Diccionario

1. Cambios en la estructura o las funciones que mejoran el desarrollo o posibilitan la supervivencia, desde un punto de vista fisiológico, de los organismos en diversas condiciones ambientales. 2. Modificaciones en la estructura de las poblaciones como respuesta, desde un punto de vista evolutivo, a las condiciones ambientales y que conducen a la formación de razas ecológicas. A diferencia de la adaptación fisiológica reseñada en la acepción 1, la adaptación de las poblaciones implica la selección de determinados genes.

Proceso de adaptación de un organismo a condiciones medioambientales distintas a las que está habituado o ajuste de una especie de la población frente a un ambiente cambiante, que sucede generalmente tras varias generaciones.

Subconjunto de partículas de aerosol atmosférico de origen biológico, con tamaños que oscilan desde pocos nanómetros hasta 100 µm. Poseen la capacidad potencial de diseminar patógenos de plantas y, por tanto, tener impacto en la Sanidad Vegetal. Se encuentran de forma ubicua en las capas bajas de la atmósfera, especialmente en la denominada capa límite planetaria. Se liberan desde la superficie terrestre debido fundamentalmente a: actividades naturales (procesos biológicos, o en el ciclo biológico de una plaga en sentido amplio en su interacción con el anfitrión o huésped y el ecosistema) y antropogénicas (agricultura, selvicultura, industria, transporte). Los bioaerosoles se transportan pasivamente a largas distancias por corrientes de aire, lo que les permite atravesar barreras geográficas. Facilitan también la diseminación de microrganismos patógenos de humanos, actuando como vehículos de propagación de enfermedades no solo de plantas sino también con impacto en la salud pública. Su capacidad de favorecer la evolución de los patógenos los convierte en un factor importante en la epidemiología vegetal y en la bioseguridad, ya que facilitan la aparición y emergencia de nuevas variantes y su adaptación al medio, incluyendo el desarrollo de resistencias a las medidas de control.

Taxonomía basada en la genética y en la citología. Campo unificador de la biología que estudia la diversidad de la vida, en particular las relaciones evolutivas entre los organismos. Sus principales objetivos incluyen describir, nombrar, clasificar, identificar y determinar relaciones entre organismos. La biosistemática incluye a la taxonomía (reconocimiento), filogenética (relaciones evolutivas), clasificación (patrones evolutivos) y taxagenética (procesos responsables del origen y adaptación). Diferentes fuentes de evidencias (morfológica, anatómica, citológica, embriológica, filogenética, evolutiva, genética, molecular, química, fisiológica, ecológica, paleobiológica y biogeográfica) se utilizan para evaluar relaciones entre los organismos.

Conjunto de cromosomas de un hongo, caracterizado por el número, tamaño, forma y patrón de bandas de los cromosomas. El estudio del cariotipo suele hacerse mediante electroforesis de campo pulsante (pulse-field gel electrophoresis, PFGE), porque a menudo los cromosomas fúngicos son muy pequeños, pero se resuelven bien por PFGE, y porque la técnica es independiente de la meiosis, permitiendo el análisis de hongos y estructuras asexuales. Su análisis se emplea en Fitopatología para identificar especies y cepas patógenas, diferenciar razas de hongos, estudiar variaciones genómicas relacionadas con la virulencia y comprender la evolución y la organización genética de los patógenos fúngicos. La inestabilidad genómica es frecuente en diversas especies de hongos fitopatógenos, como Fusarium oxysporum, y a menudo resulta en variaciones en el cariotipo y en alteraciones de la patogenicidad y virulencia. Esta variabilidad resulta fundamentalmente de reordenaciones cromosómicas y de la presencia de cromosomas accesorios, que son aquellos que están presentes solo en algunas cepas y que además son inestables. Las reordenaciones cromosómicas son la principal causa de las variaciones del cariotipo y tienen un papel importante en la evolución de los hongos fitopatógenos, ya que pueden ser un mecanismo para la generación de nuevas cepas más virulentas. Los cromosomas accesorios son también una importante fuente de polimorfismos en el cariotipo. La transferencia horizontal de cromosomas (HCT, por sus siglas en inglés) podría ser una herramienta esencial para el intercambio genético y la evolución genómica de los hongos. Los hongos fitopatógenos sufren extensas reordenaciones cromosómicas durante los ciclos reproductivos sexuales y asexuales. Estas reordenaciones cromosómicas ocurren mediante mecanismos aún desconocidos, pero poseen muchas ventajas evolutivas, ya sea en términos de adaptación, especiación, modificación o expansión del rango de huéspedes o anfitriones, o en incrementar la virulencia.

En hongos, aquel que es adicional al conjunto de cromosomas típicos de una especie, denominados cromosomas centrales, básicos o troncales (core chromosomes), y que no es esencial para la supervivencia básica del organismo. Sin embargo, los cromosomas accesorios pueden contener genes que otorguen importantes ventajas adaptativas al patógeno, como patogenicidad, resistencia frente a defensas del huésped o anfitrión, producción de toxinas, o su adaptación a un ambiente específico. Generalmente son clave en la evolución de la patogenicidad, permiten la rápida especialización en nuevos huéspedes, anfitriones u hospedadores y su estudio ayuda a comprender la emergencia de nuevas enfermedades en cultivos o masas forestales. Su presencia en Alternaria alternata, Colletotrichum gloeosporioides y Fusarium oxysporum, es relevante para estos patógenos. Comparados con los cromosomas característicos de la especie, los cromosomas accesorios difieren, entre otros aspectos, en densidad génica, contenido en GC y frecuencia de recombinación, lo que sugiere que pueden haberse adquirido por transferencia horizontal. A pesar de ser dispensables, los cromosomas accesorios tienen un papel muy importante en la patogenicidad en algunas especies de hongos, aunque no en otras. Como ejemplo, se ha observado una pérdida en la producción de toxinas y en la patogenicidad del patotipo de tomate de Alternaria alternata debido a la pérdida de un cromosoma accesorio.

Tipo de cromosoma accesorio pero que únicamente se encuentra en ciertos linajes o cepas de una especie, como en Fusarium oxysporum, donde ciertas cepas tienen uno o más cromosomas que otras cepas no poseen. Generalmente, los cromosomas específicos de linaje contienen genes que pueden conferir ventajas adaptativas relacionadas con virulencia, adquisición de patogenicidad, cambios en la gama de huésped o adaptación al ambiente, entre otras. Estos cromosomas no son necesariamente móviles, aunque pudieran serlo. La nomenclatura de este tipo de cromosomas es a veces ambigua en la literatura científica, ya que algunos autores denominan “cromosomas accesorios dispensables” a aquellos cromosomas específicos de linaje cuya pérdida no afecta al crecimiento del hongo, mientras que otros autores utilizan ambos términos como sinónimos.

Grupo de virus mutantes que se desarrolla a medida que se multiplica un virus en un huésped o anfitrión. Los virus, especialmente los de ARN y ssADN, y los viroides son nubes de mutantes relacionados por mutaciones similares. Un virus o viroide no solamente está adaptado en un momento dado a un ambiente, sino que al tratarse de una población de mutantes tiene cierto potencial para buscar otros huéspedes o anfitriones para multiplicarse y adaptarse. La mutación no es un hecho extraordinario y el aumento de variabilidad genética constituye una oportunidad para mejorar su adaptación.

Teoría biológica propuesta por el naturalista y científico inglés Charles Robert Darwin en 1859, que explica el origen de las especies naturales mediante el concepto de evolución o transformación de unas en otras a través de variaciones en las características hereditarias que se producen de modo no aleatorio, sino por selección natural y adaptación al medio y que se perpetúa por la herencia.

Término originalmente empleado en el ámbito humano y animal para describir un desequilibrio en la cantidad o diversidad de células microbianas que conforman la microbiota y, por tanto, su microbioma. El término se refiere a la ruptura del equilibrio microbiano característico de un hospedador, ya sea por alteraciones cuantitativas o cualitativas de su composición, modificaciones en sus actividades metabólicas o a cambios en su distribución espacial, frecuentemente inducidos por factores exógenos. En las plantas, la microbiota interviene en el crecimiento y en la adaptación a los estreses bióticos y abióticos. En determinadas condiciones la relación entre la planta y su microbiota foliar (compuesta por comunidades fúngicas o bacterianas) puede alterarse, provocando una disbiosis del microbioma. Como consecuencias, determinados patógenos oportunistas pueden proliferar y desencadenar procesos patológicos.

1. Período de escasa actividad que precede a una respuesta. 2. Primera fase de crecimiento o de adaptación de un microorganismo, especialmente bacterias, al ser transferido a un medio de cultivo en el que su desarrollo o multiplicación es apenas perceptible y su tasa de crecimiento nula. Precede a la fase exponencial en la curva de crecimiento de multiplicación rápida de microorganismos en un medio de cultivo.

Transferencia de material genético entre poblaciones mediante diseminación de individuos, reproducción o vectores; en el caso de los patógenos de vegetales, el flujo genético contribuye a su variabilidad genética, adaptación y virulencia, así como a la expansión geográfica de enfermedades de plantas.

1. Grupo taxonómico informal, permitido por el Código Internacional de Nomenclatura para algas, hongos y plantas, que se aplica a parásitos (más frecuentemente hongos u oomicetos) para indicar que está adaptado a un huésped o anfitrión concreto o gama de huéspedes específica. Es equivalente al patovar bacteriano. 2. Biotipo (o grupo de biotipos) de una especie de patógeno que difiere de otros en la capacidad de infectar géneros o especies seleccionadas de plantas susceptibles. Taxón infraespecífico caracterizado desde un punto de vista fisiológico (especialmente la adaptación del huésped o anfitrión) pero escasamente o en absoluto desde el punto de vista morfológico.

Sigla de Grupo para la Evaluación de Nuevas Variedades de Cultivos Extensivos en España. Grupo de trabajo integrado por técnicos de Centros e Institutos de Investigación de las Comunidades Autónomas responsables de la realización de los ensayos de las redes de experimentación de variedades, de la Oficina Española de Variedades Vegetales (OEVV) del Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación (MAPA) y de empresas del sector privado. El objetivo de GENVCE es el de ofrecer al sector cerealista (técnicos, agricultores, industriales y administración) información precisa y práctica sobre la adaptación agronómica y la calidad de las nuevas variedades de cereales y cultivos extensivos, en las distintas áreas de cultivo de España, teniendo en cuenta la sanidad de la semilla, entre otros factores.

Objetivo que se alcanza con la adopción de prácticas de gestión forestal que garanticen el suministro a largo plazo de madera para todos los usos, al mismo tiempo que se mantiene y mejora el hábitat natural, la biodiversidad y otros aspectos ecológicos. Para recibir una certificación al respecto es necesaria la adhesión voluntaria a una norma. Las más conocidas son el Programa para el Reconocimiento de Sistemas de Certificación Forestal (PEFC) y los principios del Consejo de Administración Forestal (FSC). La evaluación del estado de salud de los bosques en Europa se realiza, entre otros medios, a través del seguimiento del follaje de su arbolado. La defoliación anormal es un indicador de la salud y vitalidad de los árboles que está relacionado con factores muy diversos, tales como condiciones climáticas y fenómenos meteorológicos extremos, así como la contaminación atmosférica y las plagas. Los bosques pueden presentar daños provocados por agentes bióticos, abióticos y antrópicos (humanos). Los agentes bióticos y abióticos suelen ser (con la excepción de las especies exóticas invasoras) componentes naturales de los procesos ecológicos de estos ecosistemas. Su desarrollo descontrolado puede ocasionar perjuicios considerables en las masas forestales, constituyendo una amenaza para la gestión forestal sostenible. El fuego es un elemento natural que juega un importante papel en los procesos de regeneración, selección, adaptación y evolución de los ecosistemas naturales. Sin embargo, los incendios forestales pueden provocar consecuencias negativas en vegetación y fauna, así como contribuir a los procesos de desertificación, pérdida del suelo y suministro de agua, además de producir pérdidas de vidas humanas y bienes materiales.

1. Primera etapa de la traducción. 2. Fase de adaptación de los explantos a las condiciones de cultivo in vitro. 3. Primer síntoma visible de la formación de un órgano en la planta.

1. Estado de baja actividad metabólica que se da en períodos de reposo en el ciclo vital de muchos organismos. Es una forma de adaptación inducida por condiciones adversas. 2. (hibernation). Fase de baja actividad como la de algunas bacterias ante un tratamiento para eludir su efecto. 3. (insect dormancy). Letargo de insectos o parada de actividad y desarrollo debida a condiciones climáticas desfavorables. Cuando desaparecen, el insecto sale del letargo.

Planta espontánea que interfiere con los objetivos y necesidades del hombre porque crece entre plantas cultivadas compitiendo con ellas. Puede constituir reservorio de plagas, en sentido amplio, o vectores. Constituyen un claro modelo de adaptación a los cambios asociados a los usos y manejos del suelo, a la intensificación agraria y a la fragmentación del paisaje. La resiliencia es una de sus características.

Ciencia que pretende incrementar la productividad, la resistencia al medioambiente y a las plagas y enfermedades presentes, y generar una mejor adaptación de los microorganismos o de las especies animales domésticas o los vegetales cultivados, e incrementar su potencial bioprotector y la calidad de sus productos, por medio de modificaciones del genotipo de los individuos. En los últimos años se han desarrollado una gran variedad de técnicas de mejora genética basadas en los avances en biotecnología, biología molecular y secuenciación de genomas que se conocen comúnmente por sus siglas en inglés, NBT (New Breeding Techniques) o NGT (Novel Genomic Techniques). Entre sus diferentes aplicaciones se encuentra la selección e introducción de caracteres deseables en animales, plantas y microorganismos para la producción de alimentos, piensos o control de enfermedades. Una de las tecnologías más conocidas dentro de este grupo es la edición genética que permite una modificación del genoma de forma dirigida y específica, permitiendo mutaciones selectivas de uno o varios genes o su modificación o sustitución.

También, planta que no presenta adaptaciones a condiciones hídricas extremas. En sentido más amplio, se utiliza también para referirse a las plantas sin adaptaciones a hábitats extremos.

El utilizado por la comunidad científica para denominar e identificar las especies con precisión y de manera universal. El protocolo para nombrar especies fue propuesto en el siglo XVIII por el botánico sueco Carl Linnaeus, que estableció el sistema de nomenclatura binomial en latín que utiliza solo dos designaciones, la primera indica el género y la segunda es el epíteto específico, como nombre de la especie. Los taxónomos han establecido varios códigos para referirse a la nomenclatura científica. Estos códigos son universales y se actualizan periódicamente por consenso en el: Código Internacional de Nomenclatura para algas, hongos y plantas, Código Internacional de Nomenclatura Zoológica, Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas, Código Internacional de Nomenclatura para Plantas Cultivadas, Código Internacional de Nomenclatura Fitosociológica y el Comité Internacional de Taxonomía de Virus. Los nombres científicos de animales, plantas y microorganismos (excepto de los virus y viroides) se escriben en cursiva, con el primer componente en mayúscula (género) y, caso de mencionarse, con el segundo en minúscula (especie). Cuando a partir de tales denominaciones se crean adaptaciones al español, estas se escriben en minúscula y sin cursiva. En ocasiones, se puede leer un nombre científico seguido de una inicial, nombre o abreviatura. Ello sirve para significar a la autoridad, persona o personas que descubrieron o nombraron la especie. Así, Solanum tuberosum L. se refiere al nombre original otorgado por Linnaeus a la patata o papa o Ralstonia solanacearum (Smith) Yabuuchi et al. al agente causal de la enfermedad de la podredumbre parda de la patata o papa y de la marchitez bacteriana en los cultivos de patata o papa, tomate y otras muchas especies, cita a las autoridades que la nombraron: el nombre entre paréntesis corresponde al autor de la primera descripción como especie y el segundo a los autores de la última reclasificación. La familia y género de virus y viroides se escribe en cursiva pero no el nombre científico. Actualmente, la secuenciación y comparación del ADN de genes conservados de agentes patógenos, especialmente de bacterias, y particularmente en el caso de hongos y oomicetos, ha puesto de manifiesto incongruencias derivadas de la nomenclatura dual anamorfo-teleomorfo, que incidían negativamente sobre la Fitopatología y la Micología. Esta situación ha motivado la propuesta de cesación del sistema nomenclatural convencional para promover una nomenclatura unitaria bajo el concepto One Fungus: One Name (Un Hongo: Un Nombre) que es efectiva con fecha 1 de enero de 2013 y que ha sido bien acogida de forma generalizada, pero todavía no unánime.

Aquella que proporciona los requisitos necesarios que deben cumplir los laboratorios de ensayo y calibración, con el fin de facilitar la armonización de criterios de calidad. Su objetivo principal es garantizar la competencia técnica y la fiabilidad de los resultados analíticos. La norma contiene tanto requisitos de gestión como requisitos técnicos que inciden sobre la mejora de la calidad del trabajo realizado en laboratorio. Estos requisitos son empleados como herramientas para la difusión de un conocimiento colectivo, que facilita la integración del personal, proporciona flexibilidad en la adaptación a cambios del entorno, permite un profundo conocimiento interno y detecta anticipadamente problemas para su resolución. La acreditación de un laboratorio bajo esta norma supone el reconocimiento formal de su competencia y capacidad técnica para llevar a cabo análisis específicos.

Conjunto de genes presentes en los genomas secuenciados de todas las cepas de una misma especie o de un grupo relacionado de organismos. Representa la diversidad genética total de esa especie. Esta definición de pangenoma, denominada “pangenoma de presencia-ausencia” (presence–absence variation pangenome), es la más común en la literatura científica, aunque algunos especialistas en la disciplina de Pangenómica definen tres tipos de pangenoma, que implican diferencias en la representación del mismo y en su inclusión de genes y secuencias no codificantes. El pangenoma se divide en dos componentes principales: i) genoma central o núcleo, que representa a los genes que están presentes en todas las cepas y por estar conservados son esenciales para las funciones básicas de la especie; y ii) genoma accesorio o dispensable, que representa los genes que están presentes únicamente en algunas cepas. Estos genes diferenciales suelen estar relacionados con la adaptación al ambiente, resistencia a antibióticos, o mecanismos de patogenicidad, pero también suelen incluir secuencias típicas de fagos, plásmidos y otros elementos genéticos móviles. La importancia del pangenoma en Fitopatología es clave, ya que permite entender la diversidad genética de los patógenos y su interacción con las plantas anfitrionas u hospedadoras. Permite: i) conocer la variabilidad genética de los patógenos e identificar genes que están presentes solo en algunas cepas de un patógeno, como genes de virulencia, efectores, o de resistencia a plaguicidas, fundamental para comprender por qué ciertas cepas son más agresivas o difíciles de controlar que otras; y ii) entender la coevolución planta-patógeno, al permitir estudiar cómo los genes de los patógenos evolucionan para evadir los mecanismos de defensa de las plantas. Así, algunos genes de efectores pueden perderse por deleción o acumular mutaciones que alteren su secuencia para evitar ser detectados por genes de resistencia en las plantas. El conocimiento de qué genes del pangenoma están implicados en la infección, permite diseñar estrategias para mejorar la resistencia e identificar dianas moleculares para mejorar genéticamente cultivos determinados mediante edición genética o cruzamientos dirigidos. La identificación de los genes únicos y accesorios favorece el desarrollo de métodos, técnicas de detección y reactivos específicos de detección y diagnóstico para identificar cepas nuevas, más virulentas o resistentes. El estudio del pangenoma puede mostrar cómo una población patógena cambia con el tiempo, ayudando a predecir posibles brotes o fallos en el control basado en resistencia genética. Como ejemplo concreto, en el hongo fitopatógeno Magnaporthe oryzae (causante del añublo del arroz), el análisis del pangenoma ha permitido identificar genes de efectores que determinan si una cepa puede infectar a ciertas variedades de arroz y ello ha sido clave para el diseño de programas de mejora genética más eficaces. El pangenoma se puede representar, de forma básica, como una lista de genes presentes o ausentes en cada cepa o individuo, mediante una matriz. Como segundo tipo de pangenoma, denominado “secuencia representativa del pangenoma” (representative sequence pangenome), también puede expresarse como una concatenación de genomas completos o sus secuencias representativas, lo que es útil para análisis comparativos. El tercer tipo, denominado “pangenoma gráfico” (pangenome graph o graphical pangenome), integra múltiples secuencias genómicas de organismos de la misma población, especie o género en un único genoma de referencia.

Procesos que ocurren en muchos microorganismos, como hongos, oomicetos y bacterias, en los que se produce recombinación genética sin la necesidad de meiosis ni reproducción sexual. Implica la fusión de núcleos de células diferentes (cariogamia), el intercambio y recombinación de material genético, y la eventual segregación cromosómica. Este proceso permite la variabilidad genética en organismos que no realizan reproducción sexual convencional, permitiendo el intercambio de material genético entre individuos, lo que puede contribuir a la variabilidad genética y la adaptación a nuevos ambientes, incluyendo la resistencia a fungicidas o la capacidad de infectar nuevas especies de plantas o anfitriones. En hongos y oomicetos fitopatógenos, el intercambio de ADN generalmente ocurre a través de la fusión de hifas de diferentes cepas compatibles, seguida de la fusión de núcleos o cariogamia, recombinación genética y posterior segregación cromosómica. Los principales procesos parasexuales en bacterias son conjugación, transformación y transducción. Suele considerarse que otros elementos genéticos móviles —además de los bacteriófagos implicados en transducción—, como plásmidos o elementos transponibles, también dan lugar a procesos parasexuales en los diversos tipos de organismos; sin embargo, parasexualidad es un término muy poco utilizado en relación con estos elementos genéticos. Igualmente, los procesos de recombinación entre virus pueden considerarse procesos parasexuales, aunque la literatura científica muy raramente utiliza este concepto. Ejemplos de agentes fitopatógenos en los que se ha observado este proceso incluyen a especies como Colletotrichum acutatum, Fusarium oxysporum y Pyricularia oryzae.

1. Tiempo transcurrido entre la recepción del estímulo y el comienzo de la respuesta. 2. Tiempo que transcurre entre la infección por un agente patógeno y la producción de nuevo inóculo. 3. Período de incubación que transcurre entre la infección de una bacteria por un fago y la lisis bacteriana, o entre la inoculación de un agente patógeno y la aparición de síntomas o signos detectables en el huésped o anfitrión. 4. Fase de adaptación de un microorganismo en crecimiento o multiplicación. Se corresponde con la primera parte de la curva de crecimiento en la que el número de unidades formadoras de colonias permanece prácticamente constante, antes de iniciar la fase logarítmica o exponencial en la que los microorganismos crecen con rapidez. 5. Lapso de tiempo transcurrido entre que un vector adquiere un patógeno y puede transmitirlo con éxito a una nueva planta anfitriona causándole una infección local o sistémica.

1. Capacidad resistencia y adaptación frente a un agente perturbador o un estado o situación adversos. 2. Capacidad de un material, mecanismo o sistema para recuperar su estado inicial cuando ha cesado la perturbación a la que había estado sometido. 3. En comunidades y ecosistemas se emplea para señalar la capacidad de los mismos para resistir condiciones adversas de distintos tipos, manteniendo sus características fundacionales y siendo capaz de recuperarse tras la adversidad.

Técnica para el silenciamiento de genes de la planta mediante interferencia de ARN mediada por secuencias de pequeño tamaño de ARN (generalmente entre 20 y 32 nt). Constituye un avance en el campo que explora el uso de vectores virales para mejorar las características agronómicas de los cultivos, mediante el uso de un virus vegetal benigno o desarmado (virus modificado, al que se ha eliminado el material genético que causa la enfermedad, para convertirlo en vehículo que transporte la secuencia de ARN que se quiere introducir en un organismo). Así se transportan moléculas cortas de ARN a las plantas, desencadenando un proceso de interferencia por ARNi (RNAi) para silenciar genes de manera específica, impidiendo que la información de un gen se traduzca en una proteína. Este enfoque mejora la eficiencia en la reducción de la expresión de genes diana en las plantas y abre nuevas vías para la mejora de cultivos, incluida la de su resistencia a patógenos, la genómica funcional y la agricultura sostenible, basada en la tecnología de vectores virales. Esta tecnología se ha demostrado eficaz, en condiciones experimentales, para inducir la floración y acelerar el desarrollo de variedades mejoradas, modificar la arquitectura vegetal para facilitar la adaptación a la mecanización, mejorar la tolerancia a la sequía y producir metabolitos beneficiosos para la salud humana, entre otras aplicaciones con posibilidad de uso a escala industrial.

Estructura o complejo macromolecular presente en bacterias que permite el transporte, inyección o secreción de proteínas—y en algunos casos de ácidos nucleicos u otras moléculas— al espacio extracelular o al citoplasma de otras células. Los sistemas de secreción se distinguen por su arquitectura, mecanismo de translocación y destino del sustrato, y se definen de manera distinta para bacterias monodérmicas (grampositivas; una única membrana) y didérmicas (gramnegativas; dos membranas). De entre los más relevantes, las vías Sec (general secretory pathway) y Tat (twin-arginine translocation) se han identificado en todos los dominios de la vida (bacterias, arqueas y eucariotas), y translocan proteínas a través de la membrana citoplasmática hacia el periplasma o la membrana interna y constituyen sistemas esenciales para la biogénesis celular; por tanto, en bacterias gramnegativas se consideran como sistemas de exportación y no como verdaderos sistemas de secreción. Los sistemas de secreción denominados tipo I a tipo IX (abreviados como T1SS a T9SS) se diferencian de los anteriores porque permiten la secreción al medio extracelular o la translocación directa de proteínas u otras moléculas al interior de células diana —ya sean eucariotas u otras bacterias—, de manera que participan en procesos de interacción con el entorno, como virulencia, simbiosis, competencia microbiana y adaptación ecológica. En bacterias gramnegativas —que agrupan a las especies de mayor importancia en Fitopatología— se han descrito todos estos sistemas excepto T7SS, que solo se ha identificado en ciertas bacterias grampositivas. Una bacteria puede expresar uno o varios de estos sistemas o, a veces, ninguno; cuando están presentes, normalmente se asocian a la patogenicidad o a una mayor virulencia. Los mecanismos de secreción son variables dependiendo del sistema, pero pueden agruparse en los que secretan efectores al exterior en un único paso (sistemas I, III, IV, VI y VII) y los que requieren que los efectores sean primero secretados al periplasma, mediante los sistemas Sec o Tat, para luego secretarlos al exterior (sistemas II, V o IX). Los sistemas de mayor relevancia en bacterias fitopatógenas son: i) T2SS, que participa en la secreción de enzimas degradadoras de la pared celular vegetal; ii) T3SS, que es un determinante clave de la virulencia y especificidad de hospedador o anfitrión; iii) T4SS, por su papel en la transferencia horizontal de genes a bacterias y eucariotas y, en casos particulares, en la translocación de efectores; y iv) T6SS, que contribuye principalmente a la competencia microbiana y a la colonización de nichos asociados a plantas.

Sistema contráctil, descrito exclusivamente en bacterias gramnegativas, que permite la inyección de toxinas o efectores en células bacterianas competidoras y, en algunos casos, en células eucariotas; la bacteria secretora se protege mediante proteínas de inmunidad específicas. Diversas proteínas de los T6SS muestran estructuras homólogas a proteínas de la maquinaria contráctil de colas de bacteriófagos, aunque no muestran homología de secuencia. El T6SS está implicado principalmente en la competencia interbacteriana y la colonización de nichos. En bacterias fitopatógenas, como Pseudomonas syringae, Xanthomonas citri y diversas cepas de Ralstonia solanacearum, el T6SS contribuye a la adaptación y persistencia en la filosfera y rizosfera, mientras que se ha documentado que permite incrementar la virulencia de diversas cepas de Acidovorax y Pectobacterium spp.

Proceso en el que cromosomas completos se transfieren entre diferentes organismos, lo cual es distinto de la transferencia vertical típica de material genético de los parentales a la descendencia. Supone una transferencia masiva de genes localizados en el cromosoma transferido. Este fenómeno es particularmente relevante en los patógenos fúngicos, como se ha demostrado, entre otros, en: Alternaria alternata, Colletotrichum gloeosporioides y Fusarium oxysporum. El proceso puede suponer una rápida adaptación del organismo a nuevos nichos o nuevas condiciones ambientales; así como cambios en la patogenicidad, virulencia o especificidad hacia los huéspedes o anfitriones. Además, frecuentemente involucra cromosomas accesorios, que no son esenciales para la supervivencia básica, pero pueden portar genes que otorgan una ventaja selectiva como factores de patogenicidad. El mecanismo concreto de la transferencia horizontal de cromosomas no está enteramente determinado, pero una hipótesis sugiere que los cromosomas accesorios móviles podrían portar su propia maquinaria de transferencia, similar a los plásmidos bacterianos.

Propiedad o habilidad de un organismo para cambiar sus características de una generación a otra como resultado de una adaptación al ambiente o una mutación.

En botánica, se refiere a la adaptación de las plantas fanerógamas que aseguran su polinización con ayuda de animales. Este término incluye a la realizada por insectos (entomofilia), aves (ornitofilia) y murciélagos (quiropterofilia). Posee interés fitopatológico ya que algunos animales pueden servir de vector de transmisión de patógenos, como el caso de la bacteria Erwinia amylovora por abejas polinizadoras o de Ophiostoma spp. por escolítidos.

Capacidad relativa de un individuo de una población para sobrevivir y transmitir sus genes a la siguiente generación en relación con la capacidad de otros individuos.