Diccionario

Símbolo del aminoácido metionina, según nomenclatura de la Unión Internacional de Química Pura y Aplicada-Unión Internacional de Bioquímica (IUPAC-IUB). Es utilizado principalmente en secuencias de proteínas.

Proceso o metodología mediante el que se analizan datos de diferentes estudios realizados sobre el mismo tema. Por lo habitual, los resultados de un metaanálisis son más sólidos que los resultados de cualquier estudio individual. Implica una síntesis cuantitativa de la evidencia acumulada sobre una pregunta de investigación previamente definida. La respuesta se basará en la información contenida en los estudios de ensayos previamente publicados (estudios primarios). Las principales características del metaanálisis son la precisión, la objetividad y la replicabilidad cuando los ensayos han sido seleccionados en función de su homogeneidad y fiabilidad. Su aplicación permite obtener una estimación combinada del tamaño del efecto. También permite evaluar la heterogeneidad observada en un campo de estudio.

Término referido al uso de código de barras para identificar organismos de una muestra que contiene ADN de más de un organismo.

Parte del basidio donde ocurre la meiosis.

Conjunto de reacciones químicas que tienen lugar en un organismo vivo. Varias de estas reacciones están encadenadas en secuencias o ciclos regulados por mecanismos de retroalimentación muy eficientes. Incluye la construcción de moléculas más complejas para configurar la estructura celular (anabolismo) y la degradación de metabolitos para obtener energía (catabolismo).

Cada uno de los compuestos que intervienen en el metabolismo, al actuar como sustrato en reacciones enzimáticas o procesos metabólicos, o se generan como resultado en las reacciones metabólicas.

Aquellos que están involucrados de forma directa en el crecimiento, desarrollo y reproducción normal de un organismo con una función fisiológica importante.

Metabolito de estructura o composición química compleja, que no es un intermediario esencial para el metabolismo central y se genera como producto colateral. No son esenciales para el crecimiento, pero desempeñan una variedad de funciones de protección. Incluyen aceites, grasas, gomas, resinas (que protegen frente a la deshidratación), compuestos tóxicos, pigmentos, venenos, etc. En los microorganismos, la formación de productos secundarios va ligada a un retardo, e incluso a la detención, del crecimiento activo y de la división celular. Comprenden moléculas de diversas familias químicas como fenilpropanoides, alcaloides, terpenos y glucosinolatos, y hay evidencia de que miembros específicos de estas familias tienen, o pueden tener, funciones en la resistencia de plantas a enfermedades. Los compuestos específicos a menudo se limitan a unos pocos organismos, y por lo tanto un papel importante de estas moléculas es proporcionar una ventaja competitiva en interacciones con otros organismos, por ejemplo, como compuestos de defensa antimicrobianos producidos por plantas, o como toxinas microbianas que inhiben la función del huésped o anfitrión (fitotoxinas) o disuaden al crecimiento de otros microorganismos en su nicho. Hay un tipo de metabolito microbiano que incluye varias micotoxinas.

Ciencias y técnicas dedicadas al estudio completo del sistema constituido por el conjunto de moléculas que constituyen los intermediarios metabólicos, metabolitos, hormonas y otras moléculas señal, y los metabolitos secundarios, que se pueden encontrar en un sistema biológico.

Código de barras de ADN/ARN que permite la identificación simultánea de muchos taxones dentro de la misma muestra. La principal diferencia entre el código de barras y el metacódigo de barras es que este último no se enfoca en un organismo específico, sino que tiene como objetivo determinar la composición de especies dentro de una muestra. Un código de barras consta de una región genética variable corta que es útil para la asignación taxonómica flanqueada por regiones genéticas altamente conservadas que se pueden usar para el diseño de cebadores. El procedimiento de codificación de metabarras, como la codificación de barras general, procede en orden a través de las etapas de extracción de ADN, amplificación por PCR, secuenciación y análisis de datos. Se utilizan diferentes genes dependiendo de si el objetivo es codificar en barras una sola especie o metabarcodificar varias especies. En este último caso, se utiliza un gen conservado y de amplia distribución (“universal”). La metabarcodificación no utiliza ADN/ARN de una sola especie como punto de partida, sino de varios organismos diferentes derivados de una muestra ambiental o a granel. Tiene aplicaciones obvias para el monitoreo de la diversidad en todos los hábitats y grupos taxonómicos, la reconstrucción de ecosistemas antiguos, la detección de especies invasoras, las respuestas a la contaminación y el monitoreo de la calidad del aire. Se trata de un método único que aún está en desarrollo y probablemente seguirá evolucionando durante algún tiempo a medida que la tecnología avance y los procedimientos se estandaricen. Este sistema supera el inconveniente del uso, para identificación, de especies previamente secuenciadas.

Subdivisión posterior del corpus que tiene una forma ovalada y está precedido por un segmento anterior cilíndrico (procorpus). En algunos nematodos fitopatógenos que tienen un largo estilete, el procorpus y el metacorpus están fusionados. El metacorpus funciona como una bomba impulsando los nutrientes al intestino.

Propiedad que presentan ciertos colorantes de variar el espectro de emisión de luz, dependiendo de su estado monomérico o polimérico. Se trata de una propiedad del colorante y no del tejido en cuestión.

Campo de la Genómica en el que se persigue obtener secuencias del genoma de los diferentes microorganismos que componen una comunidad. Para ello se extrae, purifica y analiza su ADN de forma global. La posibilidad de secuenciar directamente los genomas de organismos, sin necesidad de cultivarlos in vitro, abre nuevas posibilidades en Fitopatología. Ha supuesto una revolución científica debido a su alto rendimiento y relativo bajo coste. Permite acceder al genoma sin observar a los microorganismos ni cultivarlos. Se aplica frecuentemente para estudiar la diversidad, evolución e identificación de una región del genoma en miembros de un grupo que parece ser de importancia para la gama de huéspedes, o para conocer los microorganismos presentes en muestras vegetales, de artrópodos o del medioambiente.

Aquel de densidad entre 4,0 y 7,0 g/cm3. Son tóxicos para los sistemas biológicos y constituyen contaminantes frecuentes del suelo y aguas. Entre los más contaminantes destacan el plomo (Pb) y el mercurio (Hg), seguidos por el berilio (Be), el bario (Ba), el cadmio (Cd), el cobre (Cu), el manganeso (Mn), el níquel (Ni), el estaño (Sn), el vanadio (V) y el zinc (Zn).

Transformación de las células de un tejido en otros tipos celulares que normalmente no están presentes. Es un proceso anormal que puede estar relacionado con la formación de tumores, desequilibrio hormonal, o exposición de las células a condiciones no habituales, estímulos químicos o infección por determinados agentes patógenos.

Último artejo de los tarsos de las patas de los insectos.

Ciencia que estudia los fenómenos atmosféricos.

Modificación de una molécula de proteína, ADN o ARN por la adición de un grupo metilo (-CH3).

Proceso por el cual se añade un grupo metilo a una o más bases de una molécula de ácido nucleico, por medio de unas enzimas denominadas metiltransferasas de ADN. La metilación del ADN cumple muchas funciones, como por ejemplo poder distinguir el ADN recién sintetizado en bacterias (ya que solo una de las cadenas estará metilada), para procesos de reparación durante la replicación; protección frente a ADN foráneo (bacteriófagos, plásmidos, etc.), que no estará metilado con el mismo patrón que el ADN de la bacteria y podrá ser degradado por enzimas de restricción; y, en muchos eucariotas, fundamentalmente plantas y animales, la represión de la transcripción génica. Las citosinas junto a guaninas son las bases más frecuentemente metiladas. También, la metilación de citosinas da lugar con mucha frecuencia a mutaciones en el ADN por desaminación de la citosina.

Enzima que cataliza la modificación química de ciertas bases del ADN por metilación de los nucleótidos de un sitio de reconocimiento de restricción, correspondiente a sus propias enzimas de restricción. Esta enzima protege al propio ADN frente al ataque por sus propias enzimas de restricción. La metilasa de modificación M.EcoRI se ha utilizado frecuentemente para metilar ADN foráneo y protegerlo frente a la enzima de restricción EcoRI.

Uno de los veinte aminoácidos comunes que se encuentran en las proteínas. Es un aminoácido anfipático alifático y esencial para la especie humana. Se abrevia con los símbolos Met y M, y es codificado por el codón AUG.

Procedimiento que se sigue en ciencia para hallar la verdad y enseñarla. El método científico se refiere a la serie de etapas o conjunto de técnicas y procedimientos, para obtener un conocimiento válido desde el punto de vista científico, utilizando para ello instrumentos que resulten fiables. Este sistema minimiza la influencia de la subjetividad. En Patología Vegetal los métodos de detección, diagnóstico e identificación incluyen: bioensayos, métodos bioquímicos, métodos de tipado genético, de aislamiento/extracción, hibridación molecular, amplificación molecular, métodos morfológicos y morfométricos, evaluación de la patogenicidad, microscopía óptica y electrónica, y métodos inmunológicos o serológicos. También diversos métodos químicos y técnicas analíticas.

Aquel reconocido en el ámbito nacional o internacional como el mejor o, en su defecto, el mejor método disponible de referencia publicado en una revista con reconocimiento científico o de elevado índice de impacto dentro del sector o que figura como tal en estándares internacionales de diagnóstico (EPPO/OEPP, IPPC-FAO, ISTA) de un patógeno concreto.

Se usa para la determinación de la cantidad de nitrógeno de una muestra. Se basa en la pirolisis completa de la muestra y medición del contenido de nitrógeno de los gases de combustión. El nitrógeno puede ser medido con manómetro después de absorber el dióxido de carbono en una solución alcalina o por conductividad térmica en métodos automatizados.

Técnica analítica clásica para determinar la cantidad de nitrógeno presente en una muestra. Se ha utilizado frecuentemente para la determinación de la proteína total de una muestra. Se basa en la digestión con ácido sulfúrico concentrado en presencia de sulfato potásico, sulfato de cobre y selenato de sodio a reflujo, durante unas 8 horas. Al final de un largo proceso el amoniaco absorbido se determina por titulación con ácido clorhídrico (1 mL de ácido clorhídrico 0,01 M corresponde a 0,14 mg de nitrógeno). El método mide nitrógeno total. La mayoría de las proteínas presentan un contenido de nitrógeno del 16 %, por lo que para convertir el valor en nitrógeno en peso de proteína se debe multiplicar el resultado obtenido por 6,25. Por su complejidad y laboriosidad actualmente se han generalizado otros métodos También se han desarrollado métodos químicos como el método de Biuret, método de Lowry, o el método colorimétrico de Bradford, entre otros, o métodos físicos como espectroscopía infrarroja, espectroscopía infrarroja reflectante, espectrofotometría ultravioleta, métodos refractométricos, o turbidimétricos, espectroscopía electrónica o polarografía.

Es una modificación del ensayo de Biuret y es el más ampliamente utilizado para el análisis de proteínas por su alta precisión; el artículo que lo describe es el más citado de toda la literatura científica. A menudo, y por su simplicidad y facilidad de uso, se utilizan estuches comerciales basados en otros métodos o en modificaciones del método de Lowry (como el método colorimétrico de Bradford o el BCA). Una muestra que contiene un máximo de 500 g de proteína se disuelve en una solución de carbonato sódico, sulfato de cobre, hidróxido sódico y tartrato sódico-potásico, seguido por la adición del reactivo de Folin-Ciocalteu (o reactivo del fenol, reactivo Folin-fenol, o reactivo de Folin-Denis). El color azul oscuro que se produce por interacción de los reactivos con las tirosinas de la proteína se compara colorimétricamente con el color obtenido al utilizar patrones, habitualmente de albúmina de suero bovino (BSA) a distintas concentraciones.

Técnica microbiológica de estimación estadística o conteo microbiológico basada en que, a mayor número de bacterias en una muestra, mayor será la dilución necesaria para reducir su concentración hasta el punto en que ninguna bacteria pueda crecer en la serie de tubos de dilución. Se trata de una forma de obtener datos cuantitativos en concentraciones de elementos discretos a partir de datos de incidencia positiva/negativa.

Aquel que utiliza un compuesto marcador, frecuentemente una enzima, ligado o conjugado con anticuerpos específicos, para localizar una proteína (antígeno) en una célula o tejido. Tras reaccionar las células con los anticuerpos marcados, se examinan al microscopio después de añadir el sustrato apropiado al compuesto marcador. La reacción se suele realizar generalmente mediante el uso de anticuerpos comerciales antiespecie marcados, evitando así el marcado de anticuerpos específicos del antígeno a detectar. Así, para detectar un virus determinado se puede utilizar un anticuerpo monoclonal de ratón contra este virus, y la reacción entre las partículas del virus y el anticuerpo se detectaría utilizando anticuerpos de cabra antirratón (GAM) marcados con la enzima fosfatasa alcalina. Se puede determinar la fluorescencia, cuantificar el color del precipitado o realizar autorradiografía, según convenga a la técnica de marcaje usada e incluso observar mediante microscopía electrónica si se ha empleado un marcador denso a los electrones, como el oro coloidal.

En Fitopatología, se consideran fáciles de usar y normalmente sencillos de ejecutar, porque no exigen la realización de extractos, purificación de ácidos nucleicos, o tratamiento complejo de las muestras vegetales o de vectores, en su procesado antes del análisis de las mismas mediante técnicas de cultivo o aislamiento, serológicas, de hibridación o moleculares de amplificación.

Aquellos en los que la determinación de nitrógeno, se basa en: i) activación neutrónica en la que se irradia una cantidad pesada de muestra con neutrones, lo que produce el paso de l4N a 13N; este positrón tiene una vida media de 10 minutos y emite radiaciones gamma que se registran en un contador de centelleo, y las cuentas se relacionan con el contenido de nitrógeno de la muestra, o ii) activación protónica, similar a la anterior con la variante de que la muestra se irradia con protones y se efectúa la conversión de 14N a 14O, un isótopo que decae con la emisión de un protón y de radiaciones gamma que son registradas y relacionadas con el contenido de nitrógeno de la muestra.

Ramificación del conidióforo portadora de las fiálidas en especies del género Penicillium.

Método utilizado para evaluar el estado de metilación de un gen (unión de los grupos metilo a las citosinas del ADN). En muchos eucariotas, fundamentalmente plantas y animales, los genes metilados no se expresan.

Cristalización que incluye dos ejes desiguales o distintos. Se aplica a la estructura de virus alargados de simetría helicoidal cuando se observan al microscopio electrónico. Los virus ordenan su ácido nucleico y las subunidades proteicas de la cápsida, de acuerdo a su morfología.

Que carece de simetría.

Colorante básico o catiónico, con apetencia por sustancias ácidas como el ADN o ciertos componentes de la matriz extracelular como los glicosaminoglicanos. Se utiliza en tinciones para su observación al microscopio ya que tiñe a todas las bacterias y se utiliza para observar estructuras del citoplasma bacteriano. También tiñe la calosa y sirve para localizar placas cribosas.

Ciencia interdisciplinar que estudia las relaciones entre los organismos vivos y los procesos atmosféricos. Los estudios biometeorológicos no se encuentran limitados a un ámbito espacial determinado, siendo posible su desarrollo a diferentes escalas espaciales y también temporales al poder centrar sus análisis tanto en aspectos microbiológicos, como acometer investigaciones relativas a cambios ambientales globales. A grandes rasgos comprende la humana, animal y agrícola.

En un sistema de gestión de la calidad, aquella que puede influir sobre los resultados de la medición.

Citometría de flujo en la que se utilizan diferentes fluorocromos para marcar las células o partículas en suspensión que se analizan. Los distintos fluorocromos absorben energía luminosa de una longitud de onda específica y la reemiten a una longitud de onda más larga. Las longitudes de onda a las que el fluorocromo absorbe y emite luz se conocen como espectros de excitación y emisión del fluorocromo, respectivamente; ello le confiere diferente color o espectro de fluorescencia para su identificación específica.

Técnica de análisis celular multiparamétrico. Es una forma especializada de la microscopía de fluorescencia en la cual las células o partículas en suspensión, pasan alineadas de una en una, por delante de un haz de láser focalizado en el que se toman y cuantifican diversas mediciones relacionadas con las propiedades físicas y químicas de cada célula o partícula.

En un sistema de gestión de calidad, conjunto de operaciones necesarias para asegurarse que el equipo de medición es conforme con los requisitos para su uso previsto.