Diccionario

1. Símbolo del elemento químico fósforo, de número atómico 15, del grupo de los no metales. Se encuentra en la naturaleza combinado en fosfatos inorgánicos, pero nunca en estado nativo. 2. Símbolo del aminoácido prolina, según la nomenclatura de la Unión Internacional de Química Pura y Aplicada-Unión Internacional de Bioquímica (IUPAC-IUB). Se encuentra en las proteínas.

Generación de progenitores utilizada para producir la progenie híbrida o F1.

Acrónimo del inglés. En español, electroforesis en gel de poliacrilamida.

País donde se han cultivado las plantas, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

País donde se han cultivado las plantas de donde provienen los productos vegetales, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

País donde los artículos reglamentados, que no sean plantas o productos vegetales, se expusieron por primera vez a contaminación de una o varias plagas, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

Aquel por el que pasó un envío de plantas y se fraccionó, almacenó o cambió su embalaje, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

Aquel por el que pasó un envío de plantas sin ser fraccionadas, almacenadas o cambiadas de embalaje o empaque, sin estar expuestas a contaminación por plagas en ese país, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

Secuencia de bases que se lee igual en sentido 5’-3’ que en sentido 3’-5’, como 5’-CGTATGC-3’, o que es idéntica en una cadena y en la complementaria, como 5’-CGAATTCG-3’. Son lugares de reconocimiento para numerosas endonucleasas de restricción, ARN-polimerasas y otras enzimas.

Denominación común de la enfermedad viral de la fresa o frutilla que induce decoloración y decaimiento de las plantas. La enfermedad es causada por la infección por múltiples virus de diferentes géneros, transmitidos por la mosca blanca de los invernaderos Trialeurodes vaporariorum o por distintas especies de pulgones de forma semipersistente. Los virus identificados en las plantas enfermas son: Beet pseudoyellows virus-BPYV, Strawberry pallidosis-associated virus-SPaV, Strawberry mild yellow edge virus-SMYEV, el virus del moteado de la fresa (Strawberry mottle virus-SMoV) y el polerovirus 1 de la fresa (SPV1). Los síntomas varían entre las especies y cultivares del anfitrión o huésped y las plantas infectadas pueden mostrar clorosis, coloración púrpura de las hojas, retraso en el crecimiento y muerte regresiva. Era una enfermedad considerada rara hasta que afectó a la industria de la fresa en la costa oeste de América del Norte desde Canadá hasta el sur de California, donde provocó en la década de 2010, importantes pérdidas económicas.

Sigla del inglés. En español, patrones moleculares asociados a patógenos. Son pequeñas secuencias de moléculas con motivos conservados que se repiten en grupos de bacterias y otros patógenos, que tienen un papel clave en la inmunidad innata y en el reconocimiento de las plantas y su resistencia a patógenos cuando las PAMP son reconocidas por receptores de reconocimiento de patrones (PRRs, del inglés pattern recognition receptors), que se encuentran en la superficie vegetal. Se trata en general de moléculas (elicitores), producidas por un agente microbiano o resultantes de su actividad desintegradora de la pared celular vegetal, que inducen una respuesta defensiva en la planta. Comprenden una variedad de estructuras moleculares altamente conservadas, comunes en el conjunto de un tipo de patógenos para cuyos ciclos vitales son esenciales. Como son: i) los fragmentos flg22 y flg28 de la proteína del flagelo de las bacterias, y ii) las moléculas resultantes de la degradación de la pared celular (glucanos, mananos, quitina, quitosano, péptidos) y de la membrana (ergosterol) de los hongos y oomicetos. Los lipopolisacáridos bacterianos son el prototipo de PAMP. Otros PAMP incluyen al ácido lipoteicoico para las bacterias grampositivas, peptidoglucanos, y variantes de ácidos nucleicos normalmente asociados con virus. Estos patrones moleculares esenciales para el reconocimiento de los microorganismos por parte de las células vegetales, responden de manera distinta según el microorganismo identificado.

Enfermedad epidémica que se extiende a muchos países o grandes áreas distantes entre sí o afecta a casi todas las plantas de una localidad o región.

Conjunto de personas que prueban un determinado producto para evaluarlo organolépticamente con fines culinarios o para estimar el efecto de alguna enfermedad sobre el mismo.

Conjunto de genes presentes en los genomas secuenciados de todas las cepas de una misma especie o de un grupo relacionado de organismos. Representa la diversidad genética total de esa especie. Esta definición de pangenoma, denominada “pangenoma de presencia-ausencia” (presence–absence variation pangenome), es la más común en la literatura científica, aunque algunos especialistas en la disciplina de Pangenómica definen tres tipos de pangenoma, que implican diferencias en la representación del mismo y en su inclusión de genes y secuencias no codificantes. El pangenoma se divide en dos componentes principales: i) genoma central o núcleo, que representa a los genes que están presentes en todas las cepas y por estar conservados son esenciales para las funciones básicas de la especie; y ii) genoma accesorio o dispensable, que representa los genes que están presentes únicamente en algunas cepas. Estos genes diferenciales suelen estar relacionados con la adaptación al ambiente, resistencia a antibióticos, o mecanismos de patogenicidad, pero también suelen incluir secuencias típicas de fagos, plásmidos y otros elementos genéticos móviles. La importancia del pangenoma en Fitopatología es clave, ya que permite entender la diversidad genética de los patógenos y su interacción con las plantas anfitrionas u hospedadoras. Permite: i) conocer la variabilidad genética de los patógenos e identificar genes que están presentes solo en algunas cepas de un patógeno, como genes de virulencia, efectores, o de resistencia a plaguicidas, fundamental para comprender por qué ciertas cepas son más agresivas o difíciles de controlar que otras; y ii) entender la coevolución planta-patógeno, al permitir estudiar cómo los genes de los patógenos evolucionan para evadir los mecanismos de defensa de las plantas. Así, algunos genes de efectores pueden perderse por deleción o acumular mutaciones que alteren su secuencia para evitar ser detectados por genes de resistencia en las plantas. El conocimiento de qué genes del pangenoma están implicados en la infección, permite diseñar estrategias para mejorar la resistencia e identificar dianas moleculares para mejorar genéticamente cultivos determinados mediante edición genética o cruzamientos dirigidos. La identificación de los genes únicos y accesorios favorece el desarrollo de métodos, técnicas de detección y reactivos específicos de detección y diagnóstico para identificar cepas nuevas, más virulentas o resistentes. El estudio del pangenoma puede mostrar cómo una población patógena cambia con el tiempo, ayudando a predecir posibles brotes o fallos en el control basado en resistencia genética. Como ejemplo concreto, en el hongo fitopatógeno Magnaporthe oryzae (causante del añublo del arroz), el análisis del pangenoma ha permitido identificar genes de efectores que determinan si una cepa puede infectar a ciertas variedades de arroz y ello ha sido clave para el diseño de programas de mejora genética más eficaces. El pangenoma se puede representar, de forma básica, como una lista de genes presentes o ausentes en cada cepa o individuo, mediante una matriz. Como segundo tipo de pangenoma, denominado “secuencia representativa del pangenoma” (representative sequence pangenome), también puede expresarse como una concatenación de genomas completos o sus secuencias representativas, lo que es útil para análisis comparativos. El tercer tipo, denominado “pangenoma gráfico” (pangenome graph o graphical pangenome), integra múltiples secuencias genómicas de organismos de la misma población, especie o género en un único genoma de referencia.

Forma más utilizada actualmente para representar pangenomas. 1. (variation graph or sequence graph). Estructura que representa todas las secuencias genómicas (genes, variantes, inserciones, deleciones, etc.) presentes en una población o especie determinada, organizadas en un grafo donde los nodos representan fragmentos de ADN y los arcos o bordes, conectan estos fragmentos según las distintas posibles secuencias que pueden existir en diferentes individuos. Se trata una de representación computacional del conjunto completo de la variación genética dentro de una especie (o grupo de organismos relacionados), que utiliza una estructura de grafo, en lugar de una secuencia lineal usual. Las herramientas más comunes actualmente, aunque en constante evolución y por tanto, aunque en riesgo de quedar obsoletas o superadas por otras, son: i) kit de herramientas de grafos de variación (VG Toolkit); ii) minigrafo / minigrafo-cactus (minigraph / minigraph-cactus); iii) constructor de grafos de pangenoma (pangenome graph builder, pggb); y iv) ensamblaje gráfico de fragmentos (graphical fragment assembly, gfa). 2. Grafos de de Bruijn coloreados (colored de Bruijn graphs). Este tipo es una extensión del grafo de de Bruijn tradicional, donde cada nodo (kámeros o k-mer) está «coloreado» para indicar en qué genomas o muestras están presentes. Los «colores» no son colores literales, sino etiquetas que indican la procedencia. El grafo de de Bruijn resulta muy útil para representar grandes conjuntos de genomas bacterianos.

1. Superficie que sirve de protección, separación, barrera o abrigo de plantas frente a vectores aéreos. 2. Superficie sobre la que se observan o proyectan imágenes. 3. Lámina que se sujeta delante o alrededor de un foco luminoso artificial, para que la luz no moleste a los ojos o para dirigirla hacia donde se quiera.

Enzima proteolítica aislada del jugo del fruto y látex de las hojas de Carica papaya (papaya, fruta bomba, lechosa, mamón, olocotón, o papayón). Posee actividad bactericida y bacteriostática. Se utiliza para tratar las moléculas de IgG y generar, mediante una proteólisis limitada, los fragmentos de anticuerpo correspondientes a los diferentes dominios funcionales: dos fragmentos Fab capaces de unirse al antígeno y un solo fragmento Fc, puesto que las dos cadenas pesadas se mantienen unidas gracias a enlaces disulfuro. Estos fragmentos son útiles en detección y diagnóstico.

Papel poroso utilizado para filtrar líquidos o como soporte en el cultivo de tejidos vegetales in vitro.

Lámina patentada constituida de una mezcla de materiales tipo olefina, que resulta semitransparente, flexible y resistente al agua. Sella recipientes de laboratorio de forma rápida y efectiva. La película impide la evaporación y la contaminación de las muestras y protege materiales anhidros. Puede plegarse repetidamente y doblarse alrededor de superficies afiladas sin romperse. Se hace más flexible, más suave y más resistente conforme aumenta la temperatura, aunque tiene una temperatura límite de uso entre -45 y 50 °C. Resistente al alcohol, ácidos y álcalis. Se utiliza también para proteger injertos herbáceos recién efectuados, hasta su prendimiento. Está disponible en diversos formatos comerciales, en forma de rollo o tira.

Aquel usado como prueba rápida, económica y sencilla de determinación de la concentración de iones hidrógenos contenidos en una sustancia o disolución. El papel se sumerge en la solución y tras unos segundos se retira para comparación de su color con el de una escala de pH por rangos estrechos. Se suministra comercialmente en forma de tiras o rollos.

Papel utilizado para comprobar de manera rápida y sencilla si una sustancia o disolución es ácida o básica (alcalina). Se sumerge el papel en la solución y tras unos segundos se retira para comparación de su color que indicará si es de uno u otro tipo. Se suministra comercialmente en forma de tiras o rollos.

1. Pequeño abultamiento, protuberancia o prominencia, generalmente redondeada, situada sobre la superficie de distintos órganos de vegetales y en el extremo de algunos esporangios. 2. En oomicetos, denominación de la zona mucilaginosa de la pared interna del esporangio que, cuando es joven, absorbe agua y finalmente se disuelve para permitir la salida de las zoosporas o hifa, y que, en último caso, puede producir una vesícula inestable. 3. En nematodos, proyecciones cuticulares provistas de terminaciones nerviosas encontradas en varias regiones del cuerpo, con probable función de mecanorreceptores.

En los oomicetos, se aplica a los esporangios que tienen una papila bien desarrollada.

En los nematodos, papilas localizadas en la cola.

En los nematodos, papilas localizadas en los labios.

Con aspecto semejante al papel o al pergamino y con la consistencia del papel.

Propágulo multicelular y compacto originado a partir de una o varias células de una hifa (células centrales) que son rodeadas por ramas que surgen de la misma hifa, dando lugar a una diferenciación temprana entre el núcleo (constituido por células capaces de germinar) y la vaina. Las papulosporas son consideradas como propágulos mitóticos.

Par de nucleótidos unidos a través de puentes de hidrógeno entre bases complementarias. La adenina (A) se aparea con la timina (T) y la guanina (G) lo hace con la citosina (C).

Hifas filamentosas de pared delgada, hialinas y septadas que se encuentran entre las esporas, en la gleba de los gasteromicetos o en los esporóforos de los mixomicetos. El auténtico capilicio suele tener hifas de pared gruesa, aseptadas y de coloración marrón.

Grupo que incluye al ancestro común de sus miembros, pero no a todos los descendientes de este.

Estructuras estériles o células entremezcladas con las ascas o los basidiomicetos y unidas basalmente en el himenio.

Anteridio que contacta al oogonio en un lado, como en muchas especies del género Pythium.

Aquellos datos, factores o valores numéricos que se toman como necesarios para evaluar la fiabilidad de un análisis o prueba de laboratorio. En Fitopatología los principales son: sensibilidad y especificidad analíticas, precisión analítica y exactitud diagnóstica, valor predictivo de positivos y negativos y razón de verosimilitud, tanto positiva como negativa.

Cualquier variante de una especie, especialmente aquella que no se puede definir con mayor precisión debido a la falta de información.

Alelo sensible al silenciamiento.

1. Silenciamiento de la expresión de un alelo activo por parte de otro inactivo situado en el mismo locus en ciertos heterocigotos. Fue descubierto en el maíz. La paramutación produce un aumento progresivo de metilaciones de citosinas en el alelo paramutable. Se trata de un fenómeno de naturaleza epigenética, estable y heredable, pues los alelos no se reactivan durante la meiosis o la mitosis. 2. Fenómeno por el cual un alelo cambia hereditariamente la expresión de otro alelo del mismo locus, cuando ambos están en heterocigosis. El primer alelo se denomina paramutagénico y el segundo paramutable.

Denominación de las formas alteradas del alelo paramutable.

Alelo que induce el silenciamiento.

Virus de ADN circular de doble cadena (dsADN) que presentan diversas similitudes con retrovirus —que no se encuentran en plantas—, de manera que se replican en el núcleo mediante transcripción seguida de una transcripción reversa en el citoplasma; este tipo de virus no se ha documentado en ningún otro tipo de organismo fuera de las plantas, por lo que se considera que su presencia está limitada al reino vegetal. Pertenecen principalmente a la familia Caulimoviridae y a los siguientes géneros: i) Caulimovirus, como el mosaico de la coliflor (Cauliflower mosaic virus-CaMV), que no necesita integrarse en el genoma de la planta para replicarse, aunque se han encontrado secuencias similares a CaMV integradas en genomas de algunas plantas, lo que sugiere eventos de integración pasados; ii) Badnavirus, como el virus del rayado del banano (Banana streak virus-BSV), que puede integrarse en el genoma del plátano como elemento viral endógeno (EPRV). Bajo ciertas condiciones de estrés, como la hibridación o la propagación o cultivo in vitro, los elementos virales endógenos pueden reactivarse y generar infecciones virales activas, que entorpecen los programas de mejora genética del plátano; iii) Tungrovirus, como el virus baciliforme del tungro del arroz (Rice tungro bacilliform virus-RTBV), que infecta al arroz y se transmite junto a un virus de ARN; y iv) otros géneros como Petuvirus, Soymovirus, Cavemovirus, Rosadnavirus, y Florendovirus, este último género incluye pararretrovirus endógenos (endogenous pararetroviruses, EPRVs, incluidos en el genoma de diversas especies de plantas, entre ellas de los cítricos), que no siempre causan enfermedad pero han dejado huellas en su genoma. Así pues, aunque los pararretrovirus se replican a través de un intermediario de ARN mediante transcriptasa reversa, no se integran obligatoriamente en el genoma del huésped o anfitrión como parte de su ciclo de vida normal (a diferencia de los retrovirus verdaderos), aunque en algunos casos diversas secuencias de pararretrovirus pueden integrarse de forma accidental en el genoma de la planta, como secuencias virales integradas Aunque muchas son inactivas, algunas pueden reactivarse bajo condiciones de estrés y producir virus infecciosos.

Procesos que ocurren en muchos microorganismos, como hongos, oomicetos y bacterias, en los que se produce recombinación genética sin la necesidad de meiosis ni reproducción sexual. Implica la fusión de núcleos de células diferentes (cariogamia), el intercambio y recombinación de material genético, y la eventual segregación cromosómica. Este proceso permite la variabilidad genética en organismos que no realizan reproducción sexual convencional, permitiendo el intercambio de material genético entre individuos, lo que puede contribuir a la variabilidad genética y la adaptación a nuevos ambientes, incluyendo la resistencia a fungicidas o la capacidad de infectar nuevas especies de plantas o anfitriones. En hongos y oomicetos fitopatógenos, el intercambio de ADN generalmente ocurre a través de la fusión de hifas de diferentes cepas compatibles, seguida de la fusión de núcleos o cariogamia, recombinación genética y posterior segregación cromosómica. Los principales procesos parasexuales en bacterias son conjugación, transformación y transducción. Suele considerarse que otros elementos genéticos móviles —además de los bacteriófagos implicados en transducción—, como plásmidos o elementos transponibles, también dan lugar a procesos parasexuales en los diversos tipos de organismos; sin embargo, parasexualidad es un término muy poco utilizado en relación con estos elementos genéticos. Igualmente, los procesos de recombinación entre virus pueden considerarse procesos parasexuales, aunque la literatura científica muy raramente utiliza este concepto. Ejemplos de agentes fitopatógenos en los que se ha observado este proceso incluyen a especies como Colletotrichum acutatum, Fusarium oxysporum y Pyricularia oryzae.

Perteneciente o relativo a los parásitos.

Asociación en la cual un organismo (el parásito) se desarrolla a expensas de otro (el huésped o anfitrión).

1. Organismo animal o vegetal, que vive a costa de otro de distinta especie, alimentándose de él y depauperándolo sin necesidad de llegar a matarlo. 2. Organismo que vive dentro o sobre un organismo mayor, alimentándose de este, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5. 3. Ruido que perturba las transmisiones radioeléctricas.

Patógeno que solamente entra en un huésped o anfitrión a través de una lesión o herida.