Diccionario

1. Gasto realizado para la obtención o adquisición de una cosa o de un servicio. 2. Valor monetario de lo destruido por plagas, en sentido amplio, o inmovilizado por normativa de prevención fitosanitaria en un proceso de producción.

Parte del coste que no varía con el volumen de producción.

Aquél en el que incurre una empresa, servicio de Sanidad Vegetal o laboratorio por la utilización de recursos ajenos para la realización de análisis, inspecciones, prospecciones, programas de prevención, erradicación o contención, cuarentena o saneamiento.

Parte del coste que varía con el volumen de la producción.

Regla elaborada por la Cámara de Comercio Internacional, según la cual el vendedor está obligado a sufragar los costes de fletes y seguro hasta el punto de destino. Tiene gran repercusión si la mercancía es retenida en frontera para su análisis sanitario o es rechazada por motivos sanitarios.

Aquella de microbios creada artificialmente mediante la mezcla y cultivo conjunto de diversos taxones, con la finalidad de simular la estructura y función de un microbioma natural determinado. Las comunidades microbianas asociadas a plantas no se ensamblan aleatoriamente y las teorías ecológicas sugieren que en la naturaleza tienen una organización filogenética definida y estructurada por reglas generales de ensamblaje comunitario. Mediante el aprendizaje automático, se pueden estudiar estas reglas y determinar las funciones microbianas que generan los fenotipos vegetales deseados. Es más probable que los ensamblajes bien estructurados conduzcan a una comunidad sintética estable que prospere bajo estreses ambientales, en comparación con la selección convencional de actividades microbianas individuales o taxonómicas. Sin embargo, asegurar la colonización microbiana y la estabilidad a largo plazo del fenotipo vegetal sigue siendo uno de los desafíos a superar con los SynCom, ya que la comunidad sintética puede cambiar con el tiempo. Las bacterias son los taxones microbianos más dominante en comparación con otros miembros del microbioma y las más comunes en los estudios de SynCom. La reducción de los costes de secuenciación, ha mejorado considerablemente la comprensión general de la ecología microbiana en el entorno vegetal, lo que permite ya diseñar comunidades sintéticas para mejorar la salud vegetal. El aprendizaje automático, con fenotipos de rasgos vegetales y microbianos como entrada, permite generar composiciones candidatas para SynCom. Pero establecer el número adecuado de microbios distintos en cada SynCom sigue siendo un reto práctico debido a la falta de conocimientos, de tecnologías industriales y a las dificultades para su manejo. Además, aunque una única comunidad sintética pueda proporcionar altos niveles de resistencia vegetal a múltiples patógenos, es poco realista pensar que dicha comunidad sintética funcionará como una solución universal. Para un escenario con mayores probabilidades de éxito, las comunidades sintéticas diseñadas deberían contener microbios con múltiples rasgos beneficiosos (como formación robusta de biopelículas, producción de metabolitos secundarios deseados, de compuestos orgánicos volátiles microbianos capaces de inducir resistencia vegetal, etc.) y poseer interacciones sinérgicas entre sí.

Instrumento o dispositivo que produce una señal inducida por radiación (dosis del personal) que se almacena en el dispositivo. Luego se procesa el dosímetro y se analiza la salida mediante una lectura posterior, diaria, semanal o mensual, según el riesgo de exposición. Los de uso más común por su bajo coste son los dosímetros termo luminiscentes y las placas de película.

Método de detección de agentes patógenos (transmisibles por inoculación mecánica, injerto, cuscuta o vectores), presentes en una muestra asintomática de la que se desea conocer su estado sanitario, o en aquella sintomática que se desea diagnosticar e identificar a su agente o agentes causales o asociados a los síntomas. Los ensayos biológicos más populares son la inoculación de plantas indicadoras herbáceas por inoculación mecánica o la de plantas indicadoras leñosas por injerto de inoculación. Son sensibles y frecuentemente constituyen la única forma de demostrar la patogenicidad y estimar la virulencia de agentes no cultivables. Pero precisan de instalaciones adecuadas, sofisticadas y costosas para favorecer la expresión de síntomas y evitar la contaminación exterior por vectores, y son lentos ya que precisan de días (en plantas indicadoras herbáceas) y meses o años en plantas leñosas. Hoy día están en desuso por la carencia de personal especializado, su alto coste y lentitud diagnóstica, y por la irrupción de métodos serológicos, de hibridación, amplificación molecular y de secuenciación masiva, que los van sustituyendo. No obstante, durante muchos decenios han constituido la prueba más sensible y única de conocer el estado sanitario para certificar plantas y semillas. 2. (biological test). Medida estimada de la concentración o potencia de acción de una sustancia mediante su efecto en células o tejidos vivos y en Patología vegetal muy utilizada para evaluar la virulencia. 3. (biological assay). Cualquier método, prueba o test, in vivo o in vitro, que implique experimentos en organismos vivos o sus tejidos.

La realizada sobre impresiones o improntas de secciones de material vegetal o en material escachado en soportes sólidos como membranas, donde queda inmovilizado. Permite la localización del patógeno en el tejido, además de ofrecer ventajas de facilidad de manejo de muestras y remisión de las mismas por correo a temperatura ambiente y bajo coste de procesado al no requerir purificación de ácidos nucleicos.

Técnica serológica que combina un sistema integral de análisis o dispositivo, basado en anticuerpos inmovilizados en una única tira de membrana que posee dos zonas (de conjugado y de captura) y permite la determinación rápida (5-15 minutos) de la presencia o ausencia de un patógeno o sus metabolitos o incluso de diversos analitos, como de dos aislados del mismo virus o de diferentes. Los dispositivos más utilizados en Fitopatología están compuestos por tiras reactivas inmunocromatográficas de nitrocelulosa o éster de celulosa. Para realizar el análisis, se añade una gota de extracto de la muestra o de una suspensión de células del microorganismo por un orificio redondo en la denominada zona de conjugado, mezclada con anticuerpos específicos del patógeno a detectar pero conjugados usualmente con nanopartículas de carbón coloreadas. Si la muestra contiene el antígeno problema, este se unirá a los anticuerpos conjugados formando un complejo que migrará a través de la membrana. Si no, migrarán separados el anticuerpo conjugado y la muestra sin antígeno, sin unirse. En la zona de captura del dispositivo (dos líneas separadas de anticuerpos) se encuentran fijados en una primera línea anticuerpos específicos frente a otro epítopo del antígeno problema. Al llegar la muestra a esta primera línea, los complejos formados por la unión del antígeno (muestra) con el conjugado quedarán retenidos y la línea se coloreará en este caso en rosa, negro o azul, según el color del delator (muestra positiva). En el caso contrario, si las muestras son negativas, aparecerá una segunda línea donde los conjugados sin fijarse al antígeno inexistente, quedarán retenidos por anticuerpos anti la especie animal utilizada en la prueba. Así pues, la aparición de dos líneas (positivo y control) indicarán la presencia del patógeno analizado y la aparición de una única línea de control indicará la ausencia del patógeno o su presencia en concentración inferior al límite de detección de la técnica y sus reactivos. Esta evaluación visual permite el análisis cualitativo y semicuantitativo. Mediante un lector especial, se pueden analizar de forma cuantitativa las tiras reactivas. Además de la rapidez de los resultados y la sencilla manipulación, los ensayos de flujo lateral tienen la ventaja de poder ser utilizadas en condiciones de campo por personal no especializado a un coste económico relativamente bajo.

Anegación temporal de terrenos que no están normalmente cubiertos de agua, generalmente ocasionado por los desbordamientos de ríos, torrentes de montaña y demás corrientes de agua continuas o intermitentes, así como las inundaciones causadas por el mar en zonas costeras y las producidas por la acción conjunta de ríos y mar en las zonas de transición. Su consecuencia para las plantas son fisiopatías que afectan al sistema radicular, que detiene su crecimiento con la consiguiente pérdida de rendimiento, reducción del intercambio gaseoso de la parte aérea, generación de senescencia prematura, grave marchitamiento de la hojas y clorosis. La tolerancia a inundaciones de diferentes especies vegetales es muy variable. Si su persistencia es prolongada la planta finalmente muere por anoxia (asfixia radicular). También favorece la aparición de enfermedades causadas por patógenos transmitidos por zoosporas como Phytophthora o de especies bacterianas anaerobias facultativas como las de los géneros Pectobacterium o Dickeya.

Sigla del inglés. Amplificación isotérmica mediada por bucle o asa, que utiliza una única temperatura para amplificar ácidos nucleicos y, por tanto, no requiere el uso de termocicladores ya que se puede realizar en baño termostático y la amplificación puede observarse visualmente mediante colorimetría, fluorescencia, etc. Está basada en el uso de una ADN polimerasa con actividad de desplazamiento de hebra y cuatro cebadores específicos. El método se ha adaptado a la amplificación de ARN (RT-LAMP). Su utilización se está incrementando en el diagnóstico de muestras que requieren sencillez y rapidez, bajo coste económico y la posibilidad de su uso in situ en campo, mediante equipos portátiles. Sin embargo, en muchos casos no se suele conseguir el mismo nivel de sensibilidad analítica que con PCR o RT-PCR en tiempo real.

Conjunto masivo, diverso y en constante crecimiento de datos generados en sistemas agrícolas y forestales a partir de sensores, estaciones meteorológicas, imágenes satelitales, drones, equipos de maquinaria, climatología, suelos, secuenciación genética y registros de campo, ente otros, que se procesan para extraer patrones y ayudar en la toma de decisiones para optimizar rendimientos, programar riego y fertilización, gestionar plagas y reducir costes. Estos datos, por su volumen, velocidad y variedad, requieren técnicas avanzadas de análisis como la inteligencia artificial para ser procesados y transformados en conocimiento útil. Esto permite detectar patrones epidemiológicos, anticipar brotes de enfermedades, relacionar factores ambientales con la diseminación de patógenos y el desarrollo de la enfermedad y optimizar estrategias de manejo integrado en cultivos y masas forestales. En silvicultura implica la recopilación de información de bosques a partir de sensores, imágenes satelitales y drones, datos de crecimiento, densidad, salud de la madera, calidad de cosecha, condiciones climáticas y manejo forestal, para modelar crecimiento, estimar biomasa, detectar precozmente enfermedades y plagas, cuantificar y delimitar su extensión, planificar operaciones de aprovechamiento, conservación y tratamiento, y mejorar la sostenibilidad.

En microscopía, aquel utilizado para rellenar la muestra o espécimen entre el portaobjetos (en la cual ya está fijada) y el cubreobjetos. Su misión es proteger la muestra o especialmente la delicada sección de tejidos, y suministrar un campo óptico claro. Existe una amplia gama disponible comercialmente, entre los más frecuentemente utilizados, están: Bálsamo del Canadá (actualmente en desuso debido a su alto coste y que se endurece y amarillea con los años), Permout (idóneo por su versatilidad), Merkoglass-EM Glass (apropiado en general y muy utilizado para tinciones con azul nitrotetrazolio-NBT), BioMount (muy utilizado para reacciones con anticuerpos marcados con oro coloidal), Euparal (útil si el tejido, la tinción o la matriz no toleran el xileno, usual en muchas técnicas de inmunolocalización), Gel/Mount (útil en inmunolocalización fluorescente o criosección en fresco), gelatina de glicerina, medio de goma arábiga y glicerol/PBS (muy comunes para muestras frescas), Vaspar (mezcla de vaselina y parafina fundida 1:1) y barniz pintauñas, utilizados estos dos últimos para sellar los bordes de cubreobjetos y evitar evaporación.

Campo de la Genómica en el que se persigue obtener secuencias del genoma de los diferentes microorganismos que componen una comunidad. Para ello se extrae, purifica y analiza su ADN de forma global. La posibilidad de secuenciar directamente los genomas de organismos, sin necesidad de cultivarlos in vitro, abre nuevas posibilidades en Fitopatología. Ha supuesto una revolución científica debido a su alto rendimiento y relativo bajo coste. Permite acceder al genoma sin observar a los microorganismos ni cultivarlos. Se aplica frecuentemente para estudiar la diversidad, evolución e identificación de una región del genoma en miembros de un grupo que parece ser de importancia para la gama de huéspedes, o para conocer los microorganismos presentes en muestras vegetales, de artrópodos o del medioambiente.

Protocolo práctico, portátil y de bajo coste diseñado para obtener imágenes estandarizadas y de alta calidad de colonias microbianas (bacterianas, fúngicas o de oomicetos) mediante el uso de teléfonos inteligentes y un estudio fotográfico artesanal equipado con luz anular. El sistema, permite mejorar la reproducibilidad científica y la documentación visual en investigaciones microbiológicas y fitopatológicas, así como en actividades de divulgación y educación científica. La fotografía ha revolucionado la ciencia al permitir la documentación y el análisis de fenómenos, incluidos los cultivos microbianos, donde las imágenes de alta calidad son esenciales para la investigación y publicación. Sin embargo, ciertas características inherentes de los objetos, como las superficies reflectantes de las placas de Petri y las particularidades de las colonias, suelen comprometer la calidad de las imágenes. Por ello este u otros protocolos similares, ponen de manifiesto la necesidad de soluciones accesibles y de bajo costo.

Tipo de microscopía que permite formar una imagen topográfica en escalas desde cientos de micras hasta nanómetros (1×10-9 m) sobre la superficie de un material conductor o semiconductor, mediante el barrido de una punta muy aguda conductora de una corriente eléctrica a una distancia de unos pocos nanómetros. Su coste es muy inferior al de la microscopía electrónica por lo que se ha hecho popular en muchos laboratorios para visualizar regiones de alta o baja densidad electrónica superficial e inferir la posición de átomos individuales o moléculas en la superficie de una red. Su resolución es de menos de 1 nm, lo que le permite distinguir detalles tridimensionales en la superficie de una muestra con una ampliación de varios millones de veces.

Denominación común de la enfermedad causada por el nematodo Bursaphelenchus xylophilus, considerado como organismo prioritario de cuarentena en la Unión Europea. Procede de EE. UU., aunque los daños más graves los ha producido en Japón tras su introducción a principios del siglo XX. El nematodo provoca graves daños en las especies del género Pinus y otras coníferas de los géneros Abies, Cedrus, Picea, Pseudotsuga y Tsuga. Su ataque causa el decaimiento súbito de los árboles afectados, produciendo una sintomatología conocida como seca o marchitamiento de los pinos. Provoca daños económicos y ecológicos derivados de la muerte del arbolado e importantes restricciones al comercio de madera y material de embalaje en aquellos países donde el nematodo está presente, lo que implica un aumento de los costes de comercialización de estos productos. El nematodo se desarrolla en el interior de la madera del pino y de otras especies de coníferas que presentan heridas o han sido recientemente cortados. Se transmite por insectos vectores del género Monochamus, principalmente por M. galloprovincialis. Presente en España.

Mínima densidad de población de fitófagos, de lesiones que causa una enfermedad, o de plantas destruidas o de árboles a erradicar, que puede causar daño económico. Significa, el número mínimo de insectos, lesiones o pérdida de plantas que reduce la cosecha hasta el umbral de beneficio. El nivel económico de daños es un parámetro difícil de estimar y más aún de calcular con precisión, ya que, puede variar para un mismo cultivo y fitófago o enfermedad de un año para otro y entre momentos de un mismo año por los distintos estados fenológicos y estado de desarrollo de los insectos o del inóculo de una enfermedad o la manifestación epidémica de la misma. Para su estima hay que calcular el coste del tratamiento o medida fitosanitaria por hectárea (€/ha), que será función o dependerá de: i) del valor de mercado por unidad de producción (€/kg); ii) de las unidades de daño físico por insecto fitófago o agente patógeno/enfermedad (por ejemplo, plantas marchitas/ha o frutos dañados/planta, etc.); iii) de la densidad de población de fitófagos/ha o de la prevalencia de una enfermedad o de su incidencia/ha; y iv) del daño o perjuicio económico producido valorado en €/ha en función de la estima de kg/ha de producto agrícola perdido o dañado. Si el daño físico estimado en ii) no pudiera ser reducido en su totalidad con uno o varios tratamientos o medidas fitosanitarias concretas, habría que considerar también la eficacia del tratamiento o medida fitosanitaria (% de reducción del daño). Los principales factores que producen las variaciones del NED son el coste (€/ha) del tratamiento, medida fitosanitaria o enmienda, ya que influye directamente, mientras que el valor de mercado por unidad de producción (€/kg), las unidades de daño físico y el daño económico por unidad de daño físico producido (kg/ha) influyen inversamente.

Sigla del inglés. En español, reacción en cadena de la polimerasa. Se sugiere el uso de la sigla PCR en español, en vez de RCP que le correspondería, para evitar la confusión con el uso extendido de la sigla del término “reanimación cardiopulmonar”. Se trata de una técnica de amplificación molecular desarrollada para producir múltiples copias sintéticas de una secuencia de ADN, o diana, al realizar varios ciclos sucesivos, de tres etapas secuenciales: i) desnaturalización del ADN diana a >90 °C; ii) hibridación de los cebadores o iniciadores a 40-65 °C; y iii) extensión a 72 °C. En cada ciclo se consigue, en poco tiempo, duplicar el número de copias de ADN de modo que se logra un aumento exponencial del número de copias del fragmento o amplicón. En la denominada PCR convencional, los fragmentos amplificados se separan mediante electroforesis en un gel de agarosa y se visualizan mediante métodos colorimétricos o basados en tinción con bromuro de etidio, GelRed u otros fluorocromos. También se pueden detectar los amplicones mediante hibridación en membrana, ELISA en microplaca y otros métodos, y su tamaño se calcula por comparación con fragmentos de ADN de tamaño conocido. Es utilizada frecuentemente para detectar e identificar organismos fitopatógenos, basada en la amplificación de un fragmento del material genético del patógeno. Se utiliza una pareja de iniciadores, o más, y su eficiencia se basa en la especificidad de los cebadores, tipo de polimerasa empleada, composición y estabilidad del tampón, pureza y concentración de la mezcla de nucleósidos trifosfatos (dNTPs), parámetros de la amplificación (temperatura de hibridación de los cebadores, concentración de MgCl2, etc.), así como en las características de la propia muestra. Su mayor inconveniente para la detección y diagnóstico reside en el alto riesgo de contaminaciones por aerosoles que se generan fácilmente en las distintas etapas, especialmente en la preparación de la electroforesis y que dan lugar a falsos resultados positivos, como coste de su alta sensibilidad analítica. Posee diversas variantes, entre otras: PCR anidada, PCR semianidada, PCR cooperativa, PCR asimétrica, inmunocaptura-PCR, impresión captura-PCR, escachado captura-PCR, PCR dúplex y múltiple, PCR cuantitativa, PCR en tiempo real, PCR digital, PCR capilar y otras menos comunes. La PCR es teóricamente un método de detección muy sensible. Sin embargo, en la práctica y aplicado a material vegetal, artrópodos, o especialmente ciertos tipos de suelo, la sensibilidad se reduce drásticamente por la presencia de inhibidores, que pueden dar lugar a falsos negativos. Para superar estos inconvenientes es imprescindible incluir un control positivo y varios controles negativos en el conjunto de las muestras. Asimismo, se emplean métodos de purificación de ácidos nucleicos y otras variantes más sensibles basadas en PCR anidada o PCR en tiempo real, alguna de las cuales pueden realizarse con métodos directos de preparación de la muestra. Para la amplificación a partir de ARN (PCR de ARN) debe realizarse una etapa previa de transcripción reversa (RT).

Tecnología similar a la PCR en tiempo real, pero que se basa en la separación de la muestra inicial en gran cantidad de alícuotas que son amplificadas individualmente y permite la cuantificación precisa y absoluta del producto amplificado. Se obtiene mayor sensibilidad que con PCR en tiempo real, hay menor efecto negativo de inhibidores y requiere baja cantidad de reactivos, pero los equipos y reactivos tienen en la actualidad un coste más elevado. También es frecuente la versión RT-PCR digital.

Aquella en la que se ha aumentado sustancialmente el número de árboles por hectárea de forma permanente con respecto al cultivo convencional, como consecuencia de una reducción evidente del tamaño del árbol ya sea mediante el empleo de patrones enanizantes, uso de variedades de escaso vigor, modificación del sistema de formación del árbol o del cultivo e incluso, en algunos casos, por la aplicación de sistemas retardantes del crecimiento, según definición del Diccionario de Ciencias Hortícolas de la SECH. La alta densidad de plantación, en ocasiones aumenta los riesgos de infección frente a determinadas plagas (hongos y bacterias) y en otros casos constituye una posibilidad de cultivo en zonas en las que es endémica una plaga, si la mayor producción en un corto período de tiempo inicial compensa o supera las pérdidas o costes generados por la infección. En ocasiones se realiza bajo protección de malla antivectores.

Alternativa a la mezcla de diferentes ribosondas para la detección múltiple basada en la hibridación molecular no isotópica. Esta estrategia consiste en la clonación en tándem de secuencias de ácido nucleico parciales de diferentes virus para permitir la síntesis de una ribosonda única. Se diseñó inicialmente para la detección simultánea de seis virus de frutales de hueso o carozo, y posteriormente para virus de tomate, virus y viroides de frutales y viroides de ornamentales, vid y frutales. La opción del uso de polisondas ofrece varias ventajas: i) solamente se necesita una reacción de síntesis para un gran número de virus/viroides, con el consiguiente ahorro de tiempo y costes, evitando así la variabilidad potencial en la eficiencia de las diferentes ribosondas; ii) a diferencia de la mezcla de ribosondas diferentes, esta estrategia no requiere el tratamiento con RNasa, necesario para evitar el fondo observado cuando altas cantidades de sondas de ARN-DIG están presentes en la solución de hibridación, y permite así la detección tanto de virus de ADN como de ARN en el mismo ensayo; y iii) posibilita el diseño de una “polisonda cultivo” específica para detectar diferentes virus/viroides y otros patógenos que afecten a un mismo cultivo.

Ensayo o experimento que se hace con organismos vivos. En Fitopatología habitualmente constan de ensayos sobre plantas indicadoras (incluyendo las cultivadas in vitro), hojas, flores o frutos desprendidos y manifestación de reacción de hipersensibilidad para bacterias (generalmente en hojas de tabaco), con fines de detección, diagnóstico o identificación de agentes patógenos. Los ensayos biológicos fueron los primeros en ser utilizados para el diagnóstico de virus, viroides y algunas especies bacterianas. Permiten detectar agentes patógenos, transmisibles por inoculación mecánica, cuscuta, injerto o vectores, de una planta donante problema a otra receptora sensible de la misma especie o de distinta. Las pruebas o bioensayos basados en inoculación por injerto son las más empleadas en plantas leñosas, y se basan en el establecimiento de conexiones citoplasmáticas, generalmente entre plantas de especies compatibles. Esto permite el paso de los agentes patógenos transmisibles por injerto desde la planta infectada a la planta sana. Se utilizan plantas indicadoras sensibles a la infección de una amplia gama de patógenos y que produzcan síntomas característicos. En el caso de algunas enfermedades, cuya etiología no ha podido ser aún determinada, la inoculación en distintas especies indicadoras es uno de los métodos de diagnóstico y detección disponible. La inoculación por injerto es todavía el método de inoculación biológica más utilizado para el diagnóstico de numerosas virosis de fresa, pequeños frutos, frutales, cítricos y vid, principalmente de aquellos agentes patógenos que permanecen con etiología desconocida. Los bioensayos, aunque de manera cada vez más reducida debido a su alto coste, duración y otros inconvenientes, continúan utilizándose en programas de certificación, debido a su simplicidad (aunque precisan sofisticadas instalaciones y personal experto) y polivalencia (posibilidad de detectar varios agentes patógenos, como virus, viroides y algunas bacterias, en un mismo huésped y ensayo). Las limitaciones de los métodos biológicos son el largo período de incubación (días para indicadores herbáceos y meses para leñosos) necesario para la expresión y observación de los síntomas por personal experto, el coste que implica el mantenimiento de invernaderos en condiciones controladas y los resultados a veces erráticos, debidos a interferencias entre varios agentes patógenos que pueden coinfectar una misma planta. Aún con estas limitaciones, los métodos biológicos son fiables y sensibles (se basan en la multiplicación del patógeno hasta provocar síntomas en huéspedes sensibles) y se continúan utilizando en programas de cuarentena y en estudios básicos, ya que son imprescindibles para valorar el poder patógeno y la agresividad en un determinado huésped. Paulatinamente, serán sustituidos por otros métodos, especialmente por la secuenciación masiva. 2. Los métodos de prueba biológica también describen experimentos estandarizados que determinan la toxicidad de una sustancia o material evaluando su efecto en los organismos vivos, frecuentemente en animales experimentales, sus tejidos cultivados in vitro, o plantas. Se realizan como un medio para establecer una relación causal entre el efecto biológico y la sustancia o material que se está probando.

Máquina o ingenio electrónico programable que es capaz de manipular objetos y realizar diversas operaciones, como la preparación de muestras, su análisis y la lectura e interpretación de resultados. La automatización mediante robots de los distintos pasos de las pruebas analíticas (como preparación de la muestra, realización automatizada de la técnica ELISA, extracción de ácidos nucleicos y su purificación, dispensado de reactivos y extractos, lavados, amplificación y detección de amplificados, lectura de resultados, etc.), implica que sean cada vez más utilizados. Minimizan los riesgos de contaminación y facilita el procesado de elevado número de muestras, aunque incrementa significativamente el coste del análisis. Están disponibles comercialmente distintos robots completos, como aquellos que realizan automáticamente una reacción ELISA, pruebas de PCR en tiempo real o una secuenciación completa, y sistemas robotizados para fines parciales, como el extractor de Gugerli, lavadores automáticos de placas de ELISA, robots de purificación de ácidos nucleicos, o secuenciadores automáticos, entre otros sistemas de amplia utilización y paulatinamente más económicos.

Recinto especialmente diseñado para obtener bajos niveles de contaminación y en el que se lleva a cabo un riguroso control de parámetros ambientales, del número de partículas suspendidas, temperatura, humedad, caudal de aire, presión e iluminación. Estas instalaciones están asociadas con un alto coste de operación y mantenimiento, pero son imprescindibles para manipular con seguridad agentes patógenos, plantas inoculadas con patógenos de cuarentena o mediante vectores, organismos modificados genéticamente y productos tóxicos. Poseen una serie de componentes estructurales, como son: esclusas de aire, entradas de aire filtrado estéril basado en filtros HEPA y sistema de renovación del mismo, escala de presiones o depresiones según el caso (presión positiva para evitar el acceso de contaminantes o negativa para facilitar el flujo de aire hacia zonas con menos riesgo), esclusas que mantienen diferencias de presión entre salas y el exterior, paredes recubiertas de vinilo, juntas siliconadas y esquinas redondeadas para evitar acumulación de polvo y favorecer su limpieza, eliminación del agua mediante tratamiento desinfectante, zona de lavado alejada de la zona de producción o inoculación. Los operarios deben vestir ropa adecuada para evitar la introducción de contaminantes y además todo el material se debe manipular con cuidado y por personal adiestrado en el uso de tales salas.

Tecnología de secuenciación basada en una serie de nuevas plataformas de secuenciación de alto rendimiento o nueva generación capaces de generar paralelamente, y de forma masiva, la secuencia de millones de fragmentos de ADN en un único proceso de secuenciación. Esto eleva significativamente el rendimiento a un menor coste y con ventajas significativas respecto a los sistemas convencionales. Esta tecnología permite la secuenciación de todo el genoma de un microorganismo, o de partes muy representativas del mismo, o de la mayoría de los que están presentes en una muestra vegetal (cultivables y no cultivables, patógenos o saprofitos) y sirve tanto para la detección de microorganismos ya conocidos, como de otros no descritos previamente. Como ejemplo, la tecnología de la plataforma de Oxford Nanopore es portátil y puede secuenciar ADN o ARN aislados de tejidos de plantas conteniendo microorganismos patógenos y saprofitos (bacterias, hongos, oomicetos, virus, viroides o nematodos, o infecciones mixtas de varios patógenos distintos), identificar a los patógenos por las secuencias que se obtienen automáticamente y tras un análisis bioinformático complejo, proporcionar información sobre la identidad de todos los microorganismos presentes. La significativa reducción del coste económico de este tipo de tecnologías hace posible ampliar su uso, incluso por compañías o laboratorios privados, que ofertan estos análisis de muestras. Las técnicas HTS han demostrado ser una herramienta muy valiosa en la identificación de mezclas de genotipos dentro de una sola planta. Con la ayuda de esta tecnología, se facilitará el estudio de las interacciones entre diferentes microorganismos, desvelando nuevos hábitats, mecanismos de patogénesis y de desarrollo de enfermedades. También podrá usarse para el estudio de interacciones planta-patógeno-vector a través de análisis transcriptómicos o para estudios de mecanismos de resistencia, que al final podrían conducir al desarrollo de nuevas herramientas de control.

Sistema internacional de certificación oficial de la Organización para la Cooperación y Desarrollo Económico (OCDE), que agrupa a los países más desarrollados, en el que España está adscrita y que es utilizado para la exportación de estos materiales a países terceros. Este sistema se propone: i) fomentar la producción y el uso de semillas de alta calidad en los países participantes; ii) proporcionar un marco jurídico para la certificación varietal de las semillas destinadas al comercio internacional, a través de la adopción de normas y definiciones comunes; iii) armonizar los procedimientos para la certificación; iv) reducir obstáculos técnicos al comercio y costes de transacción; y v) recopilar una amplia lista de variedades elegibles para la certificación (actualmente 200 especies y 54.000 variedades). A diferencia del sistema de certificación de la Unión Europea (UE), en el que las autoridades de control y certificación son las CC. AA., en el sistema OCDE la autoridad designada es el Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación (MAPA), a través de la Oficina española de variedades vegetales (OEVV), que realiza bajo su responsabilidad la gestión y tramitación de las certificaciones bajo este sistema (exportación de semillas). Entre otros trabajos incluye: i) la concesión de numeración de lotes y etiquetas (creación de bases de datos); ii) propuesta de inclusión de variedades y de conservadores en el catálogo OCDE, o retirada en su caso; iii) realización de los acuerdos de multiplicación en otro país; iv) recepción y archivo de los análisis internacionales (ISTA), emitidos por el Instituto Nacional de Investigación Agraria y Tecnologías Agroalimentaria (INIA); v) emisión de certificados OCDE para exportación; y vi) envío a la OCDE de estadísticas de certificación de este sistema, así como de los resultados de los ensayos de pre y post-control de semilla certificada OCDE, de carácter obligatorio, igualmente completando el modelo oficial, e intercambio de información con esta organización (participación en grupos de trabajo y reuniones anuales).

El punto donde se inicia el daño económico de una plaga en sentido amplio, fisiopatía, etc., se denomina umbral de beneficio, y se expresa en kg/ha mediante la fracción: coste del tratamiento o acción fitosanitaria o correctora (€/ha) dividido por el valor de mercado (€/kg) del producto agrícola o forestal. El daño económico aparece cuando la inversión monetaria o coste para suprimir las lesiones originadas por los fitófagos, o el coste de las acciones o medidas fitosanitarias frente a enfermedades o de las enmiendas frente a carencias, es igual a la reducción potencial del valor de la cosecha que genera el problema fitosanitario o carencial. Es decir, el umbral de beneficio representa los kilogramos de producto que hay que preservar o salvar por hectárea para que el tratamiento, la medida fitosanitaria o de enmienda, sea económicamente rentable.

Originalmente definido como el menor número de insectos que reducen el rendimiento hasta llegar al umbral de beneficio, es decir, que producen pérdidas cuyo valor es igual al del coste del tratamiento para su control. Actualmente se ha extendido para significar el nivel en el cual el coste de los daños causados por una plaga, en sentido amplio, en el cultivo o masa forestal comienza a exceder a los costes del control del fitófago, patógeno, mala hierba o del vector, causante de la misma. Los daños ocasionados son superiores a los costes de las medidas para reducirlos o evitarlos y el beneficio o ventaja de efectuar medidas, supone un buen manejo o control de plagas y vectores.

Aquel que constituye la base para medir el coste del efecto de los cambios de una plaga en sentido amplio (por ejemplo, en la biodiversidad, los ecosistemas, los recursos manejados o naturales) en el bienestar humano. Los bienes y servicios que no se venden en los mercados comerciales pueden tener un valor económico. La determinación del valor económico no impide las inquietudes éticas o altruistas para la supervivencia y bienestar de otras especies basándose en el comportamiento cooperativo, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

Denominación común de la enfermedad causada por el virus de la viruela del ciruelo o virus de la sharka de frutales de hueso o carozo (Potyvirus plumpoxi, Plum pox virus-PPV), de la familia Potyviridae, género Potyvirus. Puede afectar a todos los frutales de hueso o carozo (género Prunus), excepto al almendro. De amplia distribución geográfica en prácticamente todas las industrias frutícolas de prunus, únicamente no se ha detectado en Australia, Nueva Zelanda y Sudáfrica. Los síntomas de la enfermedad dependen del aislado viral (se han descrito 10 cepas o tipos monofiléticos distintos): D (Dideron), M (Marcus), C (Cerezo, Cherry), EA (El Amar), W (Winona), Rec (Recombinante, Recombinant), T (Turco, Turkish), CR (Cerezo ruso, Cherry Russian), An (Marcus ancestral, Ancestor Marcus) y CV (cerezo del Volga, Cherry Volga). Los aislados de PPV más prevalentes pertenecen a los tipos D, M y Rec. Las cepas PPV D y M pueden infectar con facilidad albaricoqueros o damascos (P. armeniaca), ciruelo europeo (P. domestica) y ciruelo japonés (P. salicina) y son especialmente graves en las variedades más precoces, pero no infectan a cerezo dulce (P. avium) ni a guindo o cerezo ácido (P. cerasus) y difieren en su capacidad para infectar cultivares de melocotonero o duraznero (P. persica). Estas dos cepas (D y M), también difieren en su patogenicidad; por ejemplo, los aislamientos de tipo M suelen causar epidemias más rápidas y síntomas más graves que los aislamientos de tipo D en P. armeniaca, P. domestica, P. persica y P. salicina. Además, se han descrito tipos PPV-Rec recombinantes naturales entre las cepas D y M, los cuales muestran un comportamiento epidemiológico similar al de la cepa D. Los aislados de tipo EA se restringen geográficamente a Egipto y se dispone de poca información sobre su epidemiología y sus propiedades biológicas. En varios países europeos se han identificado aislados del PPV que infectan a cerezo dulce y guindo o cerezo ácido. Dichos aislados forman dos tipos diferentes definidos como PPV-C y PPV-CR y más recientemente se ha descrito la cepa atípica CV que afecta en Rusia a cerezo ácido y no es C ni CR. Se detectó un PPV atípico en P. domestica en Canadá (PPV-W) que representa otra cepa del PPV y ha sido detectada posteriormente en varios países en Europa. En Turquía se ha detectado un segundo tipo de cepa recombinante que se ha definido como T. Se ha descrito un único aislado de PPV-An y se ha propuesto como posible ancestro de PPV-M. Los síntomas de la enfermedad pueden aparecer en los pétalos en forma de decoloración (rotura del color de los pétalos de la flor) en algunos cultivares de melocotonero o duraznero. En las hojas aparecen anillos y manchas cloróticas, que suelen desaparecer con la alta temperatura. Los síntomas económicamente más perjudiciales se presentan en los frutos, que además suelen caer prematuramente. Se producen anillos cloróticos y manchas deprimidas, generalmente acompañadas de deformaciones graves, acompañadas de gomosis interna, que confiere mal sabor al fruto, que es inservible incluso para la industria alcoholera. El endocarpio de los albaricoques o damascos con síntomas externos suele mostrar anillos cloróticos y manchas tipo ojo de perdiz, características de la infección por este virus. Los costes directos (pérdidas) e indirectos (manejo de la enfermedad) que representa la detección del virus en un país con importante industria frutícola son muy elevados. PPV se transmite por injerto y otras propagaciones vegetativas y de forma natural por distintas especies de pulgones de forma no persistente (las especies vectoras más eficientes en campo son Aphis spiraecola y Hyalopterus pruni). En España los únicos tipos detectados son PPV-D y en algunas áreas localizadas PPV-M.

Regla de la Cámara de Comercio Internacional según la cual el vendedor está obligado a entregar la mercancía (fruta, plantas vivas, etc.) cargada sobre el buque en el puerto de origen.