1. Unión de dos hebras de ácido nucleico por complementariedad de bases; por ejemplo, el apareamiento de dos hebras de ADN para formar una doble hélice. 2. (mating). Unión de individuos por parejas para reproducirse sexualmente.
ADN híbrido
ADN bicatenario (ADNbc) artificial obtenido por apareamiento de dos hebras que presentan complementariedad total o parcial de bases.
amplificación al azar de ADN polimórfico
Aquella que utiliza cebadores de PCR cortos (alrededor de 10 bases) con secuencias arbitrarias y a bajas temperaturas de apareamiento. Hay descritos gran número de cebadores disponibles y es fácil de realizar, pero tiene ciertas limitaciones de reproducibilidad.
cebador
Secuencias sintéticas de oligonucleótidos que son utilizadas para reconocer por apareamiento complementario secuencias blanco o diana en ADN molde. Consiste generalmente en ADN genómico. Comúnmente se utilizan un par de cebadores en la reacción de amplificación de la polimerasa (PCR) para definir los extremos del producto que se desea amplificar, y a partir de ellos la ADN polimerasa utilizada inicia la polimerización en dirección 5´-3´. Entre muchas otras aplicaciones también son empleados en reacciones de secuenciación de ADN, donde se utiliza solo un cebador sobre una concentración relativamente alta de ADN blanco, para polimerizar cadenas sencillas de diferente tamaño truncadas por didesoxinucleótidos (método de secuenciación de Sanger) y así determinar las secuencias de bases nitrogenadas.
estringencia de las condiciones de hibridación
Término usual en laboratorio, a pesar de que no está reconocido por la RAE. Expresa las condiciones a las cuales se desarrolla la hibridación molecular y la detección del dúplex. La estringencia (rigor o fuerza) y la estabilidad de los complejos híbridos formados, determinan la especificidad de la formación de híbridos. A temperaturas más altas y menor concentración de sal, en general se incrementa la estringencia de la hibridación. Es conveniente utilizar formamida en la solución de hibridación para favorecer un correcto apareamiento de bases y al mismo tiempo disminuir las reacciones inespecíficas. Para la detección de virus de ARN, las hibridaciones se llevan a cabo a 65-68 °C, mientras que para los viroides una buena relación de señal/fondo se consigue a 70-72 °C en 50 % de formamida. Baja estringencia permite mayor cantidad de hibridación pero con menor especificidad (baja temperatura, alta concentración de sales). Alta estringencia implica menor cantidad de hibridación, pero mayor especificidad Los factores que afectan la estringencia son temperatura, concentración de sales, las bases no complementarias y la longitud del fragmento.
estructura en varilla
Característica de la estructura secundaria de mínima energía, del ARN genómico de algunos viroides, considerados típicos. No todos los viroides adoptan este tipo de conformaciones. La aplicación de programas informáticos para el cálculo de las estructuras secundarias de minima energía libre de los viroides ha permitido la obtención de una serie de conformaciones en forma de varilla o de cuasi-varilla, en las que regiones de apareamiento intramolecular se alternan con pequeños bucles de bases desapareadas. Hay que tener en cuenta que las conformaciones obtenidas con el empleo de esta aproximación in silico no tienen necesariamente que reflejar las que los viroides adoptan in vitro o in vivo. Sin embargo, existen datos experimentales, como microscopía electrónica y repeticiones de secuencia observadas en otros dos miembros de la familia Pospiviroidae, (Citrus exocortis viroid-CEVd y Coconut cadang-cadang viroid-CCCVd), que sugieren que ocurren de tal forma y que preservan sus estructuras secundarias de tipo varilla. Los viroides con estructura secundaria en forma de varilla (viroides típicos), se replican y acumulan en el núcleo.
glioxal
Reactivo de fórmula OHC-CHO utilizado para desnaturalizar ADN y ARN. Reacciona específicamente con los residuos de guanosina, impidiendo el apareamiento de las bases, ya que elimina con ello la estructura secundaria del ácido nucleico.
hebras complementarias
Dos hebras de ADN con secuencias de nucleótidos que permiten su apareamiento de bases en toda su longitud.
helicasa
Enzima que cataliza la separación de las dos cadenas de ADN bicatenario (helicasa de ADN), o bien la separación de las dos cadenas en un ARN bicatenario o en un ARN monocatenario con apareamientos intracatenarios (helicasa de ARN).
heterodúplex
ADN de doble hélice cuyas hebras complementarias difieren ligeramente en secuencia. Ello implica que hay zonas con apareamiento incorrecto. Las moléculas heterodúplex se producen normalmente durante la recombinación genética entre cromosomas homólogos.
hibridación
1. Proceso de unión de dos hebras de ácido nucleico por complementariedad de base, como el apareamiento de dos hebras de ADN para formar una doble hélice. Esta técnica se utiliza para detectar, localizar o identificar secuencias de nucleótidos, así como para establecer una transferencia eficaz de material genético a un nuevo huésped o anfitrión. 2. (hybridisation, hybridization). Cruce o apareamiento entre dos individuos genéticamente diferentes (que difieren en una o más características hereditarias).
hibridación cruzada
La de una sonda con unas moléculas que presentan un apareamiento imperfecto (menos de 100 % de identidad).
ilegítimo
1. Contrario al Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas (CINP) o al Código Internacional de Nomenclatura para Algas, Hongos y Plantas (CINB). 2. Incompatibilidad, aplicado a tipos de apareamiento.
lazo en horquilla
Región de doble hélice formada por apareamiento de las bases de una hebra de ADN o ARN que se ha plegado sobre sí misma.
legítimo
1. Aplicado a la validez de nombres científicos publicados o epítetos, significa que los mismos están de acuerdo con el Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas (CINP), al Código Internacional de Nomenclatura de Algas, Hongos y Plantas (CINB), al Código Internacional de Clasificación y Nomenclatura de Virus (establecido por el Comité Internacional de Taxonomía de Virus-ICTV) o al dictamen de la Comisión Internacional de Nomenclatura Zoológica (ICZN) para nematodos. Un taxón puede tener más de un nombre legítimo. 2. Aplicado a tipos de apareamiento, significa compatibilidad.
raza
1. Subgrupo o biotipo de patógenos dentro de una especie, variedad o patovar que se distingue por su comportamiento a la infección o inoculación (diferencias en virulencia, expresión de síntomas o, hasta cierto punto, gama de huéspedes o anfitriones), pero no por morfología. Las razas representan un grupo de apareamiento genéticamente y, a menudo, geográficamente distinto dentro de una especie. 2. Grupo de microorganismos que puede diferenciarse de otros individuos de la misma especie, subespecie o patovar por mostrar una patogenicidad diferencial frente a distintas variedades de una especie vegetal.