1. Tablero horizontal, descubierto y elevado sobre el suelo, donde se colocan personas o instrumentos a altura suficiente para examinar las copas de los árboles durante prospecciones fitosanitarias y tomar muestras normalmente inaccesibles. 2. Entorno informático determinado, que utiliza sistemas compatibles entre sí, como las bases de datos y aplicaciones. También aquellas utilizadas para unificar las videoconferencias en la nube, un sistema de telefonía en la nube, mensajería, reuniones en línea simples, que constituyen una solución de sala de conferencias definida por software.
plataforma aérea
plataforma de secuenciación de alto rendimiento
Plataforma que puede analizar hasta 100.000 muestras diarias, habitual en la industria farmacéutica o biotecnológica, y que ofrece posibilidades muy interesantes en Fitopatología y Sanidad Vegetal. Para aprovecharlas son necesarios diseños compatibles con las necesidades de análisis de decenas de miles de muestras o especímenes de insectos, o sustratos complejos con artrópodos fitófagos y agentes patógenos junto a organismos saprofitos o beneficiosos. Asimismo, son factores limitantes y críticos el manejo robotizado de muestras y el procesado de la información mediante bases de datos de elevada fiabilidad. Pero, además, la interpretación de los resultados requiere gran experiencia y pericia, tanto en el manejo de secuencias como en Fitopatología y en Taxonomía, así como en técnicas convencionales de identificación. Los requisitos para su validación serán muy complejos y se requerirán nuevas inversiones en infraestructuras y expertos bioinformáticos para el análisis y almacenamiento de datos. Todo ello requerirá colaboraciones internacionales y coordinación para establecer nuevos protocolos, controles, métodos de validación y bancos de datos comunes, para utilizar rutinariamente este tipo de plataformas.
plataforma electrónica de detección
Aquella basada generalmente en biosensores para detección de agentes patógenos de forma específica, incluso en condiciones de campo.
amplificación de desplazamiento de cadena
Técnica de amplificación isotérmica de ácidos nucleicos que no precisa de ciclos de temperaturas para la desnaturalización de las hebras de ADN, ya que, debido a la acción de enzimas de restricción que generan mellas en el ADN, este proceso se realiza de forma enzimática. Es una modificación de la PCR o RT-PCR simple convencional que mejora su rendimiento final. Se basa en la capacidad de una ADN polimerasa modificada, para desplazar una hebra monocatenaria resultante de un corte en una región específica y a partir de esta hebra desplazada, iniciar la replicación o amplificación de ese ADN diana. Con este procedimiento, las hebras desplazadas sirven como molde para los nuevos ciclos de amplificación, generando por un lado que los productos de amplificación se multipliquen por más del doble al final de cada ciclo de amplificación y por otro, que se observe un incremento en la velocidad de reacción, sensibilidad y especificidad de la técnica respecto a la PCR o RT-PCR simple convencional. Se puede llevar a cabo la replicación, amplificación o la secuenciación de un ADN mediante una ADN polimerasa del tipo fago φ29 o 29 (Phi29). Se realiza en un único tubo, lo que contribuye a evitar contaminaciones, en plataformas convencionales de la PCR cuantitativa, con un mayor número y concentración de cebadores. Incrementa la eficiencia y sensibilidad de la PCR, y se efectúa aumentando la velocidad final de la reacción.
bancada
1. Plataforma firme sobre la que se colocan instrumentos, equipos o máquinas de laboratorio, reactivos, muestras y plantas para trabajar en ellas. 2. Espacio de laboratorio asignado a un grupo de investigación. 3. (bedplate). Plataforma fija o móvil (en cuyo caso lleva ruedas o rodillos) elevada para cultivar plantas en macetas o albergar sustrato, normalmente situadas en invernadero o abrigo de cuarentena.
BIOVEGEN
Acrónimo de la plataforma tecnológica española de biotecnología vegetal. Asociación público-privada, liderada por el sector empresarial, que reúne a entidades del sector agroalimentario con interés en I+D+i en biología vegetal aplicada. Reúne a empresas del sector agroalimentario: obtentores de variedades vegetales, fertilización y nutrición vegetal, Protección Vegetal y Sanidad Vegetal, agrobiotecnología y gestión de la I+D, organismos públicos de investigación y la Administración.
CEXVEG
Sigla de aplicación informática que tiene como objetivo la gestión y tramitación de las Solicitudes de Inspección Fitosanitaria de vegetales y productos vegetales en los Puntos de Inspección Fronterizos (PIF). La aplicación Silverlight es una tecnología de presentación electrónica creada para su ejecución en distintas plataformas. Hace posible un uso más completo, visualmente más atractivo e interactivo, y se puede ejecutar en la gran mayoría de entornos, con exploradores en múltiples dispositivos y sistemas operativos de escritorio. Este procedimiento administrativo está regulado por el reglamento R(UE) 2016/2031, de 26 de octubre, relativo a las medidas de protección contra las plagas de los vegetales. La aplicación es propiedad del Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación de España, y ha sido desarrollada por encargo de la Subdirección General de Acuerdos Sanitarios y Control en Frontera perteneciente a la Dirección General de Sanidad de la Producción Agraria del gobierno de España.
Copernicus
Denominación del programa de observación terrestre fruto de la alianza entre la Comisión Europea y la Agencia Espacial Europea para el monitoreo de la tierra y el ofrecimiento de datos públicos. Desde su plataforma se puede descargar gratuitamente coberturas de índices medioambientales, así como imágenes de satélite, datos climáticos o modelos digitales del terreno.
Euphresco
Acrónimo del inglés, en español Coordinación Europea de Investigación Fitosanitaria. Red internacional europea de organismos de investigación y financiación dedicada a coordinar proyectos científicos sobre Sanidad Vegetal. Incluye especialmente aquellos relacionados con detección, epidemiología y vectores, evaluación de riesgos y control de organismos nocivos regulados o emergentes (https://www.euphresco.net). Funciona como una plataforma de colaboración y coordinación entre organismos que financian y llevan a cabo investigación fitosanitaria.
generador de imagen espacial molecular
Sistema automatizado de obtención de imágenes microscópicas con ciclos de reactivos microfluídicos para la detección espacial in situ de múltiples dianas, como ARN o proteínas en tejido fijado con formalina e incrustado en parafina (samples fixed with formalin and embedded in paraffin, FFPE) y otras muestras intactas con resolución subcelular. Los atributos clave de la plataforma CosMxTM SMI (NanoString®, Seattle, WA) incluyen: i) química de imágenes múltiples y alta sensibilidad que funciona para la detección de ARN y proteínas; ii) análisis de imágenes de resolución subcelular tridimensional con un precisión de localización del objetivo de aproximadamente 50 nm en el plano XY; iii) esquema de codificación de gran distancia de Hamming con una tasa de error baja (0,0092 llamadas falsas por célula por gen) y bajo fondo (unos 0,04 recuentos por célula por gen); iv) alto rendimiento (hasta 1 millón de células por muestra, cuatro muestras por análisis); v) métodos de segmentación celular basados en anticuerpos; y vi) compatibilidad con muestras fijadas con formalina e incluidas en parafina (FFPE).
mesa de selección
Aquella dispuesta en una explotación agrícola o industrial, generalmente sobre una plataforma móvil, donde se separa inicialmente el producto recolectado válido del no comercializable.
piso
Cada una de las plataformas de la estructura de un árbol frutal constituidas por ramas de esqueleto y situadas en distintos planos de altura.
PNUMA
Sigla del español, Programa de las Naciones Unidas para el Medio Ambiente. Se estableció en 1972 como respuesta a la Conferencia de las Naciones Unidas sobre el Medio Humano para fomentar y apoyar la cooperación en el tema ambiental, propiciando la calidad de vida del presente sin comprometer la de las generaciones futuras. Actúa como catalizador, promotor, educador y facilitador para promover el uso racional y el desarrollo sostenible del medio ambiente mundial. Su labor abarca: i) evaluar las condiciones y las tendencias ambientales a nivel mundial, regional y nacional; ii) elaborar instrumentos ambientales internacionales y nacionales; y iii) fortalecer las instituciones para la gestión racional del medio ambiente. Posee una larga historia de contribución al desarrollo y la aplicación del derecho del medio ambiente a través de su labor normativa o mediante la facilitación de plataformas intergubernamentales para la elaboración de acuerdos principios y directrices multilaterales sobre el medio ambiente, que tienen por objeto hacer frente a los problemas ambientales mundiales. Su página electrónica es https://www.unep.org.
polinización
Transferencia de polen de las anteras al estigma de la flor, que tiene repercusión en la epidemiología y transmisión natural de ciertas enfermedades. Puede transportarse polen para polinizar: i) de forma artificial, con intervención humana, o ii) natural en la que el polen es transferido al interior de la flor, o entre flores por el viento (polinización anemófila), por el agua (polinización hidrófila) o por animales como aves o murciélagos (polinización zoófila), y más frecuentemente por insectos (polinización entomófila). Las más habituales en cultivos son la anemófila (wind pollination), entomófila (insect pollination), la autopolinización (self-pollination) con polen de la misma flor y la polinización cruzada (cross pollination) en la que se produce la polinización de una flor con polen procedente de un genotipo diferente. Ante el descenso de polinizadores naturales la Plataforma Intergubernamental Científico normativa sobre Diversidad Biológica y Servicios de los Ecosistemas (IPBES) y la Conferencia de las Partes del Convenio de Naciones Unidas sobre la Diversidad Biológica (CDB), adoptó una decisión de fomento de la ejecución de acciones para la mejora de la conservación de los polinizadores. El Parlamento Europeo solicitó a la Comisión Europea (CE), el desarrollo de una iniciativa sobre polinizadores destinada a proteger los hábitats y mitigar y detener su declive. En ese contexto surgió la Iniciativa de la Unión Europea sobre los Polinizadores (EU Pollinators Initiative), vertebrada por tres ejes prioritarios: mejorar el conocimiento sobre el declive de los polinizadores, sus causas y sus consecuencias; abordar las causas del declive de los polinizadores; y sensibilizar, involucrar a la sociedad y promover la colaboración sobre este tema.
secuenciación masiva
Tecnología de secuenciación basada en una serie de nuevas plataformas de secuenciación de alto rendimiento o nueva generación capaces de generar paralelamente, y de forma masiva, la secuencia de millones de fragmentos de ADN en un único proceso de secuenciación. Esto eleva significativamente el rendimiento a un menor coste y con ventajas significativas respecto a los sistemas convencionales. Esta tecnología permite la secuenciación de todo el genoma de un microorganismo, o de partes muy representativas del mismo, o de la mayoría de los que están presentes en una muestra vegetal (cultivables y no cultivables, patógenos o saprofitos) y sirve tanto para la detección de microorganismos ya conocidos, como de otros no descritos previamente. Como ejemplo, la tecnología de la plataforma de Oxford Nanopore es portátil y puede secuenciar ADN o ARN aislados de tejidos de plantas conteniendo microorganismos patógenos y saprofitos (bacterias, hongos, oomicetos, virus, viroides o nematodos, o infecciones mixtas de varios patógenos distintos), identificar a los patógenos por las secuencias que se obtienen automáticamente y tras un análisis bioinformático complejo, proporcionar información sobre la identidad de todos los microorganismos presentes. La significativa reducción del coste económico de este tipo de tecnologías hace posible ampliar su uso, incluso por compañías o laboratorios privados, que ofertan estos análisis de muestras. Las técnicas HTS han demostrado ser una herramienta muy valiosa en la identificación de mezclas de genotipos dentro de una sola planta. Con la ayuda de esta tecnología, se facilitará el estudio de las interacciones entre diferentes microorganismos, desvelando nuevos hábitats, mecanismos de patogénesis y de desarrollo de enfermedades. También podrá usarse para el estudio de interacciones planta-patógeno-vector a través de análisis transcriptómicos o para estudios de mecanismos de resistencia, que al final podrían conducir al desarrollo de nuevas herramientas de control.
sensor óptico
Dispositivo o instrumento basado en imágenes obtenidas por cámaras ópticas. Los actualmente disponibles ofrecen múltiples aplicaciones en agricultura de precisión y fenotipado vegetal, para la detección automática y temprana de interacciones planta-patógeno. Pueden ser empleados a distintas escalas: célula, hoja, fruto, planta, parcela experimental o ecosistema. Es posible analizar una gran diversidad de parámetros en función del sensor usado y de la plataforma desde la que se trabaje (microscopio, pequeños robots que se desplazan en la zona a analizar, vehículos tripulados o no tripulados, plataformas automatizadas de alto rendimiento, drones, aviones y satélites). Entre los sensores de mayor interés se encuentran: i) las cámaras digitales para la obtención de imágenes “rojo, verde y azul” (en inglés RGB de red, green, blue); ii) los sensores 3D; iii) cámaras multi e hiperespectrales; iv) cámaras de infrarrojos; iv) diversos sistemas para la obtención de imágenes de fluorescencia roja o verde-azul; y v) sensores de proximidad para el seguimiento de las poblaciones de organismos nocivos y sus efectos en las plantas. En general, la combinación de sensores permite incrementar el número de procesos vegetales que pueden ser analizados simultáneamente, lo que resulta un enfoque de interés para identificar ‘marcas de identidad’ para un patógeno concreto y su diagnóstico temprano.
sensor remoto, SR
Plataforma capaz de proporcionar información relativa a la copa de árboles para conseguir información espacial de alta resolución aplicable a agricultura de precisión, especialmente en áreas extensivas. Se han diseñado diversos dispositivos que actúan como sensores: i) ordenadores portátiles MSI con control de seguridad programable, y ii) sistemas de imágenes hiperespectrales (HSI) y LIDAR que son precisos, pero su resolución se ve afectada a medida que aumenta la distancia entre el sensor y el área objetivo, aunque la introducción de planes de vuelo adecuados ha subsanado el problema. La recolección de datos de la reflectancia hiperespectral también introduce factores como la variación en las capas de hojas (LAI), la orientación de las hojas (denominada distribución del ángulo de las hojas, LAD), clima, sombras y elementos no foliares como el suelo. Estos factores complican las relaciones entre la reflectancia espectral y la interpretación del estado sanitario de las plantas, aunque la técnica sea muy interesante.
sistema de aviones no tripulados
Vehículos o plataformas aéreas, frecuentemente drones, muy utilizados en teledetección para la detección temprana de enfermedades de plantas. Pueden complementar a métodos clásicos de monitoreo de cultivos, como la inspección visual y aportar nuevas posibilidades de uso extensivo y rápido.
sistema de control y experiencia de comercio
Plataforma informática de la Unión Europea que permite el seguimiento, control y certificación del comercio de animales, productos de origen animal, vegetales y sus productos y otros bienes sujetos a regulaciones sanitarias y fitosanitarias. En Sanidad Vegetal, permite garantizar la trazabilidad y el control sanitario de plantas y productos vegetales en el comercio internacional, facilitando el intercambio seguro y documentado de material vegetal y previniendo la introducción y propagación de plagas cuarentenarias. Así, TRACES se convierte en una herramienta esencial en la gestión fitosanitaria europea, integrada en los procedimientos de inspección, certificación y notificación de movimientos de mercancías reguladas.
sistema espectral no invasivo
Conjunto de tecnologías de detección basadas en el análisis de la radiación reflejada, absorbida o emitida por las plantas en diferentes rangos del espectro electromagnético (visible, infrarrojo, hiperespectral, fluorescencia, etc.), que permite diagnosticar y supervisar enfermedades de vegetales sin dañar el tejido e incluso sin tomar muestras. Se utilizan para la detección temprana de infecciones, seguimiento del estado sanitario de los cultivos y evaluación de tratamientos, aportando información fisiológica y bioquímica de forma rápida y no destructiva. Los instrumentos más utilizados para ello son: i) espectrorradiómetros portátiles que registran la reflectancia o transmitancia; ii) cámaras multiespectrales e hiperespectrales localizadas en drones o satélites; iii) cámaras térmicas; iv) fluorómetros portátiles o de imagen que evalúan la eficiencia fotosintética y detectan alteraciones tempranas provocadas por agentes patógenos; v) espectroscopía de imagen Raman que detectan vibraciones moleculares específicas de metabolitos vegetales; vi) sistemas LIDAR ; y vii) sensores acoplados a plataformas terrestres o a drones, que generalmente combinan información multiespectral, hiperespectral y térmica, para vigilancia rápida y con alta resolución de parcelas agrícolas o masas forestales.
sociedad noruega de fitopatología, NSPP
La asociación se estableció en 1891 (http://www.planteforsk.no/). Su objetivo es estimular la comunicación y la cooperación entre las personas interesadas en la protección de las plantas, las enfermedades de las plantas y sus organismos causales, los insectos plagas y los ácaros y las malas hierbas. Es una plataforma para la interacción entre todas las personas involucradas en la protección de cultivos, incluida la consultoría, la educación, la industria, la producción de cultivos, el comercio, la formulación de políticas y la investigación. Forma parte de la Fundación Europea para la Patología Vegetal (EFPP) y de la Sociedad Internacional de Patología Vegetal (ISPP).
teledetección
Técnica de adquisición de datos de la superficie terrestre desde sensores generalmente instalados en plataformas espaciales. La interacción electromagnética entre el terreno y el sensor genera una serie de datos que son procesados posteriormente para obtener información interpretable de la tierra en su conjunto o de parcelas concretas de la misma. Adquisición de información a distancia de un objeto o fenómeno, mediante el uso de instrumentos de grabación o instrumentos de fotografía o escaneo o dispositivos compactos, basados en tecnología fotónica e inteligencia artificial, mediante la combinación de robótica móvil (drones y vehículos de guiado automático-AGV), fotónica (cámaras hiperespectrales, termografía y LIDAR) y software de análisis basado en inteligencia artificial.
transistor orgánico de efecto de campo con puerta electrolítica
Plataforma o dispositivo de detección electrónica basada en la nueva tecnología del único-ensayo molecular con un transistor grande (SiMoT) con una placa biosensora tapizada con anticuerpos específicos del agente patógeno, proteína o célula a detectar. El método de biosensor electrónico sienta las bases para una plataforma de alto rendimiento, de potencial uso a gran escala para detectar mínimas cantidades de patógenos en plantas asintomáticas. Ensayado con la bacteria Xylella fastidiosa, ha demostrado ser capaz de detectar una sola célula bacteriana en condiciones de campo.
Unión Internacional de Ciencias Biológicas, UICB
Organización no gubernamental sin ánimo de lucro establecida en 1919 (https://iubs.org/), con el fin de unificar la biología a través de la diversidad. Está compuesta por Academias Nacionales y Asociaciones y Sociedades científicas internacionales. Proporciona una plataforma global para la cooperación y la interacción entre científicos de todas las disciplinas y nacionalidades para promover la investigación, la formación y la educación en ciencias biológicas, al tiempo que aboga por el acceso y la participación en los beneficios de los conocimientos y recursos. Es miembro del Consejo Internacional de Ciencias (ISC), y el único organismo internacional que representa a todo el espectro de las ciencias biológicas. Reúne actualmente a más de 110 miembros nacionales, científicos e institucionales a través de tres tipos de miembros: (nacional), y asociado. Entre sus objetivos específicos se encuentra promover el estudio de la biología en diferentes aspectos: básico y aplicado, teórico, observacional, experimental y computacional.
HTS
Sigla del inglés.