Diccionario

Estado que adopta una materia en dispersión coloidal cuando se coagula. La fase continua es sólida y la dispersa líquida. Los agentes gelificantes, naturales o sintéticos se utilizan para solidificar medios líquidos. El grado de consistencia de la mezcla dependerá del pH, temperatura y concentración del agente gelificante.

Aquel utilizado para realizar técnicas electroforéticas (tipo de cromatografía). Muy usual para separar virus, ácidos nucleicos, o proteínas de moléculas de diferentes tamaños al pasar a través de los poros de un gel de agarosa.

Medio de soporte de poliacriloilmorfolina entrecruzada, que forma geles tanto en agua como en disolventes orgánicos y que ofrece un amplio campo de aplicaciones en infiltración sobre gel. Puede utilizarse para separar materiales de pesos moleculares de hasta 105 en medio acuoso, y compuestos de menor peso molecular en disolventes como cloroformo y tetrahidrofurano.

Matriz de poliacrilamida empleada comúnmente para electroforesis en gel. Muy útil para caracterizar mezclas complejas de proteínas y para el estudio de ácidos nucleicos. Su poder de definición es muy bueno pudiendo localizar microgramos de proteína. Una ventaja de estos geles es que son químicamente inertes, transparentes y estables en una amplia gama de pH, temperatura y fuerza iónica.

Sílice hidratada en forma de gel, altamente absorbente, que se utiliza como agente deshidratante y soporte catalítico.

Proteína obtenida de huesos, piel, tendones, ligamentos, etc., de animales. Se obtienen también sustancias similares de residuos vegetales. Se usa en medios de cultivo para determinaciones de actividad proteolítica específica de algunos microorganismos, especialmente bacterias. También se usa para la preparación de una peptona, obtenida al hervir colágeno y que es soluble en agua por encima de 40 °C. Se utiliza, en ocasiones, como agente gelificante en cultivo de tejidos vegetales in vitro y como soporte sólido para el cultivo de microorganismos.

Exoenzima que degrada gelatina.

1. Abundante en gelatina. 2. Parecido a la gelatina, especialmente por la consistencia.

Organismo que tiene dos flagelos.

Técnica de separación en la cual se utiliza un gel de agarosa como fase estacionaria. Es importante en la manipulación y secuenciación de genes, ya que separa moléculas de ADN en función de su peso molecular. Las bandas del gel se ponían de manifiesto con bromuro de etidio, pero debido a su toxicidad actualmente se usan diversos colorantes como RedSafe, SYBR® Green, GelRed™ o GelGreen™. Los dos últimos son tintes fluorescentes y ultra sensibles para ácidos nucleicos, muy estables y ambientalmente seguros y que pueden eliminados de forma segura por el desagüe o en basura regular, proporcionando seguridad y reduciendo el costo en la eliminación de desechos. El método en agarosa es medianamente sensible pues es capaz de detectar bandas con niveles de ADN del orden de 10-20 ng.

Procedimiento electroforético en el cual se utiliza la poliacrilamida como matriz de soporte para separar proteínas de acuerdo con la longitud de la cadena peptídica. Puede ser unidimensional utilizando tanto proteínas nativas (no desnaturalizadas) como proteínas solubilizadas (desnaturalizadas) con dodecil sulfato sódico (sodium dodecyl sulfate, SDS). La de tipo bidimensional, separa la proteína nativa en la primera dimensión. A continuación, la placa se trata con SDS y la muestra se separa en la segunda dimensión, en la que en realidad se separan las subunidades individuales de cada proteína. También se utiliza para el diagnóstico de viroides. Se basa en la separación diferencial de moléculas de ARN de las diferentes especies de viroides en función de su tamaño, lo que permite detectarlos e identificarlos. Como parte del diagnóstico de viroides se usa también el sistema de doble electroforesis secuencial en geles de poliacrilamida, que consiste en el uso de un primer gel nativo y un segundo gel en condiciones desnaturalizantes.

Apéndice filamentoso, largo y fino libre por un extremo y, por el otro extremo, anclado en bacterias en la membrana citoplasmática y la pared celular. Está compuesto por numerosas proteínas y tiene forma de pelo o látigo. Sirve para la movilidad de las células y tiene importancia taxonómica. De entre los organismos fitopatógenos, lo poseen algunas bacterias, y las zoosporas de oomicetos, que tienen capacidad de movimientos natatorios. Asimismo, los flagelos permiten el deslizamiento en superficies sólidas, como una forma de movimiento multicelular coordinado. Su rotación impulsa a las células a través del medio líquido. En bacterias, la disposición del flagelo o flagelos varía según la especie y pueden ser monotricas (un solo flagelo, que puede ser polar si está localizado en un extremo), lofotricas (un grupo de flagelos en uno o ambos extremos), anfitricas (un flagelo en cada extremo) o peritricas (flagelos distribuidos por toda la superficie). Las zoosporas suelen tener dos flagelos en posición anterior o lateral y de estructura lisa o barbulada. El filamento del flagelo es helicoidal y se compone de subunidades proteicas de flagelina, muy conservada entre distintas especies bacterianas y que es un potente inductor del sistema inmune innato de la planta.

Aquel que realiza secciones finas (de 30 a 80 µm) de material biológico congelado para su observación con el microscopio óptico. También existen disponibles comercialmente modelos como en los microtomos de parafina.

Material gelatinoso que reviste la superficie de las raíces desarrolladas en suelos no esterilizados. Actúa de puente entre la raíz y las partículas de suelo adyacentes. Incluye agua, materiales exudados de la raíz, células bacterianas y productos metabolizados por los microorganismos (microbiota del suelo), así como coloides minerales y orgánicos procedentes del suelo.

La más baja alcanzada durante la criopreservación. Para microrganismos debe ser lo más baja posible y para períodos superiores a unos días, se aconseja guardar tubos cerrados o sellados, que contengan las células microbianas, sumergidos en nitrógeno líquido (-195 °C), o bien en la fase gaseosa del nitrógeno líquido (-140 °C). En el mercado existen variados tipos de armarios congeladores disponibles, de los cuales los más aconsejables son los que alcanzan temperaturas por debajo de -70 °C, para conservación de microorganismos o material biológico. Aquellos que solo alcanzan temperaturas entre –20 y –40 °C, como ocurre con la mayoría, no son aconsejables, entre otras cosas porque debido a la gran concentración de solutos que existen en la suspensión celular, su punto de congelación baja. El daño que se produce en las células es debido a que a estas temperaturas hay frecuentes congelaciones y descongelaciones. Si se añade un crioprotector no iónico, como el glicerol, se reduce la cantidad de hielo que se produce y se evita el aumento de la concentración iónica.

Disposición celular formada por hifas inmersas en un gel o mucílago.

Denominación común de la enfermedad producida por distintas especies de Colletotrichum (teleomorfo Glomerella), principalmente C. acutatum y C. gloeosporioides en olivo. El hongo causa podredumbre, momificado de los frutos, defoliación y seca de ramas. El nombre de la enfermedad se refiere al aspecto gelatinoso que toman los frutos en condiciones de humedad.

Compuesto orgánico de tipo amida, blanca, inodora y cristalina, soluble en agua, etanol, éter y cloroformo. Se utiliza su homopolímero (poliacrilamida) en forma de gel para la separación de proteínas mediante electroforesis o para diagnóstico e identificación de viroides en función de su tamaño. Su polímero no es tóxico, sin embargo, la acrilamida que no ha polimerizado es neurotóxica, de ahí que los geles deban ser manipulados con precaución pues pueden contener bajas cantidades de acrilamida no polimerizada. Se forma acrilamida en alimentos durante la cocción, fritura o asado y durante los procesos industriales a 120 oC y a baja humedad, y también es un componente del humo del tabaco. Los resultados de exposición realizados en humanos proporcionan pruebas limitadas en cuanto a su asociación con el desarrollo de cáncer de distintos órganos, e irregularidades en el sistema nervioso.

1. Unión física o pegadura de las cosas. 2. Primera etapa de la penetración de bacterias, hongos y plantas parásitas a la superficie del huésped o anfitrión. En bacterias gramnegativas se ha descrito que los flagelos, las fimbrias de tipo I, IV y otros componentes celulares, como los curli, son importantes para la etapa de adherencia primaria. La motilidad podría ayudar a la bacteria a alcanzar la superficie de adhesión, pero no parece ser un requisito esencial, pues muchas bacterias grampositivas inmóviles son capaces de adherirse para formar biopelículas, con la participación de proteínas de superficie. En los hongos, las hifas, tubo germinativo, y también las radículas de muchas plantas están rodeadas de mucílago, pero la fijación a la planta se realiza por las fuerzas intermoleculares de las superficies unidas estrechamente. Las esporas secas de algunos hongos poseen sustancias que al hidratarse permiten adherirse a varias superficies. Además, la liberación de enzimas cutinasas y celulasas a la superficie de la espora ayuda a la adherencia de esta a la planta anfitriona.

Lugar de un laboratorio donde se mantienen almacenadas, registradas y debidamente identificadas muestras de ADN purificado, en condiciones de seguridad y habitualmente congeladas a -80 °C o desecadas en ambiente seco, oscuro y aséptico.

Aquel de estructura química muy variada (sales minerales de aluminio o fosfato cálcico, aceites, adyuvantes de Freund, flagelina, virosomas, liposomas o micropartículas, polisacáridos, etc.), que se utiliza para reforzar la respuesta inmune contra un antígeno o hapteno, suministrado simultáneamente durante la inmunización del animal. En inmunología vegetal los más frecuentes son los adyuvantes completo e incompleto de Freund.

Sigla del inglés. En español, polimorfismo de la longitud de los fragmentos amplificados. Técnica destinada a explorar simultáneamente el polimorfismo de sitios de restricción y la amplificación arbitraria o al azar de secuencias. La resolución de los fragmentos se realiza en geles de poliacrilamida, usando preferiblemente marcadores fluorescentes o radiactivos.

Constituyente del agar que no contiene inhibidores del desarrollo de microorganismos. Debido a que su tamaño de poro es más uniforme que el del agar, se utiliza para la preparación de geles de electroforesis, y es especialmente aconsejable para resolver fragmentos grandes, de hasta 100 kb y mucho mayores, como por ejemplo los megaplásmidos de 400 o 600 kb de Rhizobium, por lo que los geles de agarosa resultan más apropiados que los geles de poliacrilamida.

1. Término genérico que engloba a todos los organismos que, no siendo embriofitas (plantas terrestres), realizan la fotosíntesis oxigénica y que agrupa a un conjunto muy diverso de procariotas (cianobacterias) y eucariotas (microalgas y macroalgas). En el caso de los eucariotas, el origen evolutivo de las algas es polifilético y se reparte en diversos grupos: reino Archaeplastida (sin. Plantae, Primoplantae), que incluye también a las plantas terrestres; reino Chromista, dentro de los infrarreinos Halvaria (en superphylum Heterokonta [sin. Stramenopila] y superphylum Alveolata, que incluye a los oomicetos) y Rhizaria, que incluye a los plasmodiofóridos; y al reino Protozoa, que también incluye a protozoos patógenos de animales, como Trypanosoma. 2. Planta acuática indiferenciada que no posee verdaderas raíces, tronco ni hojas, y que contiene clorofila, como todos los fotoautótrofos productores de oxígeno, además de otros pigmentos característicos. Se utilizan muchas de ellas para producción de agar, agarosa, alginato y carragenina, geles muy utilizados para cultivos microbianos, electroforesis y cromatografía, entre otras aplicaciones. Pueden causar problemas por su desmesurado crecimiento en aguas contaminadas. Supuestos patógenos de plantas con los que no se han cumplido los postulados de Koch, se asocian a su presencia distintos daños producidos en plantas cultivadas, descritos por primera vez en 1907. El único género detectado como posible patógeno es Cephaleuros, del que se han descrito 17 especies, entre ellas, C. virescens la más comúnmente identificada en campo, aunque también se detecta con frecuencia C. parasiticus. Algas verdes, cuyo estado vegetativo es un talo plano y circular. Se encuentran generalmente en el haz de las hojas, debajo de la cutícula. Generan un talo formado por filamentos planos, cortos, apretados y ramificados debajo de los cuales se observan rizoides irregularmente ramificados. De la superficie del talo surgen, durante los veranos húmedos, filamentos erectos, cuyo color torna del amarillo al rojizo. Estos filamentos de uno a ocho pedicelos curvados, en el extremo de cada uno de los cuales aparece un esporangio aperado o casi esférico donde se encuentran varias zoosporas, móviles y biflageladas. La esporulación y la dispersión se producen por la lluvia. Su espectro o gama de huésped es muy amplio, e incluye tanto gimnospermas como angiospermas y con más de 400 especies y variedades identificadas como huésped o anfitrión. Se han citado daños asociados en cultivos de aguacate, azufaifo, cafeto, caqui, cítricos, guayabo, jazmín, mango, manzano, níspero y zarzamora, y en plantas ornamentales como adelfa, aligustre, enebro, ficus, hiedra, magnolio y plátano de sombra. Su presencia se asocia a daños en forma de rajas en la corteza, constricciones o hinchazones en las ramas, muerte regresiva, defoliación prematura, chancros, muerte de los tejidos de las hojas y manchas superficiales en los frutos, entre otros síntomas. Las enfermedades asociadas a algas ocurren en todas las zonas tropicales y subtropicales entre las latitudes 32° norte y 32° sur. A pesar de la falta de evidencias concluyentes, la mayoría de los investigadores las considera verdaderos agentes fitopatógenos.

Método para determinar la cantidad de diversos componentes, incluyendo ADN, ARN y proteínas, por comparación con un estándar conocido. Se puede utilizar para determinar el número de copias de una secuencia de ADN (es decir, para investigar posibles mutaciones por duplicación y deleción), mediante la comparación visual de la intensidad de las bandas o la cuantificación numérica con densitometría. Si un gen presenta copias adicionales, la intensidad es de más del 100 % en el gel o película; pero si ha perdido una copia del gen, la intensidad es de aproximadamente un 50 %.

Bacteria con un único flagelo en cada uno de los polos o extremos opuestos de la célula, que le permiten revertir el sentido del movimiento activando el flagelo que permanecía inactivo.

Aquel producido por la tecnología de hibridomas desarrollada por Georges Khöler y César Milstein (1975), mediante el cultivo de un solo tipo de células híbridas entre un linfocito B de un animal inmunizado y células de mieloma de crecimiento continuo in vitro. Por tanto, está constituido por una sola especie o isotipo de inmunoglobulina, que proviene de un único clon, es totalmente específico del epítopo que lo originó y homogéneo. Los hibridomas productores de anticuerpos pueden mantenerse indefinidamente congelados en nitrógeno líquido ya que los anticuerpos segregados en cultivo in vitro, mantienen sus características en el tiempo.

Aquel de la proteína termolábil flagelina, componente mayoritario de los flagelos.

Aquel que es capaz de migrar en un medio gelosado y se combinan con anticuerpos solubles en presencia de un electrolito a una temperatura y pH adecuados para formar un complejo visible insoluble o precipitado (reacción de precipitación). Se utiliza para la determinación cualitativa y cuantitativa de antígenos y anticuerpos.

Modo de reproducción sexual en el que la fecundación se produce por la fusión de gametos inmóviles, carentes de flagelos. Es característica de diversos hongos y algas.

Lugar del laboratorio donde se mantienen almacenadas, registradas y debidamente identificadas muestras de ARN, en condiciones de seguridad y habitualmente congeladas a -80 oC, resuspendidas en etanol o desecadas, en ambiente seco y oscuro.

1. Técnica que utiliza un film de rayos X para visualizar radioactivamente moléculas o sus fragmentos marcados. Se utilizaba hace décadas generalmente para analizar la longitud y número de moléculas de ADN tras su resolución en un gel de electroforesis. 2. Imagen obtenida sobre una placa fotográfica por la aplicación de un corte de tejido que contiene un marcador radiactivo y este, por su radiación, impresiona la placa y revela así su localización y distribución en el tejido.

Colorante derivado del trifenilmetano. Originalmente se utilizó en la industria textil, pero actualmente se emplea principalmente en bioquímica para la tinción de proteínas en geles de electroforesis del tipo SDS-PAGE, y en la estimación de concentraciones de proteína mediante el método de Bradford. Ambas aplicaciones se basan en la capacidad de este colorante para unirse a todo tipo de proteínas. Hay dos variantes de este colorante: R-250 y G-250. El azul de Coomassie R-250 es el más utilizado para la tinción de geles de SDS-PAGE y permite la detección de cantidades muy pequeñas de proteínas. Por su parte, el azul de Coomassie R-250 permite una tinción de geles muy rápida, sin necesidad de desteñir el gel, y es el utilizado para la técnica de Bradford.

1. Intervalo entre dos límites de una magnitud en el que pueden darse variaciones. 2. (gel band). En un gel de electroforesis o en otras técnicas, una línea que contiene gran número de fragmentos de ácidos nucleicos o proteínas, con las mismas características (tamaño, carga, etc.) y que, por tanto, han migrado juntos hasta la misma posición. Para su visualización los geles de electroforesis suelen teñirse y fotografiarse para mejor interpretación visual de las imágenes obtenidas con la coloración. 3. En radiodifusión y televisión, intervalo de frecuencias entre dos límites definidos.

1. Talos fruticulosos o rizinas que están muy ramificados y con proyecciones laterales más cortas. 2. Flagelos que aparecen en las zoosporas que no son lisos. 3. Plantas que están compuestas de vellos en forma de penacho o de copete.

En las zoosporas, cuerpo basal o gránulo del cual salen las fibras longitudinales que constituyen el axonema de un flagelo, unido al núcleo por un rizoplasto.

Introducción de una muestra en un instrumento analítico para su análisis o sobre un gel o material de soporte similar, en una técnica electroforética o cromatográfica. También se aplica el término a la introducción de una cantidad de nutriente en un reactor y a la introducción de un líquido o medio de cultivo en un dispensador.

Conjunto de cromosomas de un hongo, caracterizado por el número, tamaño, forma y patrón de bandas de los cromosomas. El estudio del cariotipo suele hacerse mediante electroforesis de campo pulsante (pulse-field gel electrophoresis, PFGE), porque a menudo los cromosomas fúngicos son muy pequeños, pero se resuelven bien por PFGE, y porque la técnica es independiente de la meiosis, permitiendo el análisis de hongos y estructuras asexuales. Su análisis se emplea en Fitopatología para identificar especies y cepas patógenas, diferenciar razas de hongos, estudiar variaciones genómicas relacionadas con la virulencia y comprender la evolución y la organización genética de los patógenos fúngicos. La inestabilidad genómica es frecuente en diversas especies de hongos fitopatógenos, como Fusarium oxysporum, y a menudo resulta en variaciones en el cariotipo y en alteraciones de la patogenicidad y virulencia. Esta variabilidad resulta fundamentalmente de reordenaciones cromosómicas y de la presencia de cromosomas accesorios, que son aquellos que están presentes solo en algunas cepas y que además son inestables. Las reordenaciones cromosómicas son la principal causa de las variaciones del cariotipo y tienen un papel importante en la evolución de los hongos fitopatógenos, ya que pueden ser un mecanismo para la generación de nuevas cepas más virulentas. Los cromosomas accesorios son también una importante fuente de polimorfismos en el cariotipo. La transferencia horizontal de cromosomas (HCT, por sus siglas en inglés) podría ser una herramienta esencial para el intercambio genético y la evolución genómica de los hongos. Los hongos fitopatógenos sufren extensas reordenaciones cromosómicas durante los ciclos reproductivos sexuales y asexuales. Estas reordenaciones cromosómicas ocurren mediante mecanismos aún desconocidos, pero poseen muchas ventajas evolutivas, ya sea en términos de adaptación, especiación, modificación o expansión del rango de huéspedes o anfitriones, o en incrementar la virulencia.

Que tiene el aspecto de las circunvoluciones del cerebro, por ejemplo, las fructificaciones de ciertos hongos gelatinosos del orden Tremellales.

Que posee filamentos protoplásmicos similares a flagelos, pero más cortos y muy numerosos.

Apéndice protoplasmático en forma de filamento, formado por subunidades de túbulos, organizados en forma circular, pegados a un par central. Se parecen a los flagelos, pero son de menor diámetro y longitud, e impulsan a ciertos tipos de células de organismos eucarióticos (especialmente a protozoos, zoosporas y gametos) a través del agua o del medio en el que habitan.

Parte del protoplasma de la célula que no comprende el núcleo. Contiene una porción soluble de proteínas, fundamentalmente enzimas, metabolitos y sustancias iónicas, además de estructuras de membrana, orgánulos subcelulares, microtúbulos y microfilamentos. El citoplasma presenta transiciones entre una fase fluida (plasmasol) y una fase viscosa (plasmagel), las cuales provocan la ciclosis celular y el movimiento ameboide. En las células bacterianas, el citoplasma es de apariencia granular y rico en proteínas que se encuentran en suspensión coloidal, lo que le proporciona consistencia de gel. Contiene gran cantidad de enzimas, ribosomas y gránulos, y también las denominadas inclusiones citoplasmáticas constituidas fundamentalmente por sustancias de reserva.

Instrumento que permite estimar la radiactividad de un objeto, material vegetal, membrana, gel o lugar, mediante detección de partículas, así como de radiaciones ionizantes. Consiste en un tubo Geiger-Müller, como elemento sensor que detecta la radiación y la electrónica de procesamiento, que muestra el resultado. Se utilizan principalmente para instrumentación portátil debido a su sensibilidad, circuito de conteo simple y capacidad para detectar radiación de bajo nivel.

Técnica de microscopía electrónica que consiste en fracturar el tejido congelado y observar una réplica de la superficie fracturada. Permite estudiar la estructura de las membranas.

Distintas sustancias utilizadas en el proceso de crioconservación para reducir o eliminar los daños producidos por la congelación. Protegen del daño que se pueda producir en las células microbianas en el momento de la congelación. Existen diversos compuestos que se pueden utilizar como crioprotectores, pero el que se utiliza con más frecuencia es el glicerol, a una concentración del 15 al 20 %, incluso al 50 % para antisueros y diluciones de anticuerpos. También se utiliza, principalmente, el dimetilsulfóxido, la leche descremada y carbohidratos como glucosa, lactosa, sacarosa, inositol, entre otros productos. En su elección influye el tipo de microorganismo que se desee conservar.

Molde que proporciona la forma y tamaño para que polimerice el gel. Tras la polimerización, se extrae y se sumerge en un tanque con tampón para que introducida la muestra migre electroforéticamente o corra dentro del gel.

Acrónimo del inglés. Denominación común de la tinción con 4′, 6-diamidino-2-fenilindol, polvo amarillo soluble en agua, marcador fluorescente que se une a regiones enriquecidas en adenina y timina en secuencias de ADN. Se utiliza en microscopía de fluorescencia para teñir células muertas ya que no atraviesa pasivamente la membrana celular y solo lo transportan activamente al citoplasma las células vivas. Se emplea para detección de infección por micoplasmas en cultivos celulares y para la medición del contenido nuclear y la clasificación de cromosomas en citometría de flujo, evaluación de la apoptosis, detección de ADN en núcleo y organelos en inmunofluorescencia e hibridación in situ, Ha sido muy utilizado para localizar fitoplasmas en el floema de plantas sospechosas de estar infectadas. Puede sustituir al bromuro de etidio en tinciones de ADN en geles de agarosa.

Procedimiento para la eliminación de las sales de una mezcla de moléculas biológicas de alto peso molecular. Se logra mediante infiltración en un gel, diálisis o ultrafiltración molecular. Técnicas similares se emplean para la eliminación de otras moléculas pequeñas de soluciones de proteínas o ácidos nucleicos, como la eliminación del fenol en extractos de ácidos nucleicos, de antígenos tratados con formaldehido, o del exceso de colorante en el marcaje de anticuerpos con isotiocianato de fluoresceína.