Diccionario

Sustancia que se emplea para provocar una reacción química o que produce una reacción. En un sentido más amplio, sustancia que, por su capacidad de provocar determinadas reacciones, sirve en los ensayos y análisis químicos, bioquímicos, inmunológicos o serológicos, de hibridación molecular y de amplificación molecular, para revelar la presencia (detectar) o medir la cantidad de otra sustancia o diana (cuantificar), como son enzimas, anticuerpos, sondas, iniciadores, etc.

Compuestos químicos de pureza definida (pero menor que los reactivos puros), que reaccionan en condiciones específicas. Sustancias químicas con un bajo contenido de impurezas, las cuales son determinadas y cuantificadas con el objetivo de ser empleadas en análisis químicos.

Producto químico, tampón, enzima, anticuerpos, sonda, cebadores, etc., usados para el diagnóstico, detección o identificación de agentes fitopatógenos o como componente de un kit de diagnóstico.

Reactivo que cumple con los límites de pureza de productos químicos inorgánicos dispuestos por la American Chemical Society (ACS) en relación con los reactivos analíticos.

Disolución yodada a la que se le ha añadido hidrato de cloral, para visualizar y poder realizar mediciones en esporas (y su ornamentación), basidios, ascas e hifas. Se usa exponiendo tejido o células de hongos al reactivo, generalmente en una preparación de portaobjetos de microscopio, y buscando cualquiera de las tres reacciones de color: i) reacción amiloide o positiva de Melzer, en la que el material reacciona con color de azul a negro; ii) reacción pseudoamiloide o dextrinoide, en la que el material reacciona con color marrón a marrón rojizo, o iii) inamiloide o negativo de Melzer, en el que los tejidos no cambian de color o reaccionan levemente con color amarillo-marrón.

Aquel reactivo más puro, utilizado preferentemente en técnicas de alta sensibilidad y especificidad analíticas, como en cromatografía líquida de alta resolución, espectrofotometría, PCR, o pruebas de identificación bioquímica de bacterias, entre otras, que requieren alta precisión analítica y fiabilidad diagnóstica para la detección o de identificación de agentes patógenos o de sus metabolitos.

Producto químico, utilizado para extraer o purificar ADN o ARN, que se ha ensayado previamente con el fin de garantizar niveles bajos de material absorbente al ultravioleta y de enzimas capaces de desnaturalizar o hidrolizar los ácidos nucleicos.

Aquel del que se conoce con exactitud la concentración de una o varias sustancias, por lo que se usa como referencia para verificar que los métodos de análisis se realizan correctamente, y que el funcionamiento de los equipos es el adecuado.

Aquel de pureza ligeramente mayor que la de los reactivos para análisis, pero cuya composición e impurezas generalmente no se conocen, ni cualitativa ni cuantitativamente.

Hace referencia a un leve error positivo en los resultados de una prueba o test, como consecuencia de los propios reactivos utilizados o soportes de la reacción, como placas de microtitulación ELISA. Generalmente las compañías de diagnóstico hacen lo posible, e incluso en ocasiones garantizan, que sus reactivos poseen valores despreciables de blancos. Normalmente, si existen, suelen ser muy reducidos, de manera que no tienen efecto alguno en la exactitud de las pruebas o tests. El valor del blanco de reactivo es de máxima importancia a la hora de efectuar mediciones y deducciones de resultados, especialmente durante las mediciones de bajas concentraciones. Para medir el blanco de reactivo, se suele utilizar agua desionizada estéril y de alta calidad o el tampón de extracción usado (habitual en técnicas ELISA) o agua fisiológica tamponada, incluso sustrato enzimático, en lugar de la muestra y se efectúa la prueba o test normalmente, según el protocolo. Seguidamente, se sustrae el valor de blanco de reactivo al valor de los resultados de la muestra. El valor de blanco de reactivo puede cambiar entre distintos lotes de reactivos o soportes de reacción. Por tanto, debe medirse el blanco de reactivo cada vez que utilice un lote diferente de reactivos o soportes de reacción, como placas de microtitulación ELISA, o tubos o placas de PCR.

En las etiquetas de los reactivos se debe encontrar: i) el nombre y la concentración a la que se encuentra o su riqueza; ii) la fórmula química, peso molecular y densidad; iii) los números CE y CAS, correspondiendo el primero al número de identificación de la Comunidad Europea, y el segundo, mucho más usado, al internacional; iv) el lote, la fecha de caducidad y las condiciones de almacenamiento; v) indicaciones de peligro, las cuales señalan los peligros físicos, para la salud humana y para el medio ambiente; vi) consejos de prudencia (consejos de eliminación, almacenamiento, o de prevención; y vii) pictogramas de peligro.

Aquel que define el contenido de sustancias principales y contiene niveles aceptables de contaminantes. Teniendo en cuenta el contenido de la sustancia principal y las impurezas, los reactivos se dividen en: i) grado técnico: contenido de la sustancia principal en 90-99 %. Suelen ser productos de síntesis industrial; ii) grado purificado: contenido de la sustancia principal en 99-99,9 %. Tienen parámetros uniformes. Reactivo para uso general de laboratorio, generalmente para análisis cualitativo. Se pueden usar como sustratos para síntesis y sustancias auxiliares; iii) grado de laboratorio: contenido de la sustancia principal en 99,9-99,99 %. Se utilizan en laboratorios para realizar análisis cualitativos y cuantitativos de acuerdo con los problemas; iv) grado de pureza química: contenido de la sustancia principal al 99,99-99,999 %. Es el producto de más alta calidad que cumple con los requisitos de las técnicas de laboratorio especializadas. La cantidad de impurezas está por debajo del límite de detección de métodos químicos; y v) grado espectrofotométrico: contenido de la sustancia principal en 99,999-99,9999 %. Se utilizan en análisis espectrales, como cromatografía líquida de alta resolución (HPLC) y otros que requieren de alta precisión.

Aquel que en preparaciones comerciales o de laboratorio, designa sustancias químicas que cumplen con los estándares de pureza que garantizan la precisión científica y la fiabilidad del análisis químico, las reacciones químicas o las pruebas físicas.

1. Proximidad, analogía, compatibilidad o semejanza de una cosa a otra. 2. Grado de reactividad de un compuesto o grupo funcional con un reactivo dado. Se utiliza en relación con la interacción específica que se produce entre una enzima y su sustrato o bien entre un anticuerpo y un antígeno.

Molécula de colorante impermeable a la membrana celular cuando esta se encuentra intacta, con alta afinidad por el ADN de doble cadena (ADNds) y fotorreactivo. Se utilizan básicamente la monoazida de etidio o monoazida de propidio, entre otras, que se intercalan en el ADNds de las bacterias muertas, que tienen sus membranas celulares comprometidas, mediante la formación de enlaces covalentes tras la exposición a una fuente de luz visible intensa e impiden así la amplificación mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) cuantitativa (en tiempo real). El uso de agentes intercalantes supone teóricamente la ausencia de amplificación de bacterias muertas (no viables), y en la práctica retrasa la amplificación en poblaciones bacterianas constituidas por células íntegras y células comprometidas. Teóricamente, en una población constituida totalmente por células con sus membranas degradadas, no debería obtenerse amplificación molecular y, por tanto, se consideraría al patógeno bacteriano como no detectado. El uso de los colorantes intercalantes, combinado con PCR en tiempo real minimiza el riesgo de sobreestimación de células viables de bacterias patógenas, que son las que suponen un riesgo fitopatológico, que en ocasiones conduce a rechazos de material vegetal o sus productos en frontera o en estaciones de cuarentena.

Aquel que cede electrones a otro compuesto o elemento y que por tanto se oxida. Se utilizan en análisis electroforéticos, preparación de sensores y otros, para completar la desnaturalización de proteínas por rotura de puentes disulfuro. El ditiotreitol (DTT) o reactivo de Cleland es uno de los más comúnmente utilizados.

Lugar adjunto al laboratorio o empresa donde se guardan, conservan o depositan temporalmente, en condiciones apropiadas y debidamente identificados, kits, reactivos, materia prima, materiales o productos, para ser posteriormente utilizados o embalados y comercializados.

Amplificación molecular de ácidos nucleicos que se realiza a temperatura constante, no precisando de un termociclador como en la PCR convencional, ya que permite la amplificación sin la necesidad de ciclos repetidos de desnaturalización e hibridación a diferentes temperaturas. Las diferentes técnicas de amplificación isotérmica se han popularizado para detectar un amplio espectro de dianas o blancos que incluyen no solo ADN y ARN, sino también proteínas, células, pequeñas moléculas e iones. Se utiliza como principio de funcionamiento en biosensores y en variados métodos de detección, diagnóstico e identificación. La amplificación de desplazamiento de cadena (SDA), la de círculo rodante (RCA), la mediada por bucle o asa (LAMP) y NASBA son algunos ejemplos de técnicas de amplificación de ADN o ARN (RT-LAMP) que utilizan como principio la amplificación isotérmica. Aunque estas técnicas se basan principalmente en la replicación del ADN, la mayoría de estos métodos amplifican ácidos nucleicos utilizando cebadores diseñados con estrategias diferentes a las empleadas en la PCR. Además, pueden alcanzar una amplificación exponencial utilizando únicamente una ADN polimerasa (como el caso de LAMP) aunque algunas otras requieren enzimas o proteínas adicionales. Su desarrollo al margen de los circuitos comerciales interesados en explotar reactivos de PCR y sus termocicladores automáticos asociados, ha limitado su aplicación a pesar de su interés.

Técnica inmunológica de determinación cuantitativa de antígenos o anticuerpos mediante el uso de reactivos marcados con isótopos radiactivos.

1. Conjunto ordenado de documentos que una persona, laboratorio o institución producen en el ejercicio de sus funciones o actividades como laboratorio de referencia o de análisis fitopatológico. Debe conservarse, por motivos legales, al menos durante tres años para comprobar, si fuera el caso, el dictamen del diagnóstico o detección, metodología, reactivos empleados y resultados concretos incluso de los controles utilizados. 2. Lugar donde se custodian uno o varios archivos. 3. Acción y efecto de archivar o dar por terminado un diagnóstico o detección. 4. Conjunto de datos almacenados en la memoria de un ordenador u otro dispositivo electrónico, que pueda manejarse con una instrucción única.

En los experimentos biológicos, formación producida exclusivamente por los reactivos empleados y perturbadora de la correcta interpretación de los resultados obtenidos.

Examen sistemático, exhaustivo e independiente para determinar si las actividades relativas a la calidad y los resultados conexos cumplen los requisitos previstos y si esos requisitos se aplican eficazmente y son apropiados para alcanzar los objetivos. Es usual en empresas productoras de reactivos y kits de detección y diagnóstico y en laboratorios de análisis.

Para generar confianza ante el consumidor, cumplir con la regulación y proteger la reputación de una marca, fabricantes y distribuidores deben asegurar las características básicas de las materias primas o reactivos utilizados a lo largo de toda la cadena de producción, o utilizados como componentes de kits de diagnóstico, evitando posibles fraudes. Las técnicas más usuales son análisis isotópico, análisis de composición química, análisis de alérgenos, análisis de perfiles cromatográficos, análisis serológicos, pruebas de especificidad, análisis genéticos y de amplificación molecular.

1. Plataforma firme sobre la que se colocan instrumentos, equipos o máquinas de laboratorio, reactivos, muestras y plantas para trabajar en ellas. 2. Espacio de laboratorio asignado a un grupo de investigación. 3. (bedplate). Plataforma fija o móvil (en cuyo caso lleva ruedas o rodillos) elevada para cultivar plantas en macetas o albergar sustrato, normalmente situadas en invernadero o abrigo de cuarentena.

1. Conjunto de normas, medidas y protocolos que son aplicados en múltiples procedimientos realizados en investigaciones científicas, laboratorios de Sanidad Vegetal públicos o privados y trabajos docentes, con el objetivo de contribuir a la prevención de riesgos personales y para el medio ambiente. Se incluyen posibles riesgos de infecciones derivadas de la exposición a agentes potencialmente infecciosos para operadores, el medio ambiente o la agricultura, o con cargas significativas de riesgo biológico, químico o físico, a los que están expuestos en el desempeño de sus funciones los operarios y el medio ambiente. El término también incluye el manejo de residuos especiales, almacenamiento de reactivos y uso de barreras protectoras entre otros. 2. (biosafety). La bioseguridad en el laboratorio describe los principios de contención, las tecnologías y procedimientos que se aplican para prevenir la exposición no intencionada a agentes biológicos y toxinas o su liberación accidental.

Uso de la muestra para poner a cero un instrumento durante un procedimiento de análisis. Un blanco de muestra puede corregir posibles errores derivados del color o la turbidez de una muestra en un momento determinado antes de añadir reactivos. Al poner a cero un instrumento con un blanco de muestra, solo se mide el color que se desarrolla a partir de la interacción con los reactivos.

Tubo hueco, de cristal o plástico, terminado en su parte inferior en forma cónica y cerrado por la parte superior por una perilla o dedal de goma o plástico. Se utiliza para trasvasar pequeñas cantidades de líquido vertiéndolo gota a gota, especialmente para añadir reactivos, líquidos indicadores o pequeñas cantidades de producto, en métodos que no requieran mucha precisión.

1. Célula, tejido, órgano o molécula al que se dirige la acción de un reactivo (producto químico, producto ionizante, conjugado, enzima, substrato, fotón, luz ultravioleta, anticuerpo, sonda, producto fitosanitario, ácido nucleico, medicamento, enzima, etc.). 2. Fin u objeto a que se dirigen deseos o acciones (reactivos) de detección, diagnóstico o identificación, generalmente a través de la observación (directa o microscópica) o mediante reacciones analíticas apropiadas.

Inmunoensayo que se produce en la superficie de una cámara de reacción representada por un canal de microfluidos. La fuerza capilar dentro del microcanal atrae a los reactivos en la cámara de reacción y también facilita la incubación del ensayo. Una almohadilla subyacente absorbe automáticamente el exceso de líquido, siendo la única operación requerida la carga secuencial de tampones y reactivos. El volumen de muestra es de 10 L y el uso de reactivos es de 5 a 10 veces menor comparado con una técnica ELISA convencional. Se ha aplicado a varios virus de plantas.

Variante de ELISA muy sensible para detección de antígenos complejos (agentes patógenos). De manera secuencial y mediada por etapas de incubación y lavado, se tapizan los pocillos de una microplaca o la superficie de un inmunoadsorbente con anticuerpos purificados específicos del agente patógeno a detectar, se añade la muestra (extracto bruto vegetal, suspensión bacteriana, dilacerado, exudados, lloros de vid, extracto de suelo filtrado, etc.), y se añaden los mismos anticuerpos que en la primera etapa, pero conjugados con una enzima (habitualmente fosfatasa alcalina). La reacción se revela con el substrato específico de la enzima marcadora (habitualmente p-nitrofenil fosfato) que por hidrólisis y efecto batocrómico producirá un color amarillo (valor ELISA a 405 nm) de intensidad proporcional a la enzima retenida. La reacción clásica y más sensible, se realiza añadiendo 200 L/pocillo de la microplaca en cada etapa, aunque para ahorro de reactivos y economía algunos kits comerciales utilizan solo 100 L/pocillo. Otras modalidades utilizan únicamente unos microlitros Los anticuerpos utilizados para tapizar o como conjugados pueden ser producidos en la misma especie animal o no. Frecuentemente se utilizan anticuerpos policlonales para tapizado y monoclonales específicos (solos o en mezcla de varios) como conjugados, o ELISA basado completamente en anticuerpos policlonales, en anticuerpos monoclonales o recombinantes de anticuerpos monoclonales, que confieren alta especificidad y sensibilidad. DAS es la modalidad más popular de ELISA para detección de agentes patógenos o sus metabolitos.

Prueba cualitativa para proteínas y específicamente tirosina. La muestra se calienta en una solución de nitrato mercúrico y ácido nitroso (reactivo de Millon). En presencia de tirosina, se forma un precipitado blanco de proteína coagulada, que por calentamiento pasa a rojo.

Proceso llevado a cabo mediante el uso de pequeñas cantidades de reactivos o de antígenos control, anticuerpos, conjugados, iniciadores, etc., para evaluar la naturaleza de los productos o las características de la reacción o de un posible estuche de diagnóstico o detección.

1. Acción y efecto de tipificar. 2. Efecto de establecerse o perpetuarse para el futuro previsible de un organismo patógeno o vector en una planta, tras su entrada por vez primera y no habiendo sido previamente descrito en un área o en una planta huésped. Si la planta estaba infectada o infestada a su entrada, se considera establecido el patógeno o su vector, respectivamente. Es una parte necesaria para la introducción tras la entrada en un país o área y puede ser seguida por su diseminación, en cuyo caso se puede hablar de introducción efectiva. 3. Reproducción exitosa, de una especie exótica en un hábitat o en el área a la cual ha entrado, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5. 4. Fundación o institución de carácter científico o técnico. 5. Lugar donde habitualmente se ejerce una actividad, incluida la de comercio de material y reactivos de diagnóstico o de producto fitosanitarios.

Autoclave o contenedor similar, que se emplea para esterilizar medios de cultivo, productos, pequeños instrumentos, aparatos, reactivos o disoluciones, etc. El diseño de los esterilizadores para medios líquidos se basa en la cinética de muerte de los microorganismos. La inactivación por calor húmedo implica la pérdida de viabilidad, pero no la destrucción física. En la esterilización de medios de cultivo es necesario adoptar una solución de compromiso, para evitar efectos adversos del calor sobre las características del medio. Por ello, los componentes que son termolábiles deben esterilizarse por filtración e incorporarse al medio de cultivo ya esterilizado, cuando esté próximo a la temperatura ambiente.

Equipo que se utiliza comúnmente para deshidratar reactivos o muestras o para secar y esterilizar recipientes de vidrio, metal o instrumentos en el laboratorio, mediante calor seco. Posee un termostato que controla la temperatura mediante un control digital. Existen básicamente dos tipos: las que operan por convección natural o forzada y las de vacío, que operan mediante convección forzada.

1. Leyenda, marca, imagen u otro elemento o signo descriptivo o gráfico impreso, adherido o sujeto sobre un producto o su envase. Los reactivos, o los viales de cada estuche de diagnóstico suelen ser individualmente etiquetados indicando, además del contenido específico del mismo, el número de lote, la fecha de caducidad y las condiciones de almacenamiento, información que normalmente se exige en sistemas de control de la calidad y acreditación. En el caso de material vegetal se editan etiquetas especiales para cada categoría de material (planta estándar Conformitas Agrarias Communitatis (CAC) o certificada). 2. Se aplica el término, en general, a cualquier compuesto o elemento, radioactivo o no, que se utiliza para marcar o señalar un compuesto y seguirlo en un sistema biológico.

Instrumento que permite la extracción automatizada de ADN o ARN de varias muestras basado en una amplia gama de kits para la extracción y el aislamiento específico de ácidos nucleicos. Frecuentemente estos aparatos se basan en la adsorción del ácido nucleico en partículas magnéticas o paramagnéticas y sistemas de pipeteado ajustable de alta precisión. Utilizan cartuchos de reactivos sellados. Suelen estar provistos de lámpara de rayos ultravioleta para la descontaminación de la cámara de muestras.

1. Fecha después de la cual las características especificadas de un reactivo, solución, espécimen, control, etc. no pueden seguir garantizándose. Determina la fecha útil de un producto o kit. Existen leyes nacionales y de la Unión Europea que marcan las principales pautas, pero la determinación de la fecha final la realizan los propios fabricantes, o en su caso, las empresas distribuidoras. Suele depender de las condiciones de almacenamiento recomendadas. 2. Aquella que se emplea en alimentos microbiológicamente perecederos, superada la cual su consumo puede suponer un peligro para la salud.

Componente de una molécula que hace que esta sea fluorescente. Es un grupo funcional de la molécula que absorbe energía de una longitud de onda específica y la vuelve a emitir en otra determinada de mayor longitud de onda, es decir, con menor energía. La cantidad de energía emitida y su longitud de onda dependen tanto del propio fluorocromo como de su ambiente químico. Se utilizan para marcar ciertas estructuras celulares destacándolas del resto de los elementos que componen la célula, lo que permite identificar distintas moléculas o conjuntos de moléculas. Puede tener afinidad por distintos elementos celulares o puede ser acoplado químicamente a otras moléculas, como anticuerpos que específicamente reconocen a antígenos. Así pueden ser utilizados en inmunofluorescencia (para visualizar células bacterianas o fúngicas), en inmunohistoquímica (utilizada en Bacteriología y Virología) o en el análisis o detección de ADN mediante la técnica de PCR en tiempo real. El isotiocianato de fluoresceína, reactivo derivado de la fluoresceína es uno de los fluorocromos más habituales, otros comunes son los derivados de la rodamina, cumarina y cianina. Las nuevas generaciones como el Alexa Flúor o los DyLight Flúor y otros, son generalmente más fotoestables, brillantes y menos sensibles al pH que otros colorantes estándar de excitación.

Sistema automatizado de obtención de imágenes microscópicas con ciclos de reactivos microfluídicos para la detección espacial in situ de múltiples dianas, como ARN o proteínas en tejido fijado con formalina e incrustado en parafina (samples fixed with formalin and embedded in paraffin, FFPE) y otras muestras intactas con resolución subcelular. Los atributos clave de la plataforma CosMxTM SMI (NanoString®, Seattle, WA) incluyen: i) química de imágenes múltiples y alta sensibilidad que funciona para la detección de ARN y proteínas; ii) análisis de imágenes de resolución subcelular tridimensional con un precisión de localización del objetivo de aproximadamente 50 nm en el plano XY; iii) esquema de codificación de gran distancia de Hamming con una tasa de error baja (0,0092 llamadas falsas por célula por gen) y bajo fondo (unos 0,04 recuentos por célula por gen); iv) alto rendimiento (hasta 1 millón de células por muestra, cuatro muestras por análisis); v) métodos de segmentación celular basados en anticuerpos; y vi) compatibilidad con muestras fijadas con formalina e incluidas en parafina (FFPE).

Tipo de cistidio de forma irregular, con las paredes delgadas y abundante contenido oleoso, granular o refractario en su interior, reaccionan con ciertos reactivos como el sulfuro de benzaldehído, mostrándose negruzco.

Reactivo de fórmula OHC-CHO utilizado para desnaturalizar ADN y ARN. Reacciona específicamente con los residuos de guanosina, impidiendo el apareamiento de las bases, ya que elimina con ello la estructura secundaria del ácido nucleico.

Reactivo de prueba puntual; sustancia resinosa derivada de miembros del género vegetal neotropical Guaiacum que se vuelve azul cuando se aplica en solución alcohólica a un micelio fúngico activo o a un basidiocarpo que secrete fenoloxidasas.

Bacteria que no retiene el primer reactivo de la tinción de Gram (violeta de genciana o cristal violeta) al desteñirse tras decoloración con alcohol etílico-acetona, debido a la composición de su fina pared con una capa interna de mureína, una capa intermedia de lipopolisacáridos y una externa lipoproteica. Su pared toma un color rosa o rojo claro tras la tinción posterior con safranina o, para obtener una coloración más intensa, con fucsina. La gran mayoría de bacterias fitopatógenas pertenecen a este grupo.

Bacteria que sometida a la coloración de Gram tras el primer reactivo (violeta de genciana o cristal violeta), no se destiñe tras decoloración con alcohol etílico-acetona y retiene la tinción en su espesa pared compuesta del mucopéptido polimerizado denominado mureína. Su pared queda de un color azul-violeta tras la tinción posterior con safranina o, para obtener una coloración más intensa, con fucsina.

Reactivo utilizado en el análisis de aminoácidos. Si se calienta en presencia de proteínas o péptidos que se encuentran en condiciones anhidras, convierte todos los aminoácidos en hidrazidas, excepto los residuos carboxilo terminal. De este modo puede reconocerse el aminoácido terminal y la naturaleza y las cantidades relativas determinadas mediante un analizador de aminoácidos.