Diccionario

1. Muestra, modelo, ejemplar, normalmente con las características de su especie muy bien definidas. 2. Todo material biológico o muestra ambiental sometido a examen, estudio o análisis. Analíticamente equivalente a muestra.

Aquel representativo de una población de un organismo específico que se conserva como modelo y se mantiene accesible en colección para fines de identificación, verificación o comparación con otros, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

Procedimiento y documentación que dan cuenta de la integridad de un espécimen o muestra oficial en el laboratorio al registrar la trayectoria de su manejo y almacenamiento desde el momento en que se toma, deposita o ingresa en el laboratorio, hasta su análisis y disposición final.

Genoteca o base de datos de referencia de códigos de barras de ADN que puede ser utilizada para asignar identidades de especímenes desconocidos. Se trata de un repositorio de búsqueda de registros de códigos de barras, almacenamiento de datos de especímenes e imágenes, así como secuencias y archivos de seguimiento. En definitiva, una herramienta de identificación basada en la genoteca de código de barras actual que supervisa el número de registros de secuencias de código de barras y la cobertura de especies.

1. Sistema que consiste en analizar las mismas muestras por diferentes laboratorios y comparar los resultados. Se pueden perseguir tres objetivos diferentes: i) validar un método analítico o prueba y determinar la incertidumbre de los resultados, mediante la determinación de las desviaciones estándar de repetibilidad y reproducibilidad; ii) determinar las características de un producto, muestra, patógeno o espécimen de un vector, destinado a ser utilizado como material de referencia; y iii) evaluar la confiabilidad de los resultados de las pruebas de los laboratorios participantes, a modo de prueba de aptitud. 2. Organización, realización y la evaluación de mediciones, pruebas o ensayos por dos o más laboratorios u organismos de inspección de acuerdo con condiciones predeterminadas, según ISO/IEC 17043: 2010 de acuerdo con la terminología de la OEPP/EPPO.

Especímenes utilizados para determinar la validez de la calibración, es decir, la linealidad y estabilidad de un ensayo cuantitativo o de una determinación cuantitativa a lo largo del tiempo. Los controles se preparan a partir del material de referencia (separadamente de los calibradores, es decir, se pesan o miden por separado), que se adquiere o se obtiene de una reserva de especímenes ya analizados. Siempre que sea posible, los controles deberán prepararse con las mismas matrices que los especímenes y los calibradores.

Lámina delgada transparente, de cristal, vidrio o plástico, que se coloca sobre una preparación microscópica para protegerla y facilitar su observación. Son de tamaños estándar de 22×22 mm, 20×30 mm, 20×40 mm, etc., y grosor designado #1 (0,13-0,17 mm), #1½ (0,16-0,19 mm) o #2 (0,17-0,25 mm). La mayoría de los objetivos de los microscopios están corregidos ópticamente para un grosor único, generalmente 0,17 mm o #1½. El grosor del cubreobjetos está estampado sobre los objetivos bien como «17» o «0,17». Para microscopios confocales el grosor del cubreobjetos debería ser de 0,17 mm. El cubreobjetos está pegado al espécimen o muestra con un cemento soluble en agua, alcohol, o xileno, teniendo un índice de refracción próximo al del cristal del mismo (1,515). Existe una gran diversidad de medios o adhesivos de montaje comerciales.

Embudo metálico en cuyo extremo superior hay una fuente luminosa y en su parte terminal un frasco colector de especímenes. Existen de varios tamaños. La distancia de la lámpara de luz a la muestra de suelo u hojarasca debe ser de 15 cm. Se utilizan para la captura de artrópodos de la fauna del suelo o captura de vectores de hábito edáfico.

1. Fecha después de la cual las características especificadas de un reactivo, solución, espécimen, control, etc. no pueden seguir garantizándose. Determina la fecha útil de un producto o kit. Existen leyes nacionales y de la Unión Europea que marcan las principales pautas, pero la determinación de la fecha final la realizan los propios fabricantes, o en su caso, las empresas distribuidoras. Suele depender de las condiciones de almacenamiento recomendadas. 2. Aquella que se emplea en alimentos microbiológicamente perecederos, superada la cual su consumo puede suponer un peligro para la salud.

Espécimen (cepa o aislado) utilizado como modelo o ejemplo tipo, en la que se basa la descripción y nomenclatura de una nueva especie o variedad por su autor en el momento que publica la descripción original. Puede ser, con frecuencia, un ejemplar físico único (fotografía o ilustración) de un organismo, que se sabe que se usó cuando se describió formalmente la especie (o taxón de menor rango). En ocasiones es el único ejemplar físico (o fotografía o ilustración del mismo) o uno de varios, pero explícitamente designado como holotipo.

1. Espécimen identificado por el autor como típico de su especie. 2. La forma antigénica total o capacidad de reconocimiento asociada con un paratopo de inmunoglobulina o región hipervariable. Es una característica compartida entre un grupo de moléculas de inmunoglobulina o receptor de células T, basado en la especificidad de unión al antígeno (región hipervariable).

Espécimen del sexo opuesto a un holotipo o lectotipo, seleccionado después de la publicación original del nombre del material original.

Espécimen designado como especie tipo de una especie particular. Generalmente es seleccionado a partir de material original para servir como tipo nomenclatural cuando no fue asignado un holotipo con la publicación o por pérdida. El lectotipo se debe elegir entre los isotipos, si no existen isotipos se debe elegir entre los sintipos, si tampoco los hay, se elige un neotipo.

Comprende microorganismos patogénicos y no patogénicos, proteínas y ácidos nucleicos, así como todo material de origen biológico que pueda contener microorganismos, proteínas y ácidos nucleicos o partes de ellos. Incluye, pero no se limita a: bacterias, virus, viroides, hongos, oomicetos, algas, nematodos, artrópodos, priones, toxinas, organismos genéticamente modificados, ácidos nucleicos, muestras de tejidos, especímenes para diagnóstico, y aislamientos de un patógeno, como cultivo, suspensión, o esporas purificadas.

Aquel apropiado para servir como control para la prueba o el diagnóstico que se está realizando. Frecuentemente se utilizan cultivos puros de patógenos vivos o liofilizados, pero también puede ser considerado como material de referencia otro material, como muestras de plantas infectadas, preparaciones de ácidos nucleicos, imágenes de calidad diagnóstica o especímenes montados, ya sean de insectos o de esporas de hongos o cultivos in vitro. El material suministrado debe estar documentado y ser apropiado para la prueba o test y el diagnóstico que se realiza. Debe asegurarse que el material utilizado posee las características para las cuales fue seleccionado, como expresar un antígeno deseado para su uso en diagnóstico serológico, o mostrar características físicas específicas, como esporulación si se usa para diagnóstico morfológico, etc. Los materiales de referencia deben disponer de un registro técnico (por ejemplo, ficha de datos) que recoja los datos de interés para asegurar una correcta gestión, donde, al menos, debe constar: productor, origen, identidad/valor asignado, presentación, condiciones de conservación, fecha de preparación, fecha de caducidad/uso recomendada, uso previsto, e identificación de las instrucciones de uso.

En microscopía, aquel utilizado para rellenar la muestra o espécimen entre el portaobjetos (en la cual ya está fijada) y el cubreobjetos. Su misión es proteger la muestra o especialmente la delicada sección de tejidos, y suministrar un campo óptico claro. Existe una amplia gama disponible comercialmente, entre los más frecuentemente utilizados, están: Bálsamo del Canadá (actualmente en desuso debido a su alto coste y que se endurece y amarillea con los años), Permout (idóneo por su versatilidad), Merkoglass-EM Glass (apropiado en general y muy utilizado para tinciones con azul nitrotetrazolio-NBT), BioMount (muy utilizado para reacciones con anticuerpos marcados con oro coloidal), Euparal (útil si el tejido, la tinción o la matriz no toleran el xileno, usual en muchas técnicas de inmunolocalización), Gel/Mount (útil en inmunolocalización fluorescente o criosección en fresco), gelatina de glicerina, medio de goma arábiga y glicerol/PBS (muy comunes para muestras frescas), Vaspar (mezcla de vaselina y parafina fundida 1:1) y barniz pintauñas, utilizados estos dos últimos para sellar los bordes de cubreobjetos y evitar evaporación.

Instrumento basado en una modificación del sistema de microscopía de campo claro. Utiliza un enfoque de luz en forma de cono que atraviesa la muestra, la cual al estar colocada sobre un fondo oscuro se hace visible al dispersar la luz. Permite la utilización de rayos de luz para percibir en la muestra analizada las partes transparentes y las sólidas que interese estudiar. Al usar un microscopio de campo oscuro con luz polarizada se puede estudiar cualquier espécimen biológico transparente e invisible en los de iluminación común.

Espécimen (cepa, cultivo) seleccionado como el tipo nomenclatural de un taxón cuando todo el material original está perdido, es irrecuperable o se ha destruido.

1. Lente o sistema de lentes de los instrumentos ópticos, colocado en la parte que se dirige hacia el espécimen a observar. Es el elemento más importante y complejo de la lupa binocular y del microscopio óptico, porque es donde se produce la mayor parte del aumento aportado por los mismos. Recoge la luz que atraviesa la sección de tejido o muestra. Normalmente es un cilindro que contiene una o más lentes de vidrio de alta calidad y precisión, cuya función es captar la luz procedente de la muestra. En el microscopio óptico existen dos tipos básicos: objetivo seco y objetivo de inmersión, que se diferencian en función del medio situado entre la muestra y la lente del objetivo, pero los cuatro tipos clásicos son en función del aumento: i) objetivo de barrido (4x) que aumenta 40 veces; ii) objetivo de baja potencia (10x) que aumenta 100 veces; iii) objetivo de alta potencia (40x) que aumenta 400 veces; y iv) objetivo de inmersión en aceite (100x). 2. En un sistema de gestión de la calidad, resultado a lograr. Puede ser estratégico, táctico u operativo. La organización establece los objetivos de la calidad de forma coherente con la política de la calidad, para lograr resultados específicos. Véase; objetivo seco; objetivo de inmersión.

Aquel de un microscopio óptico en el que no hay ningún medio o compuesto entre la muestra o espécimen y el objetivo aparte del aire. Son apropiados para observar especímenes o muestras a un máximo de 400 aumentos.

1. Materia o asunto de que se ocupa una ciencia o estudio. 2. Muestra o espécimen sometido a estudio y observación microscópica. 3. En un sistema de gestión de la calidad.

Cada espécimen (cepa, aislado) que no sea el holotipo, isotipo o isotipos, en el que se basa la descripción de una nueva especie u otro grupo taxonómico.

Plataforma que puede analizar hasta 100.000 muestras diarias, habitual en la industria farmacéutica o biotecnológica, y que ofrece posibilidades muy interesantes en Fitopatología y Sanidad Vegetal. Para aprovecharlas son necesarios diseños compatibles con las necesidades de análisis de decenas de miles de muestras o especímenes de insectos, o sustratos complejos con artrópodos fitófagos y agentes patógenos junto a organismos saprofitos o beneficiosos. Asimismo, son factores limitantes y críticos el manejo robotizado de muestras y el procesado de la información mediante bases de datos de elevada fiabilidad. Pero, además, la interpretación de los resultados requiere gran experiencia y pericia, tanto en el manejo de secuencias como en Fitopatología y en Taxonomía, así como en técnicas convencionales de identificación. Los requisitos para su validación serán muy complejos y se requerirán nuevas inversiones en infraestructuras y expertos bioinformáticos para el análisis y almacenamiento de datos. Todo ello requerirá colaboraciones internacionales y coordinación para establecer nuevos protocolos, controles, métodos de validación y bancos de datos comunes, para utilizar rutinariamente este tipo de plataformas.

Pieza delgada y plana de vidrio, generalmente de 76 por 26 mm y aproximadamente 1 mm de grosor, que se usa para sostener objetos, muestras o especímenes para examinarlos con un microscopio. Sirve para fijar la muestra, incluso para realizar tinciones o desarrollar secuencialmente sobre el mismo diferentes etapas de métodos y evitar que se mueva fuera del alcance de la observación. Los bordes estándar son rectos y pulidos para seguridad en la manipulación. Las esquinas pueden ser rectas o redondeadas. Pueden disponer de un área rugosa para facilitar la escritura con lápiz o marcador graso. Existen comercialmente tipos desengrasados estándar (cleaned), ultradesengrasados o ultralimpios (super cleaned or chemically cleaned), libres de nucleasas (DNase/RNase free) e incluso con tratamiento hidrofílico o hidrofóbico, marcados con códigos de colores, con recubrimiento especial adhesivo (poli-L-lisina, silano, etc.) para mejorar la adherencia celular o con cámara incorporada para observaciones líquidas o apreciar movilidad. También existen versiones de plástico, para laboratorios escolares donde se prioriza la seguridad.

Todo lo relacionado con una especie, género u otro nombre dado por un(os) autor(es) en su primera publicación, como resultado de un diagnóstico, descripción, datos geográficos, sinonimia, cita de especímenes, discusión, comentarios, ilustraciones o referencias.

Cada uno de los especímenes (cepas, cultivos) de igual rango nomenclatural, citados originalmente por el autor que no designó el holotipo o que enumeró simultáneamente varios ejemplares como tipos.

1. Acción y efecto de tipificar u operación de ajustar varias cosas semejantes a un tipo o norma común, conforme al espécimen tipo a partir del cual se ha perfilado la descripción que justifica el nombre y que se conserva permanentemente en alguna institución (museo de historia natural, herbario, centro de investigación, laboratorio de referencia, etc.), perfectamente conservado, identificado y localizable. 2. Clasificación en tipos o clases de diferentes organismos, con base fenotípica, serológica y genética. Para tipificar diferentes agentes patógenos del mismo grupo, se han empleado distintas técnicas: gama de huéspedes o anfitriones, patogenicidad, agresividad, o características serológicas y moleculares. Como ejemplo los tipos del virus de la sharka de frutales de hueso o carozo (Potyvirus plumpoxi, Plum pox virus-PPV) en el que se han descrito actualmente 10 (siendo los preponderantes PPV D-Dideron, PPV M-Marcus, y PPV Rec-recombinante entre D y M). 3. (grading). Calificación de los productos de laboratorio en clases, grados o categorías comerciales, generalmente definidas en normas de calidad y en protocolos de análisis.

1. Modelo, ejemplar. 2. En nomenclatura, espécimen o especímenes en los que se basa el nombre de un grupo taxonómico (taxón). 3. Cada uno de los grandes grupos taxonómicos en que se dividen los reinos animal y vegetal, y que, a su vez, se subdividen en clases. 4. Ejemplar que sirve de base para el nombre de una categoría taxonómica, como un espécimen es el tipo de una especie.

1. Sinónimo absoluto. 2. Nombre posterior dado al espécimen tipo. 3. Un nombre que tiene el mismo tipo que otro nombre que no es ni su basónimo ni un sinónimo.

Espécimen utilizado para preparar una ilustración en la que es el tipo.

Artificio que básicamente consta de una hélice, movida por un motor conectado a una fuente de energía (generalmente eléctrica), que aspira el aire a través de una malla horizontal y de otra troncocónica invertida, entre las que se dispone un recipiente donde caen los artrópodos succionados. Todo ello está contenido en un armazón dotado de una portezuela para recoger el recipiente y poner otro nuevo. Este sistema admite variantes como la torre de succión, que consiste en la colocación de una chimenea sobre la boca superior (para capturar los pulgones que vuelan a alturas mayores), o la inclusión de una base giratoria (según un reloj temporizador) con varios recipientes (para medir las capturas de distintos intervalos de tiempo). Este tipo de trampas se ha utilizado en redes internacionales que registran el movimiento de determinadas especies de pulgones de interés agrícola, en varios países, para avisar de posibles invasiones, aunque tienen el inconveniente de su dependencia de la fuente de energía. Existen sistemas manuales a base de aspiradores portátiles aptos para inspeccionar entre hojas de un árbol o en malas hierbas, y muy utilizados para psílidos. Los especímenes capturados tras su identificación y conservación en alcohol etílico del 70 % pueden ser analizados para conocer si son portadores o no de patógenos y estimar su porcentaje en la población.

Parte (subconjunto de elementos de una población estadística) que se toma de un conjunto, como representación del mismo. Como toda información diagnóstica depende de la muestra tomada, esta debe ser idónea para el tipo de análisis a realizar y patógeno a detectar. Por ello, debe ser tomada cuidadosamente siguiendo el protocolo adecuado y remitida con rapidez y en las condiciones más adecuadas para su análisis. Asimismo, las muestras de organismos nocivos deben ser eliminadas mediante los procedimientos adecuados que impidan la diseminación de los mismos.