Diccionario

Sigla del español Oficina Nacional de Asesoramiento Científico, de página electrónica: (https://www.onac.gob.es/Paginas/index.aspx). Es un órgano directivo del Gobierno de España encargado de establecer mecanismos institucionales para reforzar el papel del conocimiento científico en la toma de decisiones del Gobierno de España. La ONAC tiene el propósito de integrar el conocimiento científico en el ámbito de las políticas públicas. En virtud de esta misión, busca a científicos y científicas que quieran colaborar proporcionando asesoramiento científico al Gobierno. Cualquier investigador o investigadora, puede expresar su interés de colaborar a través de un formulario que ofrece distintas vías concretas para el asesoramiento científico diseñadas para promover la toma de decisiones informadas por la evidencia científica.

1. Acción y efecto de clonar. 2. En su sentido más amplio, técnica que tiene como finalidad generar copias idénticas de individuos, tejidos, células o ADN. En plantas se realiza por estacas, esquejes, injerto (sistemas asexuales de multiplicación). Para genes se realiza insertando un gen de un organismo (ADN exógeno), en el material genético de un portador denominado vector (células bacterianas, levaduras, virus, plásmidos). Una vez insertado el gen, el vector se somete a condiciones controladas de laboratorio, que promueven su multiplicación, con lo que se logra que el gen deseado se copie muchas veces. En el caso de bacterias, hongos u oomicetos, se procede a su cultivo puro partiendo de una o pocas células iniciales, para generar un clon o colonia.

Siglas de Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología de Paraguay. Desarrolla actividad fundamentalmente en protección de cultivos como arroz y alubia, habichuela, judía, fríjol, frijol o poroto, además de en apicultura, biotecnología y uso de cultivos genéticamente modificados.

Zigospora partenogenética, característica de muchos Mucorales y también formada por algunas micorrizas vesículo arbusculares de la familia Endogonaceae.

Bacteriófago o fago es un término general para denominar a virus aislados de bacterias; algunos autores también utilizan el término para denominar a virus que infectan a arqueas, aunque esta acepción es controvertida. Su cápsida puede ser icosaédrica, constar de cabeza-cola, ser de tipo bastoncillo (filamentosa), o de otros tipos, y sus genomas constar de ADN o ARN y contener un número muy variable de genes. Se subdividen según sus propiedades bioquímicas o morfológicas. Un tipo de fago concreto suele infectar únicamente a una gama limitada de huéspedes o anfitriones sensibles. Infectan bacterias mediante inyección de su ácido nucleico en la célula anfitriona utilizando la maquinaria biológica de la bacteria para su reproducción. Hay dos tipos: líticos (bacteriófagos virulentos) y lisogénicos (bacteriófagos temperados), según que la infección produzca un cambio en el metabolismo bacteriano que lo lleve a la producción de nuevos bacteriófagos tras la lisis celular, o que el ADN vírico se inserte en el cromosoma bacteriano y se reproduzca con él, en forma de profago, sin destruir la célula bacteriana. Algunos se utilizan en el control biológico de bacterias fitopatógenas (también en medicina frente a bacterias multirresistentes a antibióticos), como vectores de clonación para insertar ADN dentro de las bacterias y obtener como resultado bibliotecas genómicas o genotecas de ADN recombinante (uno de los fagos más utilizados para este fin es el fago λ). Las genotecas combinatorias de anticuerpos se generan mediante la técnica de despliegue en fagos filamentosos o en bacterias. Los más importantes por sus aplicaciones biotecnológicas son el bacteriófago o fago λ (lambda), el fago 29 (phi29) y el bacteriófago M13 (que ha dado derivados fagémidos), muy utilizados como vectores de clonación.

La competencia celular se refiere a la capacidad de una célula para absorber ADN extraño (extracelular) de su entorno circundante. El proceso de captación genética se conoce como transformación. En algunos casos, el material genético absorbido por una célula puede incorporarse o recombinarse en su propio genoma. La competencia celular natural está determinada genéticamente, es decir, una bacteria está genéticamente predispuesta a tomar material genético libre (genéticamente competente) que existe en su entorno. Las células bacterianas competentes pueden tomar ADN de una variedad de fuentes; sin embargo, algunas bacterias muestran especificidad o preferencia por fragmentos de ADN que están sobrerrepresentados dentro de su genoma. Si bien una célula puede considerarse naturalmente competente, el estado de competencia no es necesariamente un estado constante. De hecho, la regulación natural de la competencia y la transformación es importante para proteger una célula. La regulación a menudo ocurre a través de señales ambientales y bioquímicas. Las células competentes artificiales o inducidas son aquellas que se han hecho competentes mediante manipulación eléctrica (electroporación) o química (cloruro de calcio), creando poros temporales en la membrana celular para que el ADN pase a través de estos. La competencia celular se ha convertido en una herramienta de investigación esencial para la clonación, porque proporciona un mecanismo para introducir nuevo material genético en una célula. Si bien hay muchas células competentes de origen natural, el organismo modelo Escherichia coli no es naturalmente competente, por lo que para utilizar estas células para la clonación se debe inducir la competencia.

Plásmido al cual se le ha adicionado la secuencia cos del genoma del bacteriófago λ. La secuencia cos abarca unos 200 nt y permite el empaquetamiento del vector en una cápsida del fago. Son vectores de clonación, muy utilizados en la elaboración de genotecas de ADN genómico de gran tamaño ya que permiten la introducción de insertos de ADN de hasta 45 kb.

Enzima de restricción proveniente de la bacteria modelo Escherichia coli que reconoce la secuencia G’AATTC (el apóstrofe señala el sitio de corte). Muy utilizada en manipulación genética ya que el vector de clonación pBR322 presenta un único sitio de rotura, que es precisamente reconocido por esta enzima, que fue una de las primeras en ser clonadas y producidas industrialmente.

1. Porcentaje de clones correctos obtenidos en una reacción de clonación. 2. Eficiencia de transferencia nuclear de ADN.

Virus constituido por un largo filamento que pertenece al género Inovirus, que comprende bacteriófagos con su ADN en forma de cadena simple. Son muy empleados como vector de clonación. El ensamblaje al nivel de la membrana de la célula huésped o anfitriona y la salida de las partículas virales no causan la lisis o muerte de la bacteria. Las bacterias infectadas continúan vivas, aunque su velocidad de crecimiento decrece. Infectan exclusivamente bacterias gramnegativas en las que se encuentra presente el pili sexual F, que se encuentra codificado por los genes del operón tra de los plásmidos conjugativos F.

Bacteriófago muy estudiado y conocido, frecuentemente utilizado como vector de clonación. Consta de un ADN bicatenario lineal de 48,5 kb que, una vez introducido en el interior de una bacteria, puede desencadenar un ciclo lítico o un ciclo lisogénico. Durante el ciclo lítico utiliza el aparato biosintético bacteriano para producir más viriones mediante la replicación del ADN y la síntesis de las proteínas del fago. El genoma se replica fundamentalmente mediante círculo rodante, generando una molécula lineal de ADN (concatémero) compuesta de genomas del virus repetidos en tándem, que se cortan y se empaquetan individualmente, dando lugar al ensamblaje de los viriones en el citoplasma de la bacteria; finalmente, la célula es lisada, liberando los viriones al medio. Durante el ciclo lisogénico el ADN en vez de multiplicarse y lisar la célula se integra en el cromosoma bacteriano donde permanece como profago, replicándose con el genoma del huésped sin producir la lisis celular. A los fagos que siguen un ciclo lisogénico se les denomina fagos moderados o atemperados. El ADN del fago λ tiene unos 46 genes, que codifican proteínas no esenciales para la multiplicación del mismo que pueden reemplazarse por el fragmento de ADN que se desea clonar. El ADN dispone en ambos extremos de unas 12 bases complementarias entre sí, que posibilitan la circularización del fago antes de su integración en el genoma del huésped. Estos extremos complementarios reciben el nombre de extremos cos (por cohesivos, pues al ser complementarios se pegan o hibridan), y constituyen la secuencia reconocida en el concatémero para el empaquetamiento de un genoma completo.

Enzima que cataliza la hidrólisis de ésteres de fosfato. Se utiliza para diversos protocolos experimentales, que incluyen, entre otros, la eliminación de grupos fosfatos de moléculas de ADN (para evitar la religación de vectores en un experimento de clonación, por ejemplo) y técnicas inmunológicas. La enzima procedente de la mucosa intestinal de ternera es la más utilizada en la técnica ELISA en Fitopatología y en inmunodetección en general, para marcar anticuerpos y proteína A. Su sustrato soluble es el p-nitrofenil fosfato en dietanolamina a pH 9,8. Su hidrólisis produce una coloración amarilla muy intensa en disolución alcalina, cuantificable espectrofotométricamente a 405 nm. Si se utiliza un sustrato cromogénico precipitante de cloruro de nitroblue tetrazolio (nitroazul de tetrazolio) o NBT con 5-bromo 4-cloro 3-indolil fosfato (BCIP), produce precipitados color azul oscuro a púrpura. Es muy utilizado para localización de patógenos (especialmente de virus) por inmunodetección (inmunohistoquímica e inmunoimpresión-ELISA) y en inmunoelectrotransferencia. Ambos sustratos están disponibles comercialmente en forma de pastillas para su disolución en agua.

Aquella que contiene fragmentos del ADN genómico generados mediante fragmentación aleatoria del genoma (sonicación) o la digestión parcial con cantidades limitantes de una enzima de restricción, la cual efectúa cortes en determinados sitios con una frecuencia elevada en el genoma. Como consecuencia, se produce una digestión parcial y aleatoria del ADN, de modo que solo tiene lugar la fragmentación de unos cuantos sitios de restricción, quedando el resto intacto. Así se genera una colección de fragmentos superpuestos con una longitud idónea para la clonación en un vector de clonación apropiado. Tras ligar el vector y el fragmento de ADN, se introduce en una célula huésped o anfitriona.

Procedimiento para la detección simultánea de varias secuencias mediante la utilización de una sonda múltiple capaz de reconocer a un número variable de secuencias nucleotídicas, mediante hibridación molecular. El sistema supone la clonación en tándem de varios fragmentos genómicos distintos en un mismo vector plasmídico lo cual permite la síntesis en la misma reacción de transcripción, de una única sonda de ARN o ADN.

Sustancia que permite medir el pH de un medio. Se suelen utilizar como indicadores sustancias químicas que modifican su color al cambiar el pH de la solución. El cambio de color se debe a un cambio estructural inducido por la protonación o desprotonación de la especie. Se comercializan habitualmente en forma de tiras o rollos de papel.

Denominación común en Colombia para designar a la enfermedad causada por el hongo Pestalotia versicolor en el fruto de la guayaba, también denominado la perseguidora en Perú o totonaco en México.

Formación de nuevas combinaciones (producidas fuera de la célula) de material heredable por inserción de una molécula de ácido nucleico en cualquier virus, plásmido u otro sistema vector. De esta forma se permite su incorporación a un organismo huésped, en el que no aparecen de forma natural, pero en el que dichas moléculas de ADN son capaces de reproducirse de forma continua. El proceso se puede también denominar clonación molecular o clonación de genes, pues puede propagarse y crecer en cultivo una línea de organismos genéticamente idénticos.

Compuesto que consta de una base nitrogenada, un azúcar pentosa y ácido fosfórico. Constituyen las unidades estructurales básicas (monómeros) a partir de las cuales se construyen los polímeros ADN y ARN. Los principales nucleótidos presentes en las células vivas son los que provienen de las purinas adenina y guanina y de las pirimidinas citosina, timina y uracilo. El azúcar es la D-desoxirribosa (en el ADN) o la D-ribosa (en el ARN). Los nucleótidos se encuentran también en la célula como mononucleótidos o dinucleótidos libres: adenina, G para guanina, T para timina, C para citosina, la segunda letra mayúscula indica el número de fosfatos (mono, di, tri) y la tercera letra es siempre P, que significa fosfato. Así dATP, significa desoxirribosa adenosina trifosfato. Los NTP son los componentes básicos del ARN y los dNTP son los componentes básicos del ADN. Se utilizan para la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), síntesis de ADNc, síntesis y marcaje de cebadores y de ADN, transcripción in vitro, amplificación isotérmica, clonación, secuenciación de Sanger y secuenciación de próxima generación (NGS), entre otras aplicaciones. Se pueden elegir comercialmente productos individuales (dATP, dGTP, dTTP, dCTP y dUTP) o como una mezcla de las cuatro especies.

Aquel mixto que funciona como vector de clonación en células de origen diverso.

Alternativa a la mezcla de diferentes ribosondas para la detección múltiple basada en la hibridación molecular no isotópica. Esta estrategia consiste en la clonación en tándem de secuencias de ácido nucleico parciales de diferentes virus para permitir la síntesis de una ribosonda única. Se diseñó inicialmente para la detección simultánea de seis virus de frutales de hueso o carozo, y posteriormente para virus de tomate, virus y viroides de frutales y viroides de ornamentales, vid y frutales. La opción del uso de polisondas ofrece varias ventajas: i) solamente se necesita una reacción de síntesis para un gran número de virus/viroides, con el consiguiente ahorro de tiempo y costes, evitando así la variabilidad potencial en la eficiencia de las diferentes ribosondas; ii) a diferencia de la mezcla de ribosondas diferentes, esta estrategia no requiere el tratamiento con RNasa, necesario para evitar el fondo observado cuando altas cantidades de sondas de ARN-DIG están presentes en la solución de hibridación, y permite así la detección tanto de virus de ADN como de ARN en el mismo ensayo; y iii) posibilita el diseño de una “polisonda cultivo” específica para detectar diferentes virus/viroides y otros patógenos que afecten a un mismo cultivo.

Fragmento de ADN que se replica como una unidad a partir de un único lugar de iniciación (origen de replicación). Para que una molécula de ADN pueda replicarse, tiene que poseer un origen de replicación. En los virus y bacterias suele haber únicamente un origen de replicación por cada replicón. Así, en bacterias que posean plásmidos nativos, tanto el cromosoma como cada plásmido representa un replicón, cada uno con su propio origen de replicación, sin embargo, algunos plásmidos nativos contienen más de un origen de replicación. Por otra parte, cada célula eucariota posee entre decenas y decenas de miles de orígenes de replicación. Mediante técnicas de ingeniería genética se pueden unir fragmentos de ADN que portan las características genéticas deseadas en un replicón apropiado, específico para el huésped, formando un vector o vehículo de clonación.

Técnica de secuenciación de ADN. Originalmente utilizaba ADN monocatenario, generalmente como resultado de la clonación en vectores derivados del fago M13, y se realizaba con nucleótidos marcados radioactivamente. En la actualidad se lleva a cabo generalmente por PCR y utilizando didesoxinucleótidos marcados con compuestos fluorescentes; cada reacción de secuenciación puede dar lugar a alrededor de 1 kb de lectura.

Glándula endocrina localizada en la parte ventral inferior del cuello de los vertebrados, relacionada con la inmunidad celular y que pierde actividad con la madurez. Se utiliza experimentalmente para obtener timocitos de su parte cortical y utilizarlos como capa de células nodriza en la producción de anticuerpos monoclonales, especialmente en la dilución y cultivo para la clonación final a una célula (monoclonal).

Aquel que puede ser utilizado para secuenciación automática de ADN, como: i) vector de clonación: ya sea de cadena simple (generalmente del bacteriófago M13) o de doble cadena (los más frecuentemente utilizados), y que pueden ser un vector plasmídico, un fagémido (vectores híbridos, plásmidos de doble cadena que contienen un origen de replicación de un bacteriófago de cadena simple), o cósmidos (que contienen el fragmento cos del fago lambda y son capaces de replicar fragmentos grandes de ADN) o; ii) fragmentos de PCR, ya sean productos de PCR de cadena sencilla, con exceso de un cebador, o productos de PCR de doble cadena, con cantidades idénticas de cada cebador.

Término aplicado fundamentalmente a fagos utilizados para clonación. Vehículo de clonación en el que el ADN foráneo o extraño se inserta sin pérdida de ningún fragmento de la secuencia del ADN original del fago.

Vehículo de clonación en el que una parte del ADN nativo ha sido sustituida por una secuencia extraña o foránea de ADN.

Aquel de clonación que debe reunir unas características básicas y adecuadas para su uso en experimentos de transformación. Deben ser portadores de algún marcador genético seleccionable en la estirpe receptora, y tener secuencias únicas de reconocimiento para alguna enzima de restricción que permita su forma lineal para poder insertarle el ADN exógeno. Generalmente son plásmidos, fagos, fagémidos, cósmidos y cromosomas artificiales bacterianos o de levadura.

Vector que puede propagarse en dos huéspedes distintos. Son vectores utilizados para la clonación o producción de proteínas en organismos distintos de Escherichia coli y pueden tener, además de un replicón adecuado para su propagación en la bacteria E. coli, elementos que les permitan mantenerse en otro organismo.

Servicio de ciencia y centro de conocimiento de la Comisión Europea (CE), de página electrónica: https://www.horizonteeuropa.es/jrc. Emplea investigadores para proporcionar evidencias científicas independientes de un amplio abanico de disciplinas, para ofrecer dicho apoyo en prácticamente todos los ámbitos de desarrollo de políticas de la Unión Europea (UE). Se encuentra distribuido en seis emplazamientos en cinco países europeos: Karlsruhe (Alemania), Bruselas y Geel (Bélgica), Sevilla (España), Ispra (Italia) y Petten (Países Bajos). El apoyo a las políticas de la UE se realiza en una amplia variedad de áreas, desde agricultura y seguridad alimentaria, hasta medioambiente y cambio climático, así como seguridad nuclear e innovación y crecimiento. Desarrolla programas de trabajo propios que son aprobados por la Comisión Europea y publicados en su página electrónica. El Consejo de Administración (Governing Board-GB) del centro común de investigación (JRC) asesora a su Director General y a la Comisión en temas relacionados con el papel estratégico del centro y su gestión científica, técnica y financiera. Sus miembros tienen también un papel importante en la representación de los intereses del centro en sus respectivos estados miembros UE y en los países asociados. En España, el Ministerio de Ciencia e Innovación alberga al representante español en el Consejo de Administración del JRC. Además, el centro cuenta con Puntos Nacionales de Contacto (NCPs) que asesoran a los interesados de cada país sobre las convocatorias que publica el JRC, promociona los eventos abiertos (cursos, talleres, etc.) (https://ec.europa.eu/jrc/en/events) y publica noticias de utilidad para los interesados nacionales en el centro. En España, el Punto Nacional de Contacto también corresponde al Ministerio de Ciencia e Innovación.