Diccionario

1. Acción y efecto de curar o curarse una planta. 2. A veces, se utiliza erróneamente para designar la edición informática de una anotación. Sin: depuración, edición genética, editor, revisión, revisor, anotación.

1. Anotación y efecto de anotar. 2. Actividad de anotar genomas, proteomas y transcriptomas. Descripción de la localización precisa, el tamaño y la función (o las funciones) de las secuencias de nucleótidos (genes, regiones reguladoras y otros elementos) de un genoma (ADN o ARN) o de las secuencias de aminoácidos de una proteína, y asignación de una función biológica probable a dichas secuencias por comparación con otras secuencias homólogas descritas en los bancos de datos. Esta tarea supone, además, un trabajo de edición informática, así como la inclusión de cualquier otra información pertinente sobre la secuencia descrita.

Molécula generalmente circular de ADN de doble cadena que se replica autónomamente y se encuentra situada extracromosómicamente en los procariotas. Aunque la gran mayoría de plásmidos son circulares, se han identificado plásmidos lineales en bacterias de varios géneros, como Rhodococcus, Salmonella, o Streptomyces. Una de sus principales características es la de no ser esenciales para el normal desarrollo del organismo que los posee, aunque en ocasiones puede permitir que el organismo se desarrolle en un ambiente hostil. Debido a que son mantenidos establemente en muy diversas condiciones, se asume que confieren alguna ventaja selectiva al portador. De hecho, muchos plásmidos codifican importantes funciones en bacterias fitopatógenas. Las bacterias fitopatógenas pueden contener plásmidos o no; cuando los portan, su número es variable, de uno a seis tipos diferentes de plásmidos o más. Generalmente están en un número de copia medio o bajo, desde 6-9 copias en cepas de Pseudomonas syringae hasta 10 o más copias en ciertas cepas de especies de Pectobacterium. El tamaño es también muy variable, desde aproximadamente 1 kb hasta más de 2 Mb. Aunque no hay una relación estricta entre el tamaño de los plásmidos y la especie fitopatógena, los plásmidos más grandes suelen encontrarse en cepas de Agrobacterium, Rhizobium y Ralstonia. Pueden ser nativos, crípticos, movilizables o conjugativos (véanse estos términos). Pueden ser eliminados de la célula bacteriana (véase curación de plásmidos). Véase plásmido nativo. Sin: episoma.

Tratamiento por diversos métodos, generalmente por sucesivos subcultivos, gradiente de temperatura, o ciertas sustancias que interfieran con la replicación de los plásmidos, con la finalidad de eliminarlos de la célula bacteriana. Uno de los métodos más usuales para plásmidos no nativos es la realización de sucesivos subcultivos de la cepa portadora del plásmido en un medio de cultivo sin los marcadores de resistencia codificados por dicho plásmido. Sin: curación de plásmidos.