Diccionario

Conjunto de productos y utensilios suficientes para conseguir un determinado fin o realizar un procedimiento concreto de análisis, diagnóstico, detección o identificación, que se comercializan como una unidad con fecha de preparación y de caducidad. Además de los mencionados, se comercializan muchos kits para procedimientos muy diversos, como para el aislamiento y purificación de ácidos nucleicos, plásmidos, o diversos tests fenotípicos, secuenciación, o identificación de células viables, que son especialmente importantes en Fitopatología. Existen kits completos que permiten realizar enteramente las operaciones de diagnóstico, detección o identificación, directa o indirecta de un patógeno. En ellos se proporcionan testigos, tampones y los diversos componentes en las proporciones adecuadas, envasados de manera que se obtenga el mejor rendimiento de los componentes costosos o difíciles de obtener. Algunos componentes pueden comercializarse incluso prepesados, parcialmente prefabricados o ligados a soportes sólidos, con el fin de evitar las etapas preparativas. Existen también kits parciales que contienen únicamente los reactivos clave (anticuerpos, conjugados, sondas, iniciadores, tampones, etc.) para el fin perseguido. De cara a ser aceptados e incluidos en estándares internacionales de diagnóstico, requieren su homologación y validación.

Indicador biológico autocontenido, utilizado para validación y control interno del proceso de esterilización a vapor. Después del proceso de esterilización a 121-137 °C, se extrae el vial del kit y se activa aplastando la ampolla de vidrio. El indicador químico colocado en la ampolla debe cambiar de azul a marrón (puede no ser un cambio inmediato y se recomienda esperar unas horas). Seguidamente se coloca la ampolla en una incubadora a 57 °C durante 48 horas, junto con otra prueba de una ampolla sin procesar, pero activada aplastando la ampolla de vidrio. Se comprueba cada 12 horas la presencia de crecimiento bacteriano, observando el color del líquido. Si el color del líquido no cambia (permanece morado), el proceso se ha superado con éxito. Si el líquido cambia de color (a verde-amarillento), indica un fallo en el proceso de esterilización.

Aquel que utiliza métodos o reactivos que no han sido todavía validados, pero que se utilizan con fin experimental en un laboratorio, centro de investigación o entorno reducido de aplicación.

Denominación común.

Tipo de matraz generalmente de vidrio borosilicato, de paredes gruesas con muy buena resistencia al vacío, similar a un matraz Erlenmeyer que incorpora un tubo de desprendimiento, tubuladura u oliva lateral próxima a la boca. Se utiliza para destilación, recolección de gases hidroneumática (desplazamiento de volúmenes), y especialmente para filtraciones al vacío conectado a una trompa de agua o bomba de vacío. Disponible para volúmenes de 250, 500, 1.000 y 2.000 mL, generalmente.

Lugar adjunto al laboratorio o empresa donde se guardan, conservan o depositan temporalmente, en condiciones apropiadas y debidamente identificados, kits, reactivos, materia prima, materiales o productos, para ser posteriormente utilizados o embalados y comercializados.

Examen sistemático, exhaustivo e independiente para determinar si las actividades relativas a la calidad y los resultados conexos cumplen los requisitos previstos y si esos requisitos se aplican eficazmente y son apropiados para alcanzar los objetivos. Es usual en empresas productoras de reactivos y kits de detección y diagnóstico y en laboratorios de análisis.

Para generar confianza ante el consumidor, cumplir con la regulación y proteger la reputación de una marca, fabricantes y distribuidores deben asegurar las características básicas de las materias primas o reactivos utilizados a lo largo de toda la cadena de producción, o utilizados como componentes de kits de diagnóstico, evitando posibles fraudes. Las técnicas más usuales son análisis isotópico, análisis de composición química, análisis de alérgenos, análisis de perfiles cromatográficos, análisis serológicos, pruebas de especificidad, análisis genéticos y de amplificación molecular.

Conjunto de propiedades de un producto vegetal, de un método de diagnóstico o de detección, o de un kit concreto, que determinan su grado de aceptación por el consumidor o usuario.

1. Asistencia, participación, colaboración. 2. Oposición que, por medio de ejercicios científicos o técnicos, o alegando méritos, se hace a cátedra, profesor titular, funcionariado, jefatura de laboratorio, etc. 3. Competición, prueba entre varios candidatos para conseguir un premio. 4. (tender). Competencia entre quienes aspiran a encargarse de ejecutar una obra, realizar una venta de productos, kits o materiales de laboratorio, o prestar un servicio bajo determinadas condiciones, a fin de elegir la propuesta que ofrezca mayores ventajas.

Sustancia capaz de absorber agua del ambiente, de una muestra vegetal, de un producto o aparato. Son muy comunes en laboratorio el cloruro de calcio anhidro, sulfato de calcio (drierita), perclorato de magnesio anhidro o pentóxido de fósforo, y gel de sílice (silicagel), que se comercializan a granel o normalmente contenidos en bolsas porosas. La hidratación del desecante se detecta por cambio de color del agente desecante que lleva incorporado un indicador. Estos productos mejoran la protección frente a posibles daños a causa de la humedad, disminuyendo el punto de rocío del embalaje durante el transporte o almacenaje de kits y aparatos de laboratorio.

Variante de ELISA muy sensible para detección de antígenos complejos (agentes patógenos). De manera secuencial y mediada por etapas de incubación y lavado, se tapizan los pocillos de una microplaca o la superficie de un inmunoadsorbente con anticuerpos purificados específicos del agente patógeno a detectar, se añade la muestra (extracto bruto vegetal, suspensión bacteriana, dilacerado, exudados, lloros de vid, extracto de suelo filtrado, etc.), y se añaden los mismos anticuerpos que en la primera etapa, pero conjugados con una enzima (habitualmente fosfatasa alcalina). La reacción se revela con el substrato específico de la enzima marcadora (habitualmente p-nitrofenil fosfato) que por hidrólisis y efecto batocrómico producirá un color amarillo (valor ELISA a 405 nm) de intensidad proporcional a la enzima retenida. La reacción clásica y más sensible, se realiza añadiendo 200 L/pocillo de la microplaca en cada etapa, aunque para ahorro de reactivos y economía algunos kits comerciales utilizan solo 100 L/pocillo. Otras modalidades utilizan únicamente unos microlitros Los anticuerpos utilizados para tapizar o como conjugados pueden ser producidos en la misma especie animal o no. Frecuentemente se utilizan anticuerpos policlonales para tapizado y monoclonales específicos (solos o en mezcla de varios) como conjugados, o ELISA basado completamente en anticuerpos policlonales, en anticuerpos monoclonales o recombinantes de anticuerpos monoclonales, que confieren alta especificidad y sensibilidad. DAS es la modalidad más popular de ELISA para detección de agentes patógenos o sus metabolitos.

Máquina capaz de confeccionar paquetes de envío con un cierto número de unidades o viales de producto en el interior de cajas. Generalmente, las cajas son cerradas y referenciadas o etiquetadas por la misma máquina. Es frecuente en la industria de kits de diagnóstico que el rellenado de las cajas de un kit sea manual y que posteriormente estas sean embaladas automáticamente mediante una máquina.

Método utilizado para cuantificar el contenido en adenosina trifosfato (ATP) de una muestra biológica. Utiliza el complejo luciferasa/luciferina de la luciérnaga. Es un ensayo muy sensible del que se han desarrollado kits que se usan en el recuento automatizado de poblaciones bacterianas en distintos sustratos.

1. Igualdad en el valor, estimación, potencia, parámetros de diagnóstico, virulencia o eficacia de dos o más cosas, kits, patógenos, vectores o personas. 2. Factor que interviene en la reacción antígeno-anticuerpo en algunas técnicas serológicas de aglutinación y precipitación, por el cual solo se produce la reacción cuando se dan ciertas concentraciones relativas de antígeno y de anticuerpo (zona de equivalencia), no produciéndose la reacción en situaciones de exceso o defecto de uno y otro. Ello afecta a la sensibilidad de la detección de estas técnicas serológicas, y por ello están en desuso. No se produce en técnicas serológicas como inmunofluorescencia o ELISA.

Técnica de inmovilizado de dianas de agentes patógenos en un soporte sólido (membrana de papel, nitrocelulosa, éster de celulosa, nailon, etc.) para su posterior detección mediante pruebas inmunológicas, de hibridación o especialmente de amplificación molecular (PCR, RT-PCR, PCR en tiempo real o isotermas). Se presiona hasta aplastar directamente el material vegetal en el soporte sólido durante unos segundos o al posible vector, con ayuda en este caso, del fondo redondeado de un tubo de plástico o vial. Se puede realizar en campo o laboratorio por personal no especializado en métodos de detección o diagnóstico. Las dianas impresas pueden ser conservadas en un lugar oscuro y seco durante meses antes de su análisis o ser remitidas por correo a temperatura ambiente hasta un laboratorio para su procesado. Su uso no implica problemas cuarentenarios y suele ser empleado en pruebas interlaboratorio y como control positivo o negativo (material vegetal certificado sano), en algunos kits de diagnóstico y detección.

Signo gráfico que identifica los productos que respetan los correspondientes criterios de naturaleza medioambiental establecidos conforme a la normativa regulatoria del sistema voluntario de etiqueta ecológica de la Unión Europea. Se aplica tanto a determinados componentes de ciertos kits o estuches, como a material vegetal, productos y embalajes de material de laboratorio y otros.

1. Explicación de un tema o asunto por escrito o de palabra. 2. Presentación pública de productos, instrumentos de laboratorio, kits o artículos de la industria del diagnóstico y detección o de la ciencia con fines divulgativos, culturales y normalmente comerciales. 3. Conjunto de artículos disponibles o no comercialmente o de productos de una exposición pública. 4. Situación de un objeto en relación con los puntos cardinales del horizonte, como la plantación frutal que tiene una exposición norte. 5. Acción de exponer a la luz una placa fotográfica o un papel sensible durante cierto tiempo para que se impresione. También, de exponer a ciertos agentes, como el sol, los rayos X, la luz ultravioleta, la lluvia, el granizo, etc. para obtener el fin perseguido. 6. Parte central de un escrito, que se dirige a una autoridad administrativa o judicial, solicitando o reclamando algo.

Instrumento que permite la extracción automatizada de ADN o ARN de varias muestras basado en una amplia gama de kits para la extracción y el aislamiento específico de ácidos nucleicos. Frecuentemente estos aparatos se basan en la adsorción del ácido nucleico en partículas magnéticas o paramagnéticas y sistemas de pipeteado ajustable de alta precisión. Utilizan cartuchos de reactivos sellados. Suelen estar provistos de lámpara de rayos ultravioleta para la descontaminación de la cámara de muestras.

1. Fecha después de la cual las características especificadas de un reactivo, solución, espécimen, control, etc. no pueden seguir garantizándose. Determina la fecha útil de un producto o kit. Existen leyes nacionales y de la Unión Europea que marcan las principales pautas, pero la determinación de la fecha final la realizan los propios fabricantes, o en su caso, las empresas distribuidoras. Suele depender de las condiciones de almacenamiento recomendadas. 2. Aquella que se emplea en alimentos microbiológicamente perecederos, superada la cual su consumo puede suponer un peligro para la salud.

Contaminante orgánico e inorgánico incluido en la muestra de ADN o ARN que interfiere atenuando o inhibiendo completamente la reacción de amplificación por PCR o RT-PCR. La mayoría frecuentemente provienen de la muestra vegetal, del suelo o de la muestra de artrópodos analizada. Pero también pueden proceder del propio operador o del material y tampones utilizados para la amplificación, que han sido contaminados por el operador. Existe una amplia gama de métodos y protocolos y normas o precauciones de trabajo para reducirlos y de kits comerciales que eliminan o reducen significativamente los distintos inhibidores procedentes de la muestra.

1. En un sistema de gestión de calidad, objeto nuevo o cambiado que crea o redistribuye valor. Las actividades que resultan en innovación generalmente se gestionan. La innovación es generalmente significativa en su efecto. 2. Creación o modificación de un producto y su introducción en el mercado, como por ejemplo un nuevo kit o un nuevo reactivo específico.

1. Agente que interviene en las operaciones de compra-venta para facilitar los contactos entre comprador y vendedor. En general, cualquiera de los agentes, que frecuentemente son representantes de firmas de diagnóstico internacionales, que intervienen en el proceso de comercialización local de productos y kits. 2. (intermediate stock). Porción de tallo insertado entre el patrón y la variedad por medio de dos injertos. Se utiliza para evitar incompatibilidad, modificar el vigor y la fructificación de la variedad, y conferir resistencia o tolerancia frente a patógenos y factores abióticos adversos.

1. Relación de equipos, materiales, productos o kits existentes en un lugar en un momento dado. 2. Lista de los activos (biológicos) asociados con una zona de contención que identifica a los agentes biológicos y toxinas almacenados dentro y fuera de la zona de contención.

Denominación común de enfermedad viral de los cítricos causada por un complejo etiológico formado por los virus de la leprosis de los cítricos tipo citoplásmico C (CiLV-C) y C2 (CiLV-C2), familia Kitaviridae y género Cilevirus, y del tipo nuclear N (CiLV-N), familia Rhabdoviridae, género Dichorhavirus. Se caracteriza por la formación de lesiones cloróticas a veces con una necrosis central, que posteriormente evolucionan a chancros de cinco a seis milímetros de diámetro. En los frutos, estos chancros son deprimidos y a veces presentan grietas, pero sin llegar a afectar a los gajos. En brotes y hojas los chancros son planos o ligeramente prominentes y pueden formar manchas concéntricas o presentar impregnación de goma. Normalmente están rodeados por un halo clorótico. En ramas viejas dan lugar a la formación de escamas gruesas y resinosas, que recuerdan las producidas por psoriasis. Las hojas y frutos muy afectados suelen sufrir abscisión y los brotes pueden secarse. Plaga reglamentada por la North American Plant Protection Organization (NAPPO) y la European and Mediterranean Plant Protection Organization (EPPO) para el movimiento de material vegetal. Es transmitido por ácaros vectores como los de la especie Brevipalpus phoenicis.

1. Parte procedente de la división de algo que debe ser distribuido entre varias personas o laboratorios. 2. Conjunto de objetos, kits o instrumental similares entre sí que se agrupan con un fin determinado, como la realización de una prueba interlaboratorios. 3. Conjunto de unidades de un solo producto, identificable por su composición homogénea, origen, etc., que forma parte de un envío, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

Comerciante de instrumentos, productos químicos de laboratorio, reactivos y kits de diagnóstico, que vende al por menor, distribuyendo en exclusiva o no, productos de otras compañías que los fabrican o producen.

Forma de mercado en la que existe un solo oferente. Puede darse en ciertas variedades, cultivares o especies vegetales, instrumentos, compuestos químicos, reactivos o kits de diagnóstico que solo son ofrecidos por una determinada empresa productora, como determinados anticuerpos monoclonales específicos o algunas variedades o especies, o reactivos patentados o registrados, durante el período de protección legal de la patente.

Aquella de unos 10 nm de diámetro utilizada como sustancia densa a los electrones para marcar anticuerpos específicos, fragmentos de anticuerpo o antígenos, con fines de detección o de localización en un tejido. Están disponibles comercialmente anticuerpos antiespecie conjugados con oro y kits completos para su marcado. A la suspensión de oro en un líquido, generalmente agua, se le denomina oro coloidal.

Forma más utilizada actualmente para representar pangenomas. 1. (variation graph or sequence graph). Estructura que representa todas las secuencias genómicas (genes, variantes, inserciones, deleciones, etc.) presentes en una población o especie determinada, organizadas en un grafo donde los nodos representan fragmentos de ADN y los arcos o bordes, conectan estos fragmentos según las distintas posibles secuencias que pueden existir en diferentes individuos. Se trata una de representación computacional del conjunto completo de la variación genética dentro de una especie (o grupo de organismos relacionados), que utiliza una estructura de grafo, en lugar de una secuencia lineal usual. Las herramientas más comunes actualmente, aunque en constante evolución y por tanto, aunque en riesgo de quedar obsoletas o superadas por otras, son: i) kit de herramientas de grafos de variación (VG Toolkit); ii) minigrafo / minigrafo-cactus (minigraph / minigraph-cactus); iii) constructor de grafos de pangenoma (pangenome graph builder, pggb); y iv) ensamblaje gráfico de fragmentos (graphical fragment assembly, gfa). 2. Grafos de de Bruijn coloreados (colored de Bruijn graphs). Este tipo es una extensión del grafo de de Bruijn tradicional, donde cada nodo (kámeros o k-mer) está «coloreado» para indicar en qué genomas o muestras están presentes. Los «colores» no son colores literales, sino etiquetas que indican la procedencia. El grafo de de Bruijn resulta muy útil para representar grandes conjuntos de genomas bacterianos.

Etapa intermedia entre la experimental de laboratorio y la producción comercial de reactivos o kits de diagnóstico. Se utiliza para estudiar el escalado y otros aspectos y problemas de producción.

1. Cosa o artículo producido, como plantas, semillas, yemas de injerto, sustancias químicas de síntesis, reactivos, secuencias o kits de diagnóstico, entre otros. 2. Cantidad que resulta de la multiplicación, como plantas propagadas o amplicones, entre otros. 3. Tipo de planta, producto vegetal u otro artículo que se moviliza con fines comerciales u otros propósitos, según la terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

Normas y directrices establecidas por la Autoridad Europea de Seguridad Alimentaria (EFSA) con el fin de armonizar la planificación de acciones de vigilancia en los estados miembros de la Unión Europea (UE), para efectuar prospecciones conforme al estatus fitosanitario del área en función del patógeno o plaga objetivo. La vigilancia fitosanitaria es esencial para la detección temprana de brotes de plagas emergentes y los protocolos desarrollados ofrecen un marco metodológico flexible a través de un diseño estadístico y basado en el riesgo. EFSA ha previsto la incorporación de nuevas herramientas con el fin de optimizar las actividades de vigilancia. En la página electrónica: https://efsa.onlinelibrary.wiley.com/doi/toc/10.1002/(ISSN)1831-4732.toolkit-plant-pest-surveillance (de acceso libre), figuran desde el 7 de junio de 2023 dichos protocolos, que sucesivamente serán completados hasta cubrir todas las plagas, en sentido amplio, que deben ser vigiladas en la UE.

Producto químico, tampón, enzima, anticuerpos, sonda, cebadores, etc., usados para el diagnóstico, detección o identificación de agentes fitopatógenos o como componente de un kit de diagnóstico.

Normativa que regula los dispositivos médicos de diagnóstico in vitro, que incluyen cualquier producto utilizado para analizar muestras biológicas fuera del cuerpo humano con fines médicos. No se aplica directamente a vegetales, pues la Unión Europea (UE) considera los kits y reactivos para detección o diagnóstico fitopatológico como diagnóstico no in vitro (no-IVD o non-IVD), pero las pruebas de diagnóstico in vitro en agricultura y silvicultura pueden estar reguladas bajo normativas fitosanitarias específicas. La regulación del diagnóstico in vitro aplicado a vegetales abarca normas y directrices que garantizan la calidad, seguridad y eficacia de las pruebas utilizadas para detectar patógenos, plagas en sentido amplio y características genéticas en plantas. En función del país o región, estas regulaciones pueden estar bajo el marco de normativas fitosanitarias, reglamentos de biotecnología o leyes de comercialización de productos agrícolas. Las normas internacionales principalmente están reguladas en forma de estándares de detección y diagnóstico de agentes patógenos del Convenio Internacional de Protección Fitosanitaria (CIPF) o estándares IPPC-FAO, de la Organización Europea y Mediterránea para la Protección de Plantas (OEPP/EPPO) o CABI, principalmente, entre otras. Además, el Codex Alimentarius establece directrices para la biotecnología aplicada a cultivos agrícolas y plantas forestales. En la UE la regulación está descrita en el Reglamento (UE) 2017/746 sobre productos sanitarios para diagnóstico in vitro (RDIV-IVDR), con posibles aplicaciones en plantas modificadas genéticamente y en la normativa sobre Sanidad Vegetal (Reglamento UE 2016/2031) que regula la detección y control de plagas en sentido amplio. En EE. UU., la USDA-APHIS regula las pruebas de diagnóstico de enfermedades en cultivos vegetales y la FDA puede intervenir si hay implicaciones en la seguridad alimentaria. En América Latina depende de organismos nacionales como SENASA (Argentina), SAG (Chile), ICA (Colombia) o SAGARPA (México), etc., con normativas específicas para diagnóstico fitosanitario. Las técnicas de detección y diagnóstico más usuales hacen referencia a ELISA, amplificación molecular por PCR o secuenciación génica. Los laboratorios deben de estar acreditados por organismos oficiales y los métodos utilizados deben de estar validados según estándares internacionales. Se considera que la correcta regulación del diagnóstico in vitro en vegetales es clave para evitar la propagación de enfermedades, garantizar la seguridad alimentaria y facilitar el comercio internacional.

Instrumento fabricado en vidrio o polipropileno, que se utiliza para realizar un vacío moderado en un recipiente. Consiste en un tubo de vidrio abierto al exterior por donde se efectúa la alimentación con agua desde el exterior, el cual se va estrechando, de manera que en su parte más estrecha termina bruscamente, aunque comunica con otro que penetra en su interior, dejando un cierto hueco por el que se produce la extracción de aire. Normalmente se usa con un matraz de Kitasato y un embudo Büchner. La corriente de agua a través de la trompa genera un vacío en el matraz que acelera la filtración de la suspensión contenida en el embudo.

1. Duración de un producto químico o biológico, kit, instrumental o aparato de laboratorio, o de un tratamiento fitosanitario, durante el cual mantiene sus características y reacciona o funciona a pleno rendimiento, almacenado en unas condiciones determinadas. Período de tiempo durante el cual los fabricantes garantizan que los componentes conservan sus propiedades y utilidades. 2. Período de tiempo durante el cual una teoría o tecnología de laboratorio dura o sigue siendo popular. Por ejemplo, la inoculación mecánica de plantas indicadoras herbáceas tuvo una vida útil de unos 20 años, y ha dejado de utilizarse de forma generalizada como método de detección de virus ante nuevas tecnologías más simples y precisas.

Denominación común del virus emergente Tomato fruit blotch virus (ToFBV, Blunervirus solani), que infecta a tomate (Solanum lycopersicum) cultivado en campo o invernadero. Pertenece al género Blunervirus, dentro de la familia Kitaviridae. Afecta a los frutos del tomate, principalmente a los más viejos, y hasta la fecha no se han descrito síntomas foliares. Los frutos afectados muestran un maduración irregular, manchas amarillas y clorosis irregular en la superficie de la piel, abolladuras y hoyuelos y, en ocasiones, manchas oscuras. No obstante, presenta síntomas muy variados y agravados por infecciones mixtas con otros virus. Aunque no se conocen vectores, se sospecha que el ácaro bronceado del tomate (Aculops lycopersici) está involucrado en la transmisión del virus. El comercio de plantas infectadas parece ser la ruta más probable de dispersión a larga distancia. Descrito por primera vez en Italia, está presente en Portugal y toda la zona mediterránea de la Organización Europea y Mediterránea para la Protección de Plantas (OEPP/EPPO), aunque se supone una mayor extensión. Presente en España.

Aquella que permite realizar el control biológico y verificar el correcto funcionamiento de la esterilización realizada en un autoclave de vapor de agua.