Diccionario

Conjunto de genes y secuencias de ADN de una bacteria. El elemento obligatorio del genoma es el cromosoma, aunque es frecuente encontrar además unidades de replicación autónomas llamadas plásmidos, que son dispensables, es decir si se pierden, la bacteria sigue siendo viable.

Denominación común del ciclo de multiplicación de un fago en el que su genoma está insertado en el genoma de la bacteria huésped o anfitriona y en el que la mayoría de genes del fago están inactivados (reprimidos); de esta manera, el fago se replica pasivamente con el genoma de la bacteria sin producir la lisis de la misma. Este ciclo conlleva la activación de la síntesis de un represor de la transcripción de los genes del virus, con el fin de evitar la entrada en el ciclo lítico y provocar la lisis de la bacteria. El represor inhibe la síntesis de los productos de otros genes y regula su propia síntesis, de manera que la concentración de represor controla la tasa de síntesis de su propio ARN mensajero. Los fagos que pueden seguir un ciclo lisogénico se denominan fagos lisogénicos o fagos temperados. Al genoma del fago que ha entrado en el ciclo lisogénico se le denomina profago. El ciclo lisogénico puede mantenerse durante muchas generaciones de la bacteria; sin embargo, el profago puede escindirse del genoma bacteriano e iniciar un ciclo lítico en respuesta a diversas condiciones ambientales que podrían poner en peligro la vida de la bacteria, como la exposición a luz UV u otros estreses. Debido a mutaciones u otras razones, algunos profagos pierden la capacidad de entrar en el ciclo lítico y quedan fijados en el genoma bacteriano. En algunas especies de bacteriófagos, el profago no se inserta en el genoma del huésped o anfitrión, sino que se replica como una molécula lineal o circular libre en el citoplasma, como el fago P1 de Escherichia coli.

Sigla del inglés. En español, análisis de polimorfismos de múltiples locus con número variable de repeticiones en tándem. Método molecular para identificar la variabilidad intraespecífica de bacterias, incluso a nivel de patovar. Las repeticiones en tándem son secuencias cortas de ADN altamente variables y repetidas un número variable de veces en el genoma bacteriano. El análisis de múltiples regiones VNTR, se denomina MLVA y permite el análisis de la variación de la secuencia en ciertas regiones del genoma. Es un método muy adecuado para estudios epidemiológicos de bacterias a largo y corto plazo. Se trata de un método específico, rápido, de fácil ejecución y bajo costo. Actualmente la posibilidad de secuenciar genomas completos a un precio razonable ha hecho decaer su uso.

Aquellas de secuencias cortas de ADN altamente variables y repetidas un número variable de veces en el genoma bacteriano.

Sigla del inglés. En español, número variable de repeticiones en tándem Las repeticiones en tándem son secuencias cortas de ADN altamente variables y repetidas un número variable de veces en el genoma bacteriano. Tienen de 21 a 47 pb y están separadas por fragmentos de secuencias no repetidas del mismo tamaño. Son altamente inestables, pudiendo presentar variabilidad en el número de unidades de cada repetición, designándose su análisis como VNTR y debido a su polimorfismo, se han utilizado como marcadores para la tipificación de especies bacterianas, pero también de otros tipos de organismos, incluyendo virus y hongos. La utilización de cebadores de PCR que delimiten la región de repetición permite visualizar el polimorfismo en el número de unidades repetidas mediante electroforesis, calculando el número de repeticiones según el tamaño de las secuencias amplificadas.