para comparar genomas. Los tres tipos más utilizados son el análisis de fragmentos de restricción de longitud polimórfica (RFLP), la amplificación aleatoria de ADN polimórfico (RAPD) e isoenzimas. Se usan también un número variable de secuencias repetitivas asociadas en tándem (VNTRs), polimorfismo puntual o de un único nucleótido (SNP) o polimorfismo puntual y otros basados en genotipado por secuenciación.

Sigla del inglés. En español, análisis de polimorfismos de múltiples locus con número variable de repeticiones en tándem. Método molecular para identificar la variabilidad intraespecífica de bacterias, incluso a nivel de patovar. Las repeticiones en tándem son secuencias cortas de ADN altamente variables y repetidas un número variable de veces en el genoma bacteriano. El análisis de múltiples regiones VNTR, se denomina MLVA y permite el análisis de la variación de la secuencia en ciertas regiones del genoma. Es un método muy adecuado para estudios epidemiológicos de bacterias a largo y corto plazo. Se trata de un método específico, rápido, de fácil ejecución y bajo costo. Actualmente la posibilidad de secuenciar genomas completos a un precio razonable ha hecho decaer su uso.

Método de caracterizar la diversidad genética intraespecífica de muy diversos organismos, incluyendo virus, bacterias y hongos. La secuenciación del genoma completo de algunas bacterias ha permitido el descubrimiento de nuevos marcadores moleculares caracterizados por ser altamente polimórficos y presentar un número variable de unidades repetitivas en el mismo locus. Este número de repeticiones varia frecuentemente de un aislado a otro y puede ser detectado por PCR utilizando oligonucleótidos que flanquean la región. Esta metodología ha sido ampliamente utilizada para el análisis de la identidad biológica de especies eucariotas y procariotas, así como en pruebas de paternidad en humanos.

Aquellas de secuencias cortas de ADN altamente variables y repetidas un número variable de veces en el genoma bacteriano.