Diccionario

Cualquier conjunto de tres nucleótidos del ARNm que codifica un aminoácido o lleva otro tipo de mensaje.

Codón que codifica un aminoácido.

Aquellos que codifican aminoácidos distintos.

Aquellos que codifican el mismo aminoácido, como UUU y UUC, ambos para la fenilalanina.

Utilización preferencial de ciertos codones sinónimos. Este fenómeno, que ocurre en todos los tipos de organismos, resulta en un patrón de utilización de determinados codones para la codificación de aminoácidos en el ARNm, que es característico de cada organismo. Esto suele dar lugar a la traducción ineficiente de un ARNm en un sistema celular heterólogo, como el de un ARNm de un gen de mamífero en células de Escherichia coli, debido a que el ARNm contiene codones sinónimos cuyos ARNt son poco abundantes en el sistema celular en que se ha de traducir. Los codones sinónimos no se usan con igual frecuencia en todas las especies; por ejemplo, de entre los cuatro codones que codifican prolina, el codón CCA se utiliza solo un 4,1 % de las veces en el genoma de la bacteria Ralstonia solanacearum, pero un 17,2 % de las veces en el genoma de la bacteria Erwinia amylovora. El patrón de utilización de codones es crítico para determinar la expresión génica y las funciones celulares, al influir en diversos procesos como el procesamiento de ARN, y la traducción y plegamiento de proteínas.

El ácido o su forma ionizada, el aspartato es uno de los veinte aminoácidos que pueden componer las proteínas. En el ARN se encuentra codificado por los codones GAU o GAC.

El ácido glutámico o su forma ionizada, el glutamato; es uno de los veinte aminoácidos que intervienen en la composición de las proteínas y que en el ARN se encuentra codificado por los codones GAC, GAA.

Uno de los aminoácidos que forman las proteínas de los seres vivos. Es codificada por los codones GCU, GCC, GCA y GCG. Es el aminoácido más pequeño después de la glicina y se clasifica como hidrofóbico.

Sustancia química orgánica en cuya composición molecular entran un grupo amino (-NH2) y otro carboxilo (-COOH) en posición orto (Ó). Las proteínas están constituidas por hasta 20 aminoácidos (11 no esenciales para humanos: alanina, asparagina, arginina, ácido aspártico, ácido glutámico, cisteína, glicina, glutamina, prolina, serina y tirosina, y nueve esenciales: fenilalanina, histidina, isoleucina, leucina, lisina, metionina, treonina, triptófano y valina) que se combinan en proporción variable, denominados proteicos o proteinogénicos. Todos ellos tienen una configuración levo (L). Los 20 aminoácidos proteinogénicos están codificados genéticamente por los codones del código genético. Por ello, se denominan aminoácidos estándar o aminoácidos canónicos.

Uno de los 20 aminoácidos que se encuentran formando parte de las proteínas. Está codificado por los codones AGA, AGG, CGU, CGC, CGA, CGG.

Uno de los 22 aminoácidos codificados en el código genético y que forman proteínas. Tiene un grupo carboxamida como su cadena lateral o grupo funcional. Los codones que la codifican son AAU y AAC.

1. Mezcla de cebadores de composición nucleotídica similar. Cada cebador de la mezcla es un oligonucleótido compuesto de un número idéntico de nucleótidos y tiene una secuencia nucleotídica básica en común con el resto de los componentes de la misma, pero difiere en ciertas posiciones (conocidas en inglés como variable, degenerate o redundant positions). Tal mezcla es necesaria para amplificar una región genómica específica, cuya secuencia nucleotídica se ha deducido a partir de la secuencia de aminoácidos conocida de la proteína, pues un mismo aminoácido puede estar codificado por más de un triplete o codón (como es el caso de la fenilalanina y la tirosina que disponen de dos codones sinónimos, y de la isoleucina que dispone de tres, como ejemplos). 2. Por extensión, cualquiera de los cebadores individuales que componen la mezcla anterior.

α-aminoácido no esencial, lo que significa que puede ser sintetizado por los humanos. Forma parte de las proteínas. Los codones que la codifican son UGU y UGC.

Clave de la información contenida en los genes que expresa la correspondencia universal entre la secuencia de los ácidos nucleicos y la de las proteínas, y que constituye el fundamento de la transmisión de los caracteres hereditarios. Se denomina degenerado cuando más de un codón codifican el mismo aminoácido.

Proceso de eliminación de ARNm portadores de una mutación terminadora o de una mutación del marco de lectura, que derivan en la creación de codones de finalización precoz de la síntesis de una proteína. De no eliminarse estos ARNm, se producirían polipéptidos defectuosos (incompletos) al ser traducidos. Se trata de un fenómeno asociado a la ribointerferencia.

Relación de aminoácidos y sus correspondientes codones codificadores.

Uno de los 20 aminoácidos comunes que se encuentran en las proteínas. Es un aminoácido hidrofóbico y esencial para la especie humana. Se abrevia con los símbolos Leu y L, y es codificado por los codones UUU y UUC.

El aminoácido más pequeño, que forma parte de las proteínas de los seres vivos. En el código genético está representada por los codones GGU, GGC, GGA o GGG. Es el único aminoácido no quiral de los 20 aminoácidos.

Uno de los 20 aminoácidos comunes que se encuentran en las proteínas. Es un aminoácido hidrofílico (polar). Se abrevia con los símbolos Gln y Q, y es codificado por los codones CAA y CAG.

Uno de los 20 aminoácidos comunes que se encuentran en las proteínas. Es un aminoácido hidrofílico (polar) cargado positivamente a pH fisiológico y esencial para la especie humana. Se abrevia con los símbolos His y H, y es codificado por los codones CAU y CAC.

Uno de los 20 aminoácidos comunes que se encuentran en las proteínas. Es un aminoácido alifático hidrofóbico (no polar) y esencial para la especie humana. Se abrevia con los símbolos Ile e I, y es codificado por los codones AUU, AUC y AUA.

1. Proceso unidireccional por el que el ARNm se traduce y lleva a cabo la colocación sucesiva de aminoácidos en los lugares indicados por sus codones, para formar una cadena polipeptídica. 2. Interpretación del sentido y significado de un texto, valor numérico o colorimétrico, señal, gráfica o dato, generado por un aparato o instrumento de laboratorio. 3. Variante de una o más letras de una secuencia. 4. Disertación, exposición o discurso sobre un tema sorteado o previamente determinado.

Uno de los 20 aminoácidos comunes que se encuentran en las proteínas. Es un aminoácido alifático hidrofóbico y esencial para la especie humana. Se abrevia con los símbolos L y Leu, y es codificado por los codones UUA, UUG, CUU, CUC, CUA y CUG.

Segmento del ARNm no traducido, localizado entre el extremo 5´ y el primer codón. Puede contener señales reguladoras y sitios de unión al ribosoma.

Uno de los veinte aminoácidos comunes que se encuentran en las proteínas. Es un aminoácido básico y cargado positivamente a pH fisiológico; es esencial para la especie humana. Sus símbolos son Lys y K, y es codificado por los codones AAA y AAG.

1. Porción de una molécula de ADN que cuando se traduce a aminoácidos, no contiene codones de terminación. El código genético lee secuencias de ADN en grupos de tres pares de bases en dirección 5’-3’, esto significa que, en una molécula de ADN de doble hebra, hay seis posibles sentidos en los que pueden abrirse marcos de lectura, tres en una de las cadenas y tres en la otra cadena. Un marco abierto de lectura largo es probable que sea parte de un gen. 2. Secuencia de ARN comprendida entre un codón de inicio (AUG) de la traducción y un codón de terminación, descontando las secuencias que corresponden a los intrones, en caso de haberlas.

Selección de una de las tres posibles formas de traducir grupos de tres nucleótidos consecutivos (codones) en un ARNm; viene determinada por el codón de iniciación y el codón de terminación. Es abierto cuando la secuencia de nucleótidos no está interrumpida por un codón de terminación y codifica aminoácidos; es bloqueado cuando la secuencia no puede traducirse en proteínas por estar interrumpida por codones de terminación; es no asignado cuando se desconoce el fenotipo o función de la secuencia.

Uno de los veinte aminoácidos comunes que se encuentran en las proteínas. Es un aminoácido anfipático alifático y esencial para la especie humana. Se abrevia con los símbolos Met y M, y es codificado por el codón AUG.

La sin sentido que da lugar al codón de terminación ámbar (UAG).

La que ocurre en el anticodón de ARNt y cambia su capacidad de reconocimiento de un codón a otro, sin variar la especificidad del aminoácido que transporta.

Tipo de mutación en la que está alterado un solo codón, de manera que codifica para un aminoácido diferente.

Adición o deleción de un nucleótido en una hebra de ADN en formación (lo cual puede deberse a la presencia de sustancias intercalares que actúan como mutágenos en la hebra que sirve de plantilla, como los colorantes de acridina) que redunda en un cambio del marco de lectura; normalmente da lugar a una terminación prematura de la traducción. Por consiguiente, el ARNm transcrito a partir del alelo mutado (con un nucleótido de más o de menos) será leído sin problemas hasta el punto de inserción o sustracción del nucleótido, pero a partir de allí, como el marco de lectura es diferente, los codones cobrarán otro significado, se incorporarán otros aminoácidos en la proteína o aparecerán codones de terminación prematura de la síntesis de esa proteína, según definición de G. Claros et al. (2003).

Las que están localizadas en un gen distinto del gen en el que se produjo la mutación primaria (tal sería el caso si, por ejemplo, ocurriera una mutación en el anticodón del ARNt correspondiente a un codón mutado del ARNm, de modo que ahora el ARNt es capaz de leer ese codón e insertar un aminoácido de función equivalente en la proteína que confiere el fenotipo).

La que da lugar a la sustitución de un nucleótido en un codón, de manera que cambia el aminoácido especificado o se genera un codón de parada.

La sin sentido que da lugar al codón ocre (UAA).

La sin sentido que da lugar al codón ópalo (UGA).

Cambio de una base por otra en un triplete de nucleótidos o codón, que deriva en la codificación de un aminoácido distinto o en la creación de un codón de terminación prematura de la síntesis de una proteína (codón sin sentido, que no codifica ningún aminoácido y da lugar a la finalización de la cadena polipeptídica, que suelen ser los codones ámbar-UAG, ocre-UAA, u ópalo-UGA). También la mutación puntual es un cambio en un solo nucleótido, o en un reducido número de nucleótidos. Pueden ser silenciosas, polimorfismos, de sentido erróneo, sin sentido, inserción, deleción, duplicación, de cambio de marco de lectura, de expansión por repetición, y de otros tipos.

La que ocasiona la alteración de un codón, pero que no da lugar a un cambio de aminoácido en esa posición de la proteína debido a la degeneración del código genético. En el código estándar, solo metionina y triptófano son codificados por un único codón cada uno, mientras que el resto de aminoácidos son codificados por dos a cuatro codones que difieren en la tercera posición del codón, aunque arginina y serina son codificados por dos codones adicionales, suponiendo un total de seis codones para cada uno de estos dos aminoácidos.

La que convierte un codón especificador de un aminoácido en un codón de paro en la secuencia del ARNm de un gen, con lo que se termina prematuramente la cadena polipeptídica que se codificaba. Un cambio de marco de lectura puede conllevar asimismo la aparición de un codón de terminación.

Producto formado por la traducción de un ARN mensajero cuando uno de sus codones de terminación se lee mal o es reconocido por un ARN transferente (ARNt) supresor. En algunos virus, como en los miembros del género Luteovirus se encuentra codificada en su genoma y juega un papel importante en su transmisión circulativa por pulgones. El ARN 3 del Potato mop-top virus (PMTV), familia Virgaviridae, género Pomovirus, agente causal de la enfermedad mop-top de la patata o papa, codifica la proteína de cubierta o cápsida (CP) de 20 kDa y una proteína de lectura abierta más grande de 67 kDa, que se expresa mediante la supresión del codón de parada ámbar que termina el gen de la proteína de cubierta. PMTV es transmitido por el plasmodiofórido Spongospora subterranea f. sp. subterranea.

Uno de los 20 aminoácidos componentes de las proteínas; está codificado por los codones UCU, UCC, UCA, UCG, AGU y AGC.

Uno de los 20 aminoácidos comunes que se encuentran en las proteínas. Tiene carga neutra y, aunque puede considerarse un aminoácido apolar (hidrofóbico) debido a que posee un anillo aromático, a menudo se considera que es polar (hidrofílico) por poseer un grupo hidroxilo. Se utiliza, en ocasiones, como fuente de nitrógeno en medios de cultivo microbiológico y de cultivo de plantas in vitro. Está codificado por los codones UAC y UAU en el ARN mensajero.

Uno de los 20 aminoácidos comunes que se encuentran en las proteínas. Es un aminoácido polar (hidrofílico) sin carga y esencial para la especie humana. Símbolos T y Thr; es codificado por los codones ACA, ACC, ACG y ACU.

Uno de los 20 aminoácidos comunes que se encuentran en las proteínas. Es un aminoácido aromático y apolar (hidrofóbico); es esencial para la especie humana. Símbolos Trp y W. Es uno de los dos aminoácidos, junto con la metionina, codificado por un único codón, en este caso UGG.

Codón que no codifica ningún aminoácido y da lugar a la finalización de la cadena polipeptídica. Se le denomina codón de terminación ocre.

Codón que no codifica ningún aminoácido y da lugar a la finalización de la cadena polipeptídica. Se le denomina codón de terminación ámbar.

Codón que no codifica ningún aminoácido y da lugar a la finalización de la cadena polipeptídica. Se le denomina codón de terminación ópalo.