Diccionario

Sigla del ácido ribonucleico.

1. Segmento de ARN con nucleótidos complementarios de un ARN mensajero, que se une a él evitando que se traduzca la proteína codificada por dicho ARN mensajero, regulando así la expresión génica. 2. Molécula de ARN (sintética o natural) sintetizada in vitro que servirá de sonda en experimentos de hibridación molecular.

Pequeños ARN generados a partir de precursores monocatenarios largos y con función de ARN interferente.

Pequeña secuencia de ARN, sobre la cual la ADN polimerasa III añade nucleótidos en la replicación del ADN.

Aquel que está formado por dos hebras complementarias. Puede aparecer en muchos tipos de organismos (virus de genoma ARN bicatenario; viroides, etc.). Es también una forma replicativa transitoria de virus. Se ha utilizado su perfil electroforético para caracterizar algunos virus y diferenciar sus aislados. Algunas plantas no infectadas por virus pueden contener ARN de doble cadena de función desconocida.

La forma de ARN que transporta información desde el ADN en el núcleo hasta los sitios de los ribosomas de síntesis de proteínas en la célula y es, por tanto, la plantilla para la síntesis de proteínas.

Aquellos producidos por recombinación no homóloga durante la replicación viral y dependientes del ARN parental para su replicación.

El ARN es un material extremadamente sensible a la degradación por ribonucleasas y debe manejarse con cuidado durante los pasos de aislamiento de ácidos nucleicos. Este es el paso más crítico para preparar con éxito ADNc y realizar una reacción de PCR en tiempo real eficiente y reproducible. Pipetas, puntas, las manos del operador o incluso la propia bancada del laboratorio, pueden ser foco de ribonucleasas. Una vez extraído el ARN, se debe evaluar su pureza, frecuentemente por espectrofotometría. Además de la concentración, la relación de absorbancia entre 260 y 280 nm (A260/A280), debe estar en el rango de 1,8-2,0. Si es inferior, puede sugerir la contaminación de la muestra por fenol, proteínas o por material vegetal.

Molécula de dos piezas que se une a la enzima endonucleasa Cas9 y permite identificar una secuencia de ADN complementaria. Compuesto por CRISPR RNA (ARNcr) y CRISPR RNA transactivador (ARNtracr). Cas9 usa la porción de ARNtracr de la guía como asa, mientras que la secuencia espaciadora de ARNcr dirige el complejo a una secuencia de ADN coincidente.

Molécula artificial de ARN con una curva cerrada o giro apretado de la horquilla, que frecuentemente se utiliza para silenciar la expresión génica a través de ARNi, ya que permite silenciar específicamente ARN mensajeros que se traducen en proteínas responsables de alteraciones o efectos indeseados dentro de la célula, inhibiendo sus efectos.

ARN pequeño inducido por la infección viral con carácter interferente de origen vírico. Comparte características similares con los ARN interferente pequeño (ARNsi) y los ARN micro (miARN) endógenos que median en el silenciamiento génico y, por tanto, son capaces de unirse a complejos efectores de silenciamiento y regular la expresión de genes con secuencias complementarias. En consecuencia, los ARNip o ARN interferente pequeño de origen vírico, dirigen el autosilenciamiento de los mismos ARN pequeños o sARN virales de los que proceden.

Grupo heterogéneo de ARNs de naturaleza muy variada, entre los que cabe destacar: i) los ARNsi de acción trans o ARNtasi (trans-acting siRNA, tasiRNA); ii) los ARNsi asociados a transcritos naturales antisentido o ARNnatsi (natural antisense siRNA, natsiRNA); y iii) los ARNsi asociados a repeticiones del genoma o ARNrasi (repeat-associated siRNA, rasiRNA). Son moléculas de ARN bicatenario perfectamente complementarias, de 20-21 nucleótidos con dos nucleótidos desemparejados en cada extremo 3´, con capacidad y efecto de interferir anulando la expresión de un gen concreto. Pueden ser introducidos de forma exógena en las células utilizando métodos de transfección basándose en la secuencia complementaria de un gen en particular, con finalidad de reducir significativamente su expresión. Las infecciones virales en plantas están asociadas con la acumulación de ARN pequeño interferente (ARNsi) virales que pueden, a su vez, actuar silenciando el propio genoma viral. Por esta razón, los virus son tanto inductores como dianas del silenciamiento por ARN. Mientras que en virus de ADN los ARNsiv podrían provenir de ARN bicatenarios (ARNds) generados durante la transcripción bidireccional de sus genomas, en virus de ARN los ARNsiv podrían generarse a partir de ARNds sintetizados durante el proceso de replicación viral.

Molécula pequeña de ARN (20 a 25 nucleótidos) que se genera por fragmentación de precursores más largos. Suprime la expresión de genes específicos mediante mecanismos conocidos globalmente como ribointerferencia o interferencia por ARN. Se pueden clasificar en tres grandes grupos: ARN interferente pequeño (ARNsi), micro ARN (ARNmi) y ARN asociados a Piwi.

Molécula de ARN que transfiere la información codificada en el ADN para que se realice la síntesis de proteínas en los ribosomas. Contiene entre 1 y 10.000 pares de bases. Se forma por transcripción de un molde de ADN.

ARNm que solamente es traducido por el ribosoma 70S.

ARNm transcrito a partir del ADN mitocondrial.

Moléculas de ARN que se generan a partir de precursores de ARN de cadena sencilla o ARNss con estructura en forma de horquilla, que se transcriben por la ARN polimerasa II (Pol II).

1. Aquel que sirve de plantilla para la síntesis de una cadena de ácido nucleico complementaria. 2. En la replicación de ADN, cualquiera de las dos cadenas del ácido nucleico bicanetario (ARNbc) que, al separarse, sirve de molde para la síntesis de una cadena hija complementaria. 3. En la transcripción, es sinónimo de cadena no codificante.

Aquel ARN de una sola cadena que mediante un enzima codificado por el ARN complementario al genoma viral (ARN polimerasa dependiente de ARN), presente en el virión, transcribe el ARN genómico a ARN mensajero. Lo tienen los virus de plantas de las familias Rhabdoviridae y Ophioviridae.

ARN de una sola cadena de sentido positivo. Constituye el genoma de la mayoría de virus de plantas y funciona como un ARN mensajero para la síntesis directa de proteínas virales. Un caso particular de virus de ssRNA se presenta cuando el genoma codifica, además de una ADN polimerasa dependiente del ARN y una replicasa, una retrotranscriptasa para el paso de transcripción inversa de la replicación. A este tipo de ssRNA se le define como ssRNA-RT y solo se da en dos géneros que incluyen virus de plantas: Pseudovirus y Sirevirus (familia Pseudoviridae).

Moléculas de ARN de pequeño tamaño que guían eficazmente al silenciamiento de genes específicos a nivel postranscripcional o transcripcional, a través del reconocimiento específico de secuencias de ARN o ADN, respectivamente. En plantas, las rutas de silenciamiento generan dos tipos de ARN pequeño: i) los ARN micro o microARN (miARN o miRNA) y ii) los ARN interferente pequeño (ARNsi o siRNA). Los sARN son móviles y por tanto el silenciamiento que promueven puede propagarse a células adyacentes y a tejidos distantes.

Enzima que cataliza la formación de ARN por transcripción del ADN. La síntesis tiene lugar desde el extremo 5´al 3´.

ARN mensajero tal como se forma a partir del ADN.

El enzima primasa hace un iniciador de ARN, un corto segmento de ácido nucleico complementario al molde, que proporciona un extremo 3′ con el que la ADN polimerasa puede trabajar. Un cebador típico es de cinco a diez nucleótidos de largo. El cebador o iniciador ceba la ADN polimerasa, es decir, le proporciona lo que necesita para funcionar. Una vez que el cebador de ARN está en su sitio, la ADN polimerasa lo extiende, añadiendo nucleótidos uno a uno para hacer una cadena nueva de ADN complementaria a la cadena molde.

Enzima que cataliza la replicación del ARN a ARN en virus cuya organización genética es en moléculas de ARN.

ARN que se encuentra en las subunidades ribosómicas grande y pequeña. En la subunidad pequeña del ribosoma existe un tipo de ARNr, mientras que en la grande se encuentran dos tipos de ARNr en los procariotas y tres en los eucariotas.

Pequeña molécula de ARN no codificante, que puede modificar la patogénesis y afectar negativamente a la replicación de su virus auxiliar, comportándose como un verdadero parásito molecular del mismo. Depende para la replicación del virus al que acompañan y no codifican proteína de cubierta, encapsidándose en las cápsidas del virus al que acompaña.

Porciones del genoma molde que se originan, en algunos virus, durante la transcripción para expresar los genes internos. Una especie de ARN menor que la longitud genómica que se encuentra en las células infectadas y, a veces, encapsidado. Cuando está encapsidado, no está involucrado en la infección natural. Cada especie de ARN subgenómico tiene un cistrón diferente en el extremo 5´ que lo abre para la traducción.

Enzima responsable de transcribir la información codificada en el ADN a ARN.

ARN de cadena simple que se pliega en la típica estructura de hoja de trébol. Traduce el lenguaje de nucleótidos al de aminoácidos, al permitir que el ribosoma transfiera el aminoácido unido a él a la proteína que sintetiza. Se encuentra disuelto en el citoplasma.

Cualquiera de las enzimas (endonucleasa o exonucleasa) que catalizan la rotura y degradación del ARN.

Aquel sintético que suele ser complementario del extremo 5’ de un ARNm. Los naturales desempeñan, por lo general, una función reguladora al disminuir la expresión del ARNm correspondiente.

Lugar del laboratorio donde se mantienen almacenadas, registradas y debidamente identificadas muestras de ARN, en condiciones de seguridad y habitualmente congeladas a -80 oC, resuspendidas en etanol o desecadas, en ambiente seco y oscuro.

Ácido nucleico formado por una cadena simple de ribonucleótidos, cada uno de ellos constituido por una ribosa, un fosforilo y una base nitrogenada derivada de la pirimidina (citosina, C o uracilo, U) o de la purina (adenina, A o guanina, G). El ARN celular es lineal y monocatenario; el genoma de los viroides y el de algunos virus está constituido por ARN bicatenario. Está presente tanto en las células procariotas como en eucariotas y es el único material genético de ciertos virus (virus de ARN) y de los viroides.

La infección viral en plantas induce la producción de pequeños sARNs de origen vírico (ARNsiv o vsiRNA). Estos ARNsiv comparten características similares con los pequeños ARN de silenciamiento ARNsi y los ARN micro (ARNmi o miRNA) endógenos que median en el silenciamiento génico y, por tanto, son capaces de unirse a complejos efectores de silenciamiento y regular la expresión de genes con secuencias complementarias. En consecuencia, los ARNsiv dirigen el denominado autosilenciamiento de los mismos ARNs virales de los que proceden.

Que tiene consistencia de carne, como en el caso de la mayoría de los hongos de la subdivisión Agaricomycotina, cuyos basidiocarpos tienen el píleo de ese tipo.

Compuesto orgánico natural, alcohol sesquiterpenoide transparente o ligeramente amarillo. Se encuentra en diversos aceites esenciales de plantas y frutas, como el melocotón o durazno, maíz, tomate o plantas herbáceas como la hierba limón, citronela o limoncillo (Cymbopogon citratus y C. flexuosus), manzanilla de Castilla, alemana o dulce (Matricaria chamomilla) y otras. Actúa como plaguicida natural frente a ácaros y constituye una feromona para varias especies de insectos. Se ha usado como desinfestante de bacterias, virus y protozoos en superficies. Aplicado a plantas induce fitotoxicidad y malformaciones en las hojas tratadas. Para evitarlo, se utiliza en nanoformulaciones que generan únicamente una leve y pasajera fitotoxicidad. Esta aplicación altera el comportamiento de pulgones, incrementa su movimiento y reduce su estancia sobre las plantas en las que han aterrizado o visitado. En consecuencia, se reduce la infección de las plantas tratadas por virus transmitidos de forma persistente. Se ha descrito que su uso combinado, en cucurbitáceas, con la introducción de enemigos naturales constituye una interesante estrategia para reducir la infección natural por vectores virulíferos o bacteriolíferos.

Aquel indehiscente con el pericarpio jugoso en todo (baya) o en parte (drupa, pepónide).