Diccionario

Ciencia que pretende incrementar la productividad, la resistencia al medioambiente y a las plagas y enfermedades presentes, y generar una mejor adaptación de los microorganismos o de las especies animales domésticas o los vegetales cultivados, e incrementar su potencial bioprotector y la calidad de sus productos, por medio de modificaciones del genotipo de los individuos. En los últimos años se han desarrollado una gran variedad de técnicas de mejora genética basadas en los avances en biotecnología, biología molecular y secuenciación de genomas que se conocen comúnmente por sus siglas en inglés, NBT (New Breeding Techniques) o NGT (Novel Genomic Techniques). Entre sus diferentes aplicaciones se encuentra la selección e introducción de caracteres deseables en animales, plantas y microorganismos para la producción de alimentos, piensos o control de enfermedades. Una de las tecnologías más conocidas dentro de este grupo es la edición genética que permite una modificación del genoma de forma dirigida y específica, permitiendo mutaciones selectivas de uno o varios genes o su modificación o sustitución.

Sigla del francés Centre International de Hautes Études Agronomiques Mediterranéennes. En español, Centro Internacional de Estudios Agronómicos Mediterráneos Avanzados. Es una Organización intergubernamental fundada en 1962 para promover la cooperación multilateral en agricultura, alimentación, pesca y territorios rurales, entre los Estados Miembros de la Unión Europea y los actores del sector de la agroalimentación. Posee escuelas de estudios superiores posgrado, denominados Institutos Agronómicos Mediterráneos, en Bari-IAMB (Italia) especializado en agricultura sostenible y protección de cultivos, Chania-IAMCh (Grecia) centrado en calidad alimentaria y productos naturales, mejora genética y biotecnológica de la horticultura, geoinformación y manejo del medio ambiente y agricultura sostenible, Montpellier-IAMM (Francia), especializado en economía agraria, agroingeniería, economía y desarrollo y Zaragoza-IAMZ (España) dedicado especialmente a medioambiente, pesca y acuicultura, producción animal, producción vegetal y ciencia, tecnología y márketing o mercadotecnia de alimentos. Todos ellos suelen organizar cursos y encuentros en los que predominan temas de interés y actualidad sobre la Protección y Sanidad Vegetal.

Siglas del Consejo Superior de Investigaciones Científicas, agencia estatal española para la investigación científica y el desarrollo tecnológico, con personalidad jurídica diferenciada, patrimonio y tesorería propios, autonomía funcional y de gestión, plena capacidad jurídica de obrar y de duración indefinida. Fundado en 1939, es la primera institución de investigación pública española y la séptima institución pública mundial. En marzo de 2021 se integraron tres organismos públicos de investigación (OPIs) en el CSIC: el Instituto Español de Oceanografía (IEO), el Instituto Geológico y Minero de España (IGME) y el Instituto Nacional de Investigación Agraria y Alimentaria (INIA), incrementando substancialmente su masa crítica en Fitopatología y Mejora genética de plantas. Actualmente el CSIC cuenta con 121 institutos de investigación distribuidos por todo el territorio nacional, a excepción de la Escuela Española de Historia y Arqueología de Roma (Italia), de los cuales 69 son de titularidad propia, 50 mixtos y dos asociados. Como unidades de apoyo a la investigación existen 10 centros de prestación de servicios (siete propios y tres mixtos) para dar apoyo técnico y administrativo a dos o más institutos y cuatro unidades técnicas especializadas (tres propias y una mixta).

Acrónimo de Instituto de Agricultura Sostenible, centro del Consejo Superior de Investigaciones Científicas de España (CSIC). Fundado en 1992 en Córdoba como un centro singular en investigación agraria, con un enfoque específico hacia los sistemas agrícolas andaluces, como cultivos herbáceos de secano y regadío y olivar, con objeto de compatibilizar la producción de alimentos con la conservación de los recursos naturales y protección medioambiental. Sus Departamentos de Agronomía, Mejora Genética Vegetal y Protección de Cultivos, abordan temas de Fitopatología.

Acrónimo del inglés. En español, Centro internacional de investigación agrícola en las zonas áridas. Instituto de investigación agrícola sin ánimo de lucro, fundado en 1977 en Alepo (Siria), dispone de una serie de centros y estaciones experimentales. Miembro del CGIAR, respaldado por el fondo CGIAR, tiene como objetivo mejorar los medios de vida de los pobres en recursos en las zonas áridas del mundo. Desarrolla programas de mejora genética de cultivos frente a patógenos de especial incidencia en zonas áridas y dispone de colecciones de germoplasma de cultivos adaptados a estas zonas.

Cualquier instalación, incluso las que dependan de iniciativas privadas, aparte de las estaciones cuarentenarias, donde las plagas, vegetales, productos vegetales u otros objetos se mantienen en condiciones de confinamiento. En ellas se cultiva, almacena, emplea, transporta o se elimina material vegetal (transformado genéticamente o no) o sus productos, de manera segura para evitar escapes de material vegetal o sus productos procedentes de importación de terceros países de la Unión Europea (UE). El nuevo régimen fitosanitario recoge los requisitos que deben cumplir las estaciones de cuarentena e instalaciones de confinamiento, que son instalaciones que se van a utilizar en caso de que los organismos nocivos (artículo 8 del Reglamento (UE) 2016/2031) o vegetales (artículo 48 y 58 del Reglamento (UE) 2016/2031) tengan que pasar períodos de cuarentena o sean utilizados para la realización de análisis oficiales, fines científicos o educativos, ensayos, selección de variedades o mejora genética.

Acrónimo de Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias, entidad autónoma de la Generalidad Valenciana/Generalitat Valenciana, con personalidad jurídica propia, creada por la Generalitat Valenciana en 1991. Procede de la transferencia del Centro Regional de Investigación y Desarrollo Agrario de Levante (CRIDA-07) del INIA a la Generalitat Valenciana en 1984. Este Centro, a su vez, fue heredero de otras instituciones fundadas en 1868. Su sede está en Moncada (Valencia) y posee un Centro específico de Protección Vegetal y Biotecnología, pero en otros Centros (Citricultura y Producción vegetal, Genómica y de Tecnología posrecolección) y Estaciones Experimentales del Instituto, también se desarrollan actividades de Fitopatología y Mejora genética de la resistencia frente a patógenos. Constituye la sede actual de dos laboratorios de Referencia del Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación para diagnóstico de Bacterias y de Virus, viroides y fitoplasmas de especies leñosas, fresa, patata y boniato, que además fueron miembros de la red RELAB.

Mecanismo esencial para mantener la homeostasis tisular en muchas formas de vida. En las plantas, de igual forma que la apoptosis en los animales, es el mecanismo por el cual se regulan una serie de procesos fisiológicos tales como la germinación, diferenciación, crecimiento, reproducción y desarrollo de semillas. Durante la vida de las plantas, células, tejidos y órganos son eliminados en un momento determinado en beneficio del propio organismo. Durante el curso normal de su desarrollo, germinación de semillas, diferenciación, crecimiento, reproducción y desarrollo de las semillas, las plantas recurren a mecanismos clásicos de muerte celular programada, para adaptarse y resistir a condiciones adversas de su ambiente tales como falta de nutrientes, temperaturas extremas, hipoxia o infección por agentes patógenos. Los mecanismos de MCP en plantas abren la posibilidad de utilizarlos en programas de mejora genética en cultivos agrícolas estratégicos.

Aquel cuyo material genético ha sido transformado de una manera ajena a los métodos naturales de multiplicación o combinación. Para su transformación se ha recurrido a una tecnología que se conoce comúnmente como manipulación o modificación genética. Esta técnica provoca cambios muy precisos en los caracteres hereditarios de un organismo y le dota de unas características de la que antes carecían en su especie o cultivar, mediante técnicas biotecnológicas. Así se pueden insertar genes de una especie en otra, algo que resulta imposible mediante cruzamientos, que es la técnica clásica de mejora genética de las especies agrícolas y forestales.

Secuencias homólogas en diferentes especies que derivan de un ancestro común mediante eventos de especiación; el concepto de ortología se aplica tanto a genes como a proteínas. Normalmente, aunque no siempre, los ortólogos mantienen la misma función en distintos organismos. En Fitopatología y mejora de la resistencia tienen interés principalmente para: i) la identificación de genes de resistencia conservados y efectivos contra un patógeno, ya que se puede buscar su ortólogo en otras especies vegetales, como los genes RPS2 y sus ortólogos que confieren resistencia a ciertas bacterias como Pseudomonas syringae; ii) estudio de la evolución de la resistencia vegetal, ya que el análisis de genes ortólogos permite entender cómo las plantas han evolucionado hacia mecanismos de defensa comunes; iii) el desarrollo de estrategias de control de enfermedades, ya que mediante edición genética (como CRISPR y técnicas derivadas), se pueden introducir ortólogos de genes resistentes en especies susceptibles; iv) en mejora asistida por marcadores, los ortólogos de genes de resistencia en cultivos modelo pueden servir como marcadores para seleccionar variedades resistentes en programas de mejora genética; v) mediante transferencia genética se pueden transferir ortólogos funcionales de genes de resistencia de una especie a otra mediante ingeniería genética, así por ejemplo la transferencia de genes de resistencia de Arabidopsis a plantas de tomate o tomatera (Solanum lycopersicum) para mejorar la resistencia a patógenos; y vi) el descubrimiento de nuevos genes candidatos, ya que si se conoce un gen funcional en una especie modelo, sus ortólogos en especies cultivadas, pueden ser buenos candidatos para estudios funcionales. Así el gen RPM1 de Arabidopsis confiere resistencia frente a especies de bacterias del género Pseudomonas, por lo que se investiga la funcionalidad de genes ortólogos en otras brasicáceas, como col o brócoli, para conferir resistencia a este u otros patógenos sin necesidad de introducir genes exógenos en estas plantas.

Conjunto de genes presentes en los genomas secuenciados de todas las cepas de una misma especie o de un grupo relacionado de organismos. Representa la diversidad genética total de esa especie. Esta definición de pangenoma, denominada “pangenoma de presencia-ausencia” (presence–absence variation pangenome), es la más común en la literatura científica, aunque algunos especialistas en la disciplina de Pangenómica definen tres tipos de pangenoma, que implican diferencias en la representación del mismo y en su inclusión de genes y secuencias no codificantes. El pangenoma se divide en dos componentes principales: i) genoma central o núcleo, que representa a los genes que están presentes en todas las cepas y por estar conservados son esenciales para las funciones básicas de la especie; y ii) genoma accesorio o dispensable, que representa los genes que están presentes únicamente en algunas cepas. Estos genes diferenciales suelen estar relacionados con la adaptación al ambiente, resistencia a antibióticos, o mecanismos de patogenicidad, pero también suelen incluir secuencias típicas de fagos, plásmidos y otros elementos genéticos móviles. La importancia del pangenoma en Fitopatología es clave, ya que permite entender la diversidad genética de los patógenos y su interacción con las plantas anfitrionas u hospedadoras. Permite: i) conocer la variabilidad genética de los patógenos e identificar genes que están presentes solo en algunas cepas de un patógeno, como genes de virulencia, efectores, o de resistencia a plaguicidas, fundamental para comprender por qué ciertas cepas son más agresivas o difíciles de controlar que otras; y ii) entender la coevolución planta-patógeno, al permitir estudiar cómo los genes de los patógenos evolucionan para evadir los mecanismos de defensa de las plantas. Así, algunos genes de efectores pueden perderse por deleción o acumular mutaciones que alteren su secuencia para evitar ser detectados por genes de resistencia en las plantas. El conocimiento de qué genes del pangenoma están implicados en la infección, permite diseñar estrategias para mejorar la resistencia e identificar dianas moleculares para mejorar genéticamente cultivos determinados mediante edición genética o cruzamientos dirigidos. La identificación de los genes únicos y accesorios favorece el desarrollo de métodos, técnicas de detección y reactivos específicos de detección y diagnóstico para identificar cepas nuevas, más virulentas o resistentes. El estudio del pangenoma puede mostrar cómo una población patógena cambia con el tiempo, ayudando a predecir posibles brotes o fallos en el control basado en resistencia genética. Como ejemplo concreto, en el hongo fitopatógeno Magnaporthe oryzae (causante del añublo del arroz), el análisis del pangenoma ha permitido identificar genes de efectores que determinan si una cepa puede infectar a ciertas variedades de arroz y ello ha sido clave para el diseño de programas de mejora genética más eficaces. El pangenoma se puede representar, de forma básica, como una lista de genes presentes o ausentes en cada cepa o individuo, mediante una matriz. Como segundo tipo de pangenoma, denominado “secuencia representativa del pangenoma” (representative sequence pangenome), también puede expresarse como una concatenación de genomas completos o sus secuencias representativas, lo que es útil para análisis comparativos. El tercer tipo, denominado “pangenoma gráfico” (pangenome graph o graphical pangenome), integra múltiples secuencias genómicas de organismos de la misma población, especie o género en un único genoma de referencia.

Virus de ADN circular de doble cadena (dsADN) que presentan diversas similitudes con retrovirus —que no se encuentran en plantas—, de manera que se replican en el núcleo mediante transcripción seguida de una transcripción reversa en el citoplasma; este tipo de virus no se ha documentado en ningún otro tipo de organismo fuera de las plantas, por lo que se considera que su presencia está limitada al reino vegetal. Pertenecen principalmente a la familia Caulimoviridae y a los siguientes géneros: i) Caulimovirus, como el mosaico de la coliflor (Cauliflower mosaic virus-CaMV), que no necesita integrarse en el genoma de la planta para replicarse, aunque se han encontrado secuencias similares a CaMV integradas en genomas de algunas plantas, lo que sugiere eventos de integración pasados; ii) Badnavirus, como el virus del rayado del banano (Banana streak virus-BSV), que puede integrarse en el genoma del plátano como elemento viral endógeno (EPRV). Bajo ciertas condiciones de estrés, como la hibridación o la propagación o cultivo in vitro, los elementos virales endógenos pueden reactivarse y generar infecciones virales activas, que entorpecen los programas de mejora genética del plátano; iii) Tungrovirus, como el virus baciliforme del tungro del arroz (Rice tungro bacilliform virus-RTBV), que infecta al arroz y se transmite junto a un virus de ARN; y iv) otros géneros como Petuvirus, Soymovirus, Cavemovirus, Rosadnavirus, y Florendovirus, este último género incluye pararretrovirus endógenos (endogenous pararetroviruses, EPRVs, incluidos en el genoma de diversas especies de plantas, entre ellas de los cítricos), que no siempre causan enfermedad pero han dejado huellas en su genoma. Así pues, aunque los pararretrovirus se replican a través de un intermediario de ARN mediante transcriptasa reversa, no se integran obligatoriamente en el genoma del huésped o anfitrión como parte de su ciclo de vida normal (a diferencia de los retrovirus verdaderos), aunque en algunos casos diversas secuencias de pararretrovirus pueden integrarse de forma accidental en el genoma de la planta, como secuencias virales integradas Aunque muchas son inactivas, algunas pueden reactivarse bajo condiciones de estrés y producir virus infecciosos.

1. Aquella de la que se obtiene material vegetal para propagación. 2. Planta que se utiliza para obtener vectores portadores de un patógeno o que aporta ciertos genes en un proceso de mejora genética.

Aquella mono- u oligogénica que puede clasificarse en categorías discretas y que está dirigida contra razas específicas de un patógeno. Este tipo de resistencia se ha observado contra todos los tipos de agentes fitopatógenos. El carácter cualitativo de su fenotipo, generalmente dominante y de tipo reacción hipersensible, facilita su rápida identificación entre los segregantes de cruzamientos entre parentales resistentes y susceptibles a un patógeno. Ello ha propiciado que los genes de resistencia (genes R) hayan sido incorporados rápidamente en los programas de mejora genética vegetal y que los cultivares resistentes derivados de ellos, en muchos casos mediante introgresión de especies silvestres o cultivadas sexualmente compatibles con la especie cultivada, se empleen extensa e intensivamente en la agricultura actual. Sin embargo, las investigaciones sobre la naturaleza bioquímica y molecular de la resistencia cualitativa y específica de raza han demostrado que: i) su herencia y naturaleza son complejas, y ii) el genoma de una especie vegetal puede contener un gran número de genes asociados con resistencia a una diversidad de agentes fitopatógenos, siendo la resistencia a algunos de ellos regulada por varias decenas de genes. Como ejemplo, el genoma del trigo contiene más de 90 genes que regulan la resistencia específica de raza a las royas del tallo (Puccinia graminis f. sp. tritici), parda (P. recondita) y amarilla (P. striiformis f. sp. tritici), así como al oídio (B. graminis f. sp. tritici), de los cuales más de 20 conciernen la resistencia contra P. recondita, según “La Sanidad Vegetal en la agricultura y la silvicultura: retos y perspectivas para el siglo XXI”.

Ente de derecho privado que no persigue fines lucrativos ni políticos sino de interés científico, técnico y social (http://www.sech.info). Se constituyó en 1981 con la finalidad de promover y alentar el interés nacional e internacional en la investigación científica, en la divulgación y en la formación en todas las ramas de la Horticultura. Su sede es la de la Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y de Montes de Córdoba. Su objetivo fundacional es promover y alentar el interés nacional e internacional en la investigación científica, en la divulgación y en la formación en todas las ramas de la Horticultura por los medios siguientes: i) el desarrollo de un mejor entendimiento entre las personas e instituciones dedicadas a las Ciencias Hortícolas; ii) la participación en todas aquellas actividades relacionadas con las Ciencias Hortícolas; iii) la difusión de los conocimientos hortícolas a través de publicaciones periódicas y demás medios que se crean convenientes; iv) la organización periódica de un Congreso Nacional de la SECH y de otras reuniones específicas; y v) establecer relaciones con otras sociedades nacionales e internacionales análogas. Posee grupos de trabajo disciplinares en los que se aborda la fitopatología, protección de cultivos y mejora genética en los diversos cultivos. Publica Actas de Horticultura SECH, boletines y otras publicaciones entre las que sobresale el pionero Diccionario de Ciencias Hortícolas (1999) de la SECH que contiene 8.270 términos de todos los campos de la Horticultura y que sido una de las guías para la elaboración del presente Diccionario de Fitopatología o glosario de términos fitopatológicos de la SEF (GEDDI-SEF).

1. Cada uno de los grupos en que se divide una especie. 2. Unidad taxonómica que representa la subdivisión de la especie. Los miembros de una subespecie se diferencian de otras subespecies de la misma especie en la frecuencia de genes, ordenación cromosómica y características fenotípicas hereditarias. 3. Población de una especie definida de acuerdo a más de un carácter (morfológico para la mayoría de los organismos, pero no en microorganismos), que distingue claramente a los miembros de la subpoblación de otros miembros de la misma especie. Las subespecies pueden originarse por separación espacial de dos líneas reproductivas, bien por procesos naturales de aislamiento geográfico, bien por programas definidos de reproducción o mejora genética.