Diccionario

Estudio de las características de un patógeno para determinar su situación taxonómica y proponer su nombre científico y si no estuviera descrito, estudiar y publicar con detalle sus características y anotar su genoma tras aislarlo en cultivo puro (bacterias, hongos y oomicetos) o purificarlo (fitoplasmas, virus y viroides). Actualmente existen nuevas posibilidades, frente al cultivo o purificación previas,

Compuesto orgánico de tipo amida, blanca, inodora y cristalina, soluble en agua, etanol, éter y cloroformo. Se utiliza su homopolímero (poliacrilamida) en forma de gel para la separación de proteínas mediante electroforesis o para diagnóstico e identificación de viroides en función de su tamaño. Su polímero no es tóxico, sin embargo, la acrilamida que no ha polimerizado es neurotóxica, de ahí que los geles deban ser manipulados con precaución pues pueden contener bajas cantidades de acrilamida no polimerizada. Se forma acrilamida en alimentos durante la cocción, fritura o asado y durante los procesos industriales a 120 oC y a baja humedad, y también es un componente del humo del tabaco. Los resultados de exposición realizados en humanos proporcionan pruebas limitadas en cuanto a su asociación con el desarrollo de cáncer de distintos órganos, e irregularidades en el sistema nervioso.

Aquella que, derivada de la infección viral origina en las células unas estructuras cuya morfología puede permitir, en muchos casos, la identificación del virus causal. Así la infección por algunos virus se caracteriza por la formación en el citoplasma de células de inclusiones cristalinas u otras amorfas, o vesículas, que se unen con agregados de partículas virales dispuestas en paralelo formando áreas de viroplasmas, que pueden observarse al microscopio óptico. Las venas menores de las dicotiledóneas, que constituyen la mayoría de las nerviaciones de las hojas, frecuentemente presentan variaciones en el número de células que las constituyen y en la estructura de sus células acompañantes, cuando el huésped o anfitrión está infectado. Por lo tanto, la citopatología de las infecciones por virus, puede proporcionar información de cambios ultraestructurales que pueden ser comparados con los que inducen otros virus y en muchos casos, identificar al agente causal, si las alteraciones son específicas.

Técnica prácticamente universal para generar patrones de amplificación de DNA para el tipado e identificación de diversas especies de bacterias. Están disponibles protocolos generales descritos por EPPO (2010 y 2014). Se realiza mediante la técnica denominada rep-PCR que se basa en la amplificación de secuencias repetitivas, específicas y conservadas, presentes en múltiples copias en los genomas de la mayoría de las bacterias gramnegativas y positivas, como las secuencias extragénicas palindrómicas repetitivas (REP), las secuencias intergénicas consenso y repetidas de enterobacterias (ERIC), las secuencias repetitivas y conservadas de las subunidades BOX A de los elementos BOX de Streptococcus pneumoniae, etc., con la finalidad de identificar bacterias muy distintas. En la mayoría de los casos, la utilización de estos cebadores da lugar a patrones de amplificación a pesar de que los organismos diana no contengan las repeticiones correspondientes (ERIC, BOX, etc.), por lo que en general se considera que es una PCR arbitraria.

Amplificación molecular de ácidos nucleicos que se realiza a temperatura constante, no precisando de un termociclador como en la PCR convencional, ya que permite la amplificación sin la necesidad de ciclos repetidos de desnaturalización e hibridación a diferentes temperaturas. Las diferentes técnicas de amplificación isotérmica se han popularizado para detectar un amplio espectro de dianas o blancos que incluyen no solo ADN y ARN, sino también proteínas, células, pequeñas moléculas e iones. Se utiliza como principio de funcionamiento en biosensores y en variados métodos de detección, diagnóstico e identificación. La amplificación de desplazamiento de cadena (SDA), la de círculo rodante (RCA), la mediada por bucle o asa (LAMP) y NASBA son algunos ejemplos de técnicas de amplificación de ADN o ARN (RT-LAMP) que utilizan como principio la amplificación isotérmica. Aunque estas técnicas se basan principalmente en la replicación del ADN, la mayoría de estos métodos amplifican ácidos nucleicos utilizando cebadores diseñados con estrategias diferentes a las empleadas en la PCR. Además, pueden alcanzar una amplificación exponencial utilizando únicamente una ADN polimerasa (como el caso de LAMP) aunque algunas otras requieren enzimas o proteínas adicionales. Su desarrollo al margen de los circuitos comerciales interesados en explotar reactivos de PCR y sus termocicladores automáticos asociados, ha limitado su aplicación a pesar de su interés.

Técnica muy utilizada para establecer un vínculo entre la evidencia biológica y un sospechoso en una investigación criminal, que también se utiliza en identificación y taxonomía fitopatológica para establecer si dos muestras de ADN son iguales o no. Una muestra de ADN se puede comparar con otra para evaluar si los perfiles coinciden y asignar un porcentaje de identidad. Dos individuos u organismos clonados pueden ser estudiados para determinar si poseen partes en común y, por tanto, se superponen entre sí. La prueba también se utiliza para establecer la paternidad.

Sistema de estudio de una imagen hiperespectral que tiene varias bandas espectrales de información a través de todo el espectro electromagnético. Constituyen un elemento básico en un sistema de teledetección. Existen múltiples métodos de procesamiento y análisis de imágenes hiperespectrales, que tienen gran importancia y son herramientas de ayuda en la identificación y la vigilancia de vegetación, entre otras y todas ellas dependen del sensor instalado y de la resolución espectral. Hay ciertas longitudes de onda absorbidas por la atmósfera, por lo que no es recomendable situar a los sensores en estos rangos del espectro en los satélites utilizados para teledetección.

Examen cualitativo o cuantitativo o ambos, de los componentes o sustancias de una planta, sus productos o muestras, de un patógeno o su vector, según métodos especializados y con un fin diagnóstico, de detección o de identificación.

Uso de secuencias repetitivas muy variables, con un tamaño medio de 2-5 pb, que se encuentran en las regiones microsatélites adyacentes a los genes o intragénicas o en otras áreas de interés, como marcadores para el análisis de ligamiento, huellas moleculares de ADN u otras aplicaciones del diagnóstico o la identificación y comprobación de la autenticidad y uso de un cultivar legalmente protegido o de microorganismos.

Término general que engloba técnicas preparativas de biología molecular empleadas para la identificación y análisis de marcadores biológicos en el genoma y proteoma. Dichas técnicas se utilizan para diagnóstico, detección e identificación de plagas, en sentido amplio.

Técnica de biología molecular muy utilizada en detección, diagnóstico e identificación, cuyo objetivo es obtener un gran número de copias de un fragmento de ADN particular, partiendo de un mínimo; en teoría, basta partir de una única copia de ese fragmento original o molde. Utiliza la reacción en cadena de la polimerasa, conocida como PCR por sus siglas en inglés (polymerase chain reaction), desarrollada en 1983 por Kary Mullis.

Órganos sensoriales pares de los nematodos, localizados en el extremo anterior, con función quimiorreceptora, constituidos por células hipodérmicas ciliadas de morfología variable que reciben estímulos externos y están conectadas a un nervio anfidial que se une (conecta) al anillo nervioso. Varían en forma y posición. Los nematodos fitoparásitos tienen sus anfidios sobre sus labios y no son fáciles de observar. Otros nematodos tienen anfidios en forma redonda o espiral situados posteriormente. La estructura y posición de los anfidios es una característica importante para la identificación.

Aquel de las cápsulas y capas mucilaginosas bacterianas, frecuentemente de naturaleza glicoproteica. Distintas cepas de una misma especie pueden poseer antígenos capsulares diferentes en composición química y por tanto los anticuerpos generados frente al antígeno K pueden tener valor para la identificación serológica específica, como en Ralstonia solanacearum.

Acrónimo del inglés. En español, índice de perfil analítico. Método de clasificar bacterias, levaduras y hongos basado en galerías comerciales de tests bioquímicos (bioMérieux) estandarizadas, y miniaturizadas para usarse con bases de datos de identificación bacteriana y fúngica (con soporte APIWEB™). Algunas de ellas, frecuentemente utilizadas en Bacteriología, son: API® 20E, conformada por 20 microtubos, permite la identificación de microorganismos pertenecientes al grupo de las enterobacterias y de otros bacilos gramnegativos; API® 50 CH, conformada por 50 microtubos, se usa para estudiar el crecimiento bacteriano en distintas fuentes de carbohidratos.

1. Acción o efecto de aplicar o aplicarse. 2. Programa informático de software diseñado para dispositivos electrónicos (como, teléfonos inteligentes, tabletas u ordenadores/computadoras portátiles) o entornos o sitios web, con el fin de realizar tareas específicas. En Sanidad Vegetal las aplicaciones ofrecen herramientas de apoyo al diagnóstico, identificación de agentes patógenos, prevención y manejo de enfermedades, fitófagos, carencias, y daños abióticos, así como para otros problemas fitosanitarios. Pueden incluir funciones como: reconocimiento de síntomas y signos mediante imágenes, acceso a bases de datos de agentes patógenos, recomendaciones de manejo integrado de plagas, predicción de riesgos basada en condiciones ambientales (granizo, heladas, viento, inundaciones, etc.), riesgos de incendio, comunicación directa con especialistas asesores o registro de incidencias en campos de cultivo o masas forestales. Su objetivo último es facilitar la toma de decisiones rápidas, precisas y sostenibles en la protección y sanidad vegetales.

Rama de la inteligencia artificial (IA) que permite a los sistemas informáticos aprender a reconocer patrones en conjuntos de datos, como por ejemplo, datos agrícolas y forestales (imágenes fotográficas próximas o aéreas, registros climáticos, sensores de campo, etc.), y mejorar sus predicciones expertas sin ser programados explícitamente. Se aplican en la detección, diagnóstico e identificación de plagas y enfermedades de plantas.

Listado de aparatos y otros datos de archivo citados posteriormente, que debe ser creado y mantenido, al menos del equipo significativo para el diagnóstico o detección, en laboratorios acreditados. Dependiendo del tipo y sensibilidad del equipo y de las condiciones recomendadas por el fabricante para asegurar la ausencia de fallos o averías, el archivo debe incluir: identidad del aparato o equipo, nombre e identificación del fabricante, fecha de compra, manual de instrucciones del fabricante, fecha, resultados y copia de las conclusiones de cualquier calibración o ajuste, y fecha de la próxima calibración prevista, mantenimiento efectuado y plan del mismo, e histórico de daños, averías y reparaciones efectuadas en el aparato o equipo.

Hongo para el cual el asca es el carácter fundamental para su identificación y diagnóstico.

Sigla del inglés. En español, Colección Americana de Cultivos Tipo. Alberga una amplia colección de microorganismos de referencia disponibles bajo petición, suministro de permisos oficiales de importación y pago de tasas. Es muy útil para comparaciones, validaciones y controles con fines de detección, diagnóstico e identificación. Mantiene en cultivo hibridomas segregantes de anticuerpos monoclonales de interés fitopatológico, que cede para uso científico.

Dispositivo o instrumento de análisis que utiliza un elemento biológico de reconocimiento (anticuerpo, ácido nucleico, célula, enzima, orgánulo, tejido, receptor, ribozima, entre otros), o nanomateriales, (como nanopartículas o nanocompuestos), materiales inteligentes o compuestos biomiméticos (aptámeros, polímeros), como catalizadores o biorreceptores, para detectar o determinar un compuesto químico. El catalizador se encuentra a menudo inmovilizado en un soporte sólido y se utiliza conjuntamente con un instrumento fisicoquímico. Este instrumento sigue la transformación química de la sustancia a analizar por medio del catalizador inmovilizado, y después lo traduce a una señal eléctrica (generalmente por electrodos redox, electrodos selectivos de iones, sensores térmicos, contadores de fotones o fluorímetros, entre otros). Constan básicamente de tres elementos: el biorreceptor o catalizador, el transductor y el procesador de señal. Primero la muestra se une específicamente al biorreceptor (generalmente en Fitopatología, anticuerpo monoclonal o recombinante, ácido nucleico, glucano, lectina, enzima, tejido, célula entera, etc.); la señal que se genera es convertida por el transductor en un impulso químico, óptico, eléctrico o de otro tipo, que sea medible, y la identificación cualitativa y cuantitativa es procesada para ser leída por el procesador de datos. Se han diseñado biosensores desarrollados para la detección de algunos patógenos de plantas, incluso para varios simultáneamente, pero no han alcanzado todavía su utilización a escala comercial.

Aquel que emplea como armas a microorganismos patógenos con el fin de hacer daño a la salud humana, animal, vegetal o medioambiental y crear inquietud, alerta y también causar daños económicos en sectores estratégicos. Para mitigar los riesgos que entrañaría tanto la dispersión intencionada de agentes biológicos por parte de actores no estatales, como la liberación accidental de los mismos, se han creado en distintos países organismos o redes de laboratorios para desempeñar funciones en el ámbito de la seguridad biológica, en especial en todo lo relacionado con la detección e identificación de agentes biológicos en las áreas sensibles de Salud humana, Sanidad ambiental, Seguridad alimentaria, Sanidad animal, y Sanidad Vegetal, con instalaciones de alta seguridad biológica.

Contenedor, recipiente o sistema cerrado destinado a crear y mantener condiciones de alta humedad absoluta, bajo condiciones estables de temperatura, que permitan la esporulación de hongos y la manifestación de síntomas de enfermedades en muestras o material vegetal naturalmente infectado o inoculado. Se utiliza para ayudar en la identificación de los agentes causales de enfermedades, o favorecer la expresión rápida de síntomas o signos. Son de especial interés para microorganismos, muy utilizadas para aquellos hongos que crezcan rápidamente sobre el huésped o anfitrión y compitan bien con los microorganismos saprofitos dentro de la cámara húmeda. Frecuentemente se utilizan placas de Petri, bolsas o recipientes de plástico en los que se introduce la muestra, esterilizada superficialmente o no, y bajo ella material absorbente, como una porción de papel de filtro estéril o Perlita humedecida con agua estéril, para mantener la humedad. La incubación se realiza durante el período, horas o días, y temperatura más apropiados para cada microorganismo, y con un fotoperiodo alternante (generalmente, 10 h de luz y 14 h de oscuridad) para favorecer el desarrollo de la fase reproductiva de muchas especies de hongos. La elección de la cámara depende del grupo de microorganismos estudiado, del tamaño de la muestra y de la naturaleza de la investigación.

Inmovilización de agentes patógenos o de parte de sus constituyentes o metabolitos de forma específica o no, con fines de detección o identificación. Se realiza normalmente en el mismo soporte sólido en el que se realiza la reacción inmunológica, de hibridación o de amplificación molecular. Frecuentemente se efectúa por medio de anticuerpos específicos en el caso de inmunoelectromicroscopía.

Sigla de Colección Española de Cultivos Tipo, único Centro de recursos microbianos público en España. Actúa como depositario y proveedor de bacterias, arqueas, levaduras y hongos filamentosos. (https://www.uv.es/uvweb/coleccion-espanola-cultivos-tipo/es). Fue fundada en 1960 en Madrid, por el profesor Julio Rodríguez Villanueva y su continuador fue el profesor Federico Uruburu que la estableció en Valencia. Es una autoridad internacional de depósito de microorganismos para fines de patentes, según el tratado de Budapest. Tiene su sede en el Parque tecnológico de la Universidad de Valencia en Burjassot (Valencia) y trata de fomentar el desarrollo de la biotecnología de base microbiológica, ofreciendo servicios tanto a la comunidad científica como al sector empresarial. Los principales servicios que ofrece son: i) depósito, conservación, suministro e identificación de microorganismos; ii) extracción, conservación y suministro de ADN; iii) formación de personal en el manejo, cultivo y conservación de microorganismos; iv) asesoramiento en nomenclatura y taxonomía; y v) liofilización por encargo.

Citometría de flujo en la que se utilizan diferentes fluorocromos para marcar las células o partículas en suspensión que se analizan. Los distintos fluorocromos absorben energía luminosa de una longitud de onda específica y la reemiten a una longitud de onda más larga. Las longitudes de onda a las que el fluorocromo absorbe y emite luz se conocen como espectros de excitación y emisión del fluorocromo, respectivamente; ello le confiere diferente color o espectro de fluorescencia para su identificación específica.

Técnica de identificación e investigación molecular de especies que consiste en la utilización de una sección corta de ADN de una región estandarizada del genoma (pequeña región de un gen, que ha sido elegida por consenso), para la identificación de animales, plantas o microorganismos. Está basada en la secuenciación de regiones cortas altamente variables del genoma y que aparecen en un elevado número de copias por célula. Una vez que se ha obtenido la secuencia de código de barras de ADN, se la coloca en la base de datos del sistema de código de barras de la vida Se utilizan estas secuencias para la identificación de especies. Con el fin de facilitar la amplificación, el código de barras de ADN debería presentar regiones de unión a cebadores muy conservadas, flanqueando la región génica elegida, de modo que podría utilizarse la misma pareja de cebadores en una amplia gama de microorganismos, y funcionarían como cebadores universales. Además, los marcadores genéticos son más fáciles de amplificar si se presentan en múltiples copias. Por otro lado, si los códigos de barras genéticos son fáciles de alinear facilitan la identificación de especies basada en árboles filogenéticos o bases de datos relacionados, que es el sistema generalmente utilizado para identificar especies por este método. Es aconsejable la cautela respecto de la fidelidad de las bases de datos a efectos de comparación de secuencias con fines de identificación; por ejemplo, recientemente se ha cuestionado la validez del código de barras del ADN basado en una sola secuencia génica, como la región intergénica del ARN ribosómico (ITS), y se ha recomendado que la delimitación de especies fúngicas se base en más de un locus (multilocus), que presumiblemente sean evolutivamente neutrales. La generación de marcadores moleculares, como el código de barras de ADN que sean específicos de especie, subespecie, raza, patovar, etc., y en el genotipado de estos, facilitarán: i) la identificación y evaluación de la distribución espacio-temporal de las variantes de cada agente nocivo, que son clave para el despliegue de las resistencias; ii) el análisis del potencial evolutivo de los agentes nocivos a través de la estructura genética de sus poblaciones, que es determinante para la estabilidad de las resistencias; e incluso; iii) la determinación del posible origen geográfico de un agente nocivo tras una introducción accidental, ilegal o voluntaria en una nueva zona. El código de barras del ADN microbiano se utiliza para caracterizar una mezcla de microorganismos, por ejemplo obtenidos sin clasificar en el medio ambiente, a partir de «marcadores genéticos universales» para identificar el ADN de muchas especies, incluso dentro de una mezcla de distintos microorganismos.

Genoteca o base de datos de referencia de códigos de barras de ADN que puede ser utilizada para asignar identidades de especímenes desconocidos. Se trata de un repositorio de búsqueda de registros de códigos de barras, almacenamiento de datos de especímenes e imágenes, así como secuencias y archivos de seguimiento. En definitiva, una herramienta de identificación basada en la genoteca de código de barras actual que supervisa el número de registros de secuencias de código de barras y la cobertura de especies.

Colorante orgánico catiónico, sintético y alcalino de triaminotrifenilmetano. Se encuentra disponible como un polvo con brillo metálico. Se utiliza para distintos fines: como indicador de pH, colorante para identificar bacterias en la tinción de Gram para distinguir entre bacterias grampositivas y gramnegativas y en medios selectivos o semiselectivos por su efecto inhibitorio de microbiota grampositiva y de algunas especies gramnegativas. También es utilizado en histología para la identificación de núcleos celulares y para medir los efectos citostáticos/citotóxicos en las líneas de células tumorales.

Método o sistema analítico instrumental basado en cromatografía líquida automatizada para el análisis de pequeños volúmenes, del orden de L, de mezclas complejas inyectadas y sometidas a presión. El efluyente de la columna se hace pasar a través de un detector adecuado, como un fluorímetro o un refractómetro diferencial. La señal que proviene del sistema de detección puede ser procesada directamente a través de un microprocesador para proporcionar una medida cuantitativa de los componentes presentes en la muestra. La cromatografía líquida de alta resolución debe calibrarse con estándares conocidos y no proporciona una identificación absoluta de la composición química de la muestra (integrantes de la mezcla).

Población inicial de un hongo, bacteria u otro microorganismo aislado en condiciones controladas, utilizada como punto de partida para su multiplicación, estudio, diagnóstico, identificación o ensayos de patogenicidad. En un contexto más amplio, es la muestra o población microbiana inicial, pura y controlada, utilizada para iniciar un proceso de fermentación, multiplicación o producción en condiciones de laboratorio o industriales.

Proceso gradual de deterioro del vigor de una planta o degeneración, que puede llevar eventualmente a su muerte. Este fenómeno puede manifestarse a través de varios síntomas, que incluyen: i) defoliación o caída prematura de hojas, clorosis o decoloración; ii) crecimiento reducido, desarrollo lento y estancado; iii) marchitamiento de hojas o tallos; iv) menor rendimiento con reducción significativa de la cantidad y calidad de superficie foliar, flores, frutos o semillas; y v) incremento en la susceptibilidad a infecciones y ataque de insectos. El declive puede estar causado por condiciones ambientales adversas (exceso o falta de agua, temperaturas extremas, mala calidad del suelo o condiciones edáficas inapropiadas), plagas y enfermedades, estrés abiótico (exposición a contaminantes, carencias nutricionales, daño físico), o por senescencia o envejecimiento natural. La identificación de las causas del declive es crucial para intentar recuperar el vigor de la planta y evitar su muerte precoz.

Técnica serológica de microscopía electrónica en la que la muestra es incubada primero con anticuerpos específicos del agente patógeno (muestra) marcados con una sustancia densa a los electrones (como oro coloidal o hierro), o con anticuerpos específicos (producidos en una especie animal determinada) y posteriormente con inmunoglobulinas anti o contra la especie primera, conjugadas con oro coloidal, antes de su observación. La imagen del objeto en estudio aparecerá recubierta (decorada) con los anticuerpos que hayan reconocido específicamente a los epítopos contenidos en la muestra estudiada, facilitando su localización en los tejidos vegetales o del vector, y su detección e identificación específica.

1. Arte o acto de reconocer o distinguir los signos o los síntomas de una enfermedad mediante su observación y confirmación por pruebas diagnósticas objetivas. 2. Conclusiones, resultado preciso o clasificación, alcanzadas tras un examen de la naturaleza y circunstancias de un estado patológico o desorden. 3. El proceso de detección e identificación de una plaga, es decir, la interpretación del resultado de un proceso de diagnóstico, según terminología de las normas NIMF 15 de la FAO.

1. Acción y efecto de diagnosticar. 2. Conjunto de observaciones, resultados de pruebas y análisis cualitativos y cuantitativos, que permiten determinar el agente causal o identificar la naturaleza de una enfermedad o desorden (que presente síntomas), o revelen la presencia asociada de sustancias específicas o metabolitos que indican enfermedad o estado patológico anormal. 3. Calificación o dictamen, normalmente por escrito, que emite el fitopatólogo o autoridad fitosanitaria competente, frente a una enfermedad o desorden, según los signos y síntomas que advierte y con los resultados de las oportunas pruebas diagnósticas de laboratorio. 4. Una característica distintiva importante para la identificación de una enfermedad u otra condición dañina para las plantas.

Proceso de detección e identificación de una plaga, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

Conjunto de herramientas de alto rendimiento para la asignación de términos de ontología génica a genes o proteínas mediante análisis de similitud de secuencias. Basado en el motor de alineamiento de secuencias de proteínas y ADN DIAMOND, cuya velocidad es de dos a cuatro órdenes de magnitud mayor que la de BLAST, D2GO posibilita la anotación funcional rápida y eficiente de conjuntos de datos a gran escala; por ejemplo, sus desarrolladores documentan la asignación de dos millones de términos GO a cerca de 130.000 proteínas en menos de 13 min en un ordenador portátil estándar. El procedimiento consiste en la transferencia de términos de ontología génica desde secuencias previamente anotadas en la base de datos no redundante del NCBI hacia las secuencias en análisis. Permite la identificación rápida de agentes patógenos y genes asociados a enfermedades de vegetales directamente en campo o laboratorio, incluso con recursos informáticos limitados. Se usa frecuentemente en Fitopatología para el análisis comparativo de secuencias obtenidas por secuenciación genómica o metagenómica. Este programa es de código abierto y uso gratuito.

1. Célula, tejido, órgano o molécula al que se dirige la acción de un reactivo (producto químico, producto ionizante, conjugado, enzima, substrato, fotón, luz ultravioleta, anticuerpo, sonda, producto fitosanitario, ácido nucleico, medicamento, enzima, etc.). 2. Fin u objeto a que se dirigen deseos o acciones (reactivos) de detección, diagnóstico o identificación, generalmente a través de la observación (directa o microscópica) o mediante reacciones analíticas apropiadas.

Obra lexicográfica del Grupo especializado en detección, diagnóstico e identificación (GEDDI) de la Sociedad Española de Fitopatología (SEF). Recoge fundamentalmente los términos o entradas relacionados con detección, diagnóstico e identificación de agentes patógenos (algas, bacterias, hongos, oomicetos, virus, viroides y virusoides) y de los agentes abióticos que causan o están asociados a enfermedades, síntomas o signos de enfermedad o a infecciones asintomáticas en estado subclínico de plantas. Su propósito es agrupar en un glosario el léxico general utilizado en España y en los países de lengua española. Se dirige, fundamentalmente a hablantes cuya lengua materna es el español, con el fin de proporcionar recursos suficientes para descifrar textos escritos y orales y les facilitará, por su doble entrada del término en inglés, el uso correcto de la terminología.

Sigla del inglés. En español, Colección Alemana de Microorganismos y Cultivos Celulares. La institución tiene su sede en el Instituto Leibniz de Braunschweig (Alemania). Dispone de numerosos grupos de investigación que abordan varios aspectos de la biodiversidad de procariotas y eucariotas. Dispone de amplias colecciones de microorganismos, virus de plantas y anticuerpos, y cultivos de líneas celulares humanas y de animales, y además oferta servicios de identificación, caracterización y análisis específicos. Ofrece un interesante servicio sin cargo, de bases de datos y herramientas bioinformáticas, para procariotas y eucariotas.

Técnica analítica rápida y eficaz de separación, apta para pequeños volúmenes, que se basa en la diferente velocidad de desplazamiento que tienen las distintas proteínas en el seno de un medio líquido, contenido en un tubo capilar, al someterlas a la acción de un campo eléctrico de alto voltaje (10-30 kvoltios, corrientes de 5-100 µA). La separación se lleva a cabo en un tubo de diámetro interno de 10-75 μm y una longitud de 20-100 cm, generalmente de sílice fundida, que se llena con el tampón que constituye el medio de separación a partir de los viales situados en los extremos del capilar. La muestra contenida en otro vial, se introduce por uno de los extremos del capilar reemplazando en el momento de la inyección uno de los viales de tampón por el vial de muestra. La monitorización de la separación se lleva a cabo colocando un detector en un punto del capilar de análisis situado generalmente antes del extremo de salida de este. Un ordenador se encarga del control de la instrumentación y de la adquisición y tratamiento de los datos suministrados por el detector. Se ha utilizado para la identificación y diferenciación de virus, como el de la tristeza de los cítricos (Closterovirus tristezae, Citrus tristeza virus-CTV), según su agresividad, combinada con polimorfismo de conformación de cadena simple (SSCP) y marcadores moleculares múltiples (MMM).

1. Colorante de color rosa. Polvo rojo insoluble en agua, benceno o cloroformo, y soluble en alcohol o soluciones alcalinas. Tiene carácter ácido, por lo cual tiñe sustancias básicas y colorea componentes y orgánulos citoplasmáticos. Aquellos componentes que se tiñen con eosina se conocen como acidófilos o eosinófilos. Los demás componentes que se tiñen con colorantes básicos se denominan basófilos. 2. La tinción hematoxilina y eosina es utilizada para la identificación de las características de hongos, la aplicación de la tinción de hematoxilina (por ser catiónica o básica), tiñe estructuras ácidas (basófilas) en tonos azul y púrpura, como por ejemplo los núcleos celulares; y el uso de eosina (tiñe componentes básicos, acidófilos, como por ejemplo estructuras citoplasmáticas y sustancias intercelulares), en tonos de color rosa.

Aquel representativo de una población de un organismo específico que se conserva como modelo y se mantiene accesible en colección para fines de identificación, verificación o comparación con otros, según terminología de la FAO, 2022. Glosario de términos fitosanitarios NIMF nº 5.

Instrumento utilizado para determinar la identidad y la estructura de moléculas orgánicas complejas. Se utiliza también para determinar la cantidad de isótopos en un compuesto dado o para controlar la cantidad de un isótopo pesado en una muestra marcada isotópicamente. La muestra es bombardeada con un haz de electrones de alta energía que provoca su fragmentación en una forma característica para un compuesto dado. Los fragmentos, de masa y carga variables, se hacen pasar, a continuación, a través de un campo magnético donde se separan en base a su relación carga/masa. Mediante la utilización de detectores apropiados, circuitos electrónicos y sistemas informatizados, se obtiene su identificación.

Boletín editado esporádicamente por el Grupo de Trabajo de Laboratorios de Diagnóstico del Ministerio de Agricultura (GTLD), que agrupaba a los laboratorios de Sanidad Vegetal de las distintas Comunidades Autónomas (CC. AA.) del estado español. En el mismo, de modo humorístico y con tono jocoso, se relataban noticias fitopatológicas y se informaba de las actividades del grupo, de sus miembros y de los laboratorios de referencia. Su coordinador y redactor jefe fue durante el período de su duración (en dos etapas desde 1992 hasta 2014) el eminente Dr. Paul Omo de Charrilandia (pseudónimo del Dr. José Luis Palomo que lo editaba desde Aldearrubia, Salamanca). En la editorial de su último número 16 de 2014 se señalaba, como siempre acertadamente que, “la creación del grupo especializado en detección, diagnóstico e identificación (GEDDI) de la Sociedad Española de Fitopatología (SEF) (GEDDI-SEF) ha supuesto una oportunidad única de mantener el antiguo grupo GTLD y ampliarlo a nuevos integrantes, que van a aportar distintos puntos de vista siempre enriquecedores”.

Tipo, modelo, patrón, nivel, norma o referencia para efectuar la detección, diagnóstico e identificación de patógenos o de sus vectores.

1. Poro en la epidermis de las partes aéreas de la planta, flanqueado por dos células especializadas (células oclusivas o células guarda) que regulan su apertura merced a los movimientos provocados por el estado de turgencia. Supone una posible vía de entrada de agentes patógenos, según definición del Diccionario de Ciencias Hortícolas de la SECH. 2. Cavidad bucal de los nematodos y parte de su aparato digestivo. Está rodeada por tres o seis labios, alrededor de la misma y la cavidad está formada por un estilete esclerotizado, en la parte anterior es cónica, su abertura se ubica en posición ventral y es reemplazada en cada muda. Está conectada con el esófago y aparato digestivo, que son clave para la identificación de nematodos.

En las etiquetas de los reactivos se debe encontrar: i) el nombre y la concentración a la que se encuentra o su riqueza; ii) la fórmula química, peso molecular y densidad; iii) los números CE y CAS, correspondiendo el primero al número de identificación de la Comunidad Europea, y el segundo, mucho más usado, al internacional; iv) el lote, la fecha de caducidad y las condiciones de almacenamiento; v) indicaciones de peligro, las cuales señalan los peligros físicos, para la salud humana y para el medio ambiente; vi) consejos de prudencia (consejos de eliminación, almacenamiento, o de prevención; y vii) pictogramas de peligro.

Parte del informe de ensayo en un sistema de gestión de la calidad según las directrices para la acreditación de la entidad de Acreditación de España (ENAC). Establece la información que debe ser incluida en un informe de ensayo y cómo debe ser estructurada. Se informará cada resultado analítico de cada método de ensayo de manera independiente. Asimismo, cada resultado debe ser expresado de forma exacta, clara, objetiva y libre de ambigüedad. El resultado, por lo tanto, se informará como: i) Positivo (incluyendo valor, si aplica). Siempre que esté técnicamente justificado y previo acuerdo con el cliente, puede utilizarse otra expresión (por ejemplo: presencia, detectado, se observa…, aislamiento de…, identificación de…). Asimismo, cuando sea necesario pueden incluirse como parte del resultado otros datos inherentes al ensayo, como por ejemplo el valor ELISA (densidad óptica de la muestra) o ciclo de corte en PCR a tiempo real (Ct o Cq); ii) Negativo. Siempre que esté técnicamente justificado y previo acuerdo con el cliente, puede utilizarse otra expresión (por ejemplo: ausencia, no detectado, no se observa…, identificación negativa de… o; iii) Resultado no concluyente. En este caso será necesario incluir comentarios en el informe de ensayo para que este resultado sea comprensible para el destinatario. Por ejemplo, para aportar información sobre la conveniencia de repetir el ensayo en una nueva muestra, la realización de nuevos ensayos adicionales o sobre las limitaciones de las técnicas o ensayos aplicados. Estos comentarios se deberán documentar y estandarizar en el apartado de expresión de resultados del procedimiento de ensayo.