Diccionario

1. Proceso para separar un organismo separándolo de la planta anfitriona o huésped, de un vector o del sustrato, líquido o atmósfera en el que se encuentra, como primer requisito de los postulados de Koch. A partir del aislamiento se intenta conseguir el cultivo puro o axénico del organismo, mediante purificación. 2. El cultivo puro en sí mismo.

Separación geográfica o física entre un campo de producción de semillas y otra parcela de la misma especie, para i) evitar la mezcla mecánica con otras semillas; ii) la contaminación por polen de otro cultivar, o iii) la infección por patógenos que pudieran transmitirse por semilla o afectar negativamente a la producción de semillas.

Técnica microbiológica basada en la concentración de células bacterianas mediante partículas magnéticas sensibilizadas con anticuerpos específicos, que son recolectadas con un imán tras incubación, antes de ser sembradas en una placa con medio sólido. El método permite detectar las células bacterianas viables que se han multiplicado en el medio de cultivo formando colonias.

El ARN es un material extremadamente sensible a la degradación por ribonucleasas y debe manejarse con cuidado durante los pasos de aislamiento de ácidos nucleicos. Este es el paso más crítico para preparar con éxito ADNc y realizar una reacción de PCR en tiempo real eficiente y reproducible. Pipetas, puntas, las manos del operador o incluso la propia bancada del laboratorio, pueden ser foco de ribonucleasas. Una vez extraído el ARN, se debe evaluar su pureza, frecuentemente por espectrofotometría. Además de la concentración, la relación de absorbancia entre 260 y 280 nm (A260/A280), debe estar en el rango de 1,8-2,0. Si es inferior, puede sugerir la contaminación de la muestra por fenol, proteínas o por material vegetal.

Conjunto de procedimientos que evitan la introducción de gérmenes patógenos dentro de un determinado organismo, ambiente u objeto. Para conseguirlo se emplea la limpieza, la esterilización del material, medios e instrumental de trabajo y el uso de técnicas de aislamiento.

Método de aislamiento de uno varios genes cromosómicos basado en la construcción previa de un denso mapa físico de marcadores moleculares circunvecinos del gen de interés. Tras la construcción de la genoteca genómica respectiva, el gen simplemente se aísla utilizando como sonda uno o más de dichos marcadores, para localizar el o los clones que contienen el gen.

Agente químico o físico que es capaz de destruir bacterias en determinadas concentraciones o condiciones. Entre ellos están los desinfectantes comunes como alcohol etílico, lejía (hipoclorito sódico), productos a base de amonio cuaternario, etc. y el calor, que se utilizan habitualmente para desinfección superficial antes de tratar las muestras vegetales en laboratorio para el aislamiento en medios de cultivo o para preparación de extractos con fines de detección o diagnóstico, y para la desinfección de superficies de trabajo en el laboratorio.

Parcela donde se producen semillas o material vegetal de base. Es la primera fuente de producción de material vegetal (semillas, yemas o plantas) a partir del material original del mejorador, de la semilla prebase, o de la propia semilla o planta base. Su función es mantener las características genéticas originales del cultivar o del patrón o portainjerto, por lo que se requieren estrictas medidas de aislamiento, inspección y destrucción de plantas no ajustadas al tipo original.

Parcela destinada a la propagación de material vegetal que va a ser certificado. Debe reunir los requisitos que marca la legislación en cuanto a situación, condiciones y aislamiento de la misma. Además, el material allí propagado debe poseer autenticidad varietal, así como sanidad y calidad general acreditadas.

1. Aislamiento de un área específica de tejido mediante una barrera de tejidos del huésped o anfitrión. 2. A diferencia de la célula procariota, que generalmente consta de un solo compartimiento rodeado por la membrana plasmática, la célula eucariota está subdividida en compartimientos rodeados por membranas, que son funcionalmente distintos. Cada compartimiento u orgánulo (u organela) contiene su propia dotación de enzimas, otras moléculas especializadas y un complejo sistema de distribución que transporta específicamente los compuestos de un compartimiento a otro. Por lo tanto, la compartimentación, o subdivisión celular en compartimientos, conduce a la especialización funcional. 3. Efectuar una separación en un recipiente o tubo de reacción (tipo Eppendorf) para realizar reacciones independientes en el mismo tubo.

1. Confinamiento oficial de artículos reglamentados para observación e investigación, o para inspección, prueba o tratamiento adicional, según la terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5. 2. Período de tiempo durante el cual los vegetales, sus muestras o sus productos son sometidos a observación visual, controles y análisis o pruebas en condiciones de aislamiento y bioseguridad, para asegurar que están libres (no se han detectado en los mismos) de agentes que puedan provocar enfermedades o plagas o sean vectores de patógenos. Se realiza por proceder de zonas infectadas, infestadas o sospechosas de estarlo. También se puede efectuar cuarentena para comprobar la certeza de un certificado sanitario emitido por un país tercero, cuando el origen del material vegetal no proceda de un país miembro de la Unión Europea. Se puede realizar cuarentena y cuarentena posentrada siempre que la normativa fitosanitaria de un país importador lo permita.

Mezcla resultante de desgarrar o partir en pequeños trozos tejidos vegetales, generalmente en agua estéril o tampón apropiado. Normalmente se realiza como paso previo al aislamiento del patógeno en medio de cultivo, como muestra directa para una prueba de detección, o para su posterior tratamiento o purificación.

Proceso de incremento artificial de las células bacterianas presentes en un extracto o dilacerado de una muestra, mediante adición de un medio de cultivo líquido, preferiblemente semiselectivo o selectivo de la bacteria diana, e incubación adecuada. El enriquecimiento aumenta la sensibilidad de detección de técnicas de aislamiento, inmunológicas (inmunofluorescencia o ELISA), de hibridación molecular y de amplificación molecular (PCR y PCR en tiempo real). Su ventaja es que permite detectar células viables. Se puede aplicar a microorganismos que puedan ser cultivados in vitro.

Parte del informe de ensayo en un sistema de gestión de la calidad según las directrices para la acreditación de la entidad de Acreditación de España (ENAC). Establece la información que debe ser incluida en un informe de ensayo y cómo debe ser estructurada. Se informará cada resultado analítico de cada método de ensayo de manera independiente. Asimismo, cada resultado debe ser expresado de forma exacta, clara, objetiva y libre de ambigüedad. El resultado, por lo tanto, se informará como: i) Positivo (incluyendo valor, si aplica). Siempre que esté técnicamente justificado y previo acuerdo con el cliente, puede utilizarse otra expresión (por ejemplo: presencia, detectado, se observa…, aislamiento de…, identificación de…). Asimismo, cuando sea necesario pueden incluirse como parte del resultado otros datos inherentes al ensayo, como por ejemplo el valor ELISA (densidad óptica de la muestra) o ciclo de corte en PCR a tiempo real (Ct o Cq); ii) Negativo. Siempre que esté técnicamente justificado y previo acuerdo con el cliente, puede utilizarse otra expresión (por ejemplo: ausencia, no detectado, no se observa…, identificación negativa de… o; iii) Resultado no concluyente. En este caso será necesario incluir comentarios en el informe de ensayo para que este resultado sea comprensible para el destinatario. Por ejemplo, para aportar información sobre la conveniencia de repetir el ensayo en una nueva muestra, la realización de nuevos ensayos adicionales o sobre las limitaciones de las técnicas o ensayos aplicados. Estos comentarios se deberán documentar y estandarizar en el apartado de expresión de resultados del procedimiento de ensayo.

Instrumento que permite la extracción automatizada de ADN o ARN de varias muestras basado en una amplia gama de kits para la extracción y el aislamiento específico de ácidos nucleicos. Frecuentemente estos aparatos se basan en la adsorción del ácido nucleico en partículas magnéticas o paramagnéticas y sistemas de pipeteado ajustable de alta precisión. Utilizan cartuchos de reactivos sellados. Suelen estar provistos de lámpara de rayos ultravioleta para la descontaminación de la cámara de muestras.

Cámara generalmente empleada para el estudio de procesos de crecimiento y desarrollo de plantas sanas o artificialmente inoculadas con patógenos. Disponen básicamente de tomas de agua y eléctricas, controles de temperatura, humedad, intensidad lumínica y fotoperiodo. Pueden incorporar luz ultravioleta germicida para la desinfección tras el experimento de cultivo. Existen versiones comerciales tipo armario, pero pueden construirse de obra para instalaciones especiales, de cuarentena o recintos de nivel P2 de aislamiento biológico.

Técnica de obtención de híbridos somáticos interespecíficos típicos, poliploides, aneuploides (híbridos asimétricos), híbridos con el contenido nuclear de un parental y fracciones de información genética del otro parental (de uno a miles de genes). Se basa en el aislamiento y cultivo de protoplastos, que permiten la obtención de células desprovistas de pared celular gracias a la acción de enzimas líticos (celulasas, pectinasas) normalmente obtenidos de microorganismos (Aspergillus spp.; Trichoderma spp.), y su posterior crecimiento (división celular, formación de microcallos y regeneración de plántulas por vía organogénica o embriogénica). Los métodos de inducción de la fusión suelen ser químicos (uso de polietilenglicol-PEG o dimetilsulfóxido-DMSO) o físicos (electrofusión), para conseguir la fusión de las células.

Para la clasificación de las poblaciones de ciertos hongos, la heterocariosis se usa como medida alternativa para determinar la relación genética entre distintos aislamientos. Aquellos capaces de formar un heterocarionte constituyen un grupo de compatibilidad vegetativa.

Equipo que se utiliza comúnmente para deshidratar reactivos o muestras o para secar y esterilizar recipientes de vidrio, metal o instrumentos en el laboratorio, mediante calor seco. Posee un termostato que controla la temperatura mediante un control digital. En general, pueden funcionar con temperaturas comprendidas entre 50 y 300 °C. Un ciclo completo de uso consiste en calentar el horno a la temperatura requerida, mantener esta temperatura durante el intervalo de tiempo adecuado, apagar la máquina y dejar el horno cerrado hasta que los objetos se enfríen y alcancen la temperatura ambiente. Los modos estándar de funcionamiento de un horno de aire caliente son de 1,5 a 2 horas a 160 °C, 45 minutos a 1 hora a 190 °C, o de 30 minutos a 250 °C. Su aislamiento térmico es de doble pared para mantener el calor y ahorrar energía: la capa interna posee una conductividad térmica baja, y su capa exterior es metálica. Además, existe un espacio lleno de aire entre ambas capas como refuerzo del aislamiento.

Reproducción de la imagen de la sección de material vegetal que se ha aplicado sobre una materia blanda, porosa o dúctil, como la superficie de papel de filtro, membrana, gel o medio de cultivo solidificado con agar. Constituye un método de preparación de muestras para detección de patógenos sin realizar extractos, para su análisis serológico y por hibridación o amplificación molecular. También se utiliza para realizar aislamiento en medio de cultivo sólido mediante contacto ligero de la sección recién efectuada con la superficie del medio e incubación posterior.

La que se realiza sobre un cultivo o aislamiento en placas de Petri de medio sólido, sembradas con un extracto o un dilacerado de una muestra. La técnica de inmunofluorescencia se realiza sobre el medio sólido desecado. Permite detectar específicamente colonias de la especie bacteriana de interés directamente de un aislamiento, sin purificación. Es muy sensible pues al realizarse sobre colonias permite detectar con sensibilidad colonias incipientes de tamaño mínimo.

Conjunto de productos y utensilios suficientes para conseguir un determinado fin o realizar un procedimiento concreto de análisis, diagnóstico, detección o identificación, que se comercializan como una unidad con fecha de preparación y de caducidad. Además de los mencionados, se comercializan muchos kits para procedimientos muy diversos, como para el aislamiento y purificación de ácidos nucleicos, plásmidos, o diversos tests fenotípicos, secuenciación, o identificación de células viables, que son especialmente importantes en Fitopatología. Existen kits completos que permiten realizar enteramente las operaciones de diagnóstico, detección o identificación, directa o indirecta de un patógeno. En ellos se proporcionan testigos, tampones y los diversos componentes en las proporciones adecuadas, envasados de manera que se obtenga el mejor rendimiento de los componentes costosos o difíciles de obtener. Algunos componentes pueden comercializarse incluso prepesados, parcialmente prefabricados o ligados a soportes sólidos, con el fin de evitar las etapas preparativas. Existen también kits parciales que contienen únicamente los reactivos clave (anticuerpos, conjugados, sondas, iniciadores, tampones, etc.) para el fin perseguido. De cara a ser aceptados e incluidos en estándares internacionales de diagnóstico, requieren su homologación y validación.

Denominación común del efectuado para detectar bacterias u otros organismos mediante un tampón apropiado o agua estéril absorbida a través de una sección de tallo o sarmiento, cuya base está depositada en un vaso de precipitado. El líquido se hace pasar a través del material vegetal por succión con una jeringa conectada a una goma elástica para asegurar la estanqueidad. Se han diseñado dispositivos manuales para la obtención de líquido de lavado interno de distintas muestras simultáneamente. También puede realizarse haciendo pasar líquido a través de la sección de material vegetal con ayuda de la presión realizada con una jeringa que contiene el líquido. Los primeros mililitros de líquido así obtenido se han utilizado para aislamiento, detección serológica (inmunofluorescencia o ELISA) o para amplificación molecular (PCR convencional o en tiempo real) de patógenos vasculares, como las especies bacterianas Xylophilus ampelinus o Xylella fastidiosa e incluso cepas tumorígenas de Allorhizobium vitis en vid.

Hongo ascomiceto o basidiomiceto, generalmente unicelular, que se reproduce por gemación o fisión y por ascosporas o esporas sexuales. Entre los géneros más importantes están Saccharomyces, Kluyveromyces, Torulopsis y Candida, los cuales se utilizan en la industria alimentaria por generar fermentaciones (producción de bebidas alcohólicas, etanol, enzimas, proteína unicelular y panificación). Constituyen un contaminante habitual en el cultivo de tejidos vegetales in vitro y en microbiología general cuando se realizan aislamientos de muestras vegetales. La producción de levaduras por hongos fitopatógenos es anecdótica y solo se conocen unas pocas especies que las produzcan, destacando Taphrina deformans por su importancia económica. Algunas especies de los géneros Taphrina y Protomyces crecen como levaduras hasta que infectan los tejidos de la planta, en cuyo momento se desarrollan típicas hifas filamentosas. El género Eremothecium, de poca importancia económica, incluye especies que, al contrario que los géneros anteriores, son hongos filamentosos que producen levaduras durante la infección del huésped. Geotrichum candidum, que produce podredumbres de frutos y verduras, también puede propagarse en forma de levadura o de micelio.

Denominación común de la enfermedad causada en trigo y otras gramíneas por el ascomiceto Pyrenophora tritici-repentis, anamorfo Drechslera tritici-repentis, (sin. Helminthosporium tritici-repentis), productor de toxinas específicas de huésped. Los aislamientos del hongo presentan variabilidad para el carácter patogenicidad, por lo cual han sido descritas cinco razas cuyas diferencias se basan en la capacidad de inducir necrosis y clorosis. Los síntomas más frecuentes se presentan como una mancha ovalada, con halo clorótico, interior tostado o pardo y centro oscuro. Su infección está asociada a importantes pérdidas de rendimiento del cultivo.

Comprende microorganismos patogénicos y no patogénicos, proteínas y ácidos nucleicos, así como todo material de origen biológico que pueda contener microorganismos, proteínas y ácidos nucleicos o partes de ellos. Incluye, pero no se limita a: bacterias, virus, viroides, hongos, oomicetos, algas, nematodos, artrópodos, priones, toxinas, organismos genéticamente modificados, ácidos nucleicos, muestras de tejidos, especímenes para diagnóstico, y aislamientos de un patógeno, como cultivo, suspensión, o esporas purificadas.

Procedimiento que se sigue en ciencia para hallar la verdad y enseñarla. El método científico se refiere a la serie de etapas o conjunto de técnicas y procedimientos, para obtener un conocimiento válido desde el punto de vista científico, utilizando para ello instrumentos que resulten fiables. Este sistema minimiza la influencia de la subjetividad. En Patología Vegetal los métodos de detección, diagnóstico e identificación incluyen: bioensayos, métodos bioquímicos, métodos de tipado genético, de aislamiento/extracción, hibridación molecular, amplificación molecular, métodos morfológicos y morfométricos, evaluación de la patogenicidad, microscopía óptica y electrónica, y métodos inmunológicos o serológicos. También diversos métodos químicos y técnicas analíticas.

En Fitopatología, se consideran fáciles de usar y normalmente sencillos de ejecutar, porque no exigen la realización de extractos, purificación de ácidos nucleicos, o tratamiento complejo de las muestras vegetales o de vectores, en su procesado antes del análisis de las mismas mediante técnicas de cultivo o aislamiento, serológicas, de hibridación o moleculares de amplificación.

Condiciones bajo las cuales los agentes biológicos pueden comúnmente manipularse de forma segura. La Organización Mundial de la Salud (OMS) clasifica los microorganismos patógenos para el hombre y los animales en cuatro grupos de riesgo (1, 2, 3 y 4), pero no considera a los patógenos de plantas ni a sus vectores, aunque se puede adoptar para estos un criterio similar Cada grupo de riesgo es específicamente apropiado para las operaciones llevadas a cabo, las vías de transmisión documentadas o sospechadas de los agentes infecciosos, y la función o la actividad de la instalación. El director del laboratorio es la persona específica y principalmente responsable de evaluar los riesgos y de aplicar adecuadamente los niveles de bioseguridad recomendados. El trabajo con agentes conocidos debe realizarse con el nivel de bioseguridad recomendado, pero cuando se cuenta con información específica relacionada con la especial virulencia, la patogenicidad, la disponibilidad de tratamientos, u otros factores que han sido alterados significativamente, se deben efectuar prácticas más estrictas. Según la OMS el nivel de bioseguridad 1 o nivel básico es para cuando el riesgo individual y poblacional se considera escaso o nulo. Las prácticas, los equipos de seguridad, el diseño y la construcción de la instalación del nivel de bioseguridad 1 son adecuados para la educación o capacitación secundaria o universitaria, y para aquellas instalaciones en las que se trabaja con cepas definidas y caracterizadas de microorganismos viables, que no se conocen como causantes de enfermedad en humanos, animales o vegetales, en la que es únicamente recomendada una pileta para lavado de manos. El nivel de bioseguridad 2 es para cuando el riesgo individual es moderado y el poblacional bajo. Las prácticas, los equipos, el diseño y la construcción de instalaciones del nivel de bioseguridad 2 son aplicables a laboratorios educativos, de diagnóstico u otros laboratorios donde se trabaja con un amplio espectro de agentes de riesgo moderado que se encuentran presentes en la comunidad y que están asociados con enfermedades humanas, animales o vegetales. Los agentes patógenos manejados, tienen pocas posibilidades de entrañar un riesgo grave, pues existen medidas preventivas y terapéuticas eficaces y el riesgo de propagación es limitado. Con buenas técnicas microbiológicas, estos agentes se pueden manejar en forma segura en una bancada o mesa de trabajo, siempre que no se produzcan salpicaduras o aerosoles en cuyo caso se utilizará una cabina de seguridad biológica. Se deben utilizar barreras primarias, tales como mascarillas contra salpicaduras, protección facial, batas y guantes y contar con barreras secundarias, tales como pilas para lavado de manos e instalaciones de descontaminación de desechos a fin de reducir la contaminación potencial del medio ambiente. El nivel de bioseguridad o de contención 3 es para cuando el riesgo individual es elevado y el poblacional bajo. Indicado para patógenos que suelen provocar enfermedades humanas, animales o vegetales graves, pero que de ordinario no se propagan de un individuo a otro y existen medidas preventivas y terapéuticas eficaces para controlarlos. Las prácticas, equipos de seguridad y el diseño y la construcción de las instalaciones del nivel de bioseguridad 3 pueden aplicarse a instalaciones clínicas, de producción, investigación, educación o diagnóstico, donde se trabaja con agentes exóticos o indígenas con potencial de transmisión respiratoria o ambiental, y que pueden provocar una infección grave y potencialmente letal. Las manipulaciones de laboratorio se deben llevar a cabo en cabina de seguridad biológica u otros equipos cerrados. Las barreras secundarias para este nivel incluyen el acceso controlado al laboratorio y sistemas de ventilación que minimizan la liberación de aerosoles infecciosos, como lo es un gradiente de presión negativa que crea un flujo de aire dirigido al interior de la instalación y el tratamiento previo de efluentes. El personal debe ducharse preventivamente al salir y entonces emplear la ropa habitual que había sido depositada a la entrada. El nivel de bioseguridad 4 o de contención máxima está destinado para cuando el riesgo individual y poblacional es alto. Está destinado al manejo de patógenos que suelen provocar enfermedades graves en el ser humano o animales y que se transmiten de un individuo a otro, directa o indirectamente y para los que no existen medidas preventivas y terapéuticas eficaces para su control. Las prácticas, equipos de seguridad, y el diseño y la construcción de instalaciones del nivel de bioseguridad 4 son aplicables al trabajo con agentes peligrosos o tóxicos que representan un alto riesgo individual de enfermedades que ponen en peligro la vida, que pueden transmitirse a través de aerosoles y para las cuales no existen vacunas o terapias disponibles. El aislamiento completo del personal de laboratorio se logra principalmente con cabinas de máxima seguridad biológica (clase III) y con un traje de cuerpo entero, con provisión de aire y presión positiva. Por lo general, la instalación del este nivel 4 es un edificio separado o una zona totalmente aislada con sistemas de gestión de desechos y requisitos de ventilación especializados y complejos. Este nivel no es necesario para los patógenos de plantas conocidos.

Denominación común de la técnica utilizada para construir mapas genéticos mediante el aislamiento secuencial de clones de ADN con solapamiento. Se suele realizar para alcanzar un locus determinado.

Sigla del inglés. En español, tampón fosfato salino. Tampón muy utilizado, especialmente en técnicas serológicas y como base de numerosos tampones de extracción y lavado en técnicas de aislamiento, serológicas, de hibridación y amplificación molecular.

Consiste en realizar una reacción de PCR de cada colonia bacteriana de un aislamiento u otra prueba, con el fin de detectar o rastrear las colonias que únicamente contienen la secuencia nucleotídica de interés.

Fragmento producido por digestión parcial de una proteína. Se utilizan distintos tipos de peptonas como ingrediente en medios de aislamiento y cultivo de bacterias, de otros microorganismos y cultivo celular in vitro.

Recipiente con varios pocillos (generalmente de seis, 12, 24, 48 o 96) independientes pero unidos en un conjunto, numerados y rotulados con una letra resaltada para facilitar su identificación. Fabricada en poliestireno virgen transparente, se comercializan estériles y generalmente envasadas individualmente. Se utilizan para el aislamiento de una sola célula hasta aumento a escala de cultivos celulares, habitualmente de cultivos de linfocitos o de hibridomas segregantes en la producción de anticuerpos monoclonales y en cultivo de tejidos in vitro y estudios de interacción entre células vegetales y agentes patógenos. Están disponibles comercialmente también con pocillos tratados para asegurar una óptima sujeción y crecimiento celular. Su diseño con el borde del pocillo ligeramente elevado y en chimenea reducen riesgos de contaminación cruzada.

1. Aislamiento en medio sólido de unos microorganismos determinados de una población compleja, a partir de la obtención de un clon de cada colonia y la comprobación, por separado, de la propiedad o característica deseada o buscada. 2. Acción y efecto de rastrear o someter a una zona, cultivo, masa forestal o una planta, a un examen detenido en busca de algo, como actividad antifúngica de extractos de plantas o determinados patógenos en plantas madre. 3. (tracking, tracing). Búsqueda de la señal emitida por un satélite utilizado en teledetección.

En silvicultura o selvicultura, superficie relativamente pequeña localizada en el interior de una masa forestal más extensa, que se destina a la producción de semilla. Los árboles semilleros o madres de semilla se seleccionan fenotípicamente. El manejo del rodal y su aislamiento de otros para evitar polinización externa está reglamentado, según definición del Diccionario de Ciencias Hortícolas de la SECH.

Secuencia de los descendientes de los aislamientos originales utilizados en las descripciones de especies y subespecies, según lo define el CNIB, que exhiben todas las propiedades fenotípicas y genotípicas relevantes citadas en la publicación de las descripciones taxonómicas originales.

Técnica de concentración de agentes patógenos, sus componentes o metabolitos, mediante microesferas, partículas o cuentas magnetizables revestidas o sensibilizadas con anticuerpos, preferiblemente con monoclonales específicos. Las células o partículas atrapadas específicamente, cuando pasan a través de un campo magnético son concentradas y lavadas para eliminar inhibidores, pudiendo ser detectadas de forma sensibles mediante cultivo y aislamiento en medio sólido, técnicas serológicas (inmunofluorescencia o ELISA), de hibridación o de amplificación molecular.

Hallazgo o descubrimiento valioso que se produce de manera accidental o casual, cuando se aplican métodos científicos adecuados y se analiza por personal experto; por ejemplo, el descubrimiento casual de la penicilina, de la cepa K84 para el biocontrol de los tumores bacterianos de distintas especies, la aparición y aislamiento de fagos líticos útiles en identificación o biocontrol en placas de aislamiento de bacterias, o del sistema CRISPR, entre otros muchos.

Cada uno de los grupos que se derivan de una cepa mediante aislamiento de una célula o varios grupos de células, que poseen propiedades o marcadores no compartidos por el resto de la población de células de la cepa madre.

1. Cada uno de los grupos en que se divide una especie. 2. Unidad taxonómica que representa la subdivisión de la especie. Los miembros de una subespecie se diferencian de otras subespecies de la misma especie en la frecuencia de genes, ordenación cromosómica y características fenotípicas hereditarias. 3. Población de una especie definida de acuerdo a más de un carácter (morfológico para la mayoría de los organismos, pero no en microorganismos), que distingue claramente a los miembros de la subpoblación de otros miembros de la misma especie. Las subespecies pueden originarse por separación espacial de dos líneas reproductivas, bien por procesos naturales de aislamiento geográfico, bien por programas definidos de reproducción o mejora genética.

Solución química resistente a los cambios de pH cuando se añaden ácidos o bases. Generalmente los basados en sales inorgánicas (fosfatos, carbonatos) y sales de ácidos orgánicos (acetato, barbiturato, borato, citrato, glicina, maleato, succinato, etc.) son los más comunes en laboratorios de Fitopatología. Además, los sistemas tampón in vivo son esenciales para mantener el pH fisiológico del citoplasma y de los fluidos extracelulares; el tampón fosfato es el principal tampón intracelular mientras que el tampón bicarbonato es el principal tampón extracelular. Los tampones son muy importantes en los protocolos de aislamiento de las partículas subcelulares, enzimas, proteínas y ácidos nucleicos. Se utilizan también en electroforesis, cromatografía y técnicas de detección (serológicas, hibridación molecular, amplificación molecular, transferencias, secuenciación, etc.).

Denominación común de la enfermedad causada por el virus de la viruela del ciruelo o virus de la sharka de frutales de hueso o carozo (Potyvirus plumpoxi, Plum pox virus-PPV), de la familia Potyviridae, género Potyvirus. Puede afectar a todos los frutales de hueso o carozo (género Prunus), excepto al almendro. De amplia distribución geográfica en prácticamente todas las industrias frutícolas de prunus, únicamente no se ha detectado en Australia, Nueva Zelanda y Sudáfrica. Los síntomas de la enfermedad dependen del aislado viral (se han descrito 10 cepas o tipos monofiléticos distintos): D (Dideron), M (Marcus), C (Cerezo, Cherry), EA (El Amar), W (Winona), Rec (Recombinante, Recombinant), T (Turco, Turkish), CR (Cerezo ruso, Cherry Russian), An (Marcus ancestral, Ancestor Marcus) y CV (cerezo del Volga, Cherry Volga). Los aislados de PPV más prevalentes pertenecen a los tipos D, M y Rec. Las cepas PPV D y M pueden infectar con facilidad albaricoqueros o damascos (P. armeniaca), ciruelo europeo (P. domestica) y ciruelo japonés (P. salicina) y son especialmente graves en las variedades más precoces, pero no infectan a cerezo dulce (P. avium) ni a guindo o cerezo ácido (P. cerasus) y difieren en su capacidad para infectar cultivares de melocotonero o duraznero (P. persica). Estas dos cepas (D y M), también difieren en su patogenicidad; por ejemplo, los aislamientos de tipo M suelen causar epidemias más rápidas y síntomas más graves que los aislamientos de tipo D en P. armeniaca, P. domestica, P. persica y P. salicina. Además, se han descrito tipos PPV-Rec recombinantes naturales entre las cepas D y M, los cuales muestran un comportamiento epidemiológico similar al de la cepa D. Los aislados de tipo EA se restringen geográficamente a Egipto y se dispone de poca información sobre su epidemiología y sus propiedades biológicas. En varios países europeos se han identificado aislados del PPV que infectan a cerezo dulce y guindo o cerezo ácido. Dichos aislados forman dos tipos diferentes definidos como PPV-C y PPV-CR y más recientemente se ha descrito la cepa atípica CV que afecta en Rusia a cerezo ácido y no es C ni CR. Se detectó un PPV atípico en P. domestica en Canadá (PPV-W) que representa otra cepa del PPV y ha sido detectada posteriormente en varios países en Europa. En Turquía se ha detectado un segundo tipo de cepa recombinante que se ha definido como T. Se ha descrito un único aislado de PPV-An y se ha propuesto como posible ancestro de PPV-M. Los síntomas de la enfermedad pueden aparecer en los pétalos en forma de decoloración (rotura del color de los pétalos de la flor) en algunos cultivares de melocotonero o duraznero. En las hojas aparecen anillos y manchas cloróticas, que suelen desaparecer con la alta temperatura. Los síntomas económicamente más perjudiciales se presentan en los frutos, que además suelen caer prematuramente. Se producen anillos cloróticos y manchas deprimidas, generalmente acompañadas de deformaciones graves, acompañadas de gomosis interna, que confiere mal sabor al fruto, que es inservible incluso para la industria alcoholera. El endocarpio de los albaricoques o damascos con síntomas externos suele mostrar anillos cloróticos y manchas tipo ojo de perdiz, características de la infección por este virus. Los costes directos (pérdidas) e indirectos (manejo de la enfermedad) que representa la detección del virus en un país con importante industria frutícola son muy elevados. PPV se transmite por injerto y otras propagaciones vegetativas y de forma natural por distintas especies de pulgones de forma no persistente (las especies vectoras más eficientes en campo son Aphis spiraecola y Hyalopterus pruni). En España los únicos tipos detectados son PPV-D y en algunas áreas localizadas PPV-M.

Área geográfica delimitada, de tamaño variable según los distintos casos, que alberga los sitios en donde fue detectada una plaga, vector o enfermedad de interés, con la finalidad de que se pueda establecer una única zona que agrupe todos los brotes que se han presentado. El concepto de contención surge principalmente de la idea, de que el aislamiento (prohibición del movimiento de material vegetal tras evaluación de riesgos) conduce al estancamiento de la progresión de una plaga, enfermedad o vector junto a acciones concretas para evitar la diseminación fuera de la zona de contención. En la misma, según la legislación de la Unión Europea (UE) solo se realiza erradicación de las plantas enfermas que presenten síntomas. Se trata de una opción que se toma ante la imposibilidad demostrada de la erradicación de una plaga en un área concreta. Es más efectiva en territorios aislados si está acompañada de medidas restrictivas del movimiento de plantas anfitrionas desde la zona a otras.

1. Cultivo o subpoblación de un microorganismo separado de su población matriz y mantenido en algún tipo de circunstancia controlada. 2. Se emplea también para designar al patógeno extraído del tejido vegetal infectado, de su vector o del sustrato, aire o líquido que lo contenía y mantenido en laboratorio.