Diccionario

1. Sustancia que tiene la propiedad químico-física de dispersar sólidos finamente en el agua u otro líquido, como la suciedad o las impurezas de un objeto. Son productos sintéticos de limpieza de un laboratorio con la propiedad de disolver sustancias indeseadas mediante un agente limpiador (agente surfactante), que envuelve la suciedad y ayuda a eliminarla, sin afectar los tejidos de la ropa, utensilios de laboratorio de vidrio, porcelana, metal o las superficies del laboratorio (suelo y bancadas) o aparatos. 2. Sustancia química, generalmente iónica, utilizada para desnaturalizar proteínas intencionada y controladamente, como el dodecil sulfato sódico.

Sustancias o compuestos utilizados en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) que permiten optimizar e incluso potenciar las condiciones de la reacción de amplificación molecular de los ácidos nucleicos. Existe una amplia lista potencial como 2-pirrolidona, acetamida, propionamida, formamida, dimetilsulfóxido, albúmina de suero bovino, polietilenglicol, cloruro potásico o detergentes no iónicos, entre otros. Se recomienda probar empíricamente cada uno de ellos en cada sistema concreto, para verificar su utilidad.

Detergente iónico que se utiliza para desnaturalizar proteínas y para favorecer la migración de partículas virales tratadas en inmunodifusión y la realización de electroforesis de subunidades proteicas.

Aquella que utiliza agentes desnaturalizantes de proteínas, para hacer que pierdan su estructura tridimensional. Generalmente se utilizan agentes físicos (calor) o químicos como los detergentes (por ejemplo, dodecil sulfato sódico, sodium dodecyl sulfate, sigla SDS), caótropos (por ejemplo, urea) o agentes reductores (2-mercaptoetanol, ditiotreitol-DTT, entre otros) o cambios de pH o fuerza iónica. Para la visualización de las proteínas se utilizan diferentes métodos de tinción, siendo el más habitual el azul de coomassie. En la SDS-PAGE, la separación es función del tamaño (masa molecular), lo que permite determinar el peso molecular de las proteínas. Para ello se compara la movilidad electroforética de la proteína de peso molecular desconocido (problema) con el de proteínas de referencia de peso molecular conocido.

Sustancia de origen endógeno o exógeno que reduce la actividad enzimática. Puede competir con el sustrato por la unión al centro activo del enzima (inhibición competitiva), o unirse a un punto distinto de la molécula de enzima (inhibición alostérica). Esta última modifica, en ocasiones, la cinética enzimática y constituye un mecanismo muy frecuente de regulación metabólica, como también lo es el proceso contrario (activación), según definición del Diccionario de Ciencias Hortícolas de la SECH. Los inhibidores de la PCR son sustancias muy heterogéneas, que reducen la intensidad o inhiben la reacción de amplificación, como por ejemplo proteínas, grasas, ácido húmico, EDTA, fenol, proteasas, detergentes y distintas sales.

Inmunodifusión realizada en un medio solidificado con agar al que se añade el detergente dodecil sulfato sódico para desnaturalizar antígenos y hacerlos solubles para que puedan migrar más fácilmente. Se ha utilizado para closterovirus y otros virus de cápsidas largas y flexuosas.

1. Conjunto de productos que utilizan agentes químicos generalmente alcalinos, biodegradables y sin fosfato ni sosa cáustica, detergentes iónicos líquidos, o productos para enjuague ácido, entre otros, con la finalidad de limpiar o suprimir suciedad o productos químicos o reactivos en el material de vidrio, plástico, caucho, utensilios metálicos, aparatos, o superficies, mediante un prelavado o un lavado. Se pueden utilizar manualmente o en máquinas lavavajillas especiales de laboratorio. El término también incluye a los descontaminantes radioactivos o tensioactivos y productos desnaturalizantes de ácidos nucleicos. 2. Utensilios utilizados para realizar la limpieza manual de material de laboratorio, como escobillas o cepillos.

Instrumento que, a base de vibraciones de alta frecuencia, elimina sustancias adheridas a las superficies. Se sumerge la muestra a limpiar en un líquido, que puede contener algún detergente y se la somete a la acción de ondas ultrasónicas. Se utiliza especialmente para limpiar vidrio e instrumentos metálicos.

Proceso de eliminación, por medios mecánicos, físicos o ambos, de restos orgánicos e inorgánicos visibles o invisibles a simple vista, de una superficie inerte. La suciedad interfiere en cualquier técnica de desinfección y esterilización posterior, por ello es una condición previa e inexcusable a dichos procedimientos. Para desprender los restos de suciedad se utilizan generalmente sustancias detergentes, acompañados de alguna acción mecánica, como un cepillado y un enjuagado exhaustivo del material. Un secado minucioso, favorece luego su conservación.

Virión cuya cápsida está rodeada por una envoltura lipídica, frecuentemente bicapa, de origen celular, adquirida durante la gemación a través de membranas del huésped o anfitrión (retículo endoplásmico, Golgi, membrana plasmática, etc.). Contiene proteínas virales, generalmente glicoproteínas, implicadas en el reconocimiento y entrada en la célula. Su función es facilitar la entrada por fusión de membranas y el reconocimiento del huésped-vector. El ejemplo clásico es el virus del bronceado del tomate-TSWV, género Orthotospovirus, de virión esférico y envuelto, característica muy ligada a su transmisión natural por trips. No obstante, esta peculiaridad, rara en virus de plantas, le resta estabilidad frente a detergentes, disolventes y desecación.

Vertido de productos naturales o manufacturados en el ambiente, de manera que provoque efectos nocivos. El nivel de contaminación se valora en términos de demanda bioquímica de oxígeno (DBO) o demanda química de oxígeno (DQO) y valores altos de estos indicadores, sugieren niveles elevados de contaminación. La liberación de energía en forma de calor y la generación de excesivos niveles de ruido (sonidos y vibraciones) en el ambiente del laboratorio, son también formas de polución, como la contaminación del agua o de la atmósfera. El vertido de materia orgánica, como aguas residuales o de escorrentía de riego agrario y desechos agrícolas en el agua, puede originar contaminación con nuevos organismos parásitos o patógenos, así como una reducción significativa del contenido en oxígeno debido a la actividad bacteriana que descompone la materia orgánica. La contaminación del agua con elevados niveles de nutrientes inorgánicos debido a la lixiviación de fertilizantes favorece el crecimiento de algas por eutrofización. Los detergentes, aceites, plaguicidas, compuestos halogenados, otros xenobióticos y metales pesados de origen minero o del uso de lodos de depuradora, también provocan efectos nocivos en la vegetación y el medio ambiente. La polución puede ser: i) puntual, debida a razones concretas, que tiene lugar en áreas reducidas y por causas fáciles de identificar y solucionar. Esta polución o contaminación terrestre es habitual en las ciudades, los emplazamientos de antiguas fábricas, los alrededores de las carreteras, los vertederos ilegales y las depuradoras, o ii) difusa, que abarca territorios muy amplios y sus causas son diversas, difíciles de identificar y solucionar. Este suceso implica la dispersión de contaminantes a través de sistemas aire-suelo-agua y tiene un importante impacto sobre la salud y el medio ambiente. Entre las causas antropogénicas más habituales de la contaminación del suelo la FAO destaca la industria, la minería, las actividades militares, la gestión de desechos (la basura tecnológica y aguas residuales), la agricultura, la ganadería y la construcción de infraestructuras urbanas y de transporte.

Productos incluidos en una reacción de PCR para mejorar la amplificación, especialmente de segmentos de ADN complejos o largos difíciles de amplificar. Se componen de una amplia gama de compuestos que incluyen detergentes no iónicos, moléculas orgánicas, amidas de bajo peso molecular y codisolventes. Potenciadores como la betaína, el dimetilsulfóxido (DMSO), la formamida y el ditiotreitol (DTT), se utilizan comúnmente para mejorar los rendimientos.

Aquella que ha perdido su conformación nativa por exposición, intencionada o no, a un agente desestabilizador como la alta temperatura, sustancias que modifican el pH, alteraciones en la concentración, alta salinidad, tratamiento con detergente o agitación molecular, entre otras muchas causas. Se realizan tratamientos de desnaturalización de proteínas de agentes patógenos para lograr su mejor migración en medios gelosados, para limpieza y esterilización, u otros variados objetivos.

Proteína aislada originalmente a partir de la medusa Aequorea victoria. La proteína verde fluorescente nativa tiene un tamaño de 27 kDa (238 residuos de aminoácido), absorbe luz azul con un máximo a 395 nm y emite luz verde con un máximo a 510 nm, tanto en organismos bioluminiscentes como en estado puro en solución. A diferencia de otros marcadores fluorescentes no requiere sustratos exógenos para emitir fluorescencia. Por sus propiedades fluorescentes y su relativa estabilidad, se ha convertido en el marcador más utilizado para la detección de la expresión génica y especialmente para la localización subcelular de proteínas. Es in vitro una proteína muy estable y resistente a altas temperaturas (tm=70 °C), a pH alcalino, a detergentes, a disolventes orgánicos y a las proteasas más comunes, con excepción de la pronasa. Soporta tratamientos con glutaraldehido lo que permite su observación en muestras fijadas para estudios de microscopía. Su fluorescencia se pierde si la proteína es desnaturalizada tras tratamientos a temperatura muy elevada, a pH extremos o tratamientos con cloruro de guanidina, y puede ser recuperada parcialmente si la proteína se renaturaliza. Se trata de un marcador ideal tanto para visualizar microorganismos como para determinar expresión génica, localizar proteínas a nivel subcelular o aplicarla a estudios de supervivencia bacteriana o fúngica; sus ventajas como marcador en bacterias se resumen en: i) es fácil de detectar; ii) no precisa sustrato exógeno; iii) permite visualizar células individuales; iv) permite un sencillo procesado de las muestras incluso en muestras fijadas si es necesario; v) ofrece la posibilidad de observar bacterias en su entorno natural, sin destruirlo y en tiempo real; vi) permite analizar células vivas y discriminarlas; vii) se puede utilizar en combinación con otros fluorocromos; y viii) no suele plantear problemas de ruido de fondo por autofluorescencia de las bacterias. Ha facilitado enormemente el estudio de las interacciones planta-patógeno y se utiliza en multitud de especies fitopatógenas como un marcador para caracterizar el proceso completo de colonización, para estudiar el patrón espacial de expresión génica y de localización proteica en distintos agentes patógenos. Ha permitido un extraordinario progreso en el conocimiento de los aspectos celulares y moleculares de las interacciones patógeno-huésped o anfitrión. Además, los organismos transgénicos que expresan la proteína verde fluorescente pueden detectarse fácilmente en el interior de la planta sin ninguna intervención externa, proporcionando una valiosa información del desarrollo del patógeno dentro de la planta. Los cambios de secuencia realizados en el gen de la proteína verde fluorescente (GFP) han dado lugar a numerosas variantes de excitación y de emisión, disponibles comercialmente.

Compuesto químico capaz de disolverse en agua y grasas, ayudando a las grasas y aceites a mezclarse con el agua. Sustancia que, al adsorberse en una interfase, reduce la tensión superficial del medio en que está disuelto o, en general, la tensión superficial entre las fases del sistema, como la de dos líquidos insolubles uno en otro. Sirve como agente humectante o detergente.

Aquella ideada por Avinent et al. (1993), obtenida al pulverizar la planta entera, algunos brotes, hojas, frutos, etc. con una sustancia pegajosa no fitotóxica (como el spray Souverode). Se emplea para el muestreo de casi todo tipo de artrópodos visitantes que, al aterrizar sobre la parte rociada con goma, quedan atrapados. Es la más mimética con la planta y fiel en sus registros de los artrópodos visitantes de la parte rociada. Las plantas trampa rociadas deben ser renovadas cada 7-10 días y los artrópodos recuperados mediante lavado con un disolvente (frecuentemente aguarrás o esencia de trementina), y subsiguiente enjuague con detergente y son finalmente lavados con agua (con ayuda de un colador) y conservados en etanol del 70 % hasta su clasificación y análisis por PCR en tiempo real u otra técnica sensible. Frecuentemente se usan métodos directos de preparación de la muestra (especialmente las de escachado-captura), sin necesidad de purificar ácidos nucleicos.

Mezcla de sales de ácidos grasos, obtenida por saponificación de ácidos grasos con una solución alcalina, que da lugar a jabón y glicerina. Se fabrica a partir de sustancias naturales, como grasas animales y vegetales. Agente limpiador generalmente utilizado para cuidado personal o también de la ropa de laboratorio.