Diccionario

Enzima que cataliza la condensación de dos moléculas, acoplada a la rotura de un nucleósido trifosfato (ATP, GTP, UTP, etc.). Es uno de los grupos principales utilizados en la clasificación de las enzimas, en: i) formadoras de enlaces C-O; ii) formadoras de enlaces C-S; iii) formadoras de enlaces C-N; y iv) formadoras de enlaces C-C.

Enzima que cataliza la formación de enlaces fosfodiéster entre los extremos 3’-OH y 5’-P de fragmentos de ADN. Restablece el enlace fosfodiéster roto (muesca) en una hebra de ADN bicatenario (ADNbc) y a veces, en una hebra de ARN.

Característica estructural de algunos viroides que poseen una estructura secundaría de minima energía libre, altamente ramificada del ARN genómico. Dentro de los viroides secuenciados, los viroides de la mancha solar del aguacate (Avocado sunblotch viroid-ASBVd), mosaico latente del melocotonero o duraznero (Peach latent mosaic viroid-PLMVd) y moteado clorótico del crisantemo (Chrysanthemum chlorotic mottle viroid, CChMVd), pueden formar estructuras de cabeza de martillo en sus dos cadenas de polaridad. La presencia de determinadas mutaciones compensatorias en diferentes variantes de secuencia del CChMVd es consistente con que este viroide adopta una estructura ramificada in vivo muy similar a la obtenida in silico. Estas ribozimas median la autoescisión de los ARN oligoméricos generados en la replicación a través de un mecanismo de círculo rodante, cuyos otros dos pasos son catalizados por una ARN polimerasa y una ARN ligasa. ASBVd, y presumiblemente PLMVd y CChMVd, se replican y acumulan en el cloroplasto.

Sistema de replicación de viroides. A causa de su incapacidad para codificar proteínas propias, los viroides deben activar alguna ARN polimerasa celular preexistente que catalice la amplificación de sus cadenas, en contraste con los virus, que codifican en sus genomas componentes de la enzima que los replica. La naturaleza circular de los ARN viroidales y la presencia en tejidos infectados de cadenas de longitud mayor que la unitaria, sugirió que su replicación transcurre por un mecanismo de círculo rodante en el que la molécula circular (+) (se asigna arbitrariamente esta polaridad a la especie infecciosa más abundante) sirve de molde para que, sobre ella, se sinteticen por transcripción reiterativa cadenas oligoméricas de polaridad complementaria (-). Estos ARNs oligoméricos (-) sirven a su vez de molde para la síntesis de oligómeros (+), que a continuación son cortados en segmentos de longitud unitaria por una ARNasa y finalmente circularizados por una ARN ligasa, generando así la misma especie molecular que inició el ciclo. Un mecanismo similar de círculo rodante se utiliza durante la replicación de diversos virus, como el fago lambda, y algunos plásmidos, y durante la transposición de diversos elementos transponibles.

Variante de PCR que permite realizar una amplificación de las regiones flanqueantes de un fragmento de ADN del que solo se conoce parte de su secuencia interna. El ADN genómico que contiene la secuencia nucleotídica flanqueada (en inglés, core region) se digiere por completo con una enzima de restricción que lo escinde en una serie de fragmentos dejando intacta dicha secuencia y las lindantes. Originalmente estos fragmentos no podían exceder de dos o tres kilobases de extensión. Los fragmentos lineales se circularizan (transforman en círculos) con una ADN-ligasa en condiciones que favorecen la formación de círculos monoméricos (compuestos de un solo fragmento y no de varios fragmentos concatenados) y se amplifican con dos iniciadores que son complementarios de sendos extremos de la secuencia conocida, pero cuyos extremos 3’ apuntan hacia fuera de la región comprendida por ambos, a la inversa de lo que sucede en la PCR simple normal, de modo que lo que se amplifica son las secuencias flanqueantes (y no la flanqueada). El producto de esta reacción en cadena será, pues, una molécula lineal de ADN bicatenario constituida por ambas secuencias flanqueantes dispuestas una a continuación de la otra, según el Vocabulario inglés-español de María V. Saladrigas, de página electrónica: www.medtrad.org/panacea.html.

Proceso enzimático catalizado por ligasas y polimerasas, entre otras proteínas, que tiende a reducir el daño producido en el ADN por diversas causas. Los daños en el ADN pueden generar cambios en la expresión de genes o en el crecimiento celular, atribuidos a diversos procesos metabólicos endógenos, que producen radicales libres de oxígeno y nitrógeno altamente reactivos, que alteran bases y atacan directamente al ADN. Además, ciertos agentes genotóxicos exógenos, tales como la luz ultravioleta y otros tipos de radiación (X, γ, rayos cósmicos), aminas aromáticas, hidrocarburo de arilo, cloruro de vinilo y ciertos metales, generan directa o indirectamente, daños en la molécula de ADN.

1. Organismo vivo (insecto, ácaro, hongo, planta parásita, nematodo, ave, animal superior mamífero, incluyendo a la especie humana) capaz de portar (pasivamente o no) inóculo primario o secundario de un organismo patógeno, transmitir un patógeno de plantas (virus, viroide, satélite, bacteria, hongo, oomiceto, nematodo, alga o planta parásita) y diseminar una enfermedad. La gran mayoría de virus (72 %) precisan de un vector para colonizar nuevos huéspedes. Estos son fundamentalmente hemípteros (el mayor número de especies con capacidad de ser vectores de virus, especialmente pulgones y moscas blancas), seguido de coleópteros, ortópteros, tisanópteros, lepidópteros, dípteros y dermápteros, hongos de los géneros Olpidium, Polymyxa, Spongospora, o ácaros y nematodos principalmente de los géneros Xiphinema, Longidorus, Trichodorus y Paratrichodorus. Las bacterias limitadas a floema (como numerosos fitoplasmas o ´Ca. Liberibacter´ spp.) o limitadas a xilema (como Xylella fastidiosa), también precisan de vectores para su transmisión natural, que frecuentemente son psilas para las de floema y cidadélidos o cercópidos para las de xilema. En general, se considera vector a cualquier medio biológico utilizado, pasiva o activamente, por un patógeno para su diseminación natural. 2. (vector, transformation vector, cloning vehicle, plant cloning vehicle). Molécula de ADN autorreplicante, como un plásmido pequeño, virus o bacteriófago (replicones por sí solos), que se utiliza para introducir un fragmento de ADN heterólogo en una célula anfitriona o para transformar células por manipulación genética. Los vectores artificiales se construyen cortando y uniendo moléculas de ADN de diferentes fuentes utilizando enzimas de restricción y ligasas.