Diccionario

Región del enzima a la cual se une el sustrato durante la conversión catalítica a un producto, formándose un complejo enzima-sustrato.

Región de una molécula de ADN que es mucho más susceptible de recombinar o de sufrir una mutación que otras zonas de tamaño similar de la misma molécula.

Lugar específico dentro del organismo objetivo (como una enzima, proteína o estructura celular) donde actúa el producto fitosanitario de manera específica para ejercer su efecto tóxico o de control. Por ejemplo, en el caso de los triazoles, el sitio de acción son las membranas y el modo de acción (MoA) es la alteración de la biosíntesis de esteroles, que se basa en inhibir la enzima C14-demetilasa, bloqueando la desmetilación de esteroles.

Lugar específico en una planta huésped o anfitriona en el cual la invasión por un patógeno puede ocurrir (raíz, tallo, ramas, brotes, hojas, flor o fruto, etc.).

Una parte concreta de un lugar de producción que es manejada como una unidad separada para propósitos fitosanitarios, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

Sitio de producción en el cual una plaga específica está ausente, tal y como se ha demostrado por evidencia científica y en el cual cuando sea apropiado, esta condición se esté manteniendo oficialmente por un período definido, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

1. Secuencia de pares de bases reconocida por una endonucleasa de restricción. 2. Secuencia de pares de bases, epítopo o determinante antigénico, reconocido por un anticuerpo.

Secuencia de DNA a la que se une específicamente una enzima de restricción. Las endonucleasas de restricción del tipo II reconocen y cortan el ADN en secuencias de tetra-, penta-, hexa- o heptanucleótidos que generalmente poseen un eje de rotación de simetría.

Conformación lineal o espacial de átomos o moléculas que es reconocida o conforma el punto de unión de un ion, compuesto, anticuerpo, virus, célula u organismo, en otra estructura u organismo.

1. Región o zona de un patógeno o sus metabolitos, elegida para producir o diseñar herramientas o reactivos apropiados para su diagnóstico universal (sitios conservados) o específico o para su inactivación efectiva por medio de pesticidas o agentes de biocontrol. 2. Región de la secuencia que se utiliza en el diseño de sondas o cebadores, ya sea por su especificidad o por representar una secuencia conservada y, por tanto, apta para un diagnóstico universal. 3. Epítopo o determinante antigénico elegido para diagnóstico selectivo o universal, por medio de anticuerpos, generalmente monoclonales o recombinantes producidos frente al mismo, ya sea natural (purificado) o sintético (generalmente péptidos).

Técnica por la que el ADN genómico o plasmídico se trocea con una endonucleasa de restricción en fragmentos de longitud variable. Los fragmentos se separan por electroforesis en gel de agarosa y se estima su tamaño. Alternativamente se transfieren a una membrana, normalmente de nitrato o éster de celulosa. Seguidamente se trata la membrana con ARN o ADN desnaturalizado, radiactivo y de secuencia complementaria al gen de interés y se procede a revelar por autorradiografía con 32P o bromuro de etidio. Si se utilizan distintas enzimas de restricción aisladas o combinadas en mezcla, puede construirse el mapa de sitios de restricción. La técnica prácticamente ha sido sustituida en la actualidad por la secuenciación.

Parte estructural del aparato bucal de los artrópodos, que tiene especial relevancia en vectores al ser un posible sitio de retención de patógenos. Estructura anatómica del estilete de pulgones. Región anatómica bien diferenciada presente en la cutícula, en la cara interna del canal alimentario/salival común, en la punta de los estiletes maxilares de los pulgones; lugar donde se retienen algunos virus como el del mosaico de la coliflor (Cauliflower mosaic virus-CaMV) de transmisión no circulante durante las penetraciones intracelulares de los estiletes en la epidermis de plantas infectadas. En el acrostilo se une la proteína de ayuda de CaMV (P2) con las proteínas cuticulares del vector.

Sigla del inglés. En español, polimorfismo de la longitud de los fragmentos amplificados. Técnica destinada a explorar simultáneamente el polimorfismo de sitios de restricción y la amplificación arbitraria o al azar de secuencias. La resolución de los fragmentos se realiza en geles de poliacrilamida, usando preferiblemente marcadores fluorescentes o radiactivos.

Estudio de los fragmentos de ADN de tamaño previsible originados por la digestión (corte) de una cadena de ADN por una enzima de restricción específica. Las alteraciones (mutaciones o polimorfismos) producidas en la secuencia de ADN que destruyen o crean nuevos sitios de corte en el ADN, modifican el tamaño y el número de los fragmentos de ADN resultantes de dicha digestión.

1. Cualquier sustancia que, al ingresar en un organismo inmunocompetente, estimula la producción de una o varias series de anticuerpos específicos que se unen a ella a través de unos sitios denominados epítopos o determinantes antigénicos. Un mismo antígeno puede contener múltiples epítopos, algunos de los cuales pueden estar repetidos, y cada epítopo es específico de un anticuerpo. Todos los inmunógenos son antigénicos, pero no todos los inmunógenos son immunogénicos La capacidad de un antígeno para reaccionar específicamente con un anticuerpo se denomina reactividad antigénica. 2. Cualquier sustancia que es capaz de unirse de forma específica a un anticuerpo o a un receptor localizado en la superficie de los linfocitos T. Los antígenos que se unen a anticuerpos son de naturaleza extremadamente diversa (pueden ser desde sustancias relativamente sencillas, como los lípidos y las hormonas, hasta macromoléculas más complejas, como los ácidos nucleicos y las proteínas, e incluso virus o un fragmento de célula, por citar unos ejemplos); en cambio, los que se unen con el receptor de superficie de los linfocitos T son únicamente de naturaleza proteínica.

1. Acción o efecto de aplicar o aplicarse. 2. Programa informático de software diseñado para dispositivos electrónicos (como, teléfonos inteligentes, tabletas u ordenadores/computadoras portátiles) o entornos o sitios web, con el fin de realizar tareas específicas. En Sanidad Vegetal las aplicaciones ofrecen herramientas de apoyo al diagnóstico, identificación de agentes patógenos, prevención y manejo de enfermedades, fitófagos, carencias, y daños abióticos, así como para otros problemas fitosanitarios. Pueden incluir funciones como: reconocimiento de síntomas y signos mediante imágenes, acceso a bases de datos de agentes patógenos, recomendaciones de manejo integrado de plagas, predicción de riesgos basada en condiciones ambientales (granizo, heladas, viento, inundaciones, etc.), riesgos de incendio, comunicación directa con especialistas asesores o registro de incidencias en campos de cultivo o masas forestales. Su objetivo último es facilitar la toma de decisiones rápidas, precisas y sostenibles en la protección y sanidad vegetales.

La forma de ARN que transporta información desde el ADN en el núcleo hasta los sitios de los ribosomas de síntesis de proteínas en la célula y es, por tanto, la plantilla para la síntesis de proteínas.

El enzima primasa hace un iniciador de ARN, un corto segmento de ácido nucleico complementario al molde, que proporciona un extremo 3′ con el que la ADN polimerasa puede trabajar. Un cebador típico es de cinco a diez nucleótidos de largo. El cebador o iniciador ceba la ADN polimerasa, es decir, le proporciona lo que necesita para funcionar. Una vez que el cebador de ARN está en su sitio, la ADN polimerasa lo extiende, añadiendo nucleótidos uno a uno para hacer una cadena nueva de ADN complementaria a la cadena molde.

1. Mezcla de cebadores de composición nucleotídica similar. Cada cebador de la mezcla es un oligonucleótido compuesto de un número idéntico de nucleótidos y tiene una secuencia nucleotídica básica en común con el resto de los componentes de la misma, pero difiere en ciertas posiciones (conocidas en inglés como variable, degenerate o redundant positions). Tal mezcla es necesaria para amplificar una región genómica específica, cuya secuencia nucleotídica se ha deducido a partir de la secuencia de aminoácidos conocida de la proteína, pues un mismo aminoácido puede estar codificado por más de un triplete o codón (como es el caso de la fenilalanina y la tirosina que disponen de dos codones sinónimos, y de la isoleucina que dispone de tres, como ejemplos). 2. Por extensión, cualquiera de los cebadores individuales que componen la mezcla anterior.

Módulo para almacenar información en una matriz de puntos o en un código de barras bidimensional Solo se puede leer con teléfonos inteligentes u otros dispositivos dedicados a la lectura de los mismos. Cuando se lee un código QR, los dispositivos se conectan directamente a mensajes de texto, correos electrónicos, sitios web, números de teléfono, protocolos de diagnóstico, lista de patógenos, etc.

Determinante o sitio antigénico escondido o no disponible para reaccionar con un anticuerpo, hasta que no sucedan cambios estructurales en la molécula que lo hagan accesible a los anticuerpos.

1. Acción y efecto de desinfectar. 2. Proceso de eliminación de los microorganismos sin discriminación, excepto sus esporas, de una superficie. Entre los microorganismos a eliminar se pueden encontrar los que infectan o pueden provocar infección en una planta, material vegetal, o sobreviven en suelo o sustrato, agua, ambiente, lugar, sitio o cosa, destruyéndolos y evitando así su desarrollo. 3. Proceso químico o físico que destruye microorganismos e inactiva virus y viroides que se pueden encontrar en la superficie de material vegetal o de lugares u objetos inertes, agua, suelo o sustrato, y atmósfera confinada, para evitar su desarrollo y prevenir la posible infección. La desinfección se lleva a cabo por medio de biocidas o germicidas, sustancias químicas antimicrobianas, algunos de cuyos mecanismos de acción y resistencia son similares a los de los antibióticos. Entre los desinfectantes químicos del agua más habituales se encuentra el cloro, las cloraminas y el ozono y entre los físicos la filtración, ebullición y la irradiación ultravioleta. Para superficies se usa o ha usado alcohol, cloro o compuestos clorados, formaldehído, glutaraldehído, peróxido, yodóforos, ácido peracético, compuestos de amonio cuaternario y cloruro de benzalconio. Se ha validado la eficacia de la mezcla de etanol del 62-71 % con 0,5 % de agua oxigenada (peróxido de hidrógeno) o con 0,1 % de hipoclorito sódico, para la eliminación e inactivación incluso de virus en superficies inertes en un minuto. Para muestras vegetales es frecuente el uso de diluciones de hipoclorito o alcohol etílico, seguidas de lavado o enjuagado con agua estéril. La eficacia de la desinfección depende de varios factores, como del tipo de contaminación del material, de la calidad de la limpieza previa, de la concentración del desinfectante, del tiempo de contacto del material con el desinfectante, y de la configuración del objeto a desinfectar. 4. Ausencia de gérmenes que pueden provocar infección.

Enzima de restricción proveniente de la bacteria modelo Escherichia coli que reconoce la secuencia G’AATTC (el apóstrofe señala el sitio de corte). Muy utilizada en manipulación genética ya que el vector de clonación pBR322 presenta un único sitio de rotura, que es precisamente reconocido por esta enzima, que fue una de las primeras en ser clonadas y producidas industrialmente.

Fragmento de ADN de un virus, procariota o eucariota que puede movilizarse e integrarse en diversos sitios de un genoma con los que no presenta homología. Estos elementos se descubrieron en el maíz. Este proceso de movilización se conoce como transposición, y puede conducir a la escisión del elemento y su inserción en un nuevo sitio o a la copia del elemento, de manera que se retiene una copia del elemento en el sitio original a la vez que se genera una nueva copia durante la transposición. Estos elementos generalmente contienen secuencias repetidas invertidas en sus extremos y codifican para una enzima responsable de su transposición, la transposasa. A menudo, los elementos genéticos móviles se denominan genéricamente como transposones, aunque este término también se utiliza habitualmente para denominar a los transposones compuestos (composite transposons), que son elementos bordeados por dos secuencias de inserción y que incluyen genes adicionales a los necesarios para la transposición.

Variante de ELISA usada en comparación de antígenos (como agentes patógenos) para establecer mapas epitópicos o parentescos serológicos, que está basada en la competición de dos antígenos por un sitio común de reacción de un anticuerpo. Se realiza mediante dos reacciones en paralelo. En una reacción en una placa tapizada con anticuerpos, se añaden antígenos conjugados, homólogos de los anticuerpos, y se valora su densidad óptica final. En la reacción en paralelo, a una placa similar se añade el antígeno homólogo usado en la reacción primera (en concentración conocida) en mezcla con el antígeno distinto que se desee comparar y se valora la densidad óptica de esta segunda reacción. Al comparar los valores ELISA finales de ambas reacciones se puede cuantificar la competición, si esta existiera, por los sitios de unión de los anticuerpos utilizados. A mayor similitud entre ambos antígenos, más competición y menor valor ELISA.

Enzima capaz de degradar de forma inespecífica moléculas de ADN extrañas con la finalidad de proteger a las células de la invasión por ADN foráneo o ajeno. Reconocen un sitio específico del ADN y cortan la doble hebra en algún punto cercano (tipo I), actúan sobre secuencias cortas y palindrómicas rompiendo en el mismo lugar de reconocimiento (tipo II), o reconocen secuencias asimétricas cortas que rompen a 24-26 pb del lugar de reconocimiento (tipo III).

1. Acción y efecto de entrar o penetrar. 2. Lugar por el que un patógeno o un vector penetra en un país o área. 3. Sitio en los tejidos de la planta a través del cual un microorganismo patógeno penetra en un huésped sensible y causa infección. 4. Etapa previa necesaria para la introducción de un patógeno o vector, si es seguida de instauración y diseminación. La entrada de una planta infectada supone también instauración, si es multiplicada.

Acrónimo del inglés. En español, Comité de acción de resistencia a fungicidas. Sitio de la Red o de Internet (web) gestionado por Syngenta Crop Protection AG desde Basilea (Suiza) con la finalidad de promover la conciencia sobre la resistencia a los fungicidas y las estrategias efectivas de manejo de la resistencia en todo el mundo. FRAC ha publicado una amplia gama de material educativo y de comunicación, que está disponible para su descarga gratuita desde la página electrónica http://www.frac.info/frac.

Aquel que permanece y actúa en la superficie donde ha sido aplicado. Se redistribuyen por agentes externos como el rocío y su actividad depende de su adherencia y tenacidad. Son fungicidas protectores de modo de acción multi-sitio, controlan un amplio espectro de hongos fitopatógenos y raramente generan resistencias. Se incluyen, entre otros, los fungicidas inorgánicos, los ditiocarbamatos y las ftalimidas.

Aquel fundamentalmente formulado a base de compuestos inorgánicos de cobre, azufre o de otros elementos. Es el grupo más antiguo de fungicidas, y siguen estando entre los más utilizados. Actúan como protectores. Su modo de acción es multi-sitio, afectando varios procesos metabólicos, lo cual hace improbable la aparición de resistencias. Son de amplio espectro y sirven para controlar diversas micosis y bacteriosis.

Aquella que contiene fragmentos del ADN genómico generados mediante fragmentación aleatoria del genoma (sonicación) o la digestión parcial con cantidades limitantes de una enzima de restricción, la cual efectúa cortes en determinados sitios con una frecuencia elevada en el genoma. Como consecuencia, se produce una digestión parcial y aleatoria del ADN, de modo que solo tiene lugar la fragmentación de unos cuantos sitios de restricción, quedando el resto intacto. Así se genera una colección de fragmentos superpuestos con una longitud idónea para la clonación en un vector de clonación apropiado. Tras ligar el vector y el fragmento de ADN, se introduce en una célula huésped o anfitriona.

Aeronave que se sostiene merced a una hélice de eje aproximadamente vertical movida por un motor, lo cual le permite elevarse y descender verticalmente. Se emplean diferentes tipos en agricultura ya sea para la localización y observación de focos de plagas, enfermedades concretas o vectores, como elemento de apoyo en lucha contra incendios o valoración de daños por heladas o inundaciones. También se usan para transporte de brigadas a sitios de difícil acceso para realizar tratamientos fitosanitarios o extinción de incendios. Los de tipo bombardero pueden llevar hasta 4.500 L de agua para la extinción de incendios; los de tratamientos aéreos, generalmente de 600 L, y pueden realizar su labor favorecidos por la turbulencia creada que facilita la penetración del producto en la masa vegetal en zonas de difícil acceso y en focos previamente detectados por drones.

Conjunto de técnicas que permiten la identificación de los sitios de los antígenos (o antigénicos) en las células, micelio o partículas de patógenos, mediante el uso de anticuerpos conjugados con moléculas delatoras, como ferritina, oro coloidal, enzimas, tinte fluorescente, etc. Permiten establecer el grado de parentesco serológico entre cepas o aislados de un mismo patógeno o diferentes. Realizadas con anticuerpos monoclonales permiten efectuar mapas de epítopos.

1. Introducción artificial de un patógeno en el sitio de infección de un huésped o anfitrión para inducir la enfermedad o los síntomas, experimentalmente. Se usa de manera incorrecta para describir la transferencia de células vivas de un microorganismo a cualquier lugar en el que crecerán y se desarrollarán. 2. Tratamiento de semillas de plantas leguminosas con bacterias para introducir fijación de nitrógeno en las raíces, o tratamiento con bacterias inductoras del crecimiento o con micorrizas para favorecer la implantación o el trasplante.

1. Tipo de recombinasa específica de sitio. En un sentido más estricto, se refiere a una familia de recombinasas de tirosina que son típicas de diversos virus, como el fago lambda, y de ciertos elementos genéticos móviles, como los integrones. 2. Enzima codificada por virus, que dirige la integración del ADN viral en el ADN del huésped o anfitrión. Se encuentra en el interior de los virus retrotranscritos y la mayoría de los virus de ADN. Entra en la célula después de la fusión, junto con el resto del material genético del virus, e interviene en varias etapas del ciclo de replicación viral. Una vez que se completa la integración del ADN, no puede revertirse.

Pares de endonucleasas de restricción, obtenidas de fuentes diferentes, que cortan el ADN en el mismo sitio de reconocimiento, aunque no necesariamente en el mismo punto de la secuencia.

Segmento del ARNm no traducido, localizado entre el extremo 5´ y el primer codón. Puede contener señales reguladoras y sitios de unión al ribosoma.

1. Representación gráfica de la localización de los genes, de los sitios de restricción, o apariencia física de genomas o de cromosomas. 2. Registro de la secuencia de bases de un gen o genoma. 3. Representación geográfica de la tierra o parte de ella en una superficie plana. Son utilizados para informar de la distribución de organismos nocivos para las plantas por organizaciones internacionales. Los mapas de áreas concretas o parcelas, asistidos con fotografías aéreas y sistemas de geolocalización, son relevantes en prospecciones o toma de muestras.

Representación gráfica y esquemática de la posición de los sitios reconocidos por varias enzimas de restricción específicos en genomas de bacteriófagos, virus, bacterias, cloroplastos, mitocondrias, etc., o en fragmentos de ácidos nucleicos o a genomas lineales. Representa los sitios del cromosoma o de una secuencia de ADN donde cortan las endonucleasas de restricción.

Medición de la distribución de la dosis absorbida dentro de un proceso de carga, utilizando dosímetros ubicados en sitios específicos durante dicho proceso, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

Método de marcado de los ácidos nucleicos para su utilización como sonda no radiactiva. Se une a la sonda un grupo que no perjudique su capacidad de hibridarse con las secuencias complementarias. Tras la hibridación, el dúplex marcado por afinidad reacciona con una molécula señal que contiene un sitio de unión para el marcador. Como moléculas señal suelen utilizarse, entre otras, anticuerpos fluorescentes o conjugados con digoxigenina, enzimas que producen cambios de color, catalizadores quimioluminiscentes, y la proteína verde fluorescente (GFP).

Enzima que cataliza la modificación química de ciertas bases del ADN por metilación de los nucleótidos de un sitio de reconocimiento de restricción, correspondiente a sus propias enzimas de restricción. Esta enzima protege al propio ADN frente al ataque por sus propias enzimas de restricción. La metilasa de modificación M.EcoRI se ha utilizado frecuentemente para metilar ADN foráneo y protegerlo frente a la enzima de restricción EcoRI.

En Fitopatología, describe la diana y el sitio específico de actividad de un producto fitosanitario de contacto o sistémico, y su efecto en el organismo objetivo a nivel celular, bioquímico o fisiológico. Se refiere al proceso afectado por el producto fitosanitario o a la secuencia de eventos que conducen a la muerte del patógeno, fitófago o mala hierba. Normalmente, la diana del producto fitosanitario es un proceso biológico clave como, por ejemplo, la respiración mitocondrial, la síntesis de la pared celular o la división nuclear. Es importante conocer con precisión el modo de acción (MoA), ya que esta información puede evitar o retrasar la resistencia de las plagas a los tratamientos mediante la adopción de prácticas de rotación de compuestos con distintos modos de acción y también permite seleccionar tratamientos combinados más eficaces. En definitiva, es fundamental para la gestión integrada de plagas. Se han elaborado tablas con los modos de acción más utilizados en fungicidas, herbicidas o bactericidas para cultivos específicos.

Secuencia de bases de los ácidos nucleicos utilizados para la síntesis de cadenas de ADN o ARN complementarias. En la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), si la hebra de ADN sintetizada posee una secuencia cebadora en un extremo y una secuencia complementaria para un segundo cebador en el otro, se habla de molde corto y si la hebra se extiende más allá del sitio complementario del segundo cebador, se habla de molde largo.

El que efectúan los virus de plantas desde los sitios iniciales de replicación (normalmente complejos asociados a estructuras membranosas), una vez superadas las primeras barreras defensivas del huésped o anfitrión. Los virus necesitan, para perpetuarse y posteriormente diseminarse, acometer diferentes tipos de movimiento en y entre las células vegetales. Deben moverse intracelularmente hasta la periferia celular y a través de las conexiones intercelulares o plasmodesmos, con el fin de invadir las células contiguas hasta acceder al sistema vascular, lo que les permitirá translocarse a las partes distales de la planta. La restricción a algunos de estos diferentes tipos de movimientos es una de las principales respuestas que las plantas han desarrollado para su defensa.

La obtenida por procedimientos de azar. Representa un conjunto finito de variables aleatorias (no necesariamente independientes) del que se conoce la función de distribución, lo que permite realizar inferencias acerca de la población de la que se ha obtenido. Método de muestreo en el que la situación de la muestra no está predeterminada ni por un muestreo previo del campo ni por una relación de un sitio de una muestra con el de otra.

Las que están localizadas en el mismo gen en el que se produjo la mutación primaria. Sería el caso de las mutaciones que restauran el marco de lectura original o producen una sustitución de aminoácido en un sitio distinto de donde se produjo la primera mutación, de suerte que compensa la desaparición del primero.

Sitio o motivo antigénico que surge solo después de que dos o más moléculas interactúen entre sí.