Diccionario

Examen o estudio pormenorizado de algo. Distinción y separación de las partes de un todo, hasta llegar a conocer sus principios o elementos.

Prueba de hipótesis basada en experimentos ficticios realizados en ordenador o computadora (es decir, in silico) con miras a formular predicciones que luego puedan comprobarse en estudios realizados in vitro o in vivo.

Aquel que tiene por objeto identificar los componentes de una sustancia, agente patógeno o su vector.

Aquel que se emplea para determinar la cantidad de cada elemento o ingrediente en una sustancia, patógeno o su vector.

Método para determinar la cantidad de diversos componentes, incluyendo ADN, ARN y proteínas, por comparación con un estándar conocido. Se puede utilizar para determinar el número de copias de una secuencia de ADN (es decir, para investigar posibles mutaciones por duplicación y deleción), mediante la comparación visual de la intensidad de las bandas o la cuantificación numérica con densitometría. Si un gen presenta copias adicionales, la intensidad es de más del 100 % en el gel o película; pero si ha perdido una copia del gen, la intensidad es de aproximadamente un 50 %.

Estudio de los fragmentos de ADN de tamaño previsible originados por la digestión (corte) de una cadena de ADN por una enzima de restricción específica. Las alteraciones (mutaciones o polimorfismos) producidas en la secuencia de ADN que destruyen o crean nuevos sitios de corte en el ADN, modifican el tamaño y el número de los fragmentos de ADN resultantes de dicha digestión.

Técnica analítica recientemente aplicada para el diagnóstico de enfermedades de las plantas. Se basa en el estudio y comparación de curvas de fusión de las cadenas de ADN. Sus principales aplicaciones son la detección de mutaciones, polimorfismos y alteraciones epigenéticas en muestras de ADN. Este método tiene ventajas sobre la PCR convencional estándar, ya que no requiere la visualización de bandas de ADN ni el uso de las sondas necesarias para PCR cuantitativa. Esta nueva herramienta de diagnóstico en Fitopatología basada en amplificación molecular es capaz, por ejemplo, de detectar el hongo Colletotrichum abscissum en cítricos durante sus etapas asintomática y sintomática.

Técnica cuya idea básica es agrupar un conjunto de observaciones en un número dado de grupos. Este agrupamiento se basa en la idea de distancia o similitud entre las observaciones.

Técnica muy utilizada para establecer un vínculo entre la evidencia biológica y un sospechoso en una investigación criminal, que también se utiliza en identificación y taxonomía fitopatológica para establecer si dos muestras de ADN son iguales o no. Una muestra de ADN se puede comparar con otra para evaluar si los perfiles coinciden y asignar un porcentaje de identidad. Dos individuos u organismos clonados pueden ser estudiados para determinar si poseen partes en común y, por tanto, se superponen entre sí. La prueba también se utiliza para establecer la paternidad.

Sistema de estudio de una imagen hiperespectral que tiene varias bandas espectrales de información a través de todo el espectro electromagnético. Constituyen un elemento básico en un sistema de teledetección. Existen múltiples métodos de procesamiento y análisis de imágenes hiperespectrales, que tienen gran importancia y son herramientas de ayuda en la identificación y la vigilancia de vegetación, entre otras y todas ellas dependen del sensor instalado y de la resolución espectral. Hay ciertas longitudes de onda absorbidas por la atmósfera, por lo que no es recomendable situar a los sensores en estos rangos del espectro en los satélites utilizados para teledetección.

Examen cualitativo o cuantitativo o ambos, de los componentes o sustancias de una planta, sus productos o muestras, de un patógeno o su vector, según métodos especializados y con un fin diagnóstico, de detección o de identificación.

Estudio de los polimorfismos de las secuencias de ADN (variantes normales) que están próximos a, o dentro de, un gen de interés (ligamiento) para identificar, en una misma familia, la segregación de una mutación patológica en un gen determinado.

Método utilizado para evaluar el estado de metilación de un gen (unión de los grupos metilo a las citosinas del ADN). En muchos eucariotas, fundamentalmente plantas y animales, los genes metilados no se expresan.

Uso de secuencias repetitivas muy variables, con un tamaño medio de 2-5 pb, que se encuentran en las regiones microsatélites adyacentes a los genes o intragénicas o en otras áreas de interés, como marcadores para el análisis de ligamiento, huellas moleculares de ADN u otras aplicaciones del diagnóstico o la identificación y comprobación de la autenticidad y uso de un cultivar legalmente protegido o de microorganismos.

Aquel realizado con técnicas, pruebas, tests, métodos estándares de oro o de referencia.

1. Proceso de evaluación de las evidencias biológicas u otras evidencias científicas y económicas para determinar si un organismo es una plaga, si debería ser reglamentado, y la intensidad de cualesquiera medidas fitosanitarias que hayan de adoptarse contra él, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5. 2. Evaluación del riesgo de plagas, según metodologías estandarizadas como las de EPPO o la EFSA y protocolos de manejo del riesgo.

Utilización de técnicas de secuenciación, análisis mutacional, rastreo de mutaciones o cualquier otro medio de estudio molecular genético, para detectar variantes en un gen que pueden estar asociadas a trastornos genéticos o patogénicos específicos. El análisis directo del ADN es posible solo cuando se conoce el gen o genes o la región genómica, asociados con el fenotipo bajo estudio.

Aquel que utiliza principalmente valores monetarios como una medida para que las autoridades que formulan las políticas comparen los costos y beneficios de diferentes tipos de bienes y servicios. Abarca más, puesto que el análisis económico no impide el uso de otras medidas que no utilicen un valor monetario, por ejemplo, el análisis cualitativo o ambiental, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

Técnica mediante la cual se separan las biomoléculas en disolución cuando se ven sometidas a un campo eléctrico. Se trata de una técnica fundamentalmente analítica, aunque también se puede realizar con fines preparativos.

Técnica que permite identificar y cuantificar la expresión de los genes en la célula, mediante la medición de los ARNm que están presentes en la misma en un momento determinado. Se basa en la obtención de pequeños fragmentos de ADNc de 9 pb, denominados etiquetas. Ello permite crear perfiles de expresión de cada célula en determinadas situaciones, ya sea en circunstancias normales de la célula sana o en momentos en que se ve afectada por algún patógeno. De esta manera se pueden comparar estos perfiles y determinar qué genes están siendo apagados o activados y así determinar cuál pudiera ser la causa asociada. Otras variantes de la técnica, como LongSAGE o MicroSAGE, presentan pequeñas variaciones para el análisis en serie de la expresión génica (SAGE) tradicional, pero usan un tamaño de etiqueta pequeño: SAGE 14 pb y LongSAGE 18 pb. SuperSAGE, con etiquetas de 26 pb, permite una óptima anotación, y análisis de nuevos transcritos en conjunción con técnicas como la de extensión hacia los extremos (3′- y 5′-RACE).

Aquellos que se realizan periódicamente en la industria alimentaria, hospitales, centros sanitarios o laboratorios de diagnóstico para determinar el recuento de microorganismos indicadores como los aerobios, enterobacterias, mohos o levaduras que dan una idea general de la contaminación presente. Estos análisis son útiles para garantizar que los procesos de limpieza y desinfección establecidos se están cumpliendo y están siendo eficaces frente a bacterias, hongos y virus. Actualmente también incluyen el análisis de coronavirus en superficie.

Análisis que indica las relaciones evolutivas entre secuencias de ADN o proteína o especies u otras entidades que descienden de ancestros comunes y puede indicar las distancias genéticas entre ellas. Los métodos filogenéticos permiten reconstruir el árbol que representa la historia evolutiva de las especies, en los que las ramas y los nodos unen diferentes taxones que pueden ser especies, individuos, genes, secuencias, etc., pero en realidad, se puede efectuar un análisis filogenético con multitud de cosas.

Término general que engloba técnicas preparativas de biología molecular empleadas para la identificación y análisis de marcadores biológicos en el genoma y proteoma. Dichas técnicas se utilizan para diagnóstico, detección e identificación de plagas, en sentido amplio.

Técnica de biología molecular muy utilizada en detección, diagnóstico e identificación, cuyo objetivo es obtener un gran número de copias de un fragmento de ADN particular, partiendo de un mínimo; en teoría, basta partir de una única copia de ese fragmento original o molde. Utiliza la reacción en cadena de la polimerasa, conocida como PCR por sus siglas en inglés (polymerase chain reaction), desarrollada en 1983 por Kary Mullis.

Análisis dirigido a detectar la presencia de una mutación específica, un tipo de mutación específica o un conjunto de mutaciones.

Aquel que se realiza, en paralelo o secuencialmente, mediante distintas técnicas basadas en principios biológicos diferentes.

Técnica que se basa en la realización de diluciones sucesivas de una suspensión celular, hasta conseguir una alícuota que contenga una sola célula. Se utiliza fundamentalmente en la obtención de anticuerpos monoclonales y en otros procesos de obtención de cultivos o líneas puras.

Técnica inmunológica de determinación cuantitativa de antígenos o anticuerpos mediante el uso de reactivos marcados con isótopos radiactivos.

Análisis múltiples de distintas partes de un material de ensayo utilizando el mismo método en las mismas condiciones, (como el mismo operador, los mismos aparatos, o el mismo laboratorio).

Estudio químico y bioquímico de los sueros, especialmente del antisuero de animales inmunizados (antisuero), que incluye a los anticuerpos monoclonales específicos y anticuerpos recombinantes, y su uso para detectar, cuantificar o identificar antígenos o anticuerpos.

Proceso o metodología mediante el que se analizan datos de diferentes estudios realizados sobre el mismo tema. Por lo habitual, los resultados de un metaanálisis son más sólidos que los resultados de cualquier estudio individual. Implica una síntesis cuantitativa de la evidencia acumulada sobre una pregunta de investigación previamente definida. La respuesta se basará en la información contenida en los estudios de ensayos previamente publicados (estudios primarios). Las principales características del metaanálisis son la precisión, la objetividad y la replicabilidad cuando los ensayos han sido seleccionados en función de su homogeneidad y fiabilidad. Su aplicación permite obtener una estimación combinada del tamaño del efecto. También permite evaluar la heterogeneidad observada en un campo de estudio.

Recinto o lugar donde se aísla material vegetal en el momento de su entrada o importación y donde permanece cierto tiempo en observación para prevenir la introducción de enfermedades, vectores o plagas y garantizar su ausencia tras inspecciones visuales y análisis de su sanidad. La cuarentena también puede efectuarse mediante cultivo in vitro.

Aquel que cede electrones a otro compuesto o elemento y que por tanto se oxida. Se utilizan en análisis electroforéticos, preparación de sensores y otros, para completar la desnaturalización de proteínas por rotura de puentes disulfuro. El ditiotreitol (DTT) o reactivo de Cleland es uno de los más comúnmente utilizados.

Instituto Tecnológico Agroalimentario, centro tecnológico privado, constituido en 1987 como asociación sin fines lucrativos. Su sede está en el Parque Tecnológico de Paterna (Valencia). Pertenece a la Federación Española de Centros Tecnológicos (FEDIT), a la Red de Institutos Tecnológicos de la Comunidad Valenciana (REDIT), al European Food Institutes (EFI), así como a numerosas entidades y asociaciones. Presta, mediante convenio, diferentes servicios entre los cuales están diferentes análisis relacionados con la sanidad vegetal.

Método que emplea la ADN polimerasa del bacteriófago Φ29 y cebadores al azar para la amplificación de moléculas de ADN. Constituye una alternativa eficaz y rápida para la detección de virus de genoma monopartito de ADN circular de cadena sencilla, incluyendo posibles nuevas variantes, al tratarse de una técnica que no precisa del conocimiento previo de la secuencia viral. Se han propuesto protocolos estandarizados EPPO para diagnóstico y detección de Begomovirus (familia Geminiviridae), que incluyen un análisis serológico inicial y una PCR para confirmar la infección.

Instrumento que realiza un análisis cuantitativo y cualitativo, generalmente automático, de los mismos, basado en cromatografía líquida de intercambio iónico.

En Biología, especie, secuencia de proteína o ácido nucleico, etc., más cercana en el tiempo y de la que descienden, mediante procesos evolutivos dos o más linajes; que se consideran homólogos porque han evolucionado a partir de un ancestro común. Su conocimiento indica la posible diversificación de un agente patógeno y es clave para entender la historia evolutiva y la propagación geográfica de un patógeno, gen, elemento genético móvil, etc. Generalmente, el ancestro común se determina mediante una predicción, que se basa en el análisis de las especies o de secuencias disponibles en la actualidad. Este análisis se lleva a cabo mediante diversos métodos, entre los que destacan los de máxima verosimilitud (maximum likelihood) y los métodos bayesianos. Se emplea principalmente en análisis filogenéticos para: (i) determinar el origen evolutivo de cepas patógenas, (ii) para reconstruir la posible diseminación espacio-temporal (geográfica y temporal) de enfermedades de plantas, y (iii) para entender mejor la coevolución entre plantas huéspedes o anfitrionas y sus agentes patógenos. Un grupo de taxones que contiene un ancestro común y todos sus descendientes se denomina grupo monofilético, que es lo contrario de grupo polifilético.

Acrónimo del inglés. En español, área de interés. Se utiliza para definir o delimitar espacialmente el área específica sobre la que se quiere realizar un análisis, recortar una imagen o descargar información cartográfica, por ejemplo, un sencillo polígono para definir una parcela de la que obtener valores de vegetación o imágenes de los árboles cultivados.