Estimación cuantitativa de la infección por virus que se calcula por la cantidad de partículas virales en un tejido concreto de la planta, semilla, vector o extracto vegetal, como, por ejemplo, ARN viral por volumen de extracto o por peso de tejido o por vector individual. Se suele calcular por el número de copias obtenidas por amplificación molecular cuantitativa tras PCR o RT-PCR en tiempo real. También se aplica el término a bacterias y hongos. En ocasiones se utiliza como sinónimo de título viral o microbiano.
aislado viral atenuado
Cepa de un virus seleccionada por no causar los síntomas asociados con el virus parental virulento, ya que provoca síndromes más débiles que los aislados comunes. Mantiene replicación normal en la planta anfitriona y su potencial o capacidad de inducir protección cruzada o preinmunización frente al virus parental. Generalmente no altera significativamente el rendimiento ni la rentabilidad del cultivo, a pesar de traslocarse sistémicamente en la planta y generar alta carga viral. Si se desea su utilización en protección cruzada, debiera ser preferentemente autóctono, de sencillo manejo y multiplicación a gran escala puro y no ser fácilmente transmisible por vectores.
antiviral
1. Que combate los virus. 2. Producto químico específico que se utiliza en el tratamiento de plantas o explantos cultivados in vitro, como 1-β-d-ribofuranosil-1,2,4-triazol-3-carboxamida (ribavirin), 2-tiouracilo, citosina, 1-β-d-arabino-furanósido-HCl (Ara-C), 8-azaguanina, 5-fluorodeoxiuridina (FudR), etc., con la finalidad de disminuir la carga viral y así aumentar las posibilidades de obtener material sano mediante cultivo de tejidos. 3. Resistencia conferida en plantas transgénicas mediante la expresión citosólica de fragmentos de anticuerpo contra la replicasa viral u otras construcciones generadas por ingeniería genética, con el fin de modular o impedir la infección.
calva
1. Una zona clara o placa de lisis, generalmente circular, generada por un bacteriófago en un césped de bacterias en un medio de agar, también se aplica a áreas similares en una colonia de hongos. Cada calva corresponde a la infección por una única partícula viral por lo que se puede estimar la carga viral de la suspensión inicial en UFP/mL (unidades formadoras de placa o calva por mililitro). 2. En los nematodos, síntoma de apariencia general de anulaciones profundas divididas longitudinalmente, debido a una infección de la cutícula.
electroterapia
Técnica que utiliza impulsos eléctricos para mejorar la salud de las plantas y, en algunos casos como auxiliar para eliminar o reducir la carga de virus o patógenos que las afectan, antes de su saneamiento. Los impulsos eléctricos pueden dañar las estructuras virales (cápsida o ADN/ARN) e inactivar su capacidad de replicarse. Con esta metodología se pretende también estimular las defensas naturales de las plantas o destruir directamente los virus presentes en sus tejidos, para posteriormente utilizar ápices caulinares de la zona tratada para efectuar microinjerto o cultivo directo in vitro, con el fin de obtener plantas saneadas. Con la aplicación de corrientes eléctricas de baja o alta intensidad a las plantas se influye en sus procesos fisiológicos, se ha demostrado que mejora el crecimiento, aumenta la resistencia a enfermedades, reduce la carga viral o viroidal en los tejidos tratados, y se promueve la resistencia contra otros patógenos (bacterias, hongos y oomicetos). Las fuentes de electricidad son generadores de pulsos eléctricos (controlan intensidad, frecuencia y duración), ya sean de corriente directa o alterna. Se aplican con electrodos metálicos (placas, varillas o hilos) que se colocan en el suelo, las raíces, los tallos o incluso las hojas, dependiendo del área a tratar. Se utilizan materiales aislantes para proteger partes no tratadas o evitar la dispersión de la corriente, cuyo nivel eléctrico se controla con voltímetros y amperímetros. Los estímulos eléctricos utilizados varían en función del objetivo del tratamiento, la sensibilidad de la planta y el tipo de virus o patógeno del que se desea disminuir o eliminar su título/carga. Los principales tipos de estímulos eléctricos aplicados para sanear o reducir la carga viral, básicamente son: i) corriente alterna de media o alta frecuencia para tratamiento de los virus más persistentes o; ii) breves ráfagas de pulsos eléctricos con voltajes altos (kilovoltios a alta frecuencia, >1 kHz).
otoñada
Denominación común de la abundante vegetación en el otoño, tras las altas temperaturas de verano. En los árboles frutales y en los cítricos se produce una brotación o crecimiento de los brotes, muy apropiada para la detección de virus al incrementarse su carga viral tras la época estival en la que disminuye su título.
PCR en tiempo real, qPCR
Método que permite monitorear la reacción de PCR o RT-PCR durante el proceso de amplificación, posibilitando la detección y cuantificación del organismo diana en la muestra en un único proceso realizado en placas o tubos. En teoría, hay una relación cuantitativa entre la cantidad de la secuencia diana inicial y la cantidad del producto amplificado en cualquier ciclo de la amplificación. Mediante la inclusión de fluorocromos se puede monitorizar el progreso de la reacción de amplificación en tiempo real, midiendo la fluorescencia liberada cada vez que se realiza una copia del ADN molde, puesto que el incremento de la intensidad de fluorescencia es proporcional a la cantidad de ADN generado. Al permitir el seguimiento de la reacción en tiempo real, se elimina la necesidad de manipular los amplificados en pasos de post-PCR, disminuyendo riesgos de contaminación entre muestras por aerosoles. La posibilidad de poder cuantificar las dianas la convierte, además, en una herramienta útil para determinar los niveles de inóculo en la muestra. Las técnicas de amplificación molecular en tiempo real se han convertido en las de referencia para diagnóstico y detección. Para el diseño de protocolos de detección mediante PCR en tiempo real se recomienda que los productos amplificados o amplicones sean de pequeño tamaño (80-150 pb), para poder alcanzar resultados óptimos en sensibilidad, especificidad y eficiencia. La posibilidad de utilizar sondas marcadas con distintas moléculas fluorescentes permite utilizar las técnicas de PCR o RT-PCR en tiempo real en formato múltiple. Sus aplicaciones son diversas además de la detección de patógenos y determinación de la carga viral, se usan en estudios de expresión génica (cuantificación absoluta con curva patrón y cuantificación relativa con gen control endógeno), detección de SNP, o estudios de discriminación alélica, entre otras. La técnica permite procesar muestras compuestas preparadas por métodos directos, en menos de 2 h. También es muy utilizada en la versión RT-PCR en tiempo real (RT-qPCR).
planta trampa
La que es atractiva para las plagas en sentido amplio y que contiene sustancias que son letales para las mismas, o disminuyen o anulan la carga viral o bacteriana de vectores. Intercaladas en el cultivo o dispuestas a modo de cortavientos o pantalla, sirven para reducir el impacto de patógenos y sus vectores o para advertir o alertar precozmente de la presencia de determinados patógenos en un área vigilada. Constituyen una estrategia de detección, alerta o control ya que actúan básicamente: i) captando inóculo sin que este sea capaz de desarrollarse, por lo cual reduce las poblaciones de una especie dañina, como los árboles transgénicos de ciruelo europeo Honey Sweet resistentes al virus de la viruela del ciruelo o virus de la sharka (Potyvirus plumpoxi, Plum pox virus-PPV) que como se transmite naturalmente de forma no persistente por pulgones virulíferos, al realizar picaduras de prueba en estos ciruelos, limpian o descargan de virus su estilete y son incapaces de transmitirlo posteriormente, si no lo adquieren de nuevo en una planta infectada; ii) disminuyendo las poblaciones de parásitos, como las solanácea Solanum sisymbriifolium y S. scabrum que actúan como trampa del nematodo Globodera pallida causante de quistes en patata o papa y otros nematodos. Si un cultivo se cosecha o destruye antes de que finalice el ciclo del cultivo, cuando los juveniles y las hembras todavía están en el interior de las raíces de la planta trampa, esto contribuye a reducir significativamente las poblaciones del patógeno; y iii) para delatar o advertir de la presencia de un patógeno y su vector en una zona vigilada, basada en su gran sensibilidad y manifestación de síntomas precoces y evidentes, como los de Polygala myrtifolia para la bacteria Xylella fastidiosa.
protección cruzada
Proceso por el cual una planta sensible infectada con un virus o cepa de baja virulencia o atenuada, se vuelve resistente o tolerante a la infección posterior por otro aislado agresivo del mismo virus o cepa relacionada, pero más virulenta. El patógeno del que se desee proteger debe poseer un gran parentesco y ser una cepa, aislado o tipo, muy próximo del que se emplee como protector. Solo aislados del mismo virus se protegen entre sí, pero no los de distintos virus. El aislado protector debe invadir sistémicamente a la planta que se desee proteger y lograr en ella alto título o carga viral. Se ha descrito y utilizado históricamente para el virus de las manchas anulares del tabaco (Tobacco ringspot virus-TRSV), virus del mosaico del tabaco (Tobacco mosaic virus-TMV) y virus X de la patata (Potato virus X-PVX). Posteriormente se ha aplicado a muy diversos virus, como el virus del mosaico del tomate (Tomato mosaic virus-ToMV), virus de la mancha anular de la papaya (Papaya ringspot virus-PRSV), virus del mosaico amarillo del calabacín (Zucchini yellow mosaic virus-ZYMV), o virus de ADN del mosaico de la coliflor (Cauliflower mosaic virus-CMV), entre otros. El método se emplea comercialmente a gran escala y con éxito en viveros de cítricos en Brasil y Sudáfrica entre otros países, para proteger al naranjo dulce, pomelo y algunos patrones de daños directos de acanaladuras en la madera que causan los aislados agresivos del virus de la tristeza de los cítricos (Closterovirus tristezae, Citrus tristeza virus-CTV). La búsqueda y selección de aislados protectores debe realizarse localmente en la población autóctona de virus y huéspedes del país y su uso supone una última opción, sin la que no sería posible el cultivo. Las desventajas y riesgos generales de la protección cruzada, básicamente, son: i) que genera entre un 5-10 % de reducción del rendimiento; ii) solo es posible si se dispone de un adecuado método de producción de inóculo y de inoculación; iii) supone aceptar el riesgo de la liberación de virus a gran escala en el ambiente; y iv) ser consciente de que las plantas preinoculadas se convierten en reservorios del virus atenuado, que puede mutar a más agresivo, recombinarse o interferir con otros virus. Por causas todavía no bien determinadas sucede con cierta frecuencia una rotura de la protección en algunos árboles preinmunizados de CTV de campo. Se ha considerado que la protección cruzada era debida al silenciamiento del ARN genómico del CTV, inducido por la cepa protectora o atenuada, pero el fenómeno debe de ser probablemente más complejo.
sanmiguelada
Denominación común de la brotación que se produce en árboles frutales a mediados y finales de septiembre en el hemisferio norte (próximo al santoral de San Miguel en el calendario gregoriano), al descender significativamente las temperaturas veraniegas. Constituye una oportunidad para el análisis de virus, ya que suele aumentar la carga viral en el árbol tras las altas temperaturas de verano.
termoterapia in vitro
Variante de la termoterapia convencional. Técnica que consiste en cultivar y mantener in vitro las plantas que se desea sanear a temperaturas moderadamente altas con el fin de promover la eliminación de virus. La duración del tratamiento depende, entre otros parámetros, del tipo de virus y de la tolerancia a altas temperaturas de la especie vegetal que se desee sanear. Generalmente, se lleva a cabo un cultivo de ápices meristemáticos de brotes al final del período de exposición a alta temperatura o se realiza microinjerto de los mismos in vitro, en un patrón adecuado. El régimen de termoterapia seleccionado debe permitir la supervivencia de la planta mientras inactiva eficazmente el virus, lo que favorecería el crecimiento de ápices meristemáticos con alta probabilidad de estar libres de virus. Generalmente, un tratamiento térmico prolongado puede aumentar la probabilidad de la eliminación del virus, pero también puede disminuir la viabilidad de los explantos tratados. La erradicación de virus por termoterapia puede ser consecuencia de uno o más de los siguientes factores: i) inhibición del movimiento de virus hacia las células meristemáticas por las altas temperaturas, entre 35 y 42 oC de cultivo in vitro; ii) reducción muy notable de la replicación viral a altas temperaturas, resultando en una menor carga viral; o iii) silenciamiento del ARN en los ápices de brotes de plantas infectadas.
título
1. Dilución máxima de un antisuero, fluido ascítico de ratón, solución de inmunoglobulinas purificadas o anticuerpos recombinantes, que es capaz de reaccionar con una cantidad concreta de antígeno, mediante una técnica serológica determinada. 2. En ocasiones, se utiliza como sinónimo de carga viral o carga microbiológica.
transmisión circulante
La de aquellos patógenos denominados circulantes (internos), fundamentalmente algunos virus, que al ser ingeridos por el vector consiguen traspasar las barreras del sistema digestivo, llegar a la hemolinfa y generalmente acumularse en las glándulas salivales del vector, por medio de complejos mecanismos en los que se implican la proteína de la cápsida y otras proteínas e incluso a endosimbiontes. Pueden ser propagativos (si se multiplican o replican en el vector, aumentando su carga viral o título) o no propagativos. La mayoría de los virus de transmisión circulante (interna) están asociados a floema y se requieren largos períodos de prueba y alimentación para poder adquirirlos e inocularlos de forma eficiente.
transmisión circulante propagativa
La de aquellos patógenos circulantes (fundamentalmente algunos virus y algunas especies bacterianas) asociados al floema, que al ser ingeridos por el vector consiguen traspasar las barreras del sistema digestivo, llegar a la hemolinfa y acumularse en las glándulas salivales del vector. Estos patógenos se multiplican o replican en el vector, aumentando su carga viral o bacteriana. Como ejemplos: i) el virus del rizado amarillo del tomate o virus de la hoja cuchara del tomate (Tomato yellow leaf curl virus-TYLCV), transmitido por la mosca blanca Bemisia tabaci y en cuya transmisión circulante está implicada una bacteria endosimbionte tipo C de la mosca blanca. Se han encontrado diferencias de eficacia en la transmisión según el biotipo de la mosca blanca presente. Los biotipos B y Q se muestran muy eficaces, y ii) las especies bacterianas de ´Candidatus Liberibacter´, asociadas a la enfermedad del HLB de los cítricos, transmitidas por distintas especies de psílidos (especialmente por la psila africana Trioza erytreae, y por el psílido asiático Diaphorina citri). Tanto aumenta el título o carga del patógeno en los vectores de transmisión circulante propagativa, que el análisis de vectores capturados en trampas constituye un método recomendado para monitorear áreas extensas y detectar si está presente, en condiciones naturales de campo, el patógeno de interés.
vector virulífero
Aquel que es capaz de adquirir virus, portarlos, en ocasiones incrementar su título o carga viral dentro del vector, y transmitirlos de forma natural o experimental, de una planta a otra.
virus circulante
Aquel persistente que al ser ingerido por el vector consigue llegar a la hemolinfa y generalmente acumularse en las glándulas salivales del vector. Pueden ser virus circulantes no propagativos o circulantes propagativos, en cuyo caso se replican en el vector, aumentando su título o carga viral.
virus X de la patata o papa
Denominación del virus Potato virus X (PVX), especie Potexvirus ecspotati, género Potexvirus y miembro tipo de la familia Alphaflexiviridae. Sus huéspedes o anfitriones son patata o papa, tabaco, tomate, pimiento y berenjena. En patata, el virus puede producir un mosaico internervial muy suave o ser asintomático. Ocasionalmente causa deformaciones, manchas cloróticas y enanismo. En general, se considera un virus leve para el cultivo de patata o papa, donde ocasiona pérdidas de cosecha del orden del 5-10 %. La infección mixta con el virus A de la patata (PVA) genera un síntoma más grave de mosaico rugoso. En tabaco y tomate produce también moteado necrótico, pudiendo causar, en casos de infecciones graves, manchas y anillos necróticos. El virus se transmite mecánicamente con facilidad y por contacto entre plantas debido a su alto título o carga viral en los tejidos vegetales. PVX está ampliamente distribuido en las zonas de cultivo de la patata de todo el mundo. Presente en España.
carga
Introducción de una muestra en un instrumento analítico para su análisis o sobre un gel o material de soporte similar, en una técnica electroforética o cromatográfica. También se aplica el término a la introducción de una cantidad de nutriente en un reactor y a la introducción de un líquido o medio de cultivo en un dispensador.