Diccionario

Proporción de plantas que sufren una infección o plaga, respecto a la población total de plantas sensibles. Indica la frecuencia de casos de enfermedad o de infección en una determinada población y en un momento dado. Los parámetros de diagnóstico como la sensibilidad y la especificidad no dependen de la prevalencia, ni la tienen en cuenta, mientras que los valores predictivos sí se ven influenciados por ella. Es clave estimar su magnitud esperada para seleccionar la técnica de detección o diagnóstico más apropiada. Ante una prevalencia esperada alta de un determinado patógeno, es más conveniente utilizar la técnica que proporcione los resultados más sensibles. Frente a una prevalencia esperada baja, se aconseja utilizar la técnica más específica, reduciendo así falsos resultados y aumentando la precisión analítica. En casos especiales de estaciones de cuarentena o programas de selección sanitaria, es conveniente utilizar varias técnicas para lograr combinar alta sensibilidad analítica y buena especificidad, pues se desconoce la prevalencia real, aunque se espere baja.

Porcentaje de plantas en una población, parcela o masa forestal que están afectadas por una enfermedad específica. Puede ser puntual (en un momento dado) o de un periodo concreto (durante un lapso temporal). Se calcula como el número de plantas enfermas entre el total de plantas evaluadas. Es fundamental para entender la magnitud y el impacto de una epidemia en el cultivo, complementando métricas como incidencia y severidad. Es una medida de la frecuencia de la enfermedad, que indica cuántas unidades (plantas, hojas, frutos, etc.) tienen la enfermedad o síntomas de la misma, de un total examinado en un momento dado.

Aquella identificada por las autoridades competentes, que puede abarcar la totalidad de un país, parte de un país o la totalidad o partes de varios países, en donde una plaga o vector específicos se encuentra a niveles poblacionales bajos y que está sujeta a medidas eficaces de vigilancia, control o erradicación, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

Denominación común de la grave enfermedad causada por la bacteria gramnegativa, Xylella fastidiosa, localizada en los vasos de xilema de estos árboles. La enfermedad tiene gran prevalencia en los naranjos dulces cv. Natal, Pera, Hamlin, Selecta y Valencia injertados sobre lima Rangpur, mandarino Cleopatra, Citrus volkameriana o citrange Troyer, en Brasil. La lima Tahití y los mandarinos no muestran síntomas. En las plantas afectadas las hojas de los brotes jóvenes muestran una clorosis similar a la de una deficiencia de zinc, mientras que en las hojas de más edad aparecen jaspeados. El envés de las hojas presenta manchas de color marrón claro y ligeramente prominentes, que se corresponden con las zonas cloróticas del haz. Estas manchas son puntiformes o alargadas, están organizadas en grupos o en líneas y finalmente se convierten en lesiones necróticas. Las ramas de la parte superior de la copa del árbol pierden sus hojas y muestran síntomas de necrosis de ramillas. Las plantas infectadas producen frutos de calibre muy pequeño y que maduran prematuramente y la producción es muy reducida. El patógeno se disemina por multiplicación vegetativa de material infectado y naturalmente por insectos vectores (cicádulas, chicharritas o saltahojas) y se han identificado numerosas especies capaces de transmitir la bacteria de forma no circulante como Acrogonia terminalis, Bucephalogonia xanthophis, Dilobopterus costalimai, Oncometopia facialis, Plesiommata corniculata y otras. Se adoptaron medidas fitopatológicas muy drásticas para su control en Brasil, y una cepa de este origen fue la primera bacteria fitopatógena enteramente secuenciada por el consorcio internacional Allexys con base en Brasil. Sin embargo, actualmente esta enfermedad no representa allí un problema económico, debido esencialmente a los tratamientos que se realizan para el control del huanglongbing (HLB) en la citricultura brasileña, que resultan también efectivos frente a los vectores de la clorosis variegada. La clorosis variegada de los cítricos está presente en varios países de Sudamérica, pero no se ha descrito en ningún país de la Unión Europea ni de la cuenca mediterránea.

Aquella que se efectúa en una población de plantas cultivadas o silvestres asintomáticas cuando hay sospechas de presencia de un patógeno o vector, o cuando se desea estimar el número de reservorios o la prevalencia. Se utiliza para detectar específicamente un patógeno concreto, varios en infección mixta, o la presencia de vectores. Los resultados permiten estimar la prevalencia y tomar medidas fitosanitarias, anticipándose a la manifestación epidemiológica de la enfermedad que pudiera causar caso de diseminación.

Término usual pero inapropiado, pues se refiere a detección en muestras asintomáticas. Se utiliza en una población para detectar específicamente un patógeno, que al ser detectado permite estimar la prevalencia del mismo y tomar medidas fitosanitarias, anticipándose a la manifestación epidemiológica de la enfermedad que causa.

Aquella infecciosa que aparece de nuevo en una población y en el momento actual está incrementando su prevalencia e incidencia, colonizando nuevos huéspedes o diseminándose en nuevas áreas geográficas.

1. En su acepción más común, aparición esporádica, simultánea y explosiva de una plaga (en sentido amplio, o de un vector) en un alto porcentaje de individuos de una población vegetal, en el tiempo y el espacio y asociada a graves pérdidas de cosecha. 2. Cualquier cambio de la cantidad de enfermedad (prevalencia o incidencia) en una población a lo largo del tiempo.

Ciencia que desarrolla técnicas para estimar la severidad y prevalencia de las enfermedades de las plantas. Trata de los tipos de muestreo y uso de escalas de severidad de síntomas a aplicar según el objetivo de cada caso. Requiere conocimiento de los efectos y daños de las enfermedades y es muy utilizada en la evaluación de productos químicos y en la mejora de la resistencia de una planta huésped.

Medida del número de individuos afectados. Tasa de ocurrencia de una enfermedad, infección o infestación en una población vegetal, planta o parte de ella (rama, yema, hoja, flor, fruto, raíz, semilla, tubérculo u otra unidad de observación) o de artrópodos, en un tiempo determinado. Representa el número de nuevos casos de infección, plantas enfermas, vectores portadores, aparición de un síntoma, muerte o lesión de plantas, o variación de la prevalencia, que se presenta durante un período de tiempo específico entre dos estimas. Se expresa en porcentaje de plantas infectadas o infestadas (o de vectores portadores) en un intervalo de tiempo respecto al total de plantas sanas de una población o grupo de interés o al total estimado de vectores. La incidencia muestra la probabilidad de que una planta de cierta población resulte infectada o afectada por una enfermedad concreta.

Aquel que evalúa la concordancia o reproducibilidad de instrumentos de medida cuyo resultado es categórico (dos o más categorías) o resultados concordantes entre dos pruebas diagnósticas o de detección distintas y utilizadas sobre las mismas muestras. Representa la proporción de acuerdos observados respecto del máximo acuerdo posible más allá del azar. En su interpretación hay que tener en cuenta que el índice depende del acuerdo observado, pero también de la prevalencia de la enfermedad o porcentaje de plantas infectadas, del carácter estudiado y de la simetría de los totales marginales. Se calcula como una fracción en la que k=Po-Pe/1-Pe, donde Po es la proporción de acuerdos observados Po=(a+d)/N (siendo a=verdaderos positivos, d= verdaderos negativos y N= número total de análisis o determinaciones) y Pe la proporción de acuerdos esperados en la hipótesis de independencia entre los observadores (Pe=(rt +su)/N2; donde r=verdaderos positivos + falsos positivos; t=verdaderos positivos + falsos negativos; s=falsos positivos + verdaderos negativos; u=falsos positivos + verdaderos negativos; y N=número total de análisis o determinaciones) es decir, de acuerdos por azar. En función del resultado del índice se valora el acuerdo como: <0,00 sin acuerdo; 0,00-0,20 insignificante; 0,21-0,40 mediano; 0,41-0,60 moderado; 0,61-0,80 sustancial, y 0,81-1,00 casi perfecto.

Denominación común de fisiopatía de melocotones o duraznos. Consiste en la aparición de lesiones corchosas en zonas concretas de la piel y mesocarpio (pulpa) del fruto de coloración marrón que muestran una patente deshidratación y son visibles externamente. En estados avanzados las lesiones se oscurecen de forma similar a una sobremaduración. La alteración puede alcanzar alta prevalencia en los frutos, con las consiguientes pérdidas económicas. Presente en España.

Denominación común de la enfermedad asociada a la infección por el virus del manchado foliar de los cítricos (Citrus leaf blotch virus-CLBV), familia Betaflexiviridae, género Citrivirus, especie Citrivirus citri. El virus ocasiona manchas en las hojas, protuberancias, crestas, sobrecrecimiento y necrosis en la línea de unión de la variedad con el patrón Poncirus trifoliata y sus híbridos citranges y citrumelos. Se transmite por injerto y semilla. La importancia económica del virus es desconocida ya que no se ha determinado su prevalencia en las distintas zonas donde se ha localizado ni se ha podido demostrar su participación junto a otros patógenos en la incompatibilidad de ciertas variedades de cítricos sobre patrones trifoliados. No obstante, posee gran interés científico para el desarrollo de un vector viral eficiente de expresión o silenciamiento de genes, basado en el virus. Se transmite por injerto y semilla. Presente en España.

Denominación común de la enfermedad causada por el virus del mosaico del pepino (Cucumber mosaic virus-CMV), familia Bromoviridae, género Cucumovirus. Se ha considerado entre los 10 virus de plantas más importantes, no solo por la cuantía de las pérdidas económicas que causa, ya que produce graves epidemias en diversos cultivos, sino también por su interés científico, puesto que ha proporcionado herramientas para el estudio de la variabilidad y evolución de virus y de la interacción virus-huésped. Es el virus de plantas con mayor gama de huéspedes o anfitriones, pues infecta a más de 1.200 especies de plantas pertenecientes a 100 familias de monocotiledóneas y dicotiledóneas. Puede causar importantes pérdidas de producción que pueden oscilar entre el 50 y el 80 % de la cosecha, según el huésped y la presencia o no de RNA satélite. Además, es un virus con un alto grado de diversidad; se conocen un gran número de cepas que difieren tanto en propiedades biológicas como moleculares. Está ampliamente distribuido en todo el mundo, siendo mayor su prevalencia en zonas templadas o tropicales. Presente en España.

Denominación común de la enfermedad causada por el virus del mosaico enanizante del maíz (Maize dwarf mosaic virus-MDMV), familia Potyviridae, género Potyvirus, especie Potyvirus zeananus. Su síntoma característico es el mosaico foliar intenso en plantas jóvenes, que se vuelve difuso conforme la planta se desarrolla y tras las altas temperaturas veraniegas, presenta un amarilleo generalizado en hojas jóvenes. Las plantas infectadas jóvenes, presentan un notable enanismo. En sorgo muestra mosaico acompañado de manchas foliares rojizas o púrpura que posteriormente se necrosan. Se transmite por pulgones en forma no persistente, inoculación mecánica y algunos aislados por semilla en baja proporción. De distribución mundial, en España posee alta prevalencia en el Valle del Ebro (especialmente en Lérida/Lleida).

Mínima densidad de población de fitófagos, de lesiones que causa una enfermedad, o de plantas destruidas o de árboles a erradicar, que puede causar daño económico. Significa, el número mínimo de insectos, lesiones o pérdida de plantas que reduce la cosecha hasta el umbral de beneficio. El nivel económico de daños es un parámetro difícil de estimar y más aún de calcular con precisión, ya que, puede variar para un mismo cultivo y fitófago o enfermedad de un año para otro y entre momentos de un mismo año por los distintos estados fenológicos y estado de desarrollo de los insectos o del inóculo de una enfermedad o la manifestación epidémica de la misma. Para su estima hay que calcular el coste del tratamiento o medida fitosanitaria por hectárea (€/ha), que será función o dependerá de: i) del valor de mercado por unidad de producción (€/kg); ii) de las unidades de daño físico por insecto fitófago o agente patógeno/enfermedad (por ejemplo, plantas marchitas/ha o frutos dañados/planta, etc.); iii) de la densidad de población de fitófagos/ha o de la prevalencia de una enfermedad o de su incidencia/ha; y iv) del daño o perjuicio económico producido valorado en €/ha en función de la estima de kg/ha de producto agrícola perdido o dañado. Si el daño físico estimado en ii) no pudiera ser reducido en su totalidad con uno o varios tratamientos o medidas fitosanitarias concretas, habría que considerar también la eficacia del tratamiento o medida fitosanitaria (% de reducción del daño). Los principales factores que producen las variaciones del NED son el coste (€/ha) del tratamiento, medida fitosanitaria o enmienda, ya que influye directamente, mientras que el valor de mercado por unidad de producción (€/kg), las unidades de daño físico y el daño económico por unidad de daño físico producido (kg/ha) influyen inversamente.

Norma internacional sobre los Requisitos para el establecimiento de áreas de baja prevalencia de plagas. Producida por la Convención Internacional de Protección Fitosanitaria (CIPF) dependiente de la Organización de Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura (FAO).

Probabilidad de que la planta esté sana o el vector no sea portador, o esté infectada o sea el vector portador, una vez obtenido el resultado de la prueba (probabilidad postest), para lo cual se desarrollan los valores predictivos. El valor predictivo positivo (VPP) es la probabilidad de que la planta o el vector sea portador, una vez que el resultado de la prueba es positivo. Por su parte, el valor predictivo negativo (VPN) es la probabilidad de que la planta esté sana o el vector no sea portador, si el resultado de la prueba ha sido negativo. Estos dos parámetros dan una información más aproximada de la probabilidad posprueba. El problema puede surgir con los valores predictivos, que dependen de la prevalencia de la infección o enfermedad (probabilidad preprueba) en la población en la que se han calculado, por lo que no serán de utilidad para diferentes poblaciones en las que la prevalencia de la enfermedad o vector en estudio varíe.

Es la prevalencia de infección o tasa de enfermedad en un momento dado.

Aquella que se realiza a plantas anfitrionas o vectores que a priori se consideran sanos (asintomáticas o no portadores, respectivamente), con la finalidad de detectar precozmente la presencia de un determinado agente patógeno en un área reducida o país. Se considera una medida preventiva para estimar la posible prevalencia de un agente patógeno.

Mide cuan probable es un resultado analítico concreto, ya sea positivo o negativo, según la presencia o ausencia de infección o enfermedad. El inconveniente de la sensibilidad, la especificidad y los valores predictivos positivo y negativo es que no pueden utilizarse para comparar dos pruebas diagnósticas, ni son fiables al aplicarlos a datos propios, debido a que, principalmente los valores predictivos, dependen mucho de la prevalencia de la enfermedad en la población estudiada. Se calculan razones de verosimilitud para positivos, dividiendo la probabilidad de un resultado positivo en una muestra sana (sensibilidad) entre la probabilidad de un resultado positivo en los sanos (1- especificidad). Para negativos se calcula dividiendo la probabilidad de un resultado negativo en muestras infectadas (1-sensibilidad) entre la probabilidad de un resultado negativo en muestras sanas (especificidad). Existen tablas de interpretación de las razones de verosimilitud, muy comunes en medicina clínica y veterinaria. El uso de razones de verosimilitud sirve para estimar la probabilidad postest, utilizando el denominado nomograma, en el que, al representar gráficamente la probabilidad previa y la razón de verosimilitud, se obtiene una línea recta hasta el valor de la probabilidad posterior o postest.

Patógeno, enfermedad o vector establecidos desde hace tiempo en una zona geográfica determinada, cuya incidencia había disminuido o incluso había desaparecido, pero que actualmente vuelve a surgir o rebrotar, incrementando notablemente su prevalencia.

Denominación común de la enfermedad causada por el virus del rizado de la hoja del tomate Nueva Delhi (Tomato leaf curl New Delhi virus-ToLCNDV), familia Geminiviridae, género Begomovirus, que modula sus síntomas y gama de huéspedes con la interferencia de ADN betasatélite (aunque no hay evidencias de la asociación del betasatélite con los aislados españoles de ToLCNDV descritos). El virus, emergente en la zona mediterránea, posee una prevalencia notable en Asia. Su gama de huéspedes o anfitriones es amplia pues infecta a solanáceas como tomate, berenjena, pimiento y patata, se ha identificado en algodón y diversas cucurbitáceas como calabacín, calabaza, melón, pepino y sandía; pero además se ha descrito en papaya, cáñamo de la India y en algunas especies silvestres como Eclipta prostrata. Sus síntomas generalmente suponen la presencia de mosaicos amarillos, hojas enrolladas, nervios hinchados y retraso en el crecimiento de las plantas. En frutos de cucurbitáceas, se observan rugosidades de la piel. En infecciones tempranas las plantas afectadas sufren un fuerte retraso en el crecimiento y la producción de frutos o tubérculos se ve significativamente afectada, pudiendo llegar a ser prácticamente nula. El virus se transmite por la mosca blanca Bemisia tabaci de modo persistente circulante. Presente en España.

Grupo heterogéneo de sistemas de secreción de dos pasos, dependientes de la vía Sec. Sólo está presente en bacterias gramnegativas, en las que es el sistema de mayor prevalencia. Actualmente se divide en cinco clases, que incluyen: i) autotransportadores clásicos o monoméricos (T5aSS); ii) sistemas de dos componentes, también conocidos como TPS (two-partner secretion system) o T5bSS; iii) autotransportadores triméricos, denominados TAAs o T5cSS; iv) sistemas de dos componentes fusionados (fused two partner section), o T5dSS, que hasta ahora solo incluyen lipasas con dominios patatina; y v) tipo T5eSS, que incluye autotransportadores en los que el orden de los dominios está revertido en comparación con el tipo T5aSS. Hay numerosas proteínas secretadas mediante los T5SS, que a menudo están implicadas en la interacción con el huésped, facilitando la patogenicidad y virulencia; la mayoría participa en adhesión, formación de biopelículas, resistencia sérica, citotoxicidad y comunicación celular. En bacterias fitopatógenas, los sistemas T5SS participan en la adhesión y colonización tisular, como las adhesinas HecA/HecB de Dickeya spp.

Densidad o nivel de fitófago o vector, prevalencia de la enfermedad, densidad de mala hierba o incidencia de la deficiencia al que, o por encima del que, el valor de las pérdidas de cosecha, exceden el costo de las prácticas de control o medidas fitosanitarias o de la enmienda. La acción, tratamiento o medida fitosanitaria, al menos desde el punto de vista económico, merece la pena ser efectuado o ejecutado, antes de que se alcance el nivel o umbral de daño económico (UDE) o el daño económico. Por lo tanto, el UT suele ser menor que el UDE (en ocasiones es igual) para permitir que las medidas de control hagan efecto antes de que se alcance el nivel de daño. Suele ser un porcentaje del UDE. Puede ser determinado a partir del conocimiento del UDE y de la dinámica de poblaciones o previsiones epidemiológicas. Es muy variable en función del cultivo, la estación del año, la zona geográfica y el valor de la cosecha. Es el nivel práctico que debe utilizarse para tomar decisiones, es decir, tratar o no tratar, aplicar acciones y medidas fitosanitarias, o no.

Aquel valor positivo o negativo, que mide la eficacia real de una prueba diagnóstica. Indica la probabilidad de estar realmente infectado (sintomático o asintomático) o de ser un vector portador de un patógeno, una vez conocido el resultado de la prueba diagnóstica. Valor predictivo positivo (VPP) es la probabilidad que tiene una muestra de estar realmente infectada, cuando el resultado de la prueba que se le realice resulta positivo, y se calcula por la fracción: “positivos verdaderos o correctamente detectados x 100 / positivos verdaderos + falsos positivos”. El valor predictivo negativo (VPN) es la probabilidad que tiene una muestra de ser negativa (no infectada o sana), cuando el resultado de la prueba es negativo, y se calcula por la fracción: “negativos verdaderos o correctamente detectados x 100 / negativos verdaderos + falsos negativos”. Los valores predictivos, manteniendo la sensibilidad y especificidad invariables, se modifican drásticamente de acuerdo con la prevalencia de la enfermedad en la población. A medida que la prevalencia disminuye, el valor predictivo negativo aumenta y el valor predictivo positivo disminuye. Esta probabilidad se calcula según el teorema de Bayes: VPP = [S x P] / [S x P + (1 – E) x (1 – P)] y VPN = [E (1 – P)] / [E (1 – P) + (1 – S) x P], donde: VPP = valor predictivo positivo, VPN = valor predictivo negativo, S = sensibilidad, P = prevalencia y E = especificidad.

Término que alude al área o entorno de mayor devastación en un desastre y a partir de este significado, se ha extendido su uso figurado para aludir a cualquier lugar que sufre con más intensidad cualquier catástrofe, de origen natural o humano. En Fitopatología y Sanidad Vegetal se refiere habitualmente a las zonas donde se producen las infecciones más frecuentemente y con mayor prevalencia de una enfermedad, o atentados biológicos, inundaciones por lluvias torrenciales, heladas, o en las que se inicia una campaña de erradicación. Frecuentemente se utiliza para designar a la parcela o zona donde primero se detectó una enfermedad exótica grave, aún sin confirmar si realmente fue el lugar de la introducción y primera manifestación.

Aquellos datos, factores o valores numéricos que se toman como necesarios para evaluar la fiabilidad de un análisis o prueba de laboratorio. En Fitopatología los principales son: sensibilidad y especificidad analíticas, precisión analítica y exactitud diagnóstica, valor predictivo de positivos y negativos y razón de verosimilitud, tanto positiva como negativa.