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Mostrando 6 resultados para "INSDC"

INSDC

Sigla del inglés. En español, consorcio de colaboración internacional entre las organizaciones DDBJ, EMBL-EBI y NCBI, que intercambian diariamente diversas bases de datos de secuencias de nucleótidos, de acceso gratuito y sin restricciones.

GenBank

Acrónimo del inglés. Base de datos pública y gratuita que contiene una extensa colección de secuencias de nucleótidos obtenidas a partir de más de 300.000 especies. Además de la secuencia, incluye información bibliográfica, anotaciones funcionales y, si se trata de una secuencia codificante, su traducción conceptual a proteína. Cada registro contiene una secuencia ininterrumpida de una molécula de polinucleótido (ADN genómico, ARN genómico, ARN precursor, ARNm (ADNc), ARN ribosómico, ARN de transferencia, ARN pequeño nuclear o ARN pequeño citoplasmático). De su gestión y distribución se encarga el NCBI (National Center for Biotechnology Information) en los Estados Unidos de América, con el ENA (European Nucleotide Archive) y el DDBJ (DNA Data Bank of Japan). Estas instituciones forman el consorcio INSDC (International Nucleotide Sequence Database Collaboration) que diariamente actualizan sus contenidos para que todas ellas dispongan de la misma información simultáneamente.

RefSeq

Acrónimo del inglés. Base de datos de secuencias de referencia de acceso abierto, anotada y seleccionada que contiene secuencias de nucleótidos disponibles públicamente, así como de sus productos proteicos y que se introdujo en 2000. Está construida por el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) y, a diferencia de GenBank, proporciona un registro único para cada molécula biológica (ADN, ARN o proteína) para los principales organismos, desde virus hasta procariotas y eucariotas, y también incluye secuencias artificiales, como vectores. Esta base de datos se deriva en su mayoría de registros del INSDC, pero solo es accesible desde el NCBI.

EMBL-EBI

Sigla del inglés. En español, Laboratorio Europeo de Biología Molecular. Institución de investigación en biología molecular financiada por 18 países europeos. Fue creado en 1974 y posee laboratorios en Barcelona (España), Grenoble (Francia), Hamburgo y Heidelberg (Alemania) y Roma (Italia). Su importante base de datos para biología es gestionada desde EMBL-EBI Hinxton (Reino Unido).

ENA

Acrónimo del inglés. En español, Archivo europeo de nucleótidos. Repositorio gestionado desde el Reino Unido, que proporciona acceso gratuito y sin restricciones a secuencias de ADN y ARN anotadas. Los datos son proporcionados por el Instituto Europeo de Bioinformática del Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL-EBI). También almacena información complementaria, como procedimientos experimentales, detalles del ensamblaje de secuencias y otros metadatos relacionados con proyectos de secuencia.

Sociedad Española de Fitopatología
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